Note: The first structure for each sequence is the reference from the RNA STRAND database, and the next 10 structures are the predictions from the algorithms in the following order: BL*, CG*, T99, CONTRAFold1.1, DIM-CG, NOM-CG, BL-FR*, MaxExpect, CONTRAFold2.0, CentroidFold. > SSTRAND_ID=ASE_00003; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Azotobacter chroococcum, strain ATCC 9043; ORGANISM=Azotobacter chroococcum gaggaaaguccgggCUCCAUAGGGCAGAGUGCCAGGUAACGCCUGGGAGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAACAACCGCCUAAGUGCGCAAGCGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACGGCUGGCAACAGUCCGUGGCUAGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGAUCCGUUGGCGUGGCCCGCGCUGGAUCCGGGUAGGUUGCUAGAGGCGGCCAGCGAUGGUCGUCGUAGAGGAAUGACUGUCCUCGACAGAAcccggcuua .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))). .....(((.(((((.((...(((((((....(((((.....))))).((((....))))....................(((((((((....((....)).((((...((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))...))))...............((((((...(((((.....))))))))))))))).))))).....((((((((....))))))))............))))))).....)).)))))))). .....(((.(((((.((.....((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))........((((((((...........((.((((...((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))...)))).))............((((((...(((((.....))))))))))).))).))))).....((((((((....))))))))...(((((.......)))))....)).)))))))). .....(((.(((((.(((....(((((..((((.(((...(((((((.(((....)))...((....((((........((.(((((...((((....)))).)))..)).))....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....))))....)).))))).))...)))......((((((...((((((...)))))))))))).))))..)))))...((((((((....)))))))).....)))....(((((...)))))..)))))))). .....(((.(((((((((........(((((((.....((((((...)))))).((((.(((((..((((((..........((((((..((((....))))......)))))....((((((.......)))))).....).))))).)..))))))))).)).......)))))).((((..(((......((((((...(((((((.))))))))))))).....)))))))...((((((((....))))))))((((((((.......)))))))).))))))))))). .....(((.(((((((((....((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))..........((((((...((((....)))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....((......))....)))))..(((((.....((((((...(((((.....)))))))))))..((.((((((.....)))))).))..)))))...((.(((((.......))))).)).....))))))). .....(((.(((((.((.....((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))............(((......)))...((.((((...((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))...)))).))..(((((.....((((((...(((((.....)))))))))))..((.((((((.....)))))).))..)))))...((.(((((.......))))).)).)).)))))))). .....(((.(((((......(((((((....(((((.....))))).((((....))))....................(((((((((....((....)).((((...((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))...))))...............((((((...(((((.....))))))))))))))).))))).....((((((((....))))))))............)))))))........)))))))). ......................((.......)).(((...)))(...)(((....)))...((......))............((((...((((....)))).)))...).......((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....................(((...(((......((((((...((((((...)))))))))))).....))).)))...((((((((....)))))))).....(((.......))).................. .........(((((....................((....(((.....))).....))..(((...........................((((....))))...............((((((.......))))))......(((....))).))).......................(....(((......((((((....(((.......))).)))))).....)))..)....((((((((....))))))))...(((((.......))))).......))))).... .........(((((.................(((((.....)))))..............................................((....)).................((((((.......))))))......(((....))).........................................((((((....(((.......))).))))))...............((((((((....))))))))...(((((.......))))).......))))).... > SSTRAND_ID=ASE_00011; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Azomonas macrocytogenes, strain 123; ORGANISM=Azomonas macrocytogenes gaggaaaguccgggcUCCAUAGGGCAAAGUGCCAGGUAACGCCUGGGAGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAACCGCCUAAGCGCUUCGGCGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACGGCUGGCAACAGUUCGUGGCUAGGUAAACCCCACUUGGAGCAAGACCAAAUAGGGAUCCAUCGGCGUGGCCCGCGCUGGAUCCGGGUAGGUUGCUAGAGGCGGUCAGCGAUGGCCGUCGUAGAGGAAUGGCUGUCCUCGacagaacccggcuua .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))). .....(((.((((((((((..(((.......(((((.....))))).((((....)))).........(((((.........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))....(((((....))))).))))).........)))...))))))..((((......((((((...(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...(((((.......)))))........))))))). .....(((.(((((.((.....((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))..........(((((((..((((....))))..((..((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........)))).))....((((..(((...(..(((((((...((((.....))))))))))).)...)))))))..))))))).((.(((((((((.........))))))))))).....)).)))))))). .....(((.(((((.(((....(((((..((((.(((...(((..((.(((....)))...((....((((..........((((((...((((....)))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....))))....)).))..).))...)))......(((((((...(((((...)))))))))))).))))..)))))...((((((((....)))))))).....)))....(((((...)))))..)))))))). .....(((.((((((((((..(((((...)))(((((.((((((...))))))..)))).........((.............((((...(((((..))))).......))))....((((((.......)))))).((((((((....)))).))))))..)(....).))...)))))(..((((......(((((((...((((((.))))))))))))).....))))).....((((((((....))))))))((((((((.......))))))))....)))))))). .....(((.(((((.((.....((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))..........((((((...((((....)))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....((......))......((((..(((...(..((((((...(((((.....))))))))))).)...)))))))...((((((((....))))))))...(((((.......)))))....)).)))))))). .....(((.(((((.((.....((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))..........(((((((..((((....)))).(((..((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........)))).)))...((((..(((...(..((((((...(((((.....))))))))))).)...)))))))..))))))).((.(((((((((.........))))))))))).....)).)))))))). .....(((.((((((((((..(((.......(((((.....))))).((((....)))).........(((((........((((((...((((....)))).)))...)))......(((((((........)))))))(((((....))))).))))).........)))...))))))..((((......((((((...(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))((.(((((.......))))).)).....))))))). ......................((((.....((((((.((((((...))))))..))))..))....))))..........(((((((.(((((((((.((((......))))....((((((.......)))))).((((((((....)))).)))).....(......)....))))))...(((......((((((...((((((...)))))))))))).....))).)))..))))))).((.((((((((((......)).))))))))))................. .........(((((((((................(((..((((.....))))...)))............(...................((((....))))...............((((((.......))))))...(.((((....))))..).)..................))))....(((......(((((((...(((.......)))))))))).....))).......((((((((....))))))))...(((((.......))))).......))))).... .........((((.((((.............(((((.....))))).......................................................................((((((.......))))))......(((....)))........................))))....(((......(((((((....(.........).))))))).....))).......((((((((....))))))))...(((((.......)))))........)))).... > SSTRAND_ID=ASE_00022; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Bacillus anthracis; ORGANISM=Bacillus anthracis UCAUAACGUUUGGGUAAUCGCUGCAACGCCAACGUUGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGCCUGAGAUGGCUGUAGUGUUCGUGCCUAGCCAAUUCAUAAGCUAGGGUAUUCUGGCUGUAAGGCUGGUUUAACGGCAGGGAAAAAACCUAAGUCCUUUCGGAUAUGGUUUGACUACCUUUAAAGUGCCACAGUGACGAAGUCCUUGAAGAAAUGAUAGGAGUGGAACGAGGUAAACCCCACGAGCGAGAAACCCAAAUAAUGGUAGGGGAAUCUUUUCCAAGGAAAUGAACGAUGGGAAAGGACAGGUUGUAUAACCUGUAGAUAGAUGAUUGCCACCGGAGUACGAGGCGUGGGCCGUUUGCAGUACAAAGGAACAGAACAUGGCUUACAGAACGUUAUGAACCA .(((((((((((........((((((((....))))))))....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((..((((((....))))))..)).)((.(((.....((((...((((....))))..))))......))).....(((((............((((...(....)...)))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))(((((((....)))))))................((...(((((.(((....))).).....))))...)).......)))))))).).))))))))))..... 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UGAAGUUGACUAAAAACAGUCGCUGUUUAGUUUUUAAAAAUUAAAAAGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGAGCAGGGUGCCAGAUAACAUCUGGAAAGCGUGAGCUUAUGACUAGUGCAACAGAAAAUAAACCACCUAUUUUGUAAUAUAUAAAAAUAUGGCCAGGGUGAAAAGGCGUGGUAAGAGCACACCGCAUAAUUGGUAACAAUUCAUGGCAUGGUAAACUCCACCCGGAGCAAAGCCAAAUAUAGGAUAAAUUUUUUGUACUGCUCGUACUUCUUAAACCUGGGUAGGCUGCUUGAAUUAGUAAGUGAUUGCUAAUCUAGAUGAAUGACUGUUAAAACAGAACCCGGCUUACACGAGUCAACUUCAAUAAC ...((((((((...........((.(((((((.....).)))))).))....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...((((.............((.(((((((((((...)))))).))).))...)).......((.(((.......))).))((((.((((....))).).))).)...))..)))))))))))))...((((......(((.(.........((((.....))))......).))).....))))......((((((((....))))))))..........................)))))))).....))))))))........ 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Clavispora opuntiae, strain CG28-540; ORGANISM=Clavispora opuntiae GUUCUCCCCAUCCCUCUCUGGGUGCUUCUGCAUUCAGAGCGAUAUAAUGCUCUUGAGAGCUUCCUGGGCGUAGAUAGUUACGCCGGGCGUCGCCAUCAGAAAAACAGCAGAGCUACGCUUUGCAUGGGAGGCGGCGCGGAUGGUUGGUCUUUCAAUACGAGGAAAGGCUGUUGAGUGCAAUUUGCGGCCUUUGGCA .......((((((...................................((((....))))..((..(((((((....))))))))).(((((((............(((((((...)))))))......))))))).))))))...(((((((........)))))))....................(....).. .....((((((((..((((((((((....)))))))))).........((((....))))......(((((((....)))))))..((((((((.((.......(((((((((...))))))).)))).))))))))))))))..)).(((.......))).(((((((((............))))))))).... 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Compost Heap B149; ORGANISM=Compost Heap B149 gaggaaaguccgggcUUCAUGAAAACACGGCGCCGGAUAACAUCCGGGGGGCGCAAGCCUACGGAAAGUGCAACAGAAAACAAACCGCCUUGCUUGGCCUCUGGCGAAGCAGGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCGUCCUGGUAACAGGGCGGCUUGGCAAACCCCGCCGGAAGCAAGGCCAAAUAGGGAAGGCAGGAUACUUCGGUAUCAGGGUCCGUUUUCAGACAAGCCGAAUUC ..............((((.........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...((((.............(((((((((((.(((...))).)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).))..))..)))))))))))))............((...(((..(((((....)))))...(((........)))..)))...)). .......(((((((((............))).))))))....(((((((((..((((((.........................(((((((((((.(((...))).)))))))))..)).......((((((.......))))))...((((((....)))))))))))).....)))).))))).....(((......((((((((..(((((....)))))...)))..)))))......)))...... ..(((...))).(((((..(((((..((((.(((........(((((((((..((((((.........................(((((((((((.(((...))).)))))))))..)).......((((((.......))))))...((((((....)))))))))))).....)))).)))))......(((..........)))..(((((....)))))..))))))))))))...)))))...... ..((...(((((((((...(....)...))).))))))....((((..((((....)))).))))..........((((((..((((((((.((((((((((((((.....((((....((.((..((((((.......))))))..(((((((....)))))))..)).))..))))))))))).....)))))....)).)))))..(((((....)))))..)))..)))))).......))...... ..........(.(((((..(((((((..(((.((...(...)(((((((((..(((((.........................((((((((((((((((...)))))))))))))...))).....((((((.......))))))..(((((((....)))))))))))).....)))).)))))......(((..........)))..(((((....))))).))).)))))))))...))))))..... ..(((...))).(((((..(((((..((((.(((........((((..((((....)))).))))...(((............((((((((((((.(((...))).)))))))))...))).....((((((.......))))))..(((((((....)))))))...((((.......))))...)))..(((..........)))..(((((....)))))..))))))))))))...)))))...... ..(((...))).(((((..(((((..((((.(((........(((((((((.(((...(....)....))).............(((((((((((.((.....)).)))))))))..)).......((((((.......))))))..(((((((....)))))))..........)))).)))))......(((..........)))..(((((....)))))..))))))))))))...)))))...... ............(((((..(((((((..((..((........((((..((((....)))).)))).....................(((((.((((((((((((((.....((((..(........((((((.......))))))(((((((((....))))))).))...)..)))))))))).....)))))))....).)))))..(((((....))))).))..)))))))))...)))))...... ...................(((((...(((..((........(((((((((..(((((..((.....))..............((((((((((((.(((...))).)))))))))...))).....((((((.......))))))..(((((((....)))))))))))).....)))).))))).((....((.....))....))..(((((....))))).))..))).))))).............. ............(((.....(((...................((((..((((....)))).))))......................((.......(((............(((............((((((.......))))))..(((((((....)))))))..........)))............)))...........)).......(....)..............)))......)))...... ........(((((...................))))).....((((..((((....)))).))))......................(((((((..((.....))..)))))))............((((((.......))))))..(((((((....)))))))...................................................................................... > SSTRAND_ID=ASE_00090; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Compost Heap B70; ORGANISM=Compost Heap B70 gaggaaaguccgggcUCCACAGGGCAGGGUGGUUGCUAACGGCAACCCGAGGCGACUCGCGGGAAAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGCGGCGACUUCGUCGCUGCGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGGGCUGGGCGACCAGCUCGGCUUGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGGUCAAAAGGGCAGGUUCGCCUGUCUGCGCAAGCGUUCGAGGGCGGCCCGCCCGAGCUUGCGGGUAGACCGCUAGAACCGGUCGGCAACGGCCGGUCCAGAUGGAUGGUCGCCACUGCGCGAGAGCGCGGUacagaauccggcuuac .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((...)))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((.........(((....))).....((((.....))))..)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).. .......(.((..(((((...(((......((((((.....))))))((((....)))).(((....(((((...........(((((((((((((...)))))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))...)))))...))).))))))))..)).)....(((((((....)))))))((....)).......(((((.(.(((((......))))).).)))))...((((((((....))))))))......((((..((...(((((((....)))))))...))))))....... ..(((..(((((.((((....(.((((.(.((((((.....)))))))..((((((..((((...................((((.((((((((((...))))))))))...(((((....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).............))))).......))))....(((((((....))))))).(((((((......(((((...)))))..)))))))......))))..(.((((((((....)))))))).).........)))))).)))).)..)))).))).))....)))....... ..(((..(((((.((((....(.((((.(.((((((.....)))))))..(((((((.((((.....((((...........(((((.((((((....)))))).)))))..(((((....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).............)))))...(((((.((....((((.((..(((((...(((....))).....)))))..)))))))).))))).))))..))))..(.((((((((....)))))))).)........))))))).)))).)..)))).))).))....)))....... .....(((.(((((((((...(((..(((((((((((...)))))))((((....))))........(((((..........((((((((((((((...)))))))))))...))).....((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))))))).))))..))))))))..........((((((((..)))))))).(((((((..((..((((((.)))))))))))))))(((.(((((.....((((((((....))))))))((....)).))))))))(((((((....))))))).......))))))).. ..(((..(.((..(((((...(((..(((.((((((.....))))))((((....))))..((......))...........((((((((((((((...)))))))))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))..........)))..))))))))..)).).....((((((....))))))..(((((((..((..(((((...))))))))))))))....((((((((..((((((((....)))))))).....))).)))))...(((((((....)))))))......)))....... .......(.((..(((((...(((......((((((.....))))))((((....)))).(((....(((((...........(((((((((((((...)))))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))...)))))...))).))))))))..)).)....((((.(((.((((((...((....))...)..)))))))).)))).(((..((((.....))))..(.((((((((....)))))))).)....((((..((...(((((((....)))))))...)))))).)))... .....(((.(((((((((....((((....((((((.....))))))((((....))))........))))..............(((((((((((...)))))))))))..(((((....((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..........))))))))))..........(((((((....))))))).(((((((......(((((...)))))..)))))))(((.((((((((..((((((((....)))))))).....))).))))))))(((((((....))))))).......))))))).. ...............(((........))).(((((((...)))))))...(((((((.((((.....((((..............(((((((((((...)))))))))))..(((((....((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).)..((....)).)))))...(((((.((....((((.((.((((((....(((....)))....)))))))).)))))).))))).))))..))))....((((((((....))))))))((....))..))))))).((((((....))))))................. ..........(..(((((...(((..(((.((((((.....))))))((((....))))........................(((((((((((((...)))))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))..........)))..))))))))..)........((((((....))))))..(((((((......((((.....))))..))))))).(..((((......((((((((....))))))))..........)))).).(((((((....)))))))................ .............(((((...(((..(((.((((((.....))))))((((....))))........................(((((((((((((...)))))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))..........)))..))))))))..........(((((((....))))))).(((((((......(((((...)))))..)))))))(((.((((......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((....)))))))................ > SSTRAND_ID=ASE_00095; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Compost Pile B75; ORGANISM=Compost Pile B75 gaggaaaguccgggcUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGGAAACCCACGACCAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCACGCAAGUGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUCCGUGGCACGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCACAAGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGCGAUUGCUGGCCUAGAUGAAUGACUGUCCACGacagaauccggcuua .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))((((....))).)((...((((.............(((((..((((((((....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)...))..)))))))))))))...((((......((((.(....(((((.....)))))).)))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))). .....(((.((((((((......(((.(((.(((((.....))))).(((....)))...)))..)))......)))).....(((.....(((((....)))))....)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).((((..((((......(((((((...((......))....))))))).....))))))))..((((((((....))))))))............(((((...)))))...))))))). .....(((.((((..((....((((((....(((((.....))))).(((....)))........(((........)))....((((((..(((((....)))))))).)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).(((((..(((...(..(((((((...((......))....))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))............))))))......))..))))))). .....(((.((((..((....(((((((((.(((((.....))))).(((....)))...))).......((..(((((..(..((..((((((((....))))).)))(((....((....(((((.(((...(.((..(((((.(((((....))))))))))..)).)..))).)))))...))...)))......(((((((....(((((...)))))))))))).))..)..)))))..(((((..(....)..))))).....)).....))))))......))..))))))). .....(((.((((((((....)))..(((((((((((...)))))).(((....)))...(((.((((............(((((((((..(((((....)))))))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....)))).)))))))))))......))))).((((..((((......(((((((....((((((.))))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))............(((((...)))))..)))))))). .....(((.(((((((((...(((..((((.(((((.....))))).(((....)))...(((.((((............(((((((((..(((((....)))))))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))..))))..)))))))).(((((......((((((....((((((...)))))))))))).....((((.....)))).....((....)).)))))..........(((((...)))))...))))))). .....(((.(((((((((...(((..((((.(((((.....))))).(((....)))...(((.((((.............((((((((..(((((....)))))))).)))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))..))))..))))))))..((((...(..(((((((...((......))....))))))).)...)))).((.(.((((((((....))))))))).))........(((((...)))))...))))))). .....(((.(((((.((....(((((((((((((((.....))))).(((....)))...(((.((((............((((((.....(((((....)))))....)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......))))).((((..((((......(((((((...((......))....))))))).....))))))))..((((((((....)))))))).............)))))......)).)))))))). .....................((((((....((((((...)))))).(((....)))...(((.((((............((((((..((((((((....))))).))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......(....)((((..((((......(((((((....(((((...)))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))............)))))).................. .........((((.............(((..(((((.....))))).(((....))).......(................(((((.....(((((....)))))....)))..)).......((((((.......))))))....(((((....))))).......)...........)))..(((..((((......(((((((....(...........)))))))).....)))))))...((((((((....))))))))............................)))).... ..........(((..................(((((.....)))))..((....)).........................(((((...(.(((((....)))))..).)))..)).......((((((.......)))))).....((((....))))..........................((..((((......(((((((....(((((...)))))))))))).....))))))....((((((((....))))))))............................)))..... > SSTRAND_ID=ASE_00097; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Compost Pile B80; ORGANISM=Compost Pile B80 gaggaaaguccgggcUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGGAAACCCACGACCAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCGCGCAAGCGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUCCGUGGCACGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCACAUGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGCGAUUGCUGGCCUAGAUGAAUGACUGUCCACGacagaacccggcuua .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))((((....))).)((...((((.............(((((..((((((((....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)...))..)))))))))))))...((((......((((.(....(((((.....)))))).)))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))). .....(((.(((((.((....(((((((((((((((.....))))).(((....)))...(((.((((.............(((((.....(((((....)))))....)))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......))))).((((..((((......(((((((.((((......))))..))))))).....))))))))..((((((((....)))))))).............)))))......)).)))))))). .....(((.(((((.((....((((((....(((((.....))))).(((....)))........(((........)))....((((((..(((((....)))))))).)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).(((((..(((...(..(((((((.((((......))))..))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))............))))))......)).)))))))). .....(((.(((((...(((.((((((..((((.(((...((((((((((....)))...(((.((((............((((((.....(((((....)))))....)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))........))))).))...)))......(((((((....(((((...)))))))))))).))))..))))))..(((((..(....)..)))))....))).....(((((...)))))..)))))))). .....(((.((((((((....((((((((((((((((...)))))).(((....)))...(((.((((............(((((((((..(((((....)))))))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....)))).)))))))))))......))))..((((..((((......(((((((....((((((.))))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))............))))))......))))))))))). .....(((.(((((.((....((((((....(((((.....))))).(((....)))........(((........)))....((((((..(((((....)))))))).)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).((((..((((...(..((((((....((((((...)))))))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))............))))))......)).)))))))). .....(((.(((((.((....((((((....(((((.....))))).(((....)))........(((........)))....((((((..(((((....)))))))).)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).((((..((((...(..(((((((.((((......))))..))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))............))))))......)).)))))))). .....(((.(((((((.....(((((((((((((((.....))))).(((....)))...(((.((((............((((((.....(((((....)))))....)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......))))).((((..((((......((((((....((((((...)))))))))))).....))))))))..((((((((....)))))))).............))))).....))..)))))))). .....................((((((....((((((...)))))).(((....)))...(((.((((............((((((..((((((((....))))).))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......(....)((((..((((......(((((((....(((((...)))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))............)))))).................. .........(((((.......((((((.(..(((((.....))))).(((....))).......(................(((((.....(((((....)))))....)))..)).......((((((.......))))))....(((((....))))).......)...........)....(((..((((......(((((((....(......).....))))))).....)))))))...((((((((....))))))))............)))))).........))))).... .......(.(((((.((....((((((....(((((.....)))))..((....)).........................(((((...(.(((((....)))))..).)))..)).......((((((.......))))))....(((((....)))))........................(((..((((......(((((((....((((.....))))))))))).....)))))))...((((((((....))))))))............))))))......)).))))))... > SSTRAND_ID=ASE_00102; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Deinococcus radiodurans, strain 298; ORGANISM=Deinococcus radiodurans GGAACGCGGGGAAACUCCUGGUCGCGCCUGAGCCGCUUUUUUGGUGGACAGGUGAGGAAAGUCCGGGCACCGCAGGGCAAGGAUGCCAGCUAACGGCUGGUCGGCGAGUCGAGCGCCCGCCUGAGCGCCGAGGGCAGGCGGAAAGCGGCGAAGCCGAAGGACAGUGCCACAGAAACCAGACCGCCACCCCACACAGGCCCCGGCGCGGGUGCGGGUGGUCAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGGUUCCCGGGAGACCGGGAGCGUCUGGUCAACCCCAUCCGGUGCAAGACCCGACCGUGCGGCGAGGGCGGCCCGCCCGUUUGAGCCGCCAGGAUGGUCGCUCGAGGCGUCCUGGCAACAGGCGUCCCAGACAGAUGAUCAGGCUGCCCUGGGGGAGACCCCGGAGCAGACAGAACCCGGCUUACCGUUUCCCCGUGCCAGCCACUGCCGCCCCCCGCGCCCGCCGCUGGGGGCGGU .....((((((((((.........((((((..(((((.....))))).))))))....(((.(((((((((.........((((((((((.....)))))(((((..((((.....(((((((...........)))))))....))))...)))).)((...(((((............((((((((((((.(..((....))..).))).)))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....))))))))..)))))..)))))))))))))...((((.......(((((..((((.....))))......)))))......))))......(((((.(((....)))))))).................((((.((((((....)))))).))))......))))))))...))))))))))..........(((((((((.(((.....))).))))))))) 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Enrichment H; ORGANISM=Enrichment H agccgaagggcaGCUACCGGUUUCUAUAGAUUUAAUGUCUGUAGUUAAACUGAGGAAACUCCACCCAUCGUACAGAACCGUGAUGUCUAAGACAUCUGCUGAGAGGCAGGACUCUGGAGCAGAAACGACACGUCUUCUGGUGGAUGAACAUGAAGAUCCGUUCUGAUUGACACCAGGAGGAACGGUGAAACGGCCAAUCCACGGGAUGCAAGGGUAAACACUGCCAGUGAAUCCUGUAUGAGGCAGAGGUAACUCGCAUAGAUGAAUGCUGCCACCAACAGAAGGUGGGUUAcucucggca .(((((((.........((((((((((((((.....))))))))..))))))....(((.(((((((((........((((((((((...)))))(((((....)))))((...(((.............((((((((((((............((.....)).......))))))))))..)).........))).)))))))))))...((((.....(((((.....(.......)..))))).....))))............................)))))))).)).))))). .(((((.(((((((....(((((((((((((.....))))))))..)))))(((....(((...((.((((((((.......(((((...)))))(((((....)))))..(.((((..(((.....((.(....(((.((((((...(........(((((((..(((....)))..))))))).......)...)))))).))).....).)).....))))))).)....))))))))))..)))....)))............))))(((((.......)))))....)))))))). .(((((.(((.((.((((.((((((((((((.....))))))))..)))).(((....)))....((((...(((((.((((.(((........((((((....))))))..((((...)))).))).))))..)))))...))))...........(((((((..(((....)))..))))))).......(((.....(((((((.((..((.........))..)).)))))))....)))...)))).)).(((........)))..(((((.......)))))....)))))))). .(((((.(((........(((((((((((((.....))))))))..)))))(((....))).(((((((.........(((..(((...(((..((((((....))))))..)))...)))...))).....(((..((((((..............(((((((..(((....)))..))))))).....((((..(((.(((((((.((..((((.....))))..)).))))))).....((.(((....)))))...)))....))))))))))..))).)))))))..)))))))). .(((((.(((.......((((((((((((((.....))))))))..)))))).(((...))).)))..........((((((.(((((.)))))((((((.((((......))))..)))))).....)))((((((((((((((((((..........))))..)))..))))))))))..))))......(((..((.((((((((((..((((.....))))..))))))))))..))))).((.(((((..((((......))))..(((((.......))))))))))))))))). .(((((.(((..(((.((((...((((((((.....)))))))).......(((....)))....((((((........))))))..........(((((....)))))....))))))).......((.((((((((((((...((((..........)))).......)))))))))..)))))......(((.....(((((((.((..((.........))..)).)))))))....)))...........((((......))))..(((((.......)))))....)))))))). .(((((.(((.((.((((.((((((((((((.....))))))))..)))).(((....)))....((((((.......(((..(((...(((...(((((....)))))...)))...)))...)))......(((((((((..(((.((.(((......))))).))).)))))))))..)))))).....(((.....(((((((.((..((.........))..)).)))))))....)))...)))).)).((((......))))..(((((.......)))))....)))))))). .(((((.(((((.....((((((((((((((.....)))))))).......(((....))).............))))))...)))))......((((((.....((((((.((....((((........(((.((((.((((((............(((((((..(((....)))..)))))))...........)))))))))).))..)........))))....)).))))))....))))))((((((..((((......))))..(((((.......))))))))))).))))). .................((((((((((((((.....))))))))..)))))).(((...))).((((((.........((((.((((...))))((((((.((((......))))..)))))).....)))).......((................(((((((..(((....)))..))))))).......(((.....(((((((.((..((((.....))))..)).)))))))....))).(((....)))((((......))))....))........))))))............ .(((((............((((((((((((.......)))))))..))))).......................(.........(.......)..((((...(((......)))....))))..............)..((((((............(((((((..(((....)))..)))))))...........)))))).(((......(((.......)))......))).....................................(((((.......))))).......))))). .(((((............(((((((((((((.....))))))))..)))))................................(((.....)))...((...................))...................((((((............(((((((..(((....)))..)))))))...........)))))).....................................................................(((((.......))))).......))))). > SSTRAND_ID=ASE_00128; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=volunteer ESH210B; ORGANISM=volunteer ESH210B gaggaaaguccgggcUCUACAGAGCAAAGUGGUGGAUAACUUCCACCCGGGGCGACCCGCGGGAAUAGUGCAACAGAGAGUAAACCGCCAAAAGAAAUUUUGGUAAGGAGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCAUUGCAAGUGAUUGCAGUGGCUAUGCAAACCCCACUUUUGAGCAAGAUCAAGAAGUUGCAAGCAAUUGCAAUGGAGUGAAUGUUUGAGAACUGCUCGUUCGAGUUCACAGGUAGAUCGCAUGACAUAUGUAGCAAUGCAUAUGCAAGAUGGAUGAUUGUCCCUCAGCAAUGAGGacagaacccggcuua .....(((.((((((((.........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((....(((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))..)))...((((.....(((((((....)))))))...((((((......((((.....))))..)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((....)))))......)))))))). .....(((.((((((((....(((((....((((((.....))))))((((....)))).(((.....((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))...)))..(((((((((...(((....(((((((....)))))))....))).)))))))))..)))))....)))...........(((.(((..((((((((....))))))))....))))))...(((((.(((....))))))))...)))))))). .....(((.(((((.(((.....(((((((((.((.....((((.(.((((....)))).)))))...((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))..)))))))))...))..((((.....(((((((....)))))))...(((((((..((((.....))))..)..)))))).....))))...((.((((((((....))))))))))...............(((((....)))))..))).)))))))). .....(((.(((((.((((....(((((((((.((.....((((.(.((((....)))).)))))...((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))..)))))))))...))..((((.....(((((((....)))))))...((((((...((((.....)))).....)))))).....))))...((.((((((((....))))))))))...))))...((((((.(((....)))))))))..)))))))). .....(((.(((((((((..))))(.....((((((.....))))))((((....))))..........)..............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....)))))))((...........))..((((((......)))))).(((((((....))))))))..((((((..((..((((.....))))))))))))......(((.((((.((((((((....)))))))))...))))))..(((((.((((....)))))))))..)))))))). .....(((.(((((.(((((..........((((((.....)))))).(((....)))..(((.....((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))...)))..((((((......)))))).(((((((....)))))))...(((((((..((((.....))))..)..))))))..))))).....((.((((((((....))))))))))...........(((((.(((....))))))))...)))))))). .....(((.(((((.(((.....(((((((((.((.....((((.(.((((....)))).)))))...((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))..)))))))))...))..((((.....(((((((....)))))))...(((((((..((((.....))))..)..)))))).....))))...((.((((((((....))))))))))...............(((((....)))))..))).)))))))). .....(((.((((((((....(((((....((((((.....))))))((((....)))).(((.....((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).))))...)))..(((((((((...(((....(((((((....)))))))....))).)))))))))..)))))....)))....................((((((((....))))))))............((((((.(((....)))))))))..)))))))). ...............(((((..........((((((.....))))))((((....)))).(((.....((((............(((((((((....)))))))..))........((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).)..))))...)))..((((((......)))))).(((((((....)))))))...((((((...((((.....)))).....))))))..))))).....((.((((((((....))))))))))...............(((((....)))))............... ..........(((((((....)))).....((((((.....))))))((((....)))).........................(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....))))))))...................................(((((((....)))))))...................................................(((((((......)))))))..............((.(((((....))))))).....)))..... .............((((....)))).....((((((.....))))))((((....)))).........................(((((((((....)))))))..))........((((((.......))))))..((((((((....))))))))...................................(((((((....)))))))...................................................((((((((....)))))))).............(((.(((((....))))))))............ > SSTRAND_ID=ASE_00132; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=volunteer ESH30-3; ORGANISM=volunteer ESH30-3 gaggaaaguccgggcAACACAGAGCAUCCUACUUCUUAACGGGAAGCUAUCUGCGAAGGUAGAGUAAUGUAGAAGAAAACAACCGCCUUUUUCCUCUUUUGGAACAAGGUAAGGGUGAGAAGGUGGAGUAAGAGCCCACCAGUUGCGUGGUGACACGGUUAAGCUGUACGUCUUAGGAGUUGUAAGGUCGAUGUAUACCGGCAUUAUGAGGGCUGCUCGCCCCACGUCGGAGGGUAGACCGCUAAAGUAAUGUGGCAACACAUUACUCAGAUAAAUGACAAACACCUUAAUUUAUUAUUAAGGacagaacccggcuua .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))((((((....))))))((..(((((...........(((((((.((((......)))).)))))..)).......(((((.........)))))(((((((((....))))..))).)).))))))))))))))))...((((........(((((.......((((.....))))...)))))......))))......((((((((....))))))))..................(((((((.....)))))))......)))))))). .....(((.(((((..............(.((((((..(((...((((.(((((....)))))...................(((((((.((((......)))).)))))..)).......(((((.((....))))))).....((((....))))....))))...)))...)))))).)...((((........(((((....((.((((.....)))))).)))))......)))).....(((((((((....))))))))).................(((((((.....)))))))......)))))))). .....(((.(((((................((((((..(((...((((.(((((....)))))...................(((((((.((((......)))).)))))..)).......(((((.(......)))))).....((((....))))....))))...)))...)))))).....((((....(...(((((....((.((((.....)))))).)))))...)..)))).....(((((((((....))))))))).................((((((.......))))))......)))))))). .....(((.(((((((((......((((((.(((((..(((..(..((((((....))))))..)..)))))))).........(((((.((((......)))).))))).))))))....(((((.((....))))))).))))((((....))))......((((..(((.............((((.((.(...(((((....((.((((.....)))))).))))).).)).)))).....(((((((((....))))))))).........))).....(((((((.....)))))))))))..)))))))). .....(((.(((((.................(((((.....)))))((((((....))))))....................(((((((((((((((((((...)))...)))))))))))))))).(......).(((((......)))))..((((.....)))).....(((.......)))((((........(((((....((.((((.....)))))).)))))......)))).....(((((((((....))))))))).................(((((((.....)))))))......)))))))). .....(((.(((((........(((.((((..........)))).))).(((((....)))))..................((((((((.((((......)))).)))))...))).....(((((.(......)))))).....((((....)))).(((((........))))).........((((........(((((....((.((((.....)))))).)))))......)))).....(((((((((....))))))))).................(((((((.....)))))))......)))))))). .....(((.(((((..............(.((((((..(((...((((.(((((....)))))................((.(((((((.((((......)))).)))))..)).))....(((((.(......)))))).....((((....))))....))))...)))...)))))).)...((((....(...(((((....((.((((.....)))))).)))))...)..)))).((..(((((((((....))))))))).))..............(((((((.....)))))))......)))))))). .....(((.(((((.......(((((.(((((((((..(((...((((.(((((....)))))..................((((((((.((((......)))).)))))...))).....(((((.........))))).....((((....))))....))))...)))...))))))(((((.((((........)))).))))).))).)))))((((.........))))..........(((((((((....))))))))).................(((((((.....)))))))......)))))))). ........................((((((.(((((.....)))))((((((....))))))......((........))....(((((.((((......)))).))))).))))))....(((((.((....))))))).....((((....))))...........((((.................))))....(((((....((.((((.....)))))).))))).((.....)).....(((((((((....))))))))).................(((((((.....)))))))............... .........(((((................................((((((....))))))....................(((((((.((((......)))).)))))..)).......(((((.........))))).....((((....)))).............................(......................(((.......)))................)......(((((((((....))))))))).................((((((.......))))))......))))).... ..............................................((((((....))))))....................(((((((((..........................)))))))))...................((((....))))........................................................................................(((((((((....))))))))).................(((((((.....)))))))............... > SSTRAND_ID=ASE_00135; 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Herpetosiphon aurantiacus, strain ATCC 23779; ORGANISM=Herpetosiphon aurantiacus gaggaaaguccgggcUCCAUAGGGCGAAGUGCCAGGUAAUGCCUGGGAGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAGAACAGACUGUCGGUUUCGAGCCGGUGAGGGUGAAACGGCGGGGUAAGAGCCCACCGCGUCAUCGGUGACGGUGACGGCAUGGCAAACCCCACCUGGAGCAGGGCCAAGAAGACCGUGAGGUCGCGGACGCGUUUGAGGGUUGCUCGCUUGAGUGUUCGGGUAGGCUGCGCAGCCGAAAGGCUGGAGGACACCAGCAAUGGUGUUCACAGAUGGAUGAUCACCGGCCCGGCGGGGCUacagaauccggcuua .....(((.(((((((((........(.((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((...)))))))..)).......((.(((.......))).))(((((((((....)))))))).)..)))..))))))).)))))...((((.....((((....))))..((((((......((((.....))))..)))))).....))))...(((((....)))))..((((((((....)))))))).................(((((....)))))......)))))))). .....(((.(((((((((...((((......(((((.....))))).((((....)))).(((.....(((((((........)))).)))......))).....(((((...((.(((((....(((...(.((((((((....)))))))))...)))..))))).))....((..((((.....((((....)))).(((((((..(((((.(.....).))))))))))))....)))))).(((((....)))))..((((((((....))))))))............))))).))))...)))))........))))))). .....(((.(((((((((...((((......(((((.....))))).((((....)))).(((...(.(((((((........)))).)))..)...))).....(((((...((.(((((....(((...(.((((((((....)))))))))...)))..))))).))....(((..(((.....((((....)))).(((((((..(((((.(.....).))))))))))))....)))))).(((((....)))))..((((((((....))))))))............))))).))))...)))))........))))))). .....(((.((((.(((.....((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))...)))......((((.(((..(..(((((.(..(((((...((.(((((....(((...(.((((((((....)))))))))...)))..))))).)).(.(((...(((.....((((....)))).(((((((..(..((((....)).))..)))))))))))..))).).(((((....)))))..((((((((....))))))))............)))))..)))))))..)))))))...))))))). ........(((((((((......(((.....((((((...))))))....))))))))..))))....(((((((........)))).))).....((((((((.........((.(((((....(((.(...((((((((....))))))))...))))..))))).))((...))...((.....((((....)))).(((((((..(((((.....)))....)))))))))....))(((())))((....))(((..((((((((....)))))))).))).(.....)))))))((((....))))...........))... .....(((.(((((((((...((((......(((((.....))))).((((....)))).(((...(.(((((((........)))).)))..)...))).....(((((...((.(((((....(((...(.((((((((....)))))))))...)))..))))).))....((..((((.....((((....)))).(((((((..(((((((....)).))))))))))))....)))))).(((((....)))))..((((((((....))))))))............))))).))))...)))))........))))))). .....(((.(((((((((...((((......(((((.....))))).((((....)))).(((...(.(((((((........)))).)))..)...))).....(((((...((.(((((....(((...(.((((((((....)))))))))...)))..))))).))....((..((((.....((((....)))).(((((((..(((((.(.....).))))))))))))....)))))).(((((....)))))..((((((((....))))))))............))))).))))...)))))........))))))). .....(((.(((((((((...((((...((((((((.....)))))...((((.(((((((..........((((........)))).(((((....((((((.((((....(((.(((.......))).)))((((((((....)))))))).........)))))))).))....))))).....((((....)))).(((((((......((((.....))))..))))))).)))))))))))((((....))))...((((((((....)))))))).............)))..))))...)))))........))))))). ...............(((((...........((((((...)))))).((((....))))...(.....(((((((........)))).))).)....((((((.((((....(((.(((.......))).)))((((((((....))))))))((...))..)))))))).)).((.(.((......((((....)))).(((((((....(((.....)))......))))))).))...).)).(((((....)))))..((((((((....))))))))....)))))........(((((....)))))............... ...............................(((((.....)))))..(((....)))......................................(((((...............((((......((.....((((((((....))))))))....))....))))....................((((....))))...............................................(((((....)))))..((((((((....))))))))...............))))).......................... ...............................((((((...))))))..(((....)))......................................((((((((............(((((............((((((((....)))))))).........)))))....................((((....))))...............................................(((((....)))))..((((((((....))))))))............)))))))).......................... > SSTRAND_ID=ASE_00144; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Heliobacterium chlorum, strain ATCC 35204; ORGANISM=Heliobacterium chlorum gaggaaaguccgggcUCGCACAUCCUGCGAUGGAUGUAGUGUUCGUGCCCGUUCGUAAUGGCGGGGCAGUCAGCUUUUUAGCAGAUUGACGGCGGGGAAAGCAUCCUACAGCCAACUUGGCCAUGGUGCAAGUACCCUGAAAGUGGAUAGAGACGAGUCGUCGGGGAAACUCGACGAGUGGAACGACUAAACCCCACGAGCGAGCAACUCAGUGUGUAGAGGCACCUGGCUGAGAGAAAUGAAUCAAUGCCGGGACGAUCGACAUAUGAUCGUAGAAAAAUGAUUGCCCCUUCUGUGGGAGGCUGGGAAGCCUAGAACCACAUUGGAacagaauccggcuua .....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((......))))))((((((.(((....))).))))).)((.(((....((((......((((...))))....)))).....))).....((((...........((((((((....)))))))).........))..))))))))))))))...(((........)))...((((((..................))))))(((((((.....)))))))................((..(((((..((((....)))).....)))))..)).......)))))))). .....(((.(((((.....((((((......))))))..(((((..(((..........)))((((((((((..((((((.........(((((((.......))).........((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...)))))))))))))..............))))...(((((.......)))))))))))..))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...)))))...)))))))). .....(((.((((..((..((((((......))))))..(((((..(((..........)))((((((((((........(((..((((.(((((((......))))...)))..((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...))))))))))))).........)))))))....((((((.......)))))).......))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...)))))))..))))))). .....(((.((((..((..((((((......))))))..(((((....((((.....)))).((((((((((..(((((.(((..((((.(((((((......))))...)))..((..((((.(((((...((((((((..((((.(((...(.(.((((((((....)))))))).).).....)))....))))..(....)...)))).).)))...)))))))))..)).........)))))))....(((((((.....))))))).))))).))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...)))))))..))))))). ......((.((((((((((((((((......)))))).)....))))))))........((.((((((((((..(((((.(((..((((.(((.((((.....))))...)))..((((((((.(((((..((((.((((..((((.(((...((..((((((((....))))))))......)).)))....))))..(.......))))).))))....))))))))))))).........)))))))....(((((((.....))))))))))))..)))))))))).))(((((.(((((....)))))....))))).((((......))))))).. .....(((.((((..((..((((((......))))))...((((..(((..........)))((((((((((.....((.(((((((...(((((((......))))...)))..((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...))))))))))))).......))))..))).)).((((((.......)))))).......))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...)))).))..))))))). .....(((.((((..((..((((((......))))))........(((.(((((((...((.((...((((.(((....)))..(((.((..(((((...(((.((....((((...))))...))))).....)))))...)).))).........((((((((....)))))))).......))))...))))))))))).)))..((((((((...((((.((((((...((........))...))))))((((((.......))))))............(((((.......)).)))......)))).....))))))))....))..))))))). .....((((((((((.((.((((((......))))))......)).)))))........((.(((((((((((((((((.((.........)).).)))))).............((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...)))))))))))))....................((((((.......)))))).......)))))))))).))(((((..((((....)))).....)))))..............))))). ................(((((((((......)))))).))).......((((.....)))).(((((((((.(((((...(...(((.((..(((((...(((.((....((((...))))...))))).....)))))...)).)...........((((((((....))))))))((((............))))..............)).)...))))).((((((...((........))...))))))((((((.......))))))........)))))))))...(((((.(((((....)))))....))))).................... ..........(((((.((..(((((......))))).......)).)))))...........((((((((((..................(((..((.......))....)))..((((((((.(((((............................((((((((....))))))))............................................)))))))))))))....................((((((.......)))))).......))))))))))...(((((.(((((....)))))....))))).................... ..........(((((.((..(((((......))))).......)).)))))...........((((((((((..................(((.................)))..((((((((.(((((............................((((((((....))))))))............................................)))))))))))))....................((((((.......)))))).......))))))))))...(((((.(((((....)))))....))))).................... > SSTRAND_ID=ASE_00147; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Heliobacillus mobilis, strain ATCC 43427; ORGANISM=Heliobacillus mobilis gaggaaaguccgggcuCGCACAUCCUGCGAUGGAUGUAGUGUUCGUGCCCGUUCGUAAUGGCGGGGCAGUCAGCUUUUUAGCAGACUGACGGCGGGGAAAGCAUCCUACAGCCAUCUUGGCCAUGGUGCAAAUACCCUGAAAGUGGAUAGAGACGAGUCGUCGGGGAAACUCGACGAGUGGAACGACUAAACCCCACGAGCGAGCAACUCAGUGUGUAGAGGCACCUGGCUGAGAGAAAUGAAUCGACGCUGGGACGAUCGCCAUAUGAUCGUAGAAAAAUGAUUGCCCCUUCUGUGGGAGGCUGGGAAGCCAAGAACCACAUUGGGacagaacccggcuua .....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((......))))))((((((.(((....))).))))).)((.(((....((((......((((...))))....)))).....))).....((((...........((((((((....)))))))).........))..))))))))))))))...(((........)))...((((((..................))))))(((((((.....)))))))................((..(((((..((((....)))).....)))))..)).......)))))))). ..........(((((....((((((......))))))...)))))..(((((........))))).(((((.(((....))).)))))..(((.((((.....))))...))).(((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...)))))))))))))).............((((((((((((.......))))))...........((.(((...(((((..((((....)))).....)))))..))).))...))))))... .....(((.(((((..(((((((((......)))))).))).((...(((............((((((((((....((((((........(((((((......))))...))).(((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...)))))))))))))).............))))))((((((.......)))))).......))))))))))...(((((..((((....)))).....)))))..)))...)).)))))))). .....(((.(((((..(((((((((......)))))).)))...((.(((............((((((((((..(((((..........(((((.(((.....)))..((....(((..((((.(((((...((((((((..((((.(((...(.(.((((((((....)))))))).).).....)))....))))..(....)...)))).).)))...)))))))))..)))....))......)))))..(((((((.....))))))).))))).))))))))))...(((((..((((....)))).....)))))..)))))....)))))))). .....(((.((((((.(((((((((......)))))).))....).))))(((......)))(((((((((.(((....))).)))))..(((.((((.....))))...))).(((((((((.(((((..(((((((((..((((.(((...((..((((((((....))))))))......)).)))....))))..(.......))))))))))....))))))))))))))......((((.........(((((((.....)))))))........)))).))))...(((((..((((....)))).....)))))..(((......)))))))). .....(((.(((((..(((((((((......)))))).)))......((((((......)))))).(((((.((......)).)))))..(((((((......))))...))).(((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...))))))))))))))........((......)).(((((((.....)))))))...........((.(((...(((((..((((....)))).....)))))..))).))...)))))))). .....(((.(((((..(((((((((......)))))).))).((...(((............((((((((((.....(((((........(((((((......))))...))).(((((((((.(((((...((((((((...((............((((((((....))))))))((((............)))).......))..)))).).)))...)))))))))))))).............))))).(((((((.....))))))).......))))))))))...(((((..((((....)))).....)))))..)))...)).)))))))). ..........(((((.(..((((((......)))))).).)))))(((((..((.....))..)))))(((((((.......)).)))))((((((((.....)))).).))).(((((((((.(((((...((((((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).).)))...)))))))))))))).............((((((((((((.......))))))..........(((.(((...(((((..((((....)))).....)))))..))).)))..))))))... ................(((((((((......)))))).)))......((((((......)))))).(((((.(((....))).)))))..(((((((......))))...))).(((((((((.(((((..((((.((((.................((((((((....))))))))((((............))))...........)))).))))....))))))))))))))...................(((((((.....)))))))..............(((...(((((..((((....)))).....)))))..)))............... ..........((((......(((((......)))))...........))))...............(((((.(((....))).)))))...((.................))..(((((((((.(((((.......(.(.....(............((((((((....)))))))).................)..............).).........))))))))))))))...................((((((.......))))))..............(((...(((((..((((....)))).....)))))..)))............... ..........(((((.(...(((((......)))))........).)))))...............(((((.(((....))).)))))..........................(((((((((.(((((.......(((..................((((((((....))))))))................................))).........))))))))))))))...................((((((.......))))))....................(((((..((((....)))).....))))).................... > SSTRAND_ID=ASE_00156; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Halobacterium sp., strain NRC-1; ORGANISM=Halobacterium sp. 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Metallosphaera sedula, strain DSM 5348; ORGANISM=Metallosphaera sedula uaggggagccuaacaggGGGCCACGGGAAACUGGGGAAACUCCAGCCUCUCGCCCAGGGGGAGUCCCGCGAGGGACGGGGUUAGGUGCUCCGACAACUGCACAGAAACGAGACCUGCGGUGGGCCAGAUGAAAAUGAUCAUUUACCCCAUCUGGCGACGGAUGGGAGGGUGUGAGAGACCUAUCGUGGGUUGAAACGGCAGAUCUCCCCUUGAGCAAGUAGGGGAGGAUAGGGCAAAAUGACUCCCCUGAUACGCAGAGCCUAAUCCCCCAAGUACAGAAGCUGgguuauuguuaggcuccccu .(((((((((((((.........(((....)))....(((.((((((((.......((.((((((((....)))))(((((.....)))))((...((((............(((((((((((...............((.....((((((((....))))))))....)).......)))))))))))........)))).))))).)).)))...((.((((((...............))))))....))...........................))))))))...))))))))))))) .(((((((((((((((.......(((((..((((((...))))))..)))))(((((.....(((((....)))))((((((((((.((.((....((((..........(((((((((((((.((........)).((((...(((((((((....)))))))).)...))))....)))))))))))))......))))..(((((((.........)))))))...((((...........))))....)).)).)))))))))).............)))))...))))))))))))))) .((((((((((((((..((((...((((..(((((.....)))))..)))))))).(((((((((((....)))))...(((..((((..........))))...)))..(((((((((((((.(..((....))..((((...(((((((((....)))))))).)...))))..).))))))))))))).....(((...((((((((.........))))))))..((((...........))))..........)))...)))))).....((.....))......)))))))))))))) .(((((((((((((((.((((..(((((..(((((....).))))..)))))..((((((..(((((....)))))..(((((..(((.((.....((((..........((((..(((((((.(..((....))..((((...(((((((((....)))))))).)...))))..).)))))))..))))......)))).((((((((.........))))))))...)))))...))))))))))).........)))).....((((.((......))))))...))))))))))))))) .(((((((((((((((.(((...(((((..((((((...))))))..))))))))((((((.(((((....)))))...(((((((.(((((....((((..........(((((((((((((((((((((......))))))((((((((((....))))))))...))......)))))))))))))))......)))).((((((((.........)))))))).(((((...........)))))...))))).))))))))))))..((......)))......))))))))))))))) ..((((((((((((((....((.(((....)))))..(((.(((((.(((......(((((((((((....)))))...(((..((((..........))))...)))..(((((((((((((.(..((....))..((((...(((((((((....)))))))).)...))))..).))))))))))))).....(((....(((((((.........)))))))...((((...........))))..........)))...))))))......))).)))))))).)))))))))))))). .(((((((((((((((....((.(((....)))))..(((.(((((.(((.((.(((((((((.(((....))).((((((.....))))))....((((.(.(...((..((((((((((((.(..((....))..((((...(((((((((....)))))))).)...))))..).))))))))))))))...))))))..))))))))).))......(((.((((.((((....((.(...........)))..)))).)))))))......))).)))))))).))))))))))))))) .((((((((((((((((((((...((....))(((....)))..)))))).((((((.....(((((....)))))((((((((((.((.((....((((..........(((((((((((((..((((((......))))))..((((((((....)))))))).............)))))))))))))......)))).((((((((.........))))))))..((((...........))))....)).)).)))))))))).............))))))...)))))))))))))) .................((((...((((..(((((.....)))))..)))))))).(((((((((((....)))))(((((((..(((((......((((..........(((((((((((((..((((((......))))))..((((((((....)))))))).............)))))))))))))......)))).((((((((.........))))))))...)))))...))))))).(((.....))).......))))))......((...))..................... .((((((((((((((..........((...((((.......))))...))............(((((....)))))((((((((((..........((((..........(((((((((((((......................((((((((....)))))))).............)))))))))))))......))))..(((((((.........)))))))................................))))))))))......................)))))))))))))) .(((((((((((((((........((((..((((((...))))))..))))...........(((((....))))).(((((((((..........((((..........(((((((((((((......................((((((((....)))))))).............)))))))))))))......))))..(((((((.........)))))))................................)))))))))......................))))))))))))))) > SSTRAND_ID=ASE_00217; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Nitrosomonas europaea; ORGANISM=Nitrosomonas europaea GAAGCCGGUCAGACAGUCGCUGCCUGGUGACAGGGAGAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGAGCAGGAUGCCGGUUAACGGCCGGCCGCCGUGAGGUGAGGAACAGGGCCACAGAGACGAGCGUAUUAAGUUACGGUGAAACGCGGUAACCUCCAUCCGGAGCAAGAUCAAAUAGGCAGAUGAUGACGCUGCUCGCUGAGUCUGCGGGUAGAUCGCUCGAGCACACGGGUAACUGUAUGCCUAGAGGAAUGACUGUCCACGACAGAACCCGGCUUAUCGGCCGGCUUC (((((((((((........((.(((......))).))....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((......)))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((......((.....))...)))))).....))))......(((.((((....)))).)))...........................)))))))).).)))))))))) 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Neisseria gonnorhoeae, strain FA 1090; ORGANISM=Neisseria gonnorhoeae CGGGACGGGCAGACAGUCGCCGCGUAUCGCGUAAGGCAUACGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGUAGAAUGCCGGUUAACGGCCGGGCGCGGUAACGCGACGGAAAGUGGAACAGAAAGCAAAACCGCCGAUGGCUGCUUUGGCAGCACAGGCAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGGGCGCACCGCGCAUUUGGUAACAAUAUGCGGCAGGCCAAACCCCAUUCGGAGCAAGACCAAACAGAACGCAAUGACGCUGCCCGCCGAGCGUUCGGGUAGGUUGCUUGAGCAUACCGGCAACGGUAUGCCUAGAGGAAUGACUGUCCGAGACAGAACCCGGCUUACCGCCUGUCCGGUGUG (.((((((((.........((.(((((..(....)..))))).))....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...((((..............(((((..(((((((....))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)...))..)))))))))))))...((((.....((((((......((.....))...)))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))...)))))))).).... ..((((((((.........((.(((((.((.....))))))).)).((.(((.((((((((((..((((.(..(((((....((..(((..((((....)))).)))...))..................(((....(((((....)))))...)))..(((((....((((((.......))))))...)))))............)))))..)...))))....))))))...............(((((....(((((((.........))))))))))))....((((((((....))))))))............(((((...)))))...))))))).))))))))))...... ..((((((((......(((.((((((((((((..(((...((((........))))....(((((........)).)))......)))..))))))).))))).))).............((((......(((....(((((....)))))...)))..((((.....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............(((((.(((((..(((.....((((((...(.((.....)))...)))))).....))))))))..((((((((....))))))))......))))).((((.....)))).)))).))))...))))))))...... 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Neisseria meningitidis, strain MC58; ORGANISM=Neisseria meningitidis CGGGACGGGCAGACAGUCGCCGCGUAUCGCGUAAGGCAUACGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGUAGAAUGCCGGUUAACGGCCGGGCGCGGUAACGCGACGGAAAGUGGAACAGAAAGCAAAACCGCCGAUGGCUGCUUUGGCAGCACAGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGGGCGCACCGCGCAUUUGGUAACAAUAUGCGGCAGGCCAAACCCCAUUCGGAGCAAGACCAAACAGAACGCAAUGACGCUGCCCGCCGAGCGUUCGGGUAGGUUGCUUGAGCAUACCGGUAACGGUAUGCCUAGAGGAAUGACUGUCCGAGACAGAACCCGGCUUACCGCCUGUCCGGUGUG (.((((((((.........((.(((((..(....)..))))).))....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...((((..............(((((..(((((((....))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)...))..)))))))))))))...((((.....((((((......((.....))...)))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))...)))))))).).... ..((((((((.........((.(((((.((.....))))))).)).((.(((.((((((((((..((((.(..(((((....((..(((..((((....)))).)))...))..................(((....(((((....)))))...)))..(((((....((((((.......))))))...)))))............)))))..)...))))....))))))...............(((((....(((((((.........))))))))))))....((((((((....))))))))............(((((...)))))...))))))).))))))))))...... ..((((((((.........((.(((((.((.....)))))))))..((.(((.((((((((((..((((.....(((.(((.((..(((..((((....)))).)))...))..)))...........(((((....(((((....)))))...)))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...)))...))))....))))))...............(((...((.(((((((.........))))))))))))....((((((((....))))))))............((((.....))))...))))))).))))))))))...... ..((.(((((((.(.((((..((((.((..((..(((...((((........)))).((((((..((((.....(((.(((.((..(((..((((....)))).)))...))..))).....((...((((((....(((((....)))))...)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))).)))...))))....))))))..).))..)).))))))..)))))))))))))).(((...(((((..(((.(((..((((((((....))))))))...))).)))..(((((...))))).))))))))(((((......))))).. ..((((((((....((((.((((((((.((.....)))))))))).(((...)))((((((((..((((....(((((((.....))))).((((....)))).(((.....................)))((..(((((((....))))).))))............((((((.......)))))).((((((((....))).))))).))......))))....))))))(..(((...(.((((((.....((.....))....)))))).)...)))).(((..((((((((....))))))))...)))......(((((...)))))...))))))....))))))))...... ..((((((((........((((((.....)))..)))...((((..(((...)))..((((((..((((......(((((.....))))).((((....)))).......((..........))...((((((....(((((....)))))...)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))....))))))...............(((...((.(((((((.........))))))))))))....((((((((....))))))))............(((((...)))))..)))).......))))))))...... ..((((((((.........((.(((((.((.....))))))).)).((.(((.((((((((((..((((......(((((.....)))))..(((((...((....(.........).....))...)))))...(((((((....))))).))......(((.....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....)))..))))....))))))....((.........(((...((.(((((((.........))))))))))))..(.((((((((....)))))))))....)).....(((((...)))))...))))))).))))))))))...... ..((((((((.........((.(((((..(....)..))))).)).((.(((.((((((((((.((((.......(((((.....))))).((((....))))........................((((((....(((((....)))))...)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...........))).).))))))...............(((((....(((((((.........))))))))))))....((((((((....))))))))............(((((...)))))...))))))).))))))))))...... ..((((((((.........((.(((((.((.....))))))).)).((.(((.((((((((((..((((......(((((.....))))).((((....)))).........................(((((....(((((....)))))...)))...))......((((((.......)))))).((((((((....))).))))).........))))....))))))...........(..(((..................)))..)......(((.(((..((((((((....))))))))...))).)))..(((((...)))))...))))))).))))))))))...... ..((((((((.....(((....((................))...............((((((..............((.......))...((((....)))).........................(((((....(((((....)))))...)))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))).))))).................))))))...(((.....((((((..................)))))).....))).......((((((((....))))))))..............................))).....))))))))...... ..((((((((...............................................((((((............................((((....))))...........................(((....(((((....)))))...)))...........((((((.......)))))).((((((((....))).))))).................))))))....((.....((((((..................)))))).....))........((((((((....))))))))......................................))))))))...... > SSTRAND_ID=ASE_00228; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Nocardoides plantarum, strain NCIMB 12834; ORGANISM=Nocardoides plantarum CACAGAGCAGGGCGGUGGGUAACACCCACCCGGGGCAACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCUCCCGAAUCCAGCGCCACCGGACGACGGAGGUAAGGGUGAAACGGUGGAGCAAGAGACCACCAGCAUGCCGGGCGACCGGCGUGGCUAGGCAAACCCCGCCCGGAGCAAGAUCAGACAGCACACGCAGGUUCCGACCGGAAGGGCUGCUCGCCCGAGUGUGCGGGUAGAUCGCUGGAGGCCGUCGGCAACGGCGGUCGUAGAUGGAUGGUCGCCCCUCCUCCCGCAAGGGCGGAGG (........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((.............................)))..)).......(((((.........)))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((...(((....)))....((((.....))))..)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((.(((....))).))))) ....((((((...(((((((...))))))).(((....)))(((((....((((............((((((((....(((.........)))....))))))..)).......(((((.........)))))..((((((((....))))))))....))))...))))).((((((..(...............)..)))))).((....)).))))))(((((......))))).((((((((..((((((((....)))))))).....))).)))))...(((((.(((....))).))))) .........(((((((((((...))))))).(((....)))(((((....((((............((((((((....(((.........)))....))))))..)).......(((((.........)))))..((((((((....))))))))....))))...)))))....(((..((((.....((((((...(((....)))....((((.....))))..)))))).....)))))))...((((((((....))))))))..............))))((((.(((....))).)))). .........((((.((((....(((...((((((....)))).))....)))))))........(((((((((.....(((((((((.(((.....))).)))..(((((....(((((.........)))))..((((((((....)))))))).............))))).......((((..((.((((((.....((((....))))((((.....))))..))))))..)).))))))))))((((((((....))))))))...)).)).)))))))))((((.(((....))).)))). ..........((((((((((...)))))))((((....))))(((((..(((...............))).)))))..(((((((((.(((.....))).)))..(........(((((.........)))))((((((((((....)))))))).)).(((.......)))).......((((...(.((((((.(...(((((..)))))((((.....))))).)))))).)...))))))))))((((((((....))))))))(........)....)))(((((((((....))))))))) .........((((((((((.....)))))).(((....)))(((((....((((...........(((((((((....(((.........)))....))))))...))).....(((((.........)))))..((((((((....))))))))....))))...)))))....(((..((((..((.((((((...(((....)))....((((.....))))..))))))..)).)))))))...((((((((....))))))))..............))))((((.(((....))).)))). ......((.((((((.((((...)))).((((((....)))).)).....((((............((((((((....(((.........)))....))))))..)).......(((((.........)))))..((((((((....))))))))....))))....))))))..(((..((((.(...((((((...(((....)))....((((.....))))..))))))...).)))))))...((((((((....))))))))..............)).(((((.(((....))).))))) .........(((((((((((...))))))).(((....)))(((((....((((..((.......(((((((((....(((.........)))....))))))...))).....(((((.........)))))..((((((((....)))))))).)).))))...)))))((..(((..((((.....((((((...(((.....((....)).......)))...)))))).....))))))))).((((((((....))))))))..............))))((((.(((....))).)))). .........(((((((((((...)))))))((((....))))(((((..(((...............))).)))))......((.((((((....((..........))....)))))).))....((((((((.((((((((....)))))))).(..(((.......)))....)...((((..((.((((((......(((....))).((((.....))))..))))))..)).)))).(....((((((((....))))))))...).))).)))))))))((((.(((....))).)))). .............((((((.....))))))((((....))))..........................(((.((......(.........)......)).)))...........(((((.........)))))..((((((((....)))))))).....................((..((((.....((((((.................((((.....))))..)))))).....))))))....((((((((....)))))))).................(((((.(((....))).))))) .............((((((.....))))))((((....))))........................................................................(((((.........)))))..((((((((....)))))))).....................((..((((.....((((((................................)))))).....))))))....((((((((....)))))))).................(((((.(((....))).))))) > SSTRAND_ID=ASE_00252; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Prochlorothrix hollandica, strain PCC 9006; ORGANISM=Prochlorothrix hollandica GCGGAGAAGUAGGCGAGGCGGCUGCGGAUUCGGCGGCGAUGCUGACUGAAUUCGAGGAAAGUCCGGGCUUCCGAAAGACCACACUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGCGUGAGCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAAAUACCGCCCUGGCCCUUCGGGGUUUCGGUGUGGUGGGUCAGGCUCCUGGAGCCGAACCGCUGUCCCUGGAAUCUGUGAGUGAAGGGCUGGGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUAUCGAGAGGUGCUGGCUCGGUAAACCCCGGUGGGACGCAAGGUCGGAGGAACUAGGGUUGGUCUUUUUCCCGUUCCGUACAGGGUCAAUCUUCGGGUUGGCGCUGCGGUGUACCGCUAGAGGUGUCUGGUAACAGGCAUUCGAGAUAGAUAGCUGCCCCUAAGUCUGGAGACAGAUGAGGGAACAGAACCCGGCUUAUGUCCAACUUCUUCGUUUUC ....((((((.((.((........(((((((((((((...)))).)))))))))....(((.((((((.(((.........(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((.(((((((.((.(((((...))))))).)))))).).))))))))).....))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))).)...(((....(((((..(((...........))))))))...(((.(((((((....))))))).)))......)))......((((((((....)))))))).................(((..(((((....)))))..))).......)))))))).).))).))))))........ 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Pirellula staleyi, strain DSM 6068; ORGANISM=Pirellula staleyi gaggaaaguccgggcUCCACAGGACAGGGUGGUCGAUAACGUCGACCGGUCGUGAGAUCAGGGACAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCGCUGCGGGCAUGAGCCCCCGUCAAGGUUUGAUUGUCUGCAUGCGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUCGAGGCGACUCGGCUGGCUAGGUAAACCCCGCCCGGAGCAAGACCAAGCAGAGAGCAUGUUGUCGGUGUCACAGCCGACAGCCGGAAUCGGUUCGGUUUCGUAUGACUCUCGGGUAGGUUGCCGGAGCUAGCGAGCAAUUGCUAGCCUAGAGAAAUGGUCGUCAGACGUUUUCGAUCCGUCGAAGAGCCCAacagaacccggcuua .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((...(((((((((......)))))))))(((((((.....))))))).....))))).....))))......((((((((....))))))))..................(...(((((((....)))))))...).......)))))))). ........(((((((...............((((((.....))))))((((....)))).(((....((((............(((((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))...))))))))))....((((.....(((((((((((((((((......)))))))))((((((((...)))))))).))).))))).....))))(((((.((((((((....)))))))).........(((.(....((((.........)))).....).))).......)))))... .....(((.(((((.((....((.(..(((((((((.((((((...((..(((....((..((......))............(((((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))....(((((..((.((((((((((.......((.....))..(((((((((......)))))))))((((((((...))))))))..)).))).))))).)))))))...((((((((....))))))))...))...)))..))...)))))).)))).))))).....).))....)).)))))))). .....(((.(((((.(((...)))..((((((((((.(((((((((.(..(((....((.(((....((((...........((((((((((((((((.(((((........)))))...)))))))).)))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))...)))..(((((((...(((.....(((((((((((((((((......)))))))))((((((((...)))))))).))).))))).)))..))).)))).((((((((....))))))))...))...)))..)))).)))))).)))))).........)))).......)))))))). .....(((.((((((((.....(((.(...(((((((((((((((((((((.........((.......))..........))))(((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))...........((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).((((.(((..((((................(((((((((((((((((......)))))))))((((((((...)))))))).))).))))))))).)))))))...((((((((....))))))))..........)...))).)))))))))))))))))...))))))..........))))). .....(((.(((((.(((...)))..((((((((((.(((((((((.((((....))))..((......))...........((((((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))....(((((..((.((((((((((.......((.....))..(((((((((......)))))))))((((((((...))))))))..)).))).))))).)))))))...((((((((....))))))))..............))).)))))).)))))).........)))).......)))))))). .....(((.(((((.((....((.(..(..((((((.((((((...((..(((....((..((......))............(((((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))....(((((..((.((((((((((....((.((.....)).)).(((((((......)))))))..((((((((...))))))))..)).))).))))).))))))).(.((((((((....)))))))))..))...)))..))...)))))).)))).))..).....).))....)).)))))))). ........(((((((...............((((((.....))))))((((....)))).(((....((((..((.......((((((((((((((((((((((........))))))..)))))))).)))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).)).))))...))))))))))....((((.....(((((...(((((((((......)))))))))((((((((...)))))))).....))))).....))))(((((.((((((((....))))))))..........(((.....((((.........)))).....))).........)))))... ...............(((...)))..(((((((((((...))))))).(((....((((..((......))...........((((((((((((((((.(((((........)))))...)))))))).)))))...))).....((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).)..(((((.((..((((((((((.......((.....))..(((((((((......)))))))))((((((((...))))))))..)).))).))))).)))))))...((((((((....))))))))..........))))....))).(((((((....)))))))))))................ ...........((((((..........(...(((((.(((((((((.((((.........((.......))..........))))(((((((((((((....((........))......)))))))).)))))...(.......((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).).........)....(((.......(((.....((((((..(((((((((......)))))))))(((((((.....)))))))...).))))).....)))...))).((((((((....))))))))..............))).)))))).)))))).......))))))................ ...........((((((......((......(((((.(((((((((.((((..............................))))(((((((((((((..((((........))))....)))))))).)))))...........((((((.......))))))..((((((((....))))))))....(((.......((((................(((((...(((((((((......)))))))))(((((((.....))))))).....))))))))).....)))...((((((((....))))))))..............))).)))))).)))))..))....))))))................ > SSTRAND_ID=ASE_00276; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Prochlorococcus sp., strain TAK9803-2; ORGANISM=Prochlorococcus sp. cugaggaaaguccgggcUCCCAUAUGGUCAGGCUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGGGCAACCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACAUACCGCCUAAUACUUUAUGUAUGGCAAGGGUGCAAGGGUGUGGUAAGAGCGCACCAGCAACAUUGAGAAGUGUUGGCUAGGUAAACCCCGGCUGGGAGCAAGGCUUAGUAGAUUUAUGACCAUUGCACAAUCUGCUUUUAAGCGCCGCUUGAGACUGUGAAGUAAUUCCAGUUCUAGAUAGAUGAUUGCCCAUCUUAUUAAAGAUGAacagaacccggcuuac .......(((.((((((((((.........(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..((((.....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((..((((((..(...........)...)))))).......)))......(((((.(((....)))))))).................((((((....)))))).......)))))))).. .......(((.(((((.((....(((((((...(((((((((..((((((((.((((...((....))...(((((.......(((((...............))))).....)))))...((((((.......))))))..(((((((....)))))))...........))))))))))))....))))))))).....)))))))....(((((.(((....)))....((.((.((((.(((....))))))))).))......)))))..((((((....))))))....)).)))))))).. .......(((.(((((.((....(((((((...(((((((((..((((((((((((....))))..((......)).............(((..((((.....)))))))..((((((...((((((.......))))))..(((((((....))))))).....))..))))..))))))))....))))))))).....))))))).(((.....)))..((((((...)))))).((((.(((....)))))))..................((((((....))))))....)).)))))))).. .......(((.(((((.((....(((((((...(((((((((..((((((((.((((...((....))....(((((((......(((((((..((((.....)))))))...))))......))))))).......((((((((((((....)))))).))).)))....))))))))))))....))))))))).....))))))).(((..(((((((.((((((...))))))(((((.(((....))))))))..)).)))))...))).((((((....))))))....)).)))))))).. .......(((.((((((((.((.(((((((...(((((((((..((((((((.((((..((((((..(......)))).......(((((((..((((.....)))))))...))))....((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))....))))))))))))....))))))))).....)))))))))...((((.....(((((((.)))))))(((((.(((....))))))))((....))..))))(..((((((....))))))..).))))))))))).. .......(((.(((((.((....(((((((...(((((((((..((((((((.((((..(((....((......))..........((((((..((((.....)))))))...))).....((((((.......))))))..(((((((....)))))))....)))....))))))))))))....))))))))).....))))))).(((.....)))....((((...)))).((((((.(((....)))))).)))...............(((((......)))))....)).)))))))).. .......(((.(((((.((....(((((((((.(((((((((..((((((((.((((...((....))....(((((((......(((((((..((((.....)))))))...))))......))))))).......((((((((((((....)))))).))).)))....))))))))))))....))))))))).))..)))))))....(((((.(((....)))....((.((.((((.(((....))))))))).))......)))))..(((((......)))))....)).)))))))).. .......(((.(((((.......(((((((...(((((((((..((((((((.((((...((....)).....((((((....(((.(((((..((((.....)))))))..)))))......))))))........((((((((((((....))))))).)).)))....))))))))))))....))))))))).....)))))))....(((((.....((((((...))))))(((((.(((....))))))))..........)))))..((((((....)))))).......)))))))).. .......................(((((((...(((((((((..((((((((.((((...((....))....(((((((......(((((((..((((.....)))))))...))))......))))))).......((((((((((((....)))))).))).)))....))))))))))))....))))))))).....))))))).(((..(((((((.((((((...)))))).((((.(((....)))))))...)).)))))...))).((((((....))))))................. .........(.(((((.....................(.((....(((((((.((((...(..........................(((((..((((.....)))))))..))........(((((.......)))))...(((((((....))))))).....).....)))))))))))......)).)((((((................))))))..................((((...........))))..................((((((....)))))).......)))))).... .........(.(((((.......(((((((.....(((((((..((((((((.((((................................(((...((.......)).)))............((((.........))))...(((((((....)))))))...........))))))))))))....))))))).......)))))))..............................((((.(((....)))))))..................((((((....)))))).......)))))).... > SSTRAND_ID=ASE_00280; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Pond Scum #2; ORGANISM=Pond Scum #2 gaggaaagugcgggcUCCACGGAAGCAUGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGACAGCGCCACAGAGAACAGACCGCCCGCCUACGCGCUAACGCGCUUUAAGCGGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUUCUCGGCAACGAGAGCGGCACGGCAAGCCCCGCCAGGAGCAAGACCAAAUAGGGACGGCGCUAUGGGCUGCUUCAGGCUCGCCGUCCGGGUAGGUCGCGCGAGGCGUCCGGCGACGGACGUCCCAGAGGAAUGGUCAUCCAGUCCGCAAGGAUGGacagaauccggcuua .....(((..((((((((.........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.((((((....)))).)..).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.....((.((.....)).)).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(.((((....)))).)......)))).))). .......((((..(((((..((.........((((((.....))))))((((....)))).(((...(((((............((((((((....((((....)))).....))))))..))......(((((((.......)))))))((((((((....))))))))....)))..))))).)).)))))..((((......(((((((.....(((((......)))))))))))).....))))))))..((((((((....)))))))).....(((.(((....))).)))((..((((.......)))).))... ..(((..(((.((((.(((.(....).))).((((((.....))))))((((....)))).........(((............((((((((....((((....)))).....))))))..))......(((((((.......)))))))((((((((....))))))))....)))..))))))).....((..((((...(..((((((((...((((....))))....)))))))).)...))))..))..((((((((....))))))))(((......)))...((((.(((....))))))).....)))...... ..(((..((((((.((((.((((..((((((((((......(((((((((((.(..((....)).....(((...........(((((((((.((.((((....))))..)).))))))...)))....(((((((.......)))))))((((((((....))))))))....)))..)))))))).)).))....((.....))..))))))))))(((.((.....))..))).)))))).)).))))))..((((((((....))))))))(((......)))...((((.(((....))))))).....)))...... ........((((((((((.........(((((((((((...)))))))((((....)))).........))))..........(((((((((.((.((((....))))..)).))))))...)))....(((((((.......)))))))((((((((....))))))))....(((.......))).)))((..((((......((((((((.....(((((...).)))))))))))).....))))..))..((((((((....)))))))).........(((....))))))))))....((((.....))))..... ..(((..(((((..((((.((((........((((((.....))))))((((....))))......((((((...........(((((((((....((((....)))).....))))))...)))....(((((((.......)))))))((((((((....))))))))....(((.......)))..........((.....))...))))))...(((.((.....))..))).)))))).))..)))))..((((((((....))))))))(((......)))...((((.(((....))))))).....)))...... ..(((..((((((.((((.((((..(((((((((((((...(((((((((((....((....)).....(((............((((((((....((((....)))).....))))))..))......(((((((.......)))))))((((((((....))))))))....)))...))))))).)).))...))).........))))))))))(((.((.....))..))).)))))).)).))))))..((((((((....))))))))(((......)))...((((.(((....))))))).....)))...... ........(((((((((....))........((((((.....))))))((((....)))).(((((........................((((.(((((......(((((..(((((...(.(((...(((((((.......)))))))((((((((....)))))))).)))..)....)))))..)))))..((((......(((((((.....(((((......)))))))))))).....)))))))))))))(((((....)))))))))).......(((....)))))))))).((((.......))))...... ...............(((..(((........(((((((...)))))))((((....))))..(.......)...............((((((.(..((((....))))...).))))))..((((((..(((((((.......)))))))((((((((....))))))))((.((((..((((.((.....))............((((((((....((.((.....)).))))))))))))))..)))).))..((((((((....))))))))(((......)))))))))..)))....))).................. ..............(................((((((.....)))))).(((....))).........................((((((((....((((....)))).....))))))..))......(((((((.......)))))))((((((((....)))))))).....................)...((((......((((((((...................)))))))).....))))......((((((((....))))))))....................(((....))).................. ...............................((((((.....))))))((((....))))........................((((((((....((((....)))).....))))))..))......(((((((.......)))))))((((((((....)))))))).........................((((......((((((((...................)))))))).....))))......((((((((....))))))))................................................ > SSTRAND_ID=ASE_00285; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Pond Scum #31; ORGANISM=Pond Scum #31 gaggaaaguccgggcUCCACGAAACAAGGGUGGCGGGUAACGCCCGCCGGCGUUCCUUCGGGGGCGCAAGGGAAAGUGCCACAGAGAGUAUACCGCCGAUGAUCCCGGACUUGAUCCGGGAACAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGGGCGCACCGGGGGGCUGGCAACAGCCACCGCAUGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGGCCGAAUAGGGGCCGCGUGCCCAUCAGCAAUGGUGGGUAGGGGAGUUUCGCCCCGAGCGGCCCGGGUUGGCUGCUAAAGCGCCGGAGCAAUCCGGCGACCAGAUGAAUGGCUGCCACCGCAGGCCCGUCCCGCAAGGGAUACCGCCUGAGGAGacagaacccggcuua .....(((.(((((((((.........((((((((((.....)))))(.(((((((....)))))))..)((...(((((............(((((..((.(((((((.....))))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((.(((((....))))).)).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.(((((((((....)))))))))((((.......))))..))))))).....)))).......(((((((....)))))))....................(...(((..(((((....)))))...).))...)........)))))))). .....(((.(((((((((.........((((((((((.....)))))).(((((((....)))))))..(((....(((((...........(((((..((.(((((((.....))))))).)))))..)).......((((((.......)))))).((.(((((....))))).))...)))))...))))))))))))..((((((....(((((((..((((((((....)))))))).((((.......))))..)))))))...)))))).......(((((((....))))))).(((......)))(((.(.((.(((((..(((((....)))))...))))).)).).)))...))))))). .....(((.(((((.............(((.((((((.....)))))).(((((((....)))))))..(((....(((((...........(((((..((.(((((((.....))))))).)))))..)).......((((((.......)))))).((.(((((....))))).))...)))))...))).)))..((((..(((((....(((((((..((((((((....)))))))).((((.......))))..)))))))...)))))))))....(((((((....))))))).(((......)))(((.(.((.(((((..(((((....)))))...))))).)).).)))..)))))))). .....(((.(((((..(((........(((.((((((.....)))))).(((((((....)))))))..(((....(((((.........(((((((..((.(((((((.....))))))).)))))...))))....((((((.......)))))).((.(((((....))))).))...)))))...))).)))..((((..(((((....(((((((.(((((((((....)))))))))((((.......))))..)))))))...)))))))))....(((((((....)))))))..........)))(((.(.((.(((((..(((((....)))))...))))).)).).)))..)))))))). .....(((.(((((((((.((((.....((((((((((...)))))))))).....))))))))(((........)))(((.........(((((((..((((((((((.....)))))))))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...)))..............(((..((((((.(..(((((((.(((((((((....)))))))))((((.......))))..)))))))..))))))))))....(((((((....))))))).(((......)))(((.((((((((((..(((((....)))))...)))))))))).)))..)))))))). .....(((.(((((.............(((.((((((.....)))))).(((((((....)))))))..(((....(((((..........((((((..((.(((((((.....))))))).)))))...))).....((((((.......))))))..(((((((....))))).))...)))))...))).)))..(((..((((((....(((((((...(((((((....)))))))..((((.......))))..)))))))...)))))))))....(((((((....))))))).(((......)))(((.(.((.(((((..(((((....)))))...))))).)).).)))..)))))))). .....(((.(((((.............(((.((((((.....)))))).(((((((....)))))))..(((....(((((...........(((((..((.(((((((.....))))))).)))))..)).......((((((.......))))))..(((((((....))))).))...)))))...))).)))..(((..((((((....(((((((..((((((((....)))))))).((((.......))))..)))))))...)))))))))....(((((((....))))))).(((......)))(((...((.(((((..(((((....)))))...))))).))...)))..)))))))). .....(((.(((((.............((((((((((.....)))))).(((((((....)))))))..(((....(((((...........(.(((.....(((((((.....)))))))...)))..)........((((((.......)))))).((.(((((....))))).))...)))))...)))))))..(((..((((((....(((((((..((((((((....)))))))).((((.......))))..)))))))...)))))))))....(((((((....))))))).(((......)))(((.(.((.(((((..(((((....)))))...))))).)).).)))..)))))))). ...............(((..........((((((((..((((((....)))))).(....)((((((........)))))..........(((((((..((.(((((((.....))))))).)))))...))))....((((((.......)))))).((.(((((....))))).))....(......)...)....(((..((((((....(((((((.(((((((((....)))))))))((((.......))))..)))))))...)))))))))....(((((((....))))))).(((......))))))))))).(((((..(((((....)))))...))))).)))................ .........(((((((((.........((((((((((.....)))))).(((((((....)))))))..........(((............(((((..((.(((((((.....))))))).)))))..)).......((((((.......)))))).((.(((((....))))).))....))).......)))))))))...(((......(((((((..((((((((....)))))))).((((.......))))..))))))).....)))........(((((((....)))))))...................((.(((((..(((((....)))))...))))).)).........)))).... ...........(...............(((.((((((.....)))))).(((((((....)))))))...........................(((..((.(((((((.....))))))).)))))...........((((((.......))))))..(.(((((....))))).)................)))........(((......(((((((.(((((((((....)))))))))((((.......))))..))))))).....)))........(((((((....)))))))...............(...((.(((((..(((((....)))))...))))).))...)......)...... > SSTRAND_ID=ASE_00291; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Reclinomonas americana, strain ATCC50394; ORGANISM=Reclinomonas americana AAAGUUUAUUGGAUGUCUGAUUAUAAUAUAUAAUAGGAAAGUCUGGACUCAUUUAAAAAGUGCAGGAUAAAUUCCUGCAGAGAAAACUCUAGGGAAAGUGUUAAAGAAAUAUAAAAACUCUUUUUUAAUAUUAGAGUUUUUUGAAAAAGAUAUAAUCUAAUAAUUUAAAAAAAAAUUAUUAAAGAAACCCCACUUUGAGCAAAACCAUUAGGUUGCUAAAAACAAAUACGUAAGAGAUUGUUUCAGAGAAAUAGACAUACAUAAAAAUUUUUUUAAAUUUUUAGGACAAAAUCCAGCUUAUAAAUAAACUUU (((((((((((........((((((...))))))....(((.(((((((((......((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...((..............((((((((...........)))))))).......((((...))))((((((((......))))))))......)))))))))))))...((((....))))......(((((............))))).................(.(((((((((....))))))))).)......)))))))).).)))))))))) 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Saccharomyces carlbergensis; ORGANISM=Saccharomyces carlbergensis GUGGAACAGUGGUGAUUCCUACGAUUAAGAAACCUGUUUGCAAAAGGGCCUGCCCACGCGGGUCAUCUUAUUUAUCAGGUGGGAAAUUCGGUGGAACACAGUGGAGCCUUGCCUUCCGGGCCAUUGUCUCUGGCAGUGGCCCCUGCUCGUGAGAGAAGAAACUUGCUGGGGAACCAGUCUUUACCGACCGUUGCUAUCAGAAAUUGAACGGGGCCCGGUCCCGCCGGGCCUCGAUGGGAACGGCAACGGUUGUUCCGUUUGACUUGUCGCCCGCCACGGCGCGCUGCAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACGCCAUUCGUGGCGAACCCGAUACCGAUUACUGCUGCUGCUCCAUC .((((.((((((((.................(((((..........(((((((....)))))))...........)))))....(((.(((((........((((((...................................((.(((....))).))((....(((((....)))))..))......(((((((.............(((((((((((...)))))))))))........)))))))...))))))...(((((((.((.(((....))).)).)))).)))....................(((((....))))).......))))))))..)))))))).)))).. 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Saccharomycopsis fibuligera, strain NRRL Y-2388; ORGANISM=Saccharomycopsis fibuligera GAUCUCUGUCCUGUUCUGGUAUCCUACGGGAUAGUCCAGGACUAUUGGAUUUAAUUCCAAAUGCUCCUGAGAGCUCCAUAGAGCGGAAGCUCUGGACGAAGCCAUCAGAAAAAUCGCUUACUUGUGAAGUGAUGGGCCACUCUACUUCGGAGUGGCUCAAUGGAAGCGGCUUCGUGGACAGUUGGCUUAGGCCGCCCUCAGGGGCGGUUUGAGCUGUUAAGUGCAAUACACAGACAUUGUGCA ..........((((((..............................................((((....)))).....(((((....)))))...(((((((.............................(((((((((((.....)))))))))))........))))))).))))))...(((((((((((((....)))))))))))))....................((...)).. .....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((.........(((((((.......)))))))(((((((((.......))))))))).........))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(((((((........))))))). .....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....))))))).(((((((..........((((((.......))))))((((((((((.......))))))))))........))))))).)))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))). .....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....)))))).((((((((.........(((((((.(....))))))))((((((((((.....)))))))))).........))))))))))))))..((((((((((((((....)))))))))))))).....(..((((........))))..). .....((((((.(((((((((((((..))))))..))))))).((((((......))))).)((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((.(((......((((((.......))))))(((((((((((.....))))))))))).).))...)))))))))))))).((((((((((((((((..))))))))))))))))....(((((((........))))))). .....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....))))....((((((....))))))..(((((((..........((((......)))).....((((((((((.......))))))))))........))))))).)))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))). .....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....))))))).(((((((.........((((((.........))))))(((((((((.......))))))))).........))))))).)))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))). .....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((.........(((((((.......)))))))(((((((((.......))))))))).........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))). .....((((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((..(((((....)))))))((((((((..........((((((.......)))))).((((((((((.....)))))))))).........)))))))))))))).(((((((((((((((....)))))))))))))))....(((((((........))))))). ......(((((.((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).((...((((....)))).)).(((((((..........((((((.......))))))(((((((((((.....)))))))))))........))))))).)))))...((((((((((((((....))))))))))))))............................ ............((((((((((((....)))))..)))))))..(((((......)))))..((((....)))).....(((((....)))))..((((((((..........((((((.......))))))(((((((((((.....)))))))))))........))))))))........((((((((((((((....))))))))))))))............................ > SSTRAND_ID=ASE_00324; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Saccharomonospora glauca, strain K195; ORGANISM=Saccharomonospora glauca gaggaaaguccgggcUCCACAGGGCAGGGUGGUUGCUAACGGCAACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCCGGCCGACAGCGGCCGGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGCCUCGGGUGACCGGGGCGGCUCGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGGCCAAGAGGAAGCCCUCGGGCUUCUGCGCAGGCGUUCGAGGGCGGCCCGUCCGAUGCCUGCGGGUAGGCCGCUAGAGCCUGUCGGCGACGGCAGGCCCAGAUGGAUGGUCGCCCAUCGUCCGCCGCGAGGCGGGCGUGGauagaacccggcguag .....(.(.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((....(((((((....)))))))..(((((((.....((((.....))))..))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(..((((((((....))))))))..)......)))))).).. .....(((((((((((((....(((...((((((((.....))))))((((....))))((((......................(((((((((....)))))))))..((((.....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).........))))..))))..))...)))....)).)))))..))))))((((((.((.((((...(((((((.(((((.......))))).)))))))...((((((((....))))))))(((......)))....(((.((((((((....)))))))))))...)))))).)))))) .......(.(((((.((....((((.((((((.(((.....))).((((((....)))).)).....((((............(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))....))))))..(((..((((....(((((((....))))))).((((((((((.(((((...))).)).))))))))))....)))))))...((((((((....))))))))(((......)))..))))..((((((((....))))))))......)).)))))).... .....(((((((((((((...((((.((...(((......((((.((((((....)))).)).....))))......)))...))))))((((....((..((((((..((((.....((((((.......))))))..((((((((....)))))))).........)))).)))))).))..))))....)).)))))..))))))((((((.((.((((..((((((((.(((((..(((((....))))).....(.((((((((....)))))))).)...)))))))))))))..((((((((....))))))))......)))))).)))))) .........(((((.((((.......(((((((((((...)))))((((((((.)))).))))...................((((((((((((....)))))))))...))).....((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).........))))))..(((..((((....((((((((..)))))))).((((((((((...((((((.))))))))))))))))....))))))).(.((((((((....)))))))).)..((((........))))((((((((....)))))))))))).....)))))..... .......(.(((((.((....((((.((((((.(((.....))).((((((....)))).)).....((((...........((((((((((((....)))))))))...))).....((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))....))))))..(((..((((.....((((((....))))))..((((((((((.(((((...))).)).))))))))))....)))))))...((((((((....))))))))(((......)))..))))..((((((((....))))))))......)).)))))).... .......(.(((((.((....((((.((((((.(((.....))).((((((....)))).)).....((((............(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))....))))....))))))..(((..((((....(((((((....))))))).((((((((((.(((((...))).)).))))))))))....)))))))...((((((((....))))))))(((......)))..))))..((((((((....))))))))......)).)))))).... .........(((((.(((((.((((.....((((((.....))))))((((....))))......................(((((((((((((....)))))))))..(((((....((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..........))))).((((...(((..(.(((((((....))))))).)...)))))))...(((((((.(((((.......))))).)))))))...((((((((....))))))))..........))))))))...(((((((....)))))))))))).....)))))..... ................((((.((((.(((((((((((...)))))((((((....)))..)))....((((...........((((((((((((....)))))))))...))).....((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).)..))))....))))))..(((..((((....(((((((....))))))).((((((((((.((.((....)).)).))))))))))....)))))))...((((((((....))))))))(((......)))..))))...(((((((....)))))))))))................ .........(.(((((((...(((..((..((((((.....)))))).(((....))).........................(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))...........))..))))))))..............((((...(((.((..()..)).)))...))))((((...(((.......)))...))))......((((((((....)))))))).................(..((((((((....)))))))).)........)).)..... .........(((((((((...(((......((((((.....))))))..((....))..........................(((((((((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))..((((((((....))))))))...............))))))))..............((((((((((.(((....))).)))))))))).......(((.......))).............((((((((....)))))))).................(..((((((((....)))))))).)........))))..... > SSTRAND_ID=ASE_00327; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Saccharomyces globosus; ORGANISM=Saccharomyces globosus UUAGAGCAGUAGCAACUCCUACGAUUUUAACCUGCUUACGAACUAUUAGUCUGAUCUAAUAAUACAUGCAGGUGGGAAAUUCGGUGAAACACAACAAAUGAGGUUUCAGUUAUUUGGGCUCGUGAGAGCAGCCUGGGGAACCUGGUUAUAAUAGCGGCGCUAUCAGAAAUUCAACGCUAUCAAAUUUUGAUGGUGAUGGGAACGGCGCUAGCAACAAACAUAUUUUAUGUACCUCACGUGUUUGACUUAAUCAUUUACUGGUUAAAGUCUGUUCAGUGCAAUCGUAGGACUUCUAAGCAAUUAGUUGCACCCGAUACCGAUCAAUGGUACUGUUCUAAU .((((((((((.((...............(((((.........((((((......)))))).......))))).....((.(((((............((((((.............((((....))))((((.((....)).))))........((((((.............(((((((((...)))))))))........)))))).....................)))))).......((((((((((.....))))))).)))....................(..((((....))))..).......)))))))...)).)))))))))).. 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TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Salt Marsh A05 (= E.coli); ORGANISM=Salt Marsh A05 (= E.coli) gaggaaaguccgggcUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGGAAACCCACGACCAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCGCGCAAGCGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGUCCGUGGCACGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCAUAAGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGCGAUUGCUGGCCUAGAUGAAUGACUGUCCACGacagaacccggcuuac .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))((((....))).)((...((((.............(((((..((((((((....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)...))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).. .....(((.(((((.((....(((((((((((((((.....))))).(((....)))...(((.((((.............(((((.....(((((....)))))....)))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......))))).((((..((((......(((((((...((......))....))))))).....))))))))..((((((((....)))))))).............)))))......)).)))))))).. .....(((.(((((.((....((((((....(((((.....))))).(((....)))........(((........)))....((((((..(((((....)))))))).)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).(((((..(((...(..(((((((...((......))....))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))............))))))......)).)))))))).. .....(((.(((((...(((.((((((..((((.(((...((((((((((....)))...(((.((((............((((((.....(((((....)))))....)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))........))))).))...)))......(((((((....(((((...)))))))))))).))))..))))))..(((((..(....)..)))))....))).....(((((...)))))..)))))))).. .....(((.((((((((....((((((((((((((((...)))))).(((....)))...(((.((((............(((((((((..(((((....)))))))).)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....)))).)))))))))))......))))..((((..((((......(((((((....((((((.))))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))............))))))......))))))))))).. .....(((.(((((.((....((((((....(((((.....))))).(((....)))........(((........)))....((((((..(((((....)))))))).)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).((((..((((...(..((((((....((((((...)))))))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))............))))))......)).)))))))).. .....(((.(((((.((....((((((....(((((.....))))).(((....)))........(((........)))....((((((..(((((....)))))))).)))..(((((....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............))))).((((..((((...(..(((((((...((......))....))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))............))))))......)).)))))))).. .....(((.(((((((.....(((((((((((((((.....))))).(((....)))...(((.((((............((((((.....(((((....)))))....)))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......))))).((((..((((......(((((((...((......))....))))))).....))))))))..((((((((....)))))))).............))))).....))..)))))))).. .....................((((((....((((((...)))))).(((....)))...(((.((((............((((((..((((((((....))))).))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))))))))))......(....)((((..((((......(((((((....(((((...)))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))............))))))................... ......((.(((((.......((((((.(..(((((.....))))).(((....))).......(................(((((.....(((((....)))))....)))..)).......((((((.......))))))....(((((....))))).......)...........)....(((..((((......(((((((...((......))....))))))).....)))))))...((((((((....))))))))............)))))).........)))))))... ......((.(((((.((....((((((....(((((.....)))))..((....)).........................(((((...(.(((((....)))))..).)))..)).......((((((.......))))))....(((((....)))))........................(((..((((......(((((((....((((.....))))))))))).....)))))))...((((((((....))))))))............))))))......)).)))))))... > SSTRAND_ID=ASE_00375; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Salt Marsh A16(21); ORGANISM=Salt Marsh A16(21) gaggaaagucCGGGCAACAAAGAGCGCCAUACUUCCUAACGGGAAGGAGGCUGACUGGAGACGGUCAGUUUACAGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGUUCCGAUAGCUAUCGGGAUAAGGGUGAAAAGGUAGGGUAAGAGCCUACCGCUCCGCCAGUGAUGUCGGGGGCAUGGUAAACCUUAUGGGUUGAAAGAUCAAAUAGGUUCCGCAUUGGAUUAAGUUCCAAGAAGAGUUGCUCGCUCUUACGCGGAAUGGGUAGAUCGAUGGAUCCUGAUUGUGAAGUCAGGGCUAGAUAAAUGGCAAGAAUCCUUUUGGUUUAUAUCAGAUGGAAacagaacccggcuuac .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((((((((....)))))))))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))((((((.((....)).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....))))......((((((((....))))))))..................(((.((((((....)))))).))).......)))))))).. .....(((.(((((...........(((((.(((((.....))))).((((((((((....)))))))))).......(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))...(((.((....)).))).)))))....((((.....))))....((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....))))..(((.((((((((....))))))))))).....))))).....(((.((((((....)))))).))).......)))))))).. .....(((.(((((...........(((((.(((((.....))))).((((((((((....)))))))))).......(((((............(((((((((......)))))))..)).......((((((.......))))))...(((.((....)).))).)))))....((((.....))))....((((...(..(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).)...))))..(((.((((((((....))))))))))).....))))).....(((.((((((....)))))).))).......)))))))).. .....(((.(((((...........(((((.(..((((..(((..(.((((((((((....)))))))))).)......(((((.........((((((((((((....))))))))...))))....((((((.......)))))).(((((.((....)).)))))...)))))..)))..))))..)...((((..((..(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..)))))))..)).))))..(((.((((((((....))))))))))).....))))).....(((.((((((....)))))).))).......)))))))).. .....(((.((((((..........)(((..((((((...)))))).((((((((((....)))))))))).........(((..........(((((((((((((())))))))))...))))....((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..))).(((((...)))))....((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....))))..(((.((((((((....)))))))))))......)))......((((((((((....)))))))))).......)))))))).. .....(((.(((((...........(((((.(((((.....))))).((((((((((....)))))))))).........((((..........(((((((((((....))))))))...))).....((((((.......)))))).(((((.((....)).)))))...)))).((((.....))))....((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....))))..(((.((((((((....))))))))))).....))))).....(((.(((((......))))).))).......)))))))).. .....(((.(((((...........(((((.(((((.....)))))..(((((((((....)))))))))........(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))..((((.((....)).)))))))))....((((.....))))....((((...(..(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).)...))))..(((.((((((((....))))))))))).....))))).....(((.(((((......))))).))).......)))))))).. .....(((.(((((...........(((.(.(((((.....))))).))))((((((....))))))((((.((....(((((...........(((((((((((....))))))))...))).....((((((.......))))))..((((.((....)).))))))))).(((((((..(.(((((....((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....)))).......(((((((....)))))))((((......))))...))))).)..)))))))......)).))))....)))))))).. .............((........))((((..((((((...)))))).((((((((((....)))))))))).........(((..........((((((((((((....))))))))...))))....((((((.......)))))).(((((.((....)).)))))....))).(((((...)))))....((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....))))..(((.((((((((....)))))))))))......)))).....(((.((((((....)))))).)))................. .........(((((.................(((((.....)))))..(((((((((....))))))))).........................(((((((((((())))))))))..)).......((((((.......))))))...(((.(......).)))...........................((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....)))).......(((((((....)))))))..................................................)))))..... ...............................(((((.....)))))..(((((((((....)))))))))...........................((((((((....))))))))...........((((((.......))))))...(((.((....)).)))...........................((((......(((((((.(((((......))))).((((((.....))))))..))))))).....))))......((((((((....))))))))........................................................... > SSTRAND_ID=ASE_00394; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Salt Marsh A46(74); ORGANISM=Salt Marsh A46(74) gaggaaaguccgggcUCCGUCAGGCAGGACGCCAGGUAACGCCUGGAGGGUGCGAGCCCAUGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAGCUUUGCUGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGGUGGUAACACGCCGCGGCAUGGUAAACCCCGUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAGCAUGGGGACCUUCGGGUCUCUACCGUACGCCUGAGCGGGCUCCCGGGUAGGUUGCUAGAGGCGACCGGUGACGGUUGUCCCAGAUGAAUGAUUGCCCACGacagaacccggcuua .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((...))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.((((((((....))))))))((((........)))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))). .....(((.(((((.((.(((.((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))..............((((((...))))))..((((((...((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...((((((..((((...(((((....((...((((.(.((..(((((((....)))))))...)).).))))...)))))))))))....))))))..((((((((....))))))))............))))))..))).)).)))))))). .....(((.(((((.((.(((.((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))..............((((((...))))))..((((((...((((((.......)))))).((((((((....))).)))))..((((......))))....((((..(((...(..((((((.((((((((....)))))))).....(((....))).)))))).)...)))))))...((((((((....))))))))............))))))..))).)).)))))))). .....(((.(((((.((.(((.(((.....))).(((...(((((((((((....))))..((....(((((.........((((((((((...))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...)))))....)).))))).))...)))......((((((.((((((((....)))))))).....(((....))).))))))((((((....((.(.((((((((....))))))))).))........))))))..))).)).)))))))). .....(((.((((((((((((.(((((((((((((((...)))))).((((....))))((((......))).........((((((((((...))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...).........)))))..((((..(((......((((((.(((((((((..)))))))))((((........)))))))))).....))))))).(.((((((((....)))))))).)...........))))...))))))))))))))). .....(((.(((((.((.(((.((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))..............((((((...))))))..((((((...((((((.......)))))).((((((((....))).)))))...(((..........))).((((..(((...(..((((((.((((((((....)))))))).....(((....))).)))))).)...)))))))...((((((((....))))))))............))))))..))).)).)))))))). .....(((.(((((.((.(((.(((.....))).(((...(((((((((((((..((((.(((......))).............((((((...))))))..)))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).....))..))))..))))).))...)))......((((((.((((((((....)))))))).....(((....))).))))))((((((((..((.(.((((((((....))))))))).))....))..))))))..))).)).)))))))). .....(((.(((((.((.(((.((((((((((((((.....))))).((((......(((((....................(((((((((...))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))).))))).)))))...)))))))))..((((..(((......((((((..(((((((....))))))).((((........)))))))))).....)))))))...((((((((....)))))))).............))))...))).)).)))))))). .................(((..(((.(((((((((((...)))))).((((....)))).(((......))).........((((((((((...))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))).)))))....(......).)))))..((((..(((......((((((.((((((((....))))))))((((........)))))))))).....)))))))...((((((((....)))))))).((......))...))).)))............... .........(((((.((.(((.(((.((((((((((.....))))).((((....)...........................(((((((.....)))))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))).)))))..........))))))))...((..((((......((((((..(((((((....))))))).((((........)))))))))).....))))))....((((((((....))))))))..............)))...))).)).))))).... .......(.(((((.((.(((.(((((((((((((((...)))))).((((....))))........................((((((((...))))))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))).))))).............)))))...((...(((......((((((.((((((((....))))))))((((........)))))))))).....))).))....((((((((....)))))))).............))))...))).)).))))))... > SSTRAND_ID=ASE_00395; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Salt Marsh A47(75); ORGANISM=Salt Marsh A47(75) gaggaaaguccgggcUCCGGCGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCAGCUCAGGCUGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCUGCUGGUAACAGCAGUGGCAGGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACAUUGGCGUGGCCCGCGUUGUUCCCGGGUAGGUCGCUUGAGGCGUCCGGUGACGGGCGUCCCAGAUGAAUGGUUGUCCACGacagaacccggcuuau .....(((.(((((((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).. .....(((.(((((((((((..((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))............((((((((....))))))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((.....)))..)))))))..((((......(((((((...(((.....)))..))))))).....))))...((.((((((((....)))))))).))......(((....))).........))))))).. .....(((.(((((((((((..((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))............((((((((....))))))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((.....)))..)))))))..((((...(..(((((((...(((.....)))..))))))).)...))))......((((((((....))))))))(((......))).(((.....)))....))))))).. .....(((.(((((((((((.(((..(..((((.((((....(((..((((....)))).)))....))))..........((((((((((....))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))))))))....))))..)))).).))))))..((((..((..(((((((...(((.....)))..)))))))..)).))))..(((.((((((((....)))))))).))).......((((....)))).....))))))).. .....(((.((((((((((..(..(.....)((((((...))))))..(((....)))).)).....((((..........(((((((((((..)))))))...))))...(((((((.......))))))).(((((((....)))))))))))(((....)))...((.((((..((((......(((((((...((((((.))))))))))))).....))))))))))((((((((....))))))))(((......))).((((...))))))))))))))).. .....(((.(((((.((.(.((((((.....(((((.....)))))..(((((...((...))...)))))...........(((((((((....))))))...))).....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((.....))).....((((..((((...(..(((((((...(((.....)))..))))))).)...))))))))..((((((((....))))))))(((......))).)).)).)).).)).)))))))).. .....(((.(((((((((((..((((.....(((((.....))))).((((....))))........))))............((((((((....))))))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((.....)))..)))))))..((((...(..(((((((...(((.....)))..))))))).)...))))...((.((((((((....)))))).))))......(((....))).........))))))).. .....(((.(((((.....(.(((((((((((((((.....))))).((((....))))........((((...........(((((((((....))))))...))).....((((((.......))))))..(((((((....)))))))))))(((....)))))))).((((..((((......(((((((...(((.....)))..))))))).....))))))))..((((((((....))))))))(((......))).))))).).......)))))))).. .................((..((((((((((((((((...))))))..(((((...((...))...)))))..........((((((((((....))))))...))))....((((((.......)))))).((((((((....))))))))...(((....)))))))).((((..((((......(((((((...(((((...)))))))))))).....))))))))..((((((((....))))))))(((......))).))))).))................ .........(((((.................(((((.....)))))..(((....))).........................((((((((....))))))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))))))))....(......)........(((..((((......(((((((...(((.....)))..))))))).....)))))))...((((((((....))))))))...........................)))))..... .........(((((.................(((((.....)))))...((....))..........................((((((((....))))))..)).......((((((.......)))))).((((((((....))))))))....................(((..((((......(((((((...(((.....)))..))))))).....))))))).(.((((((((....)))))))).).........................)))))..... > SSTRAND_ID=ASE_00407; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Salt Marsh B-A5; ORGANISM=Salt Marsh B-A5 gaggaaaguccgggcUCCAGAGGGCAGGGUGCCAGGUAACACCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCAGCAGAAAGUAUACCGCCCAAAAAUGGGGUGCUGCCCCAUUUGAGCGCCAUUCGUGGCUGGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGGCGUGGCGAUGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAUCCGUCAGCUGUGGCCCGCAGCGGAUUCGGGUAGGUCGCUACAGGCAGGUGGUGACACCUGUCGCAGAUG ..............((((........((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...((((.............(((((((.(((((((((...)))))))))....((((....)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((.(((....))).)))).)....))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))....... .............(((((...((((..(((.((((((...)))))).((((....)))).......................)))))))..((((((((.....))))))))....((((....)))).((((..((((....(((((((.......)))))))((((.(((....))).))))..........)))).)))))))))..((((......((((((....(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))....... ..(((...)))..(((((.(((....((((((((.((.((.((((..((((....))))..........((((...........(((((..((((((((.....))))))))....((((....)))).......)))))...(((((((.......)))))))....))))....)))).)).))..))))..))))..))))))))..((((...(..((((((((..((........)).)))))))).)...))))......((((((((....))))))))....... ..((.....))..(((((.(((....((((((((.((.((.((((..((((....))))..........((((........((((((((..((((((((.....))))))))....((((....)))).))))...))))...(((((((.......)))))))....))))....)))).)).))..))))..))))..))))))))..((((..((..((((((....((((((...))))))))))))..)).))))......((((((((....))))))))....... ..((.....))..(((((.(((.(..(((((((((((...)))))).((((....))))........................(((((((.(((((((((...)))))))))....((((....)))))))))...)).....(((((((.......)))))))((((((((....)))))))).......)..))))).))))))))..((((......(((((((....((((((.))))))))))))).....))))......((((((((....))))))))....... ..(((...)))..(((((...((((.((...(((((.....))))).((((....))))........................))))))..((((((((.....))))))))....((((....)))).((((..((((....(((((((.......)))))))((((.(((....))).))))..........)))).)))))))))..((((...(..((((((....(((((.....))))))))))).)...))))......((((((((....))))))))....... ..(((...)))..(((((.(((....((((((((.((.((.((((..((((....))))..........((((...........(((((..((((((((.....))))))))....((((....)))).......)))))...(((((((.......)))))))....))))....)))).)).))..))))..))))..))))))))..((((...(..((((((....(((((.....))))))))))).)...)))).((...((((((((....))))))))..))... .............(((((.(((....((((.((((((...)))))).((((....)))).......................((((((((.((((((((.....))))))))....((((....)))))))))...)))....(((((((.......)))))))((((.(((....))).))))..........))))..))))))))..((((......((((((....(((((.....))))))))))).....))))......((((((((....))))))))....... .....................((((((.(..((((((...)))))).((((....)))).(((...((((........)))).)))(((......))).).))))))((((((...((((....))))(((((..((((....(((((((.......)))))))((((.(((....))).))))((....))..)))).))))).(((..((((......((((((....((((((...)))))))))))).....)))))))...((((((((....)))))))).)))))) .............(((((.(((....((((.(((((.....))))...(((....))).................................((((((((.....))))))))....((((....))))...............(((((((.......))))))).((..(((....)))..)).......)...))))..))))))))..((((......(((((((....(((.......)))))))))).....))))......((((((((....))))))))....... .............(((((.(((....((((((((((.....))))...(((....))).................................((((((((.....))))))))....(((......)))...............(((((((.......))))))).....(((....)))...........))..))))..))))))))..((((......((((((((..((........)).)))))))).....))))......((((((((....))))))))....... > SSTRAND_ID=ASE_00413; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Synechococcus sp., strain PCC 7003; ORGANISM=Synechococcus sp. ggggaggaaaguccgggcACCACAGGGCUGGUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGCGCGAGCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAUGUAGACCGCCAGGCUCGUCCUGGUAAGGGUGCAACGGUGCGGUAAGAGCGUCACCAGCAGAGUCGAGAGGCUCUGGCUAGGUAAACCCCGCUGAAGGUGCAAGGCGAAGGUAUAUCUCGAGAAAACGGUGGCCCGCCGCCUCGAGUUGCCGAUGCUGCUAGAGGGUUUGAGUAAUCAGGCUCCCAGAGAGAUGGCGGUAAAAacagaacccggcuua ........(((.(((((((((........((..((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............((((((((.....))))))..)).......((((((.......)).))))(((((((((....))))))).)).)))..))))).))...))))...((((.........((((((....((((.....)))).)))))).......))))......((((((((....))))))))..........................)))))))). ........(((.(((((........(((.....((((((.....))))))((((....)))).........)))(((....)))..(((((((..(((...((((....((((...(((.(((((..(...((((((..(((((((....)))))))...(((((.(((.((((..........))))..))).))))).........))))))).))))).)))...))))............((((((((....)))))))))))).))).)))))))..........)))))))). ........(((.(((((.((((......)))).((((((.....))))))((((....))))..((......)).......(((..(((((((..(((..((((((..((((((...((((((.......)).))))..(((((((....))))))).....))..)))).)))..))).(((..(((..(((....((((((....((((.....)))).))))))..)))..))))))....((((((((....))))))))...)))...)))))))....)))...)))))))). ........(((.(((((........(((..(((((((((.....))))))((((....))))...)))...))).......(((..(((((((..(((...(((((....(..(..(((((.(((.........((((((((((((....)))))).))).)))..))).)))))...)..)..((((..((((...((((((....(((((...))))).)))))).))))..))))))))).((((((((....))))))))...)))...)))))))....)))...)))))))). ........(((.((((((((((......)))).((((((.....))))))((((....)))).........).........(((..(((((((..(((...((((....(..........(((.......)).)((((((((((((....))))))).)).)))....).((((..........))))..((((...((((((....((((((.)))))).)))))).))))............((((((((....)))))))))))).))).)))))))....)))...)))))))). ........(((.(((((.((((......))))..(((((.....))))).((((....))))..((......)).((....))...(((((((..(((..(((....)))..(((.(((((((((..(.(.((((((..(((((((....)))))))...(((((.(((.((((..........))))..))).))))).........)))))))))))))........)))).))).......((((((((....))))))))...)))...)))))))..........)))))))). ........(((.(((((.((((......)))).((((((.....))))))((((....))))..((......)).......(((..(((((((..(((..((((((..((((((...((((((.......)).))))..(((((((....))))))).....))..)))).)))..))).((..(((...(((....((((((....((((.....)))).))))))..)))...)))))..(.((((((((....)))))).)))...))).)))))))....)))...)))))))). ........(((.(((((.......((((((.(.((((((.....))))))((((....)))).......((((((((....))).....((((((.....))))))...)))))...((((((.......)).))))(((((((((....))))))).))(((((.(((.((((..........))))..))).))))).........).))))))((((((((.(((.((....)).))).))((((((((....))))))))..........))))))..........)))))))). ..................((((......)))).((((((.....))))))((((....))))..((......)).(......)...(((((((..(((.(.((((...((((.....((((((.......)).)))).((((((((....))))))).).......))))..............((((..((((...((((((....(((((...))))).)))))).))))..))))......((((((((....)))))))))))))))).)))))))................... ............((.(.................((((((.....))))))((((....)))).........................(((((((.......))................................(..((((((((....))))))).)...)......................((...(((....((((((.....((....)).....))))))..)))...)).......((((((((....))))))))..........)))))............).)).... ..............(..................((((((.....))))))((((....))))........................((((((((.......)....................................((((((((....))))))).)...............................(((....((((((....(((....)))....))))))..)))............((((((((....)))))))).........)))))))............)...... > SSTRAND_ID=ASE_00421; TYPE=Ribonuclease P RNA; EXT_SOURCE=RNase P Database; EXT_ID=Thermococcus litoralis; ORGANISM=Thermococcus litoralis uaggcgagggggcuggggGCCCUCGGGUAUUUGACCCGAGGAAGUUCCGCCCACCGCACCGGGGCCGCGGUGCCGCAAGGCACCUCCCGGAAGGGAGGGCAACGGCGCAGAAACGACACGUCCCUCGGGAAAUGUGGAUGAAAGCGGUGAAGGCUCCCGGCGACGGGAGCUGAGUUAACCCGCAGACAAUCCCGAGGGGAGCGGUGAAACGGCCGUCCCGCGGGGUGCAAGGCCGAGAUAGGGGCUAUGAGUUCCCGGUGUGAGCCCCGUGGUAGGCCGCUCAGUCGAAUGCCCCAUUAAUACAGAAGGCGGGcuauagcccccucgccua .(((((((((((((.........(((((.....)))))....(((.(((((((((.........((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((.............((((....((((((((....))))))))........))))......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((......(((((.....(.........)..)))))......)))).............................))))))))..))))))))))))). 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CUCAACUUGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAACGAACGCUGGCGGCAGGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGCCCCGCAAGGGGAGUGGCAGACGGGUGAGUAACGCGUGGGAAUCUACCGUGCCCUGCGGAAUAGCUCCGGGAAACUGGAAUUAAUACCGCAUACGCCCUACGGGGGAAAGAUUUAUCGGGGUAUGAUGAGCCCGCGUUGGAUUAGCUAGUUGGUGGGGUAAAGGCCUACCAAGGCGACGAUCCAUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACAUUGGGACUGAGACACGGCCCAAACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGGACAAUGGGCGCAAGCCUGAUCCAGCCAUGCCGCGUGAGUGAUGAAGGCCUUAGGGUUGUAAAGCUCUUUCACCGGAGAAGAUAAUGACGGUAUCCGGAGAAGAAGCCCCGGCUAACUUCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGAAGGGGGCUAGCGUUGUUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGUAGGCGGAUAUUUAAGUCAGGGGUGAAAUCCCAGAGCUCAACUCUGGAACUGCCUUUGAUACUGGGUAUCUUGAGUAUGGAAGAGGUAAGUGGAAUUCCGAGUGUAGAGGUGAAAUUCGUAGAUAUUCGGAGGAACGCCAGUGGCGAAGGCGGCUUACUGGUCCAUUACUGACGCUGAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAAUGUUAGCCGUCGGGCAGUAUACUGUUCGGUGGCGCAGCUAACGCAUUAAACAUUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGAUUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGCAGAACCUUACCAGCUCUUGACAUUCGGGGUUUGGGCAGUGGAGACAUUGUCCUUCAGUUAGGCUGGCCCCAGAACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCGCCCUUAGUUGCCAGCAUUUAGUUGGGCACUCUAAGGGGACUGCCGGUGAUAAGCCGAGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCCUUACGGGCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUGGUGACAGUGGGCAGCGAGACAGCGAUGUCGAGCUAAUCUCCAAAAGCCAUCUCAGUUCGGAUUGCACUCUGCAACUCGAGUGCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGAUCAGCAUGCUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUUGGUUUUACCCGAAGGUAGUGCGCUAACCGCAAGGAGGCAGCUAACCACGGUAGGGUCAGCGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU 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> SSTRAND_ID=CRW_00054; TYPE=16S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.b.Anabaena.sp; ORGANISM=Anabaena sp. GAAACGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGUCUCUUCGGAGAUAGUGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGAGAAUCUAGCUUCAGGUCGGGGACAACCACUGGAAACGGUGGCUAAUACCGGAUGUGCCGAAAGGUGAAAGAUUUAUUGCCUGAAGAUGAGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGUGGUAAGAGCGCACCAAGGCGACGAUCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUACCGCGUGAGGGAGGAAGGCUCUUGGGUUGUAAACCUCUUUUCUCAGGGAAUAAAAAAAUGAAGGUACCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCCGCAGGUGGCACUGUAAGUCUGCUGUUAAAGAGCAAGGCUCAACCUUGUAAAGGCAGUGGAAACUACAGAGCUAGAGUACGUUCGGGGCAGAGGGAAUUCCUGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCAGGAAGAACACCGGUGGCGAAAGCGCUCUGCUAGGCCGUAACUGACACUGAGGGACGAAAGCUAGGGGAGCGAAUGGGAUUAGAUACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAGGCGUGGCUUGUAUCGACCCGAGCCGUGCCGGAGCCAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGCACGCAAGUGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGUAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCAAGACUUGACAUGUCGCGAAUCUUCUUGAAAGGGAAGAGUGCCUUAGGGAGCGCGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUCGUUUUUAGUUGCCAGCAUUAAGUUGGGCACUCUAGAGAGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACGUCUUGGGCUACACACGUACUACAAUGCUACGGACAGAGGGCAGCAAGCUAGCGAUAGCAAGCAAAUCCCGUAAACCGUAGCUCAGUUCAGAUCGCAGGCUGCAACUCGCCUGCGUGAAGGAGGAAUCGCUAGUAAUUGCAGGUCAGCAUACUGCAGUGAAUUCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGCAACGCCCGAAGUCAUUACUCCAACUUUUAGGAGAGGAGGAUGCCUAAGGCAGUGCUGGUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGUGGCUGGAUCACCUCCUUU 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> SSTRAND_ID=CRW_00129; TYPE=16S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.b.H.influenzae; ORGANISM=Haemophilus influenzae (operons A-F) AAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAGCAGGAGAAAGCUUGCUUUCUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGCUUGGGAAUCUGGCUUAUGGAGGGGGAUAACGACGGGAAACUGUCGCUAAUACCGCGUAUUAUCGGAAGAUGAAAGUGCGGGACUGAGAGGCCGCAUGCCAUAGGAUGAGCCCAAGUGGGAUUAGGUAGUUGGUGGGGUAAAUGCCUACCAAGCCUGCGAUCUCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCGCAAUGGGGGGAACCCUGACGCAGCCAUGCCGCGUGAAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUUCUUUCGGUAUUGAGGAAGGUUGAUGUGUUAAUAGUACAUCAAAUUGACGUUAAAUACAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCGAGCGUUAAUCGGAAUAACUGGGCGUAAAGGGCACGCAGGCGGUUAUUUAAGUGAGGUGUGAAAGCCCUGGGCUUAACCUAGGAAUUGCAUUUCAGACUGGGUAACUAGAGUACUUUAGGGAGGGGUAGAAUUCCACGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUGUGGAGGAAUACCGAAGGCGAAGGCAGCCCCUUGGGAAUGUACUGACGCUCAUGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCUGUAAACGCUGUCGAUUUGGGGAUUGGGCUUAGAGCUUGGUGCCCGUAGCUAACGUGAUAAAUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUACUCUUGACAUCCUAAGAAGAGCUCAGAGAUGAGCUUGUGCCUUCGGGAACUUAGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGACUUGGUCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGAGUAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGUAUACAGAGGGAAGCGAAGCUGCGAGGUGGAGCGAAUCUCAUAAAGUACGUCUAAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGAAUCAGAAUGUCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGUACCAGAAGUAGAUAGCUUAACCUUUUGGAGGGCGUUUACCACGGUAUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCUUA 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> SSTRAND_ID=CRW_00167; TYPE=16S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.b.N.meningitidis.MD58.GEN; ORGANISM=Neisseria meningitidis UGAACAUAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAUGCUUUACACAUGCAAGUCGGACGGCAGCACAGAGAAGCUUGCUUCUCGGGUGGCGAGUGGCGAACGGGUGAGUAACAUAUCGGAACGUACCGAGUAGUGGGGGAUAACUGAUCGAAAGAUCAGCUAAUACCGCAUACGUCUUGAGAGAGAAAGCAGGGGACCUUCGGGCCUUGCGCUAUUCGAGCGGCCGAUAUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGUAAAGGCCUACCAAGGCGACGAUCAGUAGCGGGUCUGAGAGGAUGAUCCGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUGGACAAUGGGCGCAAGCCUGAUCCAGCCAUGCCGCGUGUCUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGGACUUUUGUCAGGGAAGAAAAGGCUGUUGCUAAUAUCAGCGGCUGAUGACGGUACCUGAAGAAUAAGCACCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGUGCGAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGGGCGCAGACGGUUACUUAAGCAGGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCCGGGAACUGCGUUCUGAACUGGGUGACUCGAGUGUGUCAGAGGGAGGUAGAAUUCCACGUGUAGCAGUGAAAUGCGUAGAGAUGUGGAGGAAUACCGAUGGCGAAGGCAGCCUCCUGGGACAACACUGACGUUCAUGCCCGAAAGCGUGGGUAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGUCAAUUAGCUGUUGGGCAACCUGAUUGCUUGGUAGCGUAGCUAACGCGUGAAAUUGACCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGAUUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGGUGGAUGAUGUGGAUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUGUACGGAAUCCUCCGGAGACGGAGGAGUGCCUUCGGGAGCCGUAACACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUCAUUAGUUGCCAUCAUUCAGUUGGGCACUCUAAUGAGACUGCCGGUGACAAGCCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCCUUAUGACCAGGGCUUCACACGUCAUACAAUGGUCGGUACAGAGGGUAGCCAAGCCGCGAGGCGGAGCCAAUCUCACAAAACCGAUCGUAGUCCGGAUUGCACUCUGCAACUCGAGUGCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCAGGUCAGCAUACUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGGGAUACCAGAAGUAGGUAGGAUAACCACAAGGAGUCCGCUUACCACGGUAUGCUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU 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> SSTRAND_ID=CRW_00235; TYPE=16S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.b.S.setonii; ORGANISM=Streptomyces setonii CAUUCACGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCGUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAUGAAGCCGCUUCGGUGGUGGAUUAGUGGCGAACGGGUGAGUAACACGUGGGCAAUCUGCCCUUCACUCUGGGACAAGCCCUGGAAACGGGGUCUAAUACCGGAUAACACUCUGUCCCGCAUGGGACGGGGUUAAAAGCUCCGGCGGUGAAGGAUGAGCCCGCGGCCUAUCAGCUUGUUGGUGGGGUAAUGGCCUACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGCCUGAGAGGGCGACCGGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGAAAGCCUGAUGCAGCGACGCCGCGUGAGGGAUGACGGCCUUCGGGUUGUAAACCUCUUUCAGCAGGGAAGAAGCGAAAGUGACGGUACCUGCAGAAGAAGCGCCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGCGCAAGCGUUGUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGAGCUCGUAGGCGGCUUGUCACGUCGGAUGUGAAAGCCCGGGGCUUAACCCCGGGUCUGCAUUCGAUACGGGCUAGCUAGAGUGUGGUAGGGGAGAUCGGAAUUCCUGGUGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUAUCAGGAGGAACACCGGUGGCGAAGGCGGAUCUCUGGGCCAUUACUGACGCUGAGGAGCGAAAGCGUGGGGAGCGAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGUUGGGAACUAGGUGUUGGCGACAUUCCACGUCGUCGGUGCCGCAGCUAACGCAUUAAGUUCCCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCAUGUGGCUUAAUUCGACGCAACGCGAAGAACCUUACCAAGGCUUGACAUAUACCGGAAAGCAUCAGAGAUGGUGCCCCCCUUGUGGUCGGUAUACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUCUGUGUUGCCAGCAUGCCCUUCGGGGUGAUGGGGACUCACAGGAGACUGCCGGGGUCAACUCGGAGGAAGGUGGGGACGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGUCUUGGGCUGCACACGUGCUACAAUGGCCGGUACAAUGAGCUGCGAUGCCGCGAGGCGGAGCGAAUCUCAAAAAGCCGGUCUCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACUCGACCCCAUGAAGUCGGAGUUGCUAGUAAUCGCAGAUCAGCAUUGCUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGUCACGAAAGUCGGUAACACCCGAAGCCGGUGGCCCAACCCCUUGUGGGAGGGAGCUGUCGAAGGUGGGACUGGCGAUUGGGACGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU 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UACAGGUUUGGUCCCAGCCUUUCUGUUAAUUUUUAAUAGAAUUACACAUGCAAGUAUCCACACCCCAGUGAGAAUGCCCUCUAAAUCACCCAGAUCAAAAGGAGCGGGUAUCAAGCACACCAUACACCGUAGCUCAAAACGCCCUGCUCAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGACCAAAAUUAAGCCAUGAACGAAAGUUUGACUAAGCCAUAUUAACCAGAGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACUCAAACUAACAGAAAUACGGCGUAAAGCGUGUUAAAGAAUUAAAAGUACAAAUAAAGUUAAAUUCUAACUAAACUGUAAAAAGCCCUAACUAGAAUAAAAAUCUACUACAAAAGUGACUUUAACAAUACUGACCACACGAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACACAGAUAAUUCCAAAAACAAAACUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCAUACCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAACCCUUGCUAAUCCAGUCUAUAUACCGCCAUCUCCAGCAAACCCUAAAAAGGACUAAAAGUAAGCUCAACUAUUACACAUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAACCUAUGGGCUGGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUAGAACAAGAACACAACCCACCCGAACGAAAACUCCUAUGAAAGCUAGGAACUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUCAAGAGUAGAGUGCUUGAUUGAACAAGGCUAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUAACACAAACCCAUAAACAUAAUAGCUAGACAAAACCAAAUGAGAGGAGACAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGACAAAU 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TYPE=16S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.m.H.sapiens.5; ORGANISM=Homo sapiens 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RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.m.H.sapiens.geno; ORGANISM=Homo sapiens AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGCUCUUAGUAAGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGUUCCAGUGAGUUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGGACAAGCAUCAAGCACGCAGCAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUUAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCUAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGUCAAUAGAAGCCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCACCCCCUCCCCAAUAAAGCUAAAACUCACCUGAGUUGUAAAAAACUCCAGUUGACACAAAAUAGACUACGAAAGUGGCUUUAACAUAUCUGAACACACAAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUCAACAGUUAAAUCAACAAAACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCAAAGGACCUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUGAUGAAGGCUACAAAGUAAGCGCAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGUGGCAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACCCCAGAAAACUACGAUAGCCCUUAUGAAACUUAAGGGUCGAAGGUGGAUUUAGCAGUAAACUGAGAGUAGAGUGCUUAGUUGAACAGGGCCCUGAAGCGCGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUACUUCAAAGGACAUUUAACUAAAACCCCUACGCAUUUAUAUAGAGGAGACAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACGAAC 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RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.m.Manis.sp; ORGANISM=Manis sp. CAUAGGUUUGGUCCCAGCCUUUUUAUUAGUUUAUGAUAAAAUUACACAUGCAAGUAUCCGCCCUACGGUGAAAACGCCCUUUAGCCUUUACAAGUCAAAAGGAGCUGGUAUCAAGCACGCCAAUUUAAGGCAGCUAGUGACACCUUGCUUACGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGUGAUAAAAAUUAAACCAUUAACGAAAGUUAGAUUUAGUUAUAUCAUUUAUGGGUUGGUAAAUCUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCUAAUUAAUAAAAAACCGGCGUAAAAAGUGUCAAAGUGUAUUUAAAUCAAAUAAAAUUAAGCCCUAAUCAAGCUGUAAAAAGCCUCGAUUAUAGUAAAAAUAAACUAUGAAAAUAAUUUUAAUAAAACCCACACACGAUAGCUAAGAUCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCUUAAACCUAAAUAAUUAAUUAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGUACUACUAGCAAUAGCUUGAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUCCUAUAAACGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCAAUCCUAGCUAAUGCAGCCUAUAUACCGCCAUCCUCAGCAAACCCUAAUAAAGGAACCAUAGUAAGCAAGAUCAUUGAAACAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCUUAUGGAUUGGGAAGAGAUGGGCUACAUUUUCUAAAACAGAAUAAGACGAAUACCCUUAUGAAAAUAAGGGUUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAGACAAGAAUAGAGAGCUUGACUGAAUUAGGCCCUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCUUCAAAUUUCCAAAAAACAGUAAAUAUAUUAAUGAAUAACAAGAAUGAGAAGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAGGUGUGCUUGGAUAAU 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Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.m.N.typhlops; ORGANISM=Notoryctes typhlops 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EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.m.O.anatinus; ORGANISM=Ornithorhynchus anatinus UAAAGGUUUGGUCCUAGCCUUACUGUUAGAUUUGAUUAGAUUUAUACAUGCAAGUAUCCGCAACCCAGUGAGAAUACCCUAAAAACUCUUAACAAGUUAGAAGGAGUAGAUAUCAGGCACACUAAAGUAGCCCACAACAUCUUGCCCUAGCCACACCCCCACGGGACACAGCAGUAAUAGAAAUUAGUCAAUAAACGCAAGUUUGAACAAGUCAUAAUCAAUAAGAGUCGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUGACUCAACCUAACAAAUAACGGUGUAAAACGUGUUUAAAAACUUAAACUAAUAAGAUUAAAGUAGAACUAAACUGUGAUAAGUCAUAGUUAAUACUAAAGCCAUCUACGAAAGUGAUCUUAGACUAAUUGAAUACACGAUAGCUAAGGUACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUCAAGUCGUUUAAUAACAAAACUACUCACCAGAGAACUACUAGCAACAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGGCGGUGCUUCACCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGAUACACCUCACCAUCUUUUGCCACUACUGUCUAUAUACCGCCAUCGUCAGCCAACCCUAAAAAGGAACAAAAGUAGGCGUAAUCAUUUUUCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCUAUAAGAUGGAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACAUUAGAACAUACGAAAAACUCUAUGAAACUAGAGUAUUAAGGAGGAUUUAGUAGUAAGCCAAGAAUAGAGAGCUUGACUGAACUGGGCAAUGAAGCACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAUCAAGCAACACAAACAUUCCUAAAAUCCCAACGCUUUUCAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACCGGAAGGUGUGCUUGGAAUAUC 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EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.m.R.norvegicus; ORGANISM=Rattus norvegicus AAAGGUUUGGUCCUGGCCUUAUAAUUAAUUGGAGGUAAGAUUACACAUGCAAACAUCCAUAAACCGGUGUAAAAUCCCUUAAAGAUUUGCCUAAAACUUAAGGAGAGGGCAUCAAGCACAUAAUAUAGCUCAAGACGCCUUGCCUAGCCACACCCCCACGGGACUCAGCAGUGAUAAAUAUUAAGCAAUGAACGAAAGUUUGACUAAGCUAGUACCUCUCAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAAUUAUUUUCGGCGUAAAACGUGCCAACUAUAAAUCUCAUAAUAGAAUUAAAAUCCAACUUAUAUGUGAAAAUUCAUUGUUAGGACCUAAGCCCAAUAACGAAAGUAAUUCUAAUCAUUUAUAUAAUGCACGAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUUAAUAAUUAAACCUACAAAAUUAUUUGCCAGAGAACUACUAGCUACAGCUUAAAACACAAAGGACUUGGCGGUACUUUAUAUCCGUCUAGAGGAGCCUGUUCUAUAAUCGAUAAACCCCGUUCUACCUUACCCCUUCUCGCUAAUUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUAAAAAGGCACUAAGUUAGCACAAGACAACAUAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCAAUGAAGCGGAAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUUUUCCCAGAGAACAUUACGAAACCCUUAUGAAACUAAAGGACAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAAUUAAGAAUAGAGAGCUUAAUUGAAUAGAGCAAUGAAGUACGCACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAAUUAGAUUGACAUUCACAUAUACAUAAUUUCACUAACAAAUUUAUGAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAAUAAU 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EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.a.H.marismortui.2; ORGANISM=Haloarcula marismortui rrnA 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> SSTRAND_ID=CRW_00474; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.B.bacilliformis; ORGANISM=Bartonella bacilliformis AUCAAGUGUCUUAAGGGCAUUUGGUGGAUGCCUUGGCAUGCACAGGCGAUGAAGGACGUGAUACGCUGCGAUAAGCUACGGGGAGGUGCGAAUACCCUUUGAUCCGUAGAUUUCCGAAUGGGGCAACCCACCUUUGACUGCUGGAAACGUUAAGCUGUUUUGCAAAAGACAGUUUAGGUUUCUAGUUGUCUUUAAUAAGGUAUCUUCAUCUGAAUAAAAUAGGGUGUAAGAAGCGAACGCAGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCUGUAGGAAAGGACAUCAACCGAGACUCCGUUAGUAGUGGCGAGCGAACGCGGACCAGGCCAGUGGCUUAAAUUUAGAAAAGUAGAAUCGAUUGGAAAGUCGAACCAAAGAGGGUGAUAGUCCCGUAUACGUAAAUCUGAUUUAAGUCCUUGAGUAAGGCGGGACACGUGAAAUCCUGUCUGAACAUGGGUCGACCACGAUCCAAGCCUAAGUACUCGUGCAUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCCCGACGAGGGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCGAAUGCCUACAAACAGUCGGAGCCCAAGAUUUGUUCUGGGUGACGGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAGUCUAACGAGCAAGCUUAAGCCGAUAGGUGUAGGCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUCAGUUCGUUGGAUUAGACCCGAAACCGAGUGAUCUAGCCAUGAGCAGGCUGAAGGUAAGGUAACACUUACUGGAGGGCCGAACCCGUAUCUGUUGCAAUAGAUUGGGAUGACUUGUGGCUAGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACUCGGAAAUAGCUGGUUCUCCGCGAAAUCUAUUUAGGUAGAGCGUUAGUUGAAUUCUCCAGGGGGUAGAGCACUGGAUGGGCUAGGGGUCCUCACCGGAUUACCAAACCUAACCAAACUCCGAAUACCUGGAAGAACUGACUGGCAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGGAAAGGGCAACAACCCUAACCACCAUCUAAGGUCCCCAAGUUAUGGCUAAGUGGGAAAGGAUGUGAGGAUCCCAAAACAACCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAACAGCUCACUGGUCUAAAUAAGGGUCUUUGCGCCGAAAAUGUAACGGGGCUAAAGCCAUACACCGAAGCUGUGGAUUUACUCUUAUGAGUAAGUGGUAGCGGAGCGUUCCGUAAGCCUGUGAAGGGAGACUCGCGAGAGCUCCUGGAGGUAUCGGAAGUGAGAAUGCUGACAUGAGUAACGAUAAAGGGAGUGAGAGACUCCCUCGCCGAAAGUCCAAGGGUUCCUGCUUAAAGUUAAUCUGAGCAGGGUGAGUCGGCCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAACCACGUUAAUAUUCGUGGACCUGUGGGAAGUGACGGAUUAGGAAUAUUGUAAGGUCUUAUUGGAUUGAUCUUGCAGUAGAAUAAUCCCAGGAAAUAGCUCCCACAUAUAGACCGUACCCGAAACCGACACAGGUGGACAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUACGUUGAAGGAACUCGGCAAAUUGCACGCGUAACUUCGGAAGAAGCGUGACCCUUUAGCGGGCAACCGUUAGAGGGUGGCACAGACCAGGGGGUAGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGGCUCUGCGAAGUCGCAAGACGAUGUAUAGGGUCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGAUGUGCAAGCAUUGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAACGACUUCCCCGCUGUCUCCAACGUAGACUCAGUGAAAUUGAAUUCCCCCGUGAAGAUGCGGGGUUCCUGCGGUUAGACGGAAAGACCCCGUGCACCUUUACUAUAGCUUUACACUGGCAUUUGUGUCGGCAUGUGUAGGAUAGGUGGUAGACUUUGAAGCAGGGGCGCUAGCCCUUGUGGAGUCAUCCUUGAAAUACCACCCUUACCGACAUGGAUGUCUAACUGCAGUCCGUUAUCCGGAUUCAAGACAGUGUAUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCGCGAAGGUAGGCUCAGAACGGUCGGAAAUCGUUUGUUGAGUGCAAUGGCAUAAGCCUGCCUGACUGUGAGACUGACAAGUCGAGCAGAGUCGAAAGACGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACGCCGGGGAUAACAGGCUGAUGACCCCCAAGAGUCCAUAUCGACGGGGUUGUUUGGCACCUCGAUGUCGACUCAUCGCAUCCUGGGGCUGGAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGUGAGUUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGUGUAGGAAUAUUGACAGGAUCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGUAUCUCUGGUGGACCUGUUGUGGCGCCAGCCGCAUAGCAGGGUAGCUAUAUACGGACGGGAUAACCGCUGAAGGCAUCUAAGCGGGAAACCCACCUGAAAACGAGUAUUCCCUUGAGAACCGUGGUAGACCACCACGUUGAUAGGUCAGGCGUGGAAGUGUGGUAACACAUGAAGCUUACUGAUACUAAUAGUUCGAUUGGCUUGAUCGUUCUCAUUU 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> SSTRAND_ID=CRW_00477; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.B.cepacia; ORGANISM=Burkholderia cepacia 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> SSTRAND_ID=CRW_00478; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.B.mallei; ORGANISM=Burkholderia mallei GGUCAAGCGAACAAGUGCAUGUGGUGGAUGCCUUGGCGAUCACAGGCGAUGAAGGACGCGGUAGCCUGCGAAAAGCUACGGGGAGCUGGCAAACGAGCUUUGAUCCGUAGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCGGCCCUUUUGGGUCAUCCUAGACUGAAUACAUAGGUCUAGUGAGGCGAACGCGGUGAACUGAAACAUCUAAGUAACCGCAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCAAAGUAGUGGCGAGCGAAAUGGGAAGAGCCUGUACUCUUUAUUUGUAUUGUUAGCCGAACGCUCUGGAAAGUGCGGCCAUAGCAGGUGAUAGCCCUGUAGGCGAAAACAGUAUGAAAGAACUAGGUGUACGACAAGUAGGGCGGGACACGUGAAAUCCUGUCUGAAGAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCGUGAUCGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAUCCUGAAACCGCAUGCAUACAAACAGUCGGAGCCUCUUCGGGGGUGACGGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUACGUUCAGUAGCAAGCUUAACCGAAUAGGGCAGGCGUAGCGAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGUUCAGUUGCUGGGCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUAUCCAUGGCCAGGAUGAAGGUGCGGUAACACGUACUGGAGGUCCGAACCCACUAACGUUGAAAAGUUAGGGGAUGAGCUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCUAAACAAACCUGGAAAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAACUAUUUAGGUAGUGCCUCGUGUCUCACCUUCGGGGGUAGAGCACUGUCAUGGUUGGGGGGUCUAUUGCAGAUUACCCCGCCAUAGCAAACUCCGAAUACCGAAGAGUGCAAUCACGGGAGACAGACAUCGGGUGCUAACGUCCGGUGUCAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCCAAAUAUGGCUAAGUGGGAAACGAAGUGGGAAGGCUAAAACAGUCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGAUCGAGUCGUCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAGCCAUAUACCGAAGCUGCGGAUGCGAGCUAGUCUCGCAUGGUAGGAGAGCGUUCCGUAAGCCUGCGAAGGUGCGUUGAAAAGCGUGCUGGAGGUAUCGGAAGUGCGAAUGCUGACAUGAGUAGCGAUAAAGGGGGUGAAAGGCCCCCUCGCCGUAAGCCCAAGGUUUCCUACGCAACGUUCAUCGGCGUAGGGUGAGUCGGCCCCUAAGGCGAGGCAGAAAUGCGUAGCUGAUGGGAAGCAGGUCAAUAUUCCUGCACCGUCGUUAGAUGCGAUGGGGGGACGGAUCGCGGAAGGUUGUCCGGGUGUUGGAAGUCCCGGUCGCUGCAUUGGAGAAGGCGCUUAGGCAAAUCCGGGCGCAGGAUUCAAGGGUGUGGCGCGAGCUCCUUCGGGAGCGAAGCAAUUGGAAGUGGUUCCAAGAAAAGCCUCUAAGCUUCAGUCUAACGAUGACCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGAGAUGAGUAUUCUAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGAGAAGGAACUCGGCAAAUUGGUACCGUAACUUCGGGAUAAGGUACGCCCUGGUAGCUUGACUGGCCUGCGCCAGAAGGGUGAAGGGGUUGCAAUAAACUGGUGGCUGCGACUGUUUAAUAAAAACACAGCACUCUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGAUUAAAUGAUGGGGUGCAAGCUCUUGAUUGAAGUCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAACGAUGGCCACACUGUCUCCUCCCGAGACUCAGCGAAGUUGAAGUGUUUGUGAUGAUGCAAUCUACCCGCGGCUAGACGGAAAGACCCCAUGAACCUUUACUGUAGCUUUGCAUUGGACUUUGAACCGAUCUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUAUGAAACCGGAAUGCUAGUUUCGGUGGAGCCGUCCUUGAAAUACCACCCUGGUUUGUUUGAGGUUCUAACCUUGGCCCGUGAUCCGGGUCGGGGACAGUGCAUGGUAGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCCAAAGCGUAACGGAGGAGUACGAAGGUACGCUAGGUACGGUCGGAAAUCGUGCUGAUAGUGCAAUGGCAUAAGCGUGCUUAACUGCGAGACCGACAAGUCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCUGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCUCAUCCUGGGGCUGUAGCCGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGAGGUACGUGAGCUGGGUUUAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGUUGGAAGUUUGAAGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGAACCUCUGGUGUACCGGUUGUGACGCCAGUCGCAUCGCCGGGUAGCUAUGUUCGGAAGAGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAACUCGCCUUAAGAUGAGACUUCCCCGGGGACUUGAUCCCCUUGAAGGGUCGUUCGAGACCAGGACGUUGAUAGGUCGGGUGUGUAAGCGCAGUAAUGCGUUCAGCUAACCGAUACUAAUUGCCCGUACGGCUUGAUCCUA 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> SSTRAND_ID=CRW_00481; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.B.subtilis; ORGANISM=Bacillus subtilis GGUUAAGUUAGAAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGGAGCCGAUGAAGGACGGGACGAACACCGAUAUGCUUCGGGGAGCUGUAAGCAAGCUUUGAUCCGGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCACCACUCGUAAUGGAGUGGUAUCCAUAUCUGAAUUCAUAGGAUAUGAGAAGGCAGACCCGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCGGAGAAGAGAAAGCAAAUGCGAUUCCCUGAGUAGCGGCGACGAACACGGGAUCAGCCCAAACCAAGAGGCUUGCCUCUGUGGUUGUAGGACACUCUGUACGGAGUUACAAAAGAACGAGGUAGAUGAAGAGGUCUGGAAAGGGCCCGCCAUAGGAGGUAACAGCCCUGUAGUCAAAACUUCGUUCUCUCCUGAGUGGAUCCUGAGUACGGCGGAACACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAAGGCUAAAUACUCCCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAGAGAUCCUGAAACCGUGUGCCUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAACGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUCCCGUGCAAGGUUAAGCAGAAGAUGCGGAGCCGCAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGCAUGAGUACGUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCAUGUCCAGGGUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGCCCGAACCCACGCACGUUGAAAAGUGCGGGGAUGAGGUGUGGGUAGGGGUGAAAUGCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGGUAAGAGUCUUGGAGGUAGAGCACUGAUUGGACUAGGGGCCCUCACCGGGUUACCGAAUUCAGUCAAACUCCGAAUGCCAAUGACUUAUCCUUGGGAGUCAGACUGCGAGUGAUAAGAUCCGUAGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUAUACGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGAGUUGCUUAGACAACCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACUCUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACGUAUCACCGAAGCUGCGGACUGUUCUUCGAACAGUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCUGUGAAGCCAGACCGGAAGGACUGGUGGACGGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUAUGAGUAGCGAAAAGAGGGGUGAGAAUCCCUCCACCGAAUGCCUAAGGGUUCCUGAGGAAGGCUCGUCCGCUCAGGGUUAGUCGGGACCUAAGCCGAGGCCGAAAGGCGUAGGCGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUCCUCACCAUUUGAGCAAUGGGGGGUCGCAGGAGGAUAGGGUAAGCGCGGUAUUGGAUAUCCGCGUCCAAGCAGUUAGGCUGGGAAAUAGGCAAAUCCGUUUCCCAUAAGGCUGAGCUGUGAUGGCGAGCGAAAUAUAGUAGCGAAGUUCCUGAUUCCACACUGCCAAGAAAAGCCUCUAGCGAGGUGAGAGGUGCCCGUACCGCAAACCGUCACAGGUAGGCGAGGAGAGAAUCCUAAGGUGAUCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUGUUAGGGUGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUAGCAAAAACACAGGUCUCUGCGAAGCCGUAAGGCGAAGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGCGCUUAGCGUAAGCGAAGGUGCGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUUAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGAUAUUGAAUGUUGGUACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUGGAAACCGGAGCGCCAGCUUCGGUGGAGGCAUCGGUGGGAUACUACCCUGGCUGUAUUGACCUUCUAACCCCCCGCCCUUAUCGGGCGGGGAGACAGUGUCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCGCAGAGUGUAAAGGCACAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGCUCCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGCGGGCGCUGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGCACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCUGCCAAGGGCAUCGCUGGGUAGCUAUGUGCGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAUUCCGCAAGGAAGUAAGAUCCCUGAAAGAUGAUCAGGUUGAUAGGUCUGAGGUGGAAGUGUGGCAACACAUGGAGCUGACAGAUACUAAUCGAUCGAGGACUUAACCAU 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> SSTRAND_ID=CRW_00483; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.C.botulinum.a; ORGANISM=Clostridium botulinum A 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> SSTRAND_ID=CRW_00492; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.E.coli; ORGANISM=Escherichia coli GGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCUU 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> SSTRAND_ID=CRW_00495; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.E.rhusiopathiae; ORGANISM=Erysipelothrix rhusiopathiae (str. 715) GAUUAAAUAUGUAAGGGCGUACGGUGGAUGCCUAGGCACUAAGAGCUGAUGAAGGACGCGACUAACAGCGAAAUGCCUCGGGGAGUGGUACGUACACAACGAUCCGGGGGUAUCCGAAUGGGGAAACCCAAUACUGGUUAUGCAGUAUUACACAUAAAUGAAUACAUAGUUUAUGAUGAGGCAACCUUGCGAACUGAAACAUCUUAGUAGCAAGAGGAAAAGAAAACAAAAGUGAUUCCCUGAGUAGUGGCGAGCGAAACGGGAAAAGCCCAAACCAUCUUCGUGAUGGGGUAGUAGGACCACAACGUGGGAUAUCGAAGCUAGUCGAAUGGCAUUGAAAGGCCAGUCAAAGAAGGUGCAAACCCUGUAGACGAAAGCGUAAGAUACUCUAGUGGUAUCCUGAGUACGGCGAGGCACGUGAAACCUUGUCGGAAUCAACCGGGACCACCCGGUAAGGCUAAAUACUCCUUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCGCGGAAGCGGAGUGAAAUAGAUCCUGAAACCGUAUGCUUACAAGAAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACUCAUAAUGUGCGAGGUUAAGUUGAAGAGACGGAGCCGAAGCGAAAGCGAGUCUUAAUAGGGCGAUAUAGUACAUUGUGGUAGACCCGAAACUGAGUGAUCUAGCCAUGACCAGGUUGAAGUUUGGGUGAAACCAAAUGGAGGACCGAACCGACCAUCGUUGAAAAGCUGGCGGAUGAGUUGUGGCUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACUCAGAUAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCGUCAAUGUAAGGCCACUGGAGGUAGAGCACUGAAUGUAUGAUGGCCCCAUCUCGGGGUACUGAAUAUAAUCAAACUCCGAAUGCCAGUGGAUAGUAGUUGGCAGUCAGACUAUGGGUGAUAAGGUCCGUAGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCAUCAGUUAAGGUCCCAAAAUUCAUGCUAAGUGGAAAAGGAUGUGGGGAUGCACAGACAACUAGGAGGUUGGCUCAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACUAGUCGAGUGACCCUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAGUAUGAUACCGAAACUAUGGAUUUAUUGUUUCAAUAAAUGGUAGGGGAGCGUUCUAUACUGCGUUGAAGCUGUACCGUAAGGAGCAGUGGAGUGUAUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAGAUGUCAGUGAGAAUCUGACACACCGAUUGCCUAAGGUUUCCAGGGGAAGGCUCGUCCUCCCUGGGUAAGUCGGGACCUAAGAUGAGGCUGAAAAGCGUAGUCGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCCGAUACAUAAGUGAAGGAAUGACAGAGAAGGCUAGGUUAAGCCAGCGACUGGAAGUGCUGGUUUAAGCGAAGGAGCUGUAUGGUAGGCAAAUCCGCCAUGCAAAGCAAAGGCGUUAUGAGGAGUGAACCCGUGAGGAAGUAGCGAAGUAACUGAUGCCAGCUCUCAAGAAAAGUUUCUAGCGUUAAUUAUGUAUUGGCCCGUACCAAAACCGACACAGGUAGGCAAGGAGAGAAUCCUAAGGUGAGCGAGAGAACUGUUGCCAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCGAAAGAGCCGCAGUGAAGAGGCCCAAGCGACUGUUUAACUAAAACACAGCUCUCUGCAAAGUCGCAAGACGAAGUAUAGGGGGUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGGGAAUAUGUUAGAAUUCGUUCGAAGCAUUGAACUGAAGCCCCAGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGUGUAACGAUUUGGGCGCUGUCUCGGCAGCAGACUCGGUGAAAUCUUAGUACCGGUAAAGAUGCCGGUUACCCGCAACUAGACGGAAAGACCCCAUGGAGCUUUACUGUAGCUUGAUAUUGAACUUUGAGCCUACAUGUACAGGAUAGGUGGGAGACUAUGAAGCAUGUACGCUAGUAUAUGUGGAGUCGCCAUUGGGAUACCACUCUUGUAUGAUUGAAAUUCUAACCGCGGUCCGUGAUCCGGAUCCGGGAGAGUGUCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUACCCUCAGAUUGGUUGGAAAUCAAUCGACGAGCGUAAAGGCAGAAGGGUGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGCUUAGUGAUCCGGCGGUUCCGCGUGGAAGGGCCGUCGCUUAACGGAUAAAAGCUACCCUGGGGAUAACAGGCUGAUCUCGCCCAAGAGUUCACAUCGACGGCGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGAGCUGAAUUAGGUUCCAAGGGUUGGGCUGUCCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGUUGUGGGCGUAGGAAAUUUGAGGAGCGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCUGCCAAGGGCAUCGCUGGGUAGCUAAGUAUGGACUGGAUAAGCGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAGCCAACUCCAAGAUGAGAUUUCCCAUACGUAAGUAGUAAGACCCCUGAGAGACGAUCAGGUUGAUAGGUCAGAGGUGGAAGCAUAGUGAUAUGUGGAGCUGACUGAUACUAAUAGGUCCAGGUUUUAAUCACCAA 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> SSTRAND_ID=CRW_00499; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.L.interrogans; ORGANISM=Leptospira interrogans GGUCAAGUAAGAAAGGGCGUACGGGGGAUGCCCGGGCAUCAGGACGCGAUGAAGGACGUGGCUUUCUGCGAUAAGCAACGGGGAGUUGUAAGCAAGCAUUGAUCCGUUGAUUUCCGAAUGGGGCAACCCUCUUGGUGAAUAACCGAGAACGCAAACGCGAGCAAAGUCGGGGAAUUGAAACAUCUUAGUACCCGGAAUAAAAGAAAAUAAGAAUGAUUCCGUCAGUAGCGGUGAGCGAACGCGGAAGAGCCUAAACCCCUGCCUACGUUACAGAUCUAAUUCGCUGUAGCAGGGGUGUUGUAGGACUGGCAGGAGUAGAUUAGAAUGCUCCACAAAGUUACCAAGCACAAGAUUAGCAGAACGGUAUUGGAAAAGCCGACCAUAGAGGGUGAAAGUCCUGUAAGCGAAAAUUUUGUGCCUUUGGCCAGUAUCCUGAGUACCACGGAACACGUGUAAUUCAGUGGGAAUCUGCGGGGACCACCCCGUAAGGCUAAACAGUACCUGAUGACCGAUAGAGAACAAGUACCGCGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCGGGGGACCGGAGUGAAAUAGUACCUGAAACCGUAUGCUUACAAGGUAUCAGAGCCUUUUAAUGGGUGAUGGUGUGCCUUUUGUAGAAUGAGCCGGCGAGUUAUUUUACGUUGCAAGCUUAAGGCAGUGAGAUGCCGUAGGCGAAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUAAAGUAGCGUGGAAUAGACCCGAAGCCUGUCGAGCUAUCCAUGUCCAGGUUGAAGGUGGGGUAAAACUCACUGGAGGACCGAACCCUUUUUCGUUGAAAAGAAUUGGGAUGAGGUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCCUAUCAAGGCAGGCGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGGUUUAGGCCUAGCGUCAGUUGUUUAGUUGCGGGGGUAGAGCUCUGAAAGGACUAGGGGGCCCACAAGCUUACCAAACCCUAUCAAACUUCGAAUACCGUAACUCCAAAGACUGGCAGUCAGACUACGGGGGAUAAGCUCCGUGGUCAAAAGGGAAACAGCCCAGACCGUCGUUUAAGGCCCCAAAGUUCAUGCUAAGUGGCAAAGGAUGUGGGGGCGCAUAUACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGCUCCCGCGCCGAAAAUGUAAUCGGGACUAAGCAUGGCGCCGAAGGCACGGAUUCCGUAAGGAGUGGUAGGAGAGCGUUCUUUCUUCCGUUGAAGGCGUACCGUAAGGAGCGCUGGAGGAGUAAGAAAUGAAGAUGCUGGCAUGAGUAGCGUAAAGGGGAGUGAGAUUCUUCCCCACCGAUAGCCUAAGGGUUCCCCGGGAAGGCCAAUCCGCCGGGGGUUAGUCGGCCCCUAAGACGAGGCUAAGAAUGCGUAGUCGAUGGGAAGCAGGUUCAUAUUCCUGCACCGAGUAAAUUGUGCGAUGGAGUGACGCAGGAGGAUAGUUAGUGCGGCUUAUUGGUUGCCGUUGCGAGUAGUAGGCAUUGAGAGUGAUUGGAAAAUCCGUCACUUGAGCUGAGAACUCGCGGGAUCCUAACGAAUGUUAGGCGUAGCUUUCGACUCCAAGCUGCCAAGAAAUAGCUUCUAAGUUUAGGUUUAUUCGACCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGGCAAGUAGAGAAUACUAAGGUGUUCGAGAUAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAUUACUCCUGUAACUUCGGGAUAAGGGAGACCGGAGAUGCUUUAGCCUGCGGCAAAGAGUAUCGAAGGUGGCACAAAAAUGGGGGUAGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGACUCUGCCAAAUCGGAAGAUGAAGUAUAGGGUCUGACACCUGCCCGGUGCUGGAAGGUCAAGAGGACGGGUUAGCAGCAAUGCGAAAGCUCGGAAUUUAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUGACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGUGUAACGACUUCCCCACUGUCUCAACGAGAGUCUCGGCGAAAUUGUAGUACCCGUGAAGAUGCGGGUUACCUGCGAUAGGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGUAACCUGGCAUUGAACUUUGGUCCUGUAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUAUGAAAUCUGGACGCCAGUCUGGAUGGAGCCGUCGUUGAAAUACCACCCUUACUUGACCCAAGUUCUAACCGAAUGAAACAACAUUCGAGACAAUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGCGCGGACGGAAAUCGCGCCAAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUAACUGUGAGACAGACAAGUCGAGCAGGUACGAAAGUAGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUCGCGUCCAAGAGUCCAUAUCGACGACGCGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCAUCGCAGGCGUUGGAGAUUUGACGGAAUCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGAACCUCUGGUGUAUCAGUUGUUUCGCCAGAAGCAACGCUGAGUAGCUAUGUUCGGCAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUAUAAGUGGGAAACCCUUCUGAAGAUAAGAUCUCCCUGGGAGCAAUCCCCUAAAGACCCCAAGAAGAUGACUUGGUUGAUAGGUCACAGAUGCAAGUGUGGUAACACAUUCAGUCGAGUGAUACUAAUCGGUCGUGAGGCUUGACCAU 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> SSTRAND_ID=CRW_00503; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.M.genitalium; ORGANISM=Mycoplasma genitalium 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> SSTRAND_ID=CRW_00508; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.N.meningitidis; ORGANISM=Neisseria meningitidis AGUCAAGUGAAUAAGUGCAUCAGGUGGAUGCCUUGGCGAUGAUAGGCGACGAAGGACGUGUAAGCCUGCGAAAAGCGCGGGGGAGCUGGCAAUAAAGCAAUGAUCCCGCGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACUGCAUUCUGUGCAGUAUCCUAAGUUGAAUACAUAGACUUAGAGAAGCGAACCCGGAGAACUGAACCAUCUAAGUACCCGGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCGCAAGUAGUGGCGAGCGAACGCGGAGGAGCCUGUACGUAAUAACUGUCGAGAUAGAAGAACAAGCUGGGAAGCUUGACCAUAGUGGGUGACAGUCCCGUAUUCGAAAUCUCAACAGCGGUACUAAGCGUACGAAAAGUAGGGCGGGACACGUGAAAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCAUCAUCGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGGAGGGAAGUGAAACAGAACCUGAAACCUGAUGCAUACAAACAGUGGGAGCGCCCUAGAGGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAACGACUUACAUUCAGUAGCGAGCUUAACCGAAUAGGGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCUUAAUAGGGCGAUGAGUUGCUGGGUGUAGACCCGAAACCGAGUGAUCUAUCCAUGGCCAGGUUGAAGGUGCCGUAACAGGUACUGGAGGACCGAACCCACGCAUGUUGCAAAAUGCGGGGAUGAGCUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCUAAACAAACUCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAACUAUUUAGGUAGUGCCUCGAGCAAGACACUGAUGGGGGUAAAGCACUGUUAUGGCUAGGGGGUUAUUGCAACUUACCAACCCAUGGCAAACUCAGAAUACCAUCAAGUGGUUCCUCGGGAGACAGACAGCGGGUGCUAACGUCCGUUGUCAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCCAAUGAUAGAUUAAGUGGUAAACGAAGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGUCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUCAAAUCUAUAACCGAAGCUGCGGAUGCCAGUUUACUGGCAUGGUAGGGGAGCGUUCUGUAGGCCGAUGAAGGUGCAUUGUAAAGUGUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGUUGACAUGAGUAGCGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGAAAGCCCAAGGUUUCCUACGCAACGUUCAUCGGCGUAGGGUGAGUCGGCCCCUAAGGCGAGGCAGAAAUGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGAUUCAAAUGCGAUGUGGGGACGGAGAAGGUUAGGUUGGCAAGCUGUUGGAAUAGCUUGUUUAAGCCGGUAGGUGGAAGACUUAGGCAAAUCCGGGUCUUCUUAACACCGAGAAGUGAUGACGAGUGUCUACGGACAUGAAGUAACCGAUACCACGCUUCCAGGAAAAGCCACUAAGCUUCAGUUUGAAUUGAACCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGGCAGGAUGAGAAUUCUAAGGCGCUUGAGAGAACUCAGGAGAAGGAACUCGGCAAAUUGAUACCGUAACUUCGGGAGAAGGUAUGCCCUCUAAGGUUAAGGACUUGCUCCGUAAGCCCUGGAGGGUCGCAGAGAAUAGGUGGCUGCGACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUCUGCUAACACGAAAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAUUGAAGAUGUGAGAGCAUCGGAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAUGGCGUAACGAUGGCCACACUGUCUCCUCCUGAGACUCAGCGAAGUUGAAGUGGUUGUGAAGAUGCAAUCUACCCGCUGCUAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUGUAGCUUUGCAUUGGACUUUGAAGUCACUUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGCAGAGACGCCAGUCUCUGUGGAGCCGUCCUUGAAAUACCACCCUGGUGUCUUUGAGGUUCUAACCCAGACCCGUCAUCCGGGUCGGGGACCGUGCAUGGUAGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCCAAAGCGUAACGGAGGAGUUCGAAGGUUACCUAGGUCCGGUCGGAAAUCGGACUGAUAGUGCAAUGGCAAAAGGUAGCUUAACUGCGAGACCGACAAGUCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGACAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUUCCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGAGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGUGAGCUGGGUUUAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCCUAUCUGCAGUGGCGUUGGAAGUUUGACGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGAACCUCUGGUGUACCGGUUGUAACGCCAGUUGCAUAGCCGGGUAGCUAAGUUCGGAAGAGAUAAGCGCUGAAAGCAUCUAAGCGCGAAACUCGCCUGAAGAUGAGACUUCCCUUGCGGUUUAACCGCACUAAAGAGUCGUUCGAGACCAGGACGUUGAUAGGUGGGGUGUGGAAGCGCGGUAACGCGUGAAGCUAACCCAUACUAAUUGCUCGUGAGGCUUGACUCU 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> SSTRAND_ID=CRW_00516; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.b.S.carnosus; ORGANISM=Staphylococcus carnosus GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCUGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGUAGCUGUAAGUAAGCGUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGGAACCCAGCACAAGUUAUGUUGUGUUAUCGACAUGUGAAUACAUAGCAUGUCUGAAGGCAGACGUGGAGAACUGAAACAUCUUAGUACCCGCAGGAAGAGAAAGAAAACUCGAUUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAAUGAGCUUGCUCAUUGGGGUUGUAGGACACUCUAUAUGGAGUUACAAAAGAAUCGAUUAGACGAACCGUACUGGAAAGUUGGACCAGAGAAGGUAAAAGUCCUGUAGUCGAAAAUCGAUUCUCUCCUGAGUGGAUCCUGAGUACGACGGAGCACGUGGAAUUCCGUCGGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGUACCCCGGAAGGGGAGUGAAAGAGAACUUGAAACCGUGUGCUUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUCUGAUGCAAGGUUAAGCAGCGAAUGCGGAGCCGCAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUGAGUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUGUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACGAGGGGCCCUUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUCAAUUUAACUUGGGAGUCAGAACGUGGGUGAUAAGGUCCAUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGCAAAGGAUGUGGUAUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUGUGGACUGUCCUUCGGACAGUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUCGAAGCAUGAUCGCAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAAAGAUGGGUGAGAAUCCCAUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCCGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCGCCAAGGAUCGUUUUAAGCGAUGGGGGGACACAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCUGUUGGAGUGCACGUCCAAGCAGUGAGACUGAAUAGUAGGCAAAUCCGCUAUUCUCAAGGUCAAGCUGUGAUGGGGAGAGGAAACAUGUUUCCUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGUCGAGAAAAGCCUCUAGCUAGUGAUUUGGCGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGAGCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUCACGCUCUGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUCAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUAGAAACGUGAGCGCCAGCUUACGUGGAGGCGUUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGAUUUCUAACCCGCGCCAUUUAUCAUGGUGGGAGACAGUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAGUGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACUUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGUCGUGGGCGCAGGAAGUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUAUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGACUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGGGGUGGAAGCAUAGCGAUAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCGAAGACUUAAUCCA 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> SSTRAND_ID=CRW_00520; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.c.C.reinhardtii; ORGANISM=Chlamydomonas reinhardtii UCAAAUGAAUUAAGGCGUACGGUGGAGACCUAGGCACUCAGAGACGAAGAAGGGCGCAGAUACCGGCGAUACGCUUCGGGGAGCUGGCAACAAGCUUUGAUCCGAAGAUUCCCGAAUAGGGCAACCUCAUAGAACUACCUAUAUAAUUCAUAGUUAGGUAAGAGGCAACCCAGUGAACUGAAACAUCUAAGUAGCUGGAGGAAAAGAAAGCAAACGCGAUUCCCGUAGUAGCGGCGAGCGAACCGGGAACAGCCUAAACCUAUGUCGCAAGAUGUAGGGGUCGUGGGAGGACAACAUAAAAAUCGCUAUUUUUAAUACGAAGCAGCUGAAUCCUGCACCAUAGAUGGUGAAAGUCCAGUAGUAAAAAGAAAAUUUAGAUUUUUGUCUAAUCCCGAGUAGCAUGGGGCACGUGAAAUCCCGUGUGAAUCAGCGAGGACCACCUCGUAAGGCUAAAUACUCCUGAGUGACCGAUAGCGAAAUAGUACCACGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCUGUUGGGGAGUGAAAUAGAACAUGAAACCGUAUGCUGACAAGCAGUGGGAGCAAGAAUGCUUGUGACCGCGUGCCUGUUGAAGAAUGAGCCGGCGACUUAUAGGGAGUGGCUGGGUUAAGGAGUAAAAUCCGGAGCCCAAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGCAAAUGGUCACUUCUUAUGGACCCGAACCCGGGUGAUCUAUUCAUGGCCAGGAUGAAGCUUGGGUAACACCAAGUGGAGGUCCGAACCGACCGAUGUUGAAAAAUCGGCGGAUGAGCUGUGAAUAGGGGAGAAAUUCCAAUCGAACUCGGAGCUAGCUGGAUCUCCCCGAAAUGCGUUGAGGCGCAGCGGUAACGAUGAACUGUCUUGGGGUAAAGCUACUGUUUCGAUGCGGGCUGCGAAAGCGGUACCAAGUCGUGGCAAACUCAGAAUACAAGACAUGUCUUCCGUAAACCAGUGAGACAGUGGGGGAUAAGCUUCAUUGUCAAGAGGGAAACAGCCCAGAUCACCAGCUAAGGCCCCUAAAUGGUCACUAAGUGGAAAAGGAUGUGAGAAUGCUGAAACAACCAGGAGGUUUGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUAAAGCGUUCUUGCGCCGAUAAUGGCCGGGACUAAGUGACCUGCCGAAGCUGUGAUAUAAUUUAUUAUAUAAAUUAUAGGUAGGGGAGCGUUCCGCUCUCGGGUGAAGUUUUCACGUAAGUGGGGAUGGACGAAGCGGAAGUGAGAAUGUCGGCUUGAGUAACGAAAACAUUGGUGAGAAUCCAAUGCCCCGAAAACCUAAGGGUUCCUCCACUAGGUUCGUCCAUGGGGGGUUAGUCAGGACCUAAGACUAGGCCAAACGGCGUCGUCGAUGGAAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACGAGUUAAAUUAUGAUCUGAGGGACGAAGGAGGCUAAGCUAGAACUGUUUUUGGAUUGCAGUGGAAGCGUUUAGACGUUGAGAGAUAGAAAAAAAGCUAUCUUGAGUGGAGACGUGAUCCCUAUUUGAUGGUUCGCCGUCGAGUAGCUAGUGAUGUCAUACUUCCAAGAAAAGCUCAUACAUCUUUAUAAUUUAAUGACCUGUACCUGAAACCGACACAGGUAGGUUGGUAGAGAAUACCAAGGGGCGCGAGAGAACUCUCUCUAAGGAACUCGGCAAACUGGCCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGCACCCAUCCGUAACAAGGUGGGUCGCAGUGACCAGGCCCAGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGGUCUCCGCAAAGUCGUAAGACAAUAUAUGGGGGCUGACGCCUGCCCAGUGCCGGAAGGUUAAGGAAGUUGGUUAUUUCGUAAGAAAAAAGCUGACGACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGUCGUAACUAUAACGAUCCUAAGGUAGCGAAAUUCAUUGUCGAGUAAGUUUCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCGGAGAGAGGCUCGGUGAAAUAGACUUGUCCCGUGAAGAUGCGGACUACCUACACCUGGACAGAAAGACCCUAUGAAGCUUGACUGUAUCUUGGAAUUGGGUUUGGGCUUUUCUUGCGCAGCCUAGGUGGGAGGCUAUGAAGAUUACCUUCCGGGGUAAUUAGAGCCGUCAUUGAGAGACCACUCUGGAAGAGCUAGAAUCCUAAUGGGGAUCCUUGAAUCAGGACCCUUGACAGUUUCAGGUGGGCAGUUUAUUUGGGGCGAAUGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGUGCAAAGGUUCCCUCAGUCUGGACGGAAAUCAGACAUUGAGUGUAAAGGCAAAAGGGAGCUUGACUGCAAGACCUACAAGUCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGCCUUAGUGAUCCGACGGUGCCGCGUGGAAGGGCCGUCGCUCAACGGAUAAAAGUUACUCUAGGGAUAACAGGCUGAUCUUCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGAAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUCGGUCUGUAGUAGGUCCGAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGUGGUACGUGAGCUGGGUUCAAAACGUCGUGAGACAGUUUGGUCCAUAUCCGGUGUAGGCGUUAGAGCAUUGAGAGUAGCCUUUCAUAGUACGAGAGGACCUGAAAGGACAUGCCAAUUGUGUACCAGUUCUCAUUCCAAUGGGAAACGCUGGGUAGCUACGCAUGGAUAGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGUAGGAAGCUAAACUCAAGAUGAGUGCUCUCUAAGGCCGCGGCUAGACAAGCCGUUAUAUAGGUAUCAGGUGUACAGUCAGCAAUGGCUUUAGCCGAGAUAUACUAAAGGCCGUUUGAUUUUGACCUU 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> SSTRAND_ID=CRW_00522; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.c.P.falciparum; ORGANISM=Plasmodium falciparum (plastid-like) AAUAUAUAAUUAAAUAUAUAUAAUAAAUUUAAAAGGAUGUCUAUAAUUUUUAUUAAAUAAGAAAGACGUUAUAUAUAUUAACGAAAUUUUUAUAAUAAUUAAUAAAAAUAUAUUUAUAUUUAUUAAUAAAUAUUAUUAUAAAAGUAUCUGAUAAAAUAUUUUUAUAUAAAUAUUUUAUUUAAAAACUUAAGGAAUUGAAUCAUCUUAGUACUUAAAGGAAUAAAAAGUAAUAACGAUUUUCAUAGUAGCGGCGAGCGAAUUGAAAAAAAAUAAACAUUUAAAAAAAUAUGUAAAAUUUUAAUAAAGUAAUAUAAUAUAUAAUUUUAUAUAAAUAAUAUAAAAAAUAAUAAGAAUUACCUUAUAAAAUUAAAUAUAAUAAAAGUUUAUAGAGAAAAGUACCGUGAGGAAAGAUGAAAAGAAUUUUGAAAAAAUAGUGAAAAGAAUCUGAAUUUUAAUUUAAAUAAAUUAUAAUAAAAUUUAAUUUUAAUUUUAUUAUAUUCUUGUUGAAGAAAGAAUUAGCAAGUUAUAAUAAAUAGUAUAAUAAUUAGGUUAAAUAUAUUUAAAUAAUGAAGCCAAAGUUAAAUCGAAUUUAUUUUUUUAAUAAAUUUAAAAUAUAUUAUUUAUUAUAGACCCGAAAUCAAAUGAUCUAAUUAUAUUUAAAAUAAAAUUUAAAUAAAAUUAAAUUAUAGUUUGAAUUGAUUACUGUUGCAAAAGUAUCAAAUAAAAUAUAAUUAGUGGUGAAAUGCCAAUCGAAUUUGAAGAUAGCUGGUUCUCUUUGAAAUAUAUGUAAGUAUAGUAUUUAUAUAUAAAUAAAUGUAAAACUCUUUUUUUAUUAGAUUAAUUUAAAUAAUUAAUAUUAAUAUUAAUAAUUUAAUAAUUUUAUUUAAUAAAAUAUAUAUAUUAUUAGAAAAUAAAGGAUAAGCUUUAUUUUCAAAAGGGAAACAGCCCUAAUUAUAAAUUAAGAUUUUUAAAUAUUAAUUAAGUUUUAAAAAGAAUAUAAAAUUAUAUUAAUAAUUAAAAAGUAAAUUUAGAAGCAGUUAUCUUUUAAAGAGUGCGUAAAAGCUCAUUAAUUUAAUAAUUUUAGUUCAAAAAUAAUCGAAAAUAAAUUAAUUAUCGAUAUUAUAAAAUUUAAUAUUAGUACAAUUAAAUUGGUAAAAGAGCGUUUUGAUAAAAUAUUAUUUAUAUGUAAAUUAAAAUAAUAAAAUCAAAAGUGAUAAUGCUAAUUUGAGUAAUGUAAAUAUUGGUAAAAAUCCAAUACUUCUAUAAUUUAAGGUUUCCUAUUUAUAAUUUUUUUUAAUAGGGUUAGUCGAAUCUUAAAAUGAGAUGAAACGUGUAAUUGAUAGAUAAUAAGUUAAUAUUCUUAUACUAUAUUAUAAUUUAUAUUUUAAGACUAAUAUUAAUAAUUUUAAUAUUAUUUAUAUUAUAUAAAAAUUAUUAAUAUAUUUAUUAUAAUAUAUUCGUACCGUAAACUGACACUAGUAAAUAUAUAUAUAUUAUUAAGAAGUUAAGAUAAUUUUUUUUAAGGAACUCGGCAAUUUAAUCUUGUAACUUAGGGAUAAAAGAUACUUUUUAGUUGAAAAUAAAAAAUUUAAGCGACUGUUUAACAAAAACACAAAUCUUUGCUAAAUUGAAAAAUGAUGUAUAAAGAUUGACAUCUGCCCAGUGCUAUUAUGUUAAAAUAAUAUAUGUAAUUAAAUUAUAAUAUAUAUAUAAGCUAUAGUAAACGGCGGCUGUAUCUAUAACGGUCCAAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCAUGAAAGAUGUAACGACUUAAAUGCUGUCUUAAAAAAAAUCUUAAUGAAAUAAAAUUAUCUGUGAAGAUACAGAUUUCUUAUAUUAGGACAGAAAGACCCUAUGAAGCUUUACUAUUAAUAAAUAAUGAAAAUAUAUAUAUUUAACAUAGUAUAAAUGGGAAACAAUAAUAUUAUUUUCUUGGAAAUAAUUUAGUUAAAAAUGAAAUACCAUUUUAUUUAUAUAUAAAUUCUUAUAGAAAUUUUAUAACAAAUUUUUAAACAAUAUUUAUGAGAUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAUAUAUAAACGGAGGAGUACAAUGUUAUAUUUAUUAUAUAAAGAUAUAAUAUAUAAUUAACUGUAAAAUUUACAAAUUAAACAGAGAUAAAUGUCGGUCUUAAUGAUCCGAUAAUUAUUUAGUAAUAAAAUUAUCGCUUAACGGAUAAAAGUUACUCUAGGGAUAACAGGCUAAUCUUUUCCGAGAGUCCAUAUUGACGAAAAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUUAUCGCAUCCUAAAGCAGUAGUAUGUUUUAAGGGUAAGUCUGUUCGCCUAUUAAAGCGAUACGUGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCAUAUCUAAUAUAAGUGUUAGAAUAUUGAAAUUAUUUUUUUUAGUACGAGAGGAUCAAAAAAAUUAUACCAAUGAUAUAUCAAUUAUAAAAUUUUUUUGUAAAGUUGAGUAGUUAAGUAUAAAAUUUUAAUUGUUGAAGUAAUAUAAAUAAGAAAAUUUAGUUAAAAAUAAUAUUCUAAUCAUAUAAAUGAAUAAAACAAUAAUUAGAAAAAUUAUUUUAUAGGAUUAGUAUGUAUUUAUAGUAAUAUAUUUAGUGUAUAAUUCCUAAUAAGUUGAAUAUUUAAUUA 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> SSTRAND_ID=CRW_00530; TYPE=23S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.233.m.A.caerulea; ORGANISM=Albinaria caerulea AAAUCUAAAUAUUAACAAUACUGGUGAAGAUCAACAUAAAAAGUAAAACAUACCUUUUGCAUAAUGGUGAUACUAAAUUUAUUCUAAGAUUUUAUAUUUCCCGAAAAUAAAAGAUCUAACUUUUCAUGCGAAAUUAUUAGAACACAAAAUCUAUUGUGGCAUAAAUAGACCUCAAUGAAAAGUUAGUAGUGAAACACUUUCACUUUUAUUGAUAUCUGGAUAUAGAAUAAAUAUAUUUAGUAUAUAAAUACAUUCUUAAAGCGAUAAGGUUUUAAGCGAAGAAUUUUAUAUAACAGUAAAAAUUUCUAAUUAAUAAUAUUAACUGGUAGUUUUAUUGAUAUACAUAUAUUUAUAUAUUAAAUUCCUUGAAAUUCUAUUUAUAUAUUACAACCGGUCAGUAUACUAAUAAUGUAUCAAUUAGUAAAUAGGUAUAAUAAAUAUUAGUAAGGAACUCGACAAAUAAUUGCUUACGACUGUUUAUCAAAAACAUAGCCAAAAGUAGAUAUUUUUGGUGUUAUCUGCCCAGUGAAAAAUUUUAACGGCCGCAGUACCUUGACUGUGCAAAGGUAGCAUAAUAAUUUGACUUUUAAAUGGAGCCUAGAAUGAAAGAAAGAACGUAUGCAACUUGUCUCAUUGAUAUUACUUUAAAUUUAAUGGUUGAGUGAAAAUACUCAUAAUUUUAAUAAUAGACGAGAAGACCCUUAGAAUUUUUAAAAGCAAUAAGUAAUUCUUAUUAGAUUUUUUGUUGGGGCAACAAUAUUUCAAAUAAUAAAUAUAUUAAUGAAAGUAAUAAGUCGAUUAAAUAAUUAUAGAAAAAUUACCUAAGGGAUAACAGCAUAAUUUUAUUAAUAAGCUUGUGACCUCGAUGUUGGACUAGGUACUAUUAAGGCUAAUCGUUUUAAUAUAAUAUGUUCUGUUCGAACUUUGUUACCUACAUGAUCUGAGUUCAGACCGGCGUAAGCCAGGUCAGUUUCUAUCUUUUAUCUGGCCUAUAAUAGUACGAAAGGACCUUAUAGGCACUUAUUCAUAAGUAUA 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> SSTRAND_ID=CRW_00557; TYPE=5S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.5.b.G.stearothermophilus.2; ORGANISM=Geobacillus stearothermophilus CCUAGUGGUGAUAGCGGAGGGGAAACACCCGUUCCCAUCCCGAACACGGAAGUUAAGCCCUCCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGCCAGCGCCCCUGCAAGAGUAGGUCGCUGCUAGGC ((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((....))))).))....)).))...)))))))). 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AGAAAACUGAGCCUUAGUGGAGAAAUCCGCUAAGUGGAAGCUCUCAAACUCAGGGAAACCUAAGUCAGCCUCAAUCAGAUACCCCAGGGUUAUGGUUGAGGAGAUAUGGCAAUCCUGAGCCAAGCCGUUUGAUAGCAAUGGCUAUCUGGUUCUUCAAGCGGAAGGUGCAGAGGCCCGACGGAGCUACCCUAACGUCAAGUCGAGGGUAAAGGGAGGGUCCAAUCCUCAAAGCCCGCUGAGGCUCGGAGCAGCGAAAGUUGUGGGAGGGUG ((....))....(((((((((....)))))))))...............((((((...((...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))..))...))))))(((...((((((((.(((..(((....))))))..))))))))..)))...(.(((((........((((((..((......))))))))......)))))).((((((....................(((((....)))))..)))))). ......((((((((((((((.....((((((....((((.........(((((((...((........(((((((((...(((....)))..)))))))))......))...)))))))((((((((((.......)))))))...)))))))...))))))(((....(.(((((..(.....((((((..((......))))))))...)..))))))...)))......)))))))))))))).(((((....)))))......... ............(((((((((....))))))))).....((((((...(((((((...((...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))..))...)))))))...(((((((.......))))))).((((..(((((.....)))))..)))).(((((.(((.((.(((((..((......))))))).....(((((.....)))))...))))).)).))).....(((((....)))))..)))))). ......((((((((((((((.....(((((...))))).((((........(((....)))..(((..(((((((((...(((....)))..)))))))))......(((....(((.(((...((((((((((((....)))).........))))))))..))).)))..))).))).))))((((((.((.....))..))))))....(((((.....))))).....)))))))))))))).(((((....)))))......... ......((((((((((((((.....((((((.)))))).(((((....(((((((....(((((((..(((((((((((.((((..))))))))))))))).)))))))...)))))))...(((((((.(....)))))))).((((..(((((.....)))))..))))........)))))((((((..((......))))))))....((((((...)))))).....)))))))))))))).(((((....)))))......... ...........((((((((((....))))))))).)...((((((..(((.(((....))).)))...(((((((((...(((....)))..)))))))))......(((........))).(((((((.......))))))).((((..(((((.....)))))..)))).(((((.(((.((.(((((..((......))))))).....(((((.....)))))...))))).)).))).....(((((....)))))..)))))). ...........((((((((((....))))))))).)...((((((...(((((((...((...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))..))...)))))))...(((((((.......))))))).((((..(((((.....)))))..)))).(((((.(((.((((((((..((......))))))).....(((((.....)))))..)))))).)).))).....(((((....)))))..)))))). ........(((((((((((((....))))))))).....)))).....(((((((...((...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))..))...)))))))((((((((((.......)))))))...)))..((((.(((((.(((......(((((........((((((..((......))))))))......)))))....)))......)))))))))(((...(((((....)))))....))).. ......((((((((((((((.....(((((...))))).(((((....(((((((...((...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))..))...)))))))...((((((..(....).))))))..(..............)..((.((....))))...)))))((((((.((.....))..))))))....(((((.....))))).....)))))))))))))).(((((....)))))......... ........(((((((((((((....)))))).................(((((((....(...(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))...)...)))))))....((...............))...............................(((.........(((((............))))).......)))....................)))))))...(((((....)))))......... ......(((((((((((((((....)))....................(((((((...(....(((..(((((((((...(((....)))..))))))))).)))...)...)))))))............(((((....)))))...........................((((........((((((............))))))......))))................)))))))))))).(((((....)))))......... > SSTRAND_ID=CRW_00630; TYPE=Group I Intron; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=a.I1.e.A.capsulatus.G184B.C1.SSU; ORGANISM=Ajellomyces capsulatus AAACACUUGCAUGUUUUGCCGCAGCAACUCUGCGCCGAAAAGCAGCCUGAAAGGGUGAUGUGGUGCCCUUGGACAAAAAUAUUAAAUGCUAGUCCGGCCUUCUCACAGGCUGGGCGACACACUCAAAUUGCGGGAAACCCCUAAAGCCUUCACUACCAAGCUUGUGUUUCGAAAGGACAUGGUGGCCAGGUUAAUUGCCUCGGGUACGGUCACAACGUGAAGGAUGUUCCAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCCCCUACGUGUGGUGUCCGUAAUACAGACAUUCCAUAUGGGGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGGUGUGGGUGCGUUACUCUCGAAGUGACAAGCUUAAGAUAUAGUCCGGCUUCAGUAGAAAUGCUGGAGAUCAGGUUCCACCUGUGAUUAAAACGGgagccugcggcuuaauuu (.....((((.(((......)))))))...).........((((((((....))))(((((.................)))))...)))).(((((((((......)))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((.(((.(((....)))))))))..((((((.....)))).))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((...((((...(((.((((((.((...)).)))))).)))..))))..))).............)))))))(((..((((((.....))))))..)))...............((((((((....))))))))..(((((...))))).............................. 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guaacaagguUUCCGUAGAAAGUACGAACGAAUUUAAUGAUUCUUCUGCGGUUGAAACUUAUCGAAGCCUUAGUAGCCUGAAAGGUGCUUUGCGCGACUAUAAACAAUGACGAAGCUUAAAUGCUAGUGAAGACAGUGUUCGCACUGAAUAAUCUUUGCAAAACCAUCGAAUUGCGGGGACGCCCUUAGAGCUUCACGUACGGCCAAUCGUUCGAAAGGAUUGAUUUGGCAUCAGGUUAAUGGCCUCGAGUAUCGUAAUAACCGUGAAGAUUGGGUAAUCCGCAGCCAAGUGCUAAACAAGUAUUGGUAAACUCUACUUGCAUGCUAAUGGUUCACAGACUAAGUGAUGGUUGGGGAGAUGUCUAGUCUCUCUUAAGAUAUAGUCGGGCACCUCGGGAAACCUUGGUGGUAAUUCAACUGUGAAUAUGCUCUAGUUUCGGCUAGUUCAUAUCAAUAUGAGAUAACUGu .....((((((((......((((.(((.((..................)).)))..))))...))))))))((((((((...))))((((((..................)))))).....)))).(((((((...(((((.....))))).)))))))..(((((((....((((((....(((......(((((((((((.((((((((((....)))).)))).))..(((((.......))).))....)))....).)))))))...)))...))))))(((...(((....((((((...........))))))...)).)..))).............)))))))((((((((.....)))))))).............((((((..((....))..))))..((((...(((.((((........)))))))..))))((((....))))......)).. 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Lab CRW; EXT_ID=a.I1.e.C.grayi.UNK.SSU.1046; ORGANISM=Cladonia grayi gagcucuuucuugauuuuguggguGUUUGCCAAUGCAGCAUUGCCCAGUAUAGCCUUUAGCUAGUCCGCUCCGGCGGGCCACAUCCUCCCUGUGCUGAAAGCCUUCCCCUUACAGGGGCGGUAUCAGCAGCCAAAGAAUGCCAGCGCGGCUUCUUCGGUUCACAGACUAGGCGAGUGAUGGGCUGAGCCCUUAGGGGUCUCAGUUCGAGAUAUAGUCGAGCCCCAGGGUCUAAGACCUGGGUGUUUGCGgguggugcauggccguucuuaguugguggaguga ...................((((((..(((.......))).))))))...((((.....))))((((((....)))))).............((((((..(((..(((((...))))).))).))))))(((.(((((.(((.....)))))))).)))...(.(((((..........(((((((((((....))).))))))))......)))))).((((((((........)))))).....))................................... ..(((((...((((((....(((((...((((.....(((((((((....((((.....))))((((((....))))))..((((((((((.((((((..(((..((((.....)))).))).))))))(((.(((((.(((.....)))))))).))).........))).))).))))((((((((((....))).)))))))...........(((((((((((........)))))).))))).))))))))).)))))))))..)))))).))))).. 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UAAAGGUUUGGUCCUGGCCUUUUUAUUAGUUGGUAGUAAAAUUAUACAUGCAAGUUUCAGCAACCCAGUGAGAAUACCCUUUAAAUCUGCUAGAUUAAUAGGAGUAGGUAUCAAGCACACCAUUAGGUAGCUAAUAACACCUUGCUUAGCCACACCCCCACGGGUUACAGCAGUAACAAAAAUUUAGCAAUUAACGAAAGUUAGACUAAGUUAUACUACUCUAGGGUUGGUAAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCAUACGAUUAACCCAAACUAAUAAAUACCGGCGUAAAGCGUGUUCAGGGGAAACAAAACAAUAAAGAUGAAAUAUUUCUACACUGUAAAAAGUUAUAGAAGUACUAAAAAUAUACUACGAAAGUGACUUUAUUACACCUUACAACACGAUAGCUAAGACACAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACUUUAAUAAUUUAAAACAAAAUUAUUCGCCAGAGAACUACUAGCAAUAGCCUAAAACUUAAAGGACUUGGCGGUGCUUUAUAUCCACCUAGAGGAGCCUGUUAUAUAAUCGAUAAACCCCGAUAAACCUCACCACUUCUUGCUAAUCCAGUCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUUAAAAGGCAAAACAGUAAGCUUAAUAAUUUCCAUAAAAACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCUAUGUAGUGGUAUUCAAUGGGCUACAUUUUCUGAUCCAGAACAUUCUUAACGGAUAUUUUUAUGAAAUUAAAAAUUAAAGGAGGAUUUAGUAGUAAACUAAGAAUAGAGAGCUUAGUUGAAUUAGGCCAUGAAGCACGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAACUAUAUUCUAUUAAACAUAUUUUAUCCUAAUAAAUACAAGAGGAGAUAAGUCGUAACAAGGUAAGCAUACUGGAAAGUGUGCUUGGAAAACU 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EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=b.16.m.A.mississippiensis; ORGANISM=Alligator mississippiensis AGAAUCUUGGUCUUAAAUCUCCUAUUACUUUUCCCCCUAAUUAUACAUGCAAGACUCCCCACAACAGUGAAACAGCCCACCAUAACAGGUUUGGAGCCGGUAUCAGGCAACCGCCCAAGACGCCAAGCAAUUCAGCCACACCCCCACGGGUCCACAGCAGUAGUUAAUAUUAGGCCAUAAGCGAAAGCCUGACCUAGUAAGGGGGACACUAGGGCCGGUUAAUCUCGUGCCAGCGACCGCGGUUAUACGACAGACCCAAAAUAAUAGAUACGGCGUAAAGCACGACUAGUACUGACGUCCCUACACCUAGGGAAGAAUAACCCCAGGCUGUAAAAAGCCAUAGGCAAUAAGAACCAUAUUCCCUAACAACAAACAACUACAACUCGUGAAAGCUAGGACAUAAACUAAGAUUAGAUACCUUACUAUACCUAGCUGUAACACAAUAAUCAAACAACCUAUUAUUCGCCAAAUAACUACGAGCAAUAGCUUAAAACUCAAAGGACUUGACGGCACUUUAAACCCCCCUAGAGGAGCCUGUCCUAUAAUCGACAGUACACGUUACACCCGACCACCUUUAGCCUACUCAGUCUGUAUACCGCCGUCGCAAGCCCGUCCCAUUUGAGGGAAACAAAACGCGCGCAACAGCUCAACCGAGCUAACACGUCAGGUCAAGGUGCAGCCAACAAGGUGGAAGAGAUGGGCUACAUUUUCUCAACAUGUAGAAAUAUUCAACGGAGAGCCCUAUGAAAUACAGGACUGUCAAAGCCGAUUUAGCAGUAAACUGGGAAAGAAUACCUAGUUGAAGUCGGUAACGAAGUGCGUACACACCGCCGGUCACCUCCUCGAACCCAACAAAAUGCCCAAACAACAGGCACAAUGUUGGGCAAGAUGGGGAAAGUCGUAACAAGGUAAGCGUACCGGAAGGUGCACUUGGAACAU 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TYPE=16S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=b.16.m.C.parallelus.NOR; ORGANISM=Chorthippus parallelus UAGAAGUUUUAUUCUUGCUUAUUUAUUCAUUUUUUUCUUUGUAUUAUAUGCAAGUUUUUUUAGACUAAAAGUUCUUUUUGCAGUGAUUUAAUUUAAUUAUCAAGUGAUUUUGGAAUUAGCAAUUGAUUUAGUAUUGGCAUAUUUCGUGCCAGCAGCCGCGGUUAUACGAUUAAUGCAAGUGAAUAUAUUUGGUUAAAACAGUUAUUUUAUGAUUUUAGGAUUAAUUUAUAAAUUUUUAAGGUGGAAUUUUAAUUUUAUUUGUGAUUCUUAUUAUGAUUCUGUGAAACUUAGAUAAUAAACUAGGAUUAGAUACCCUAUUAUUUUAAGUGUUAAUCAUGUUUACCAGGGUAGUAUUAGUUAGGAUCUUAAAACUCAAAGAAUUUGGCGGUAUUUCAUUCCAUUUAGAGGAACCUACCCCGUAAUUGAUAAUACACGAUUAACUAUACUUAAUUUAUUUGUUUGUAUAUCUCCGUUAUCAGAAAAUCUUUAUUGGAGUUAUAAUUUUCUUGAUUUAUAAUUAUAAAAUAUUUCAGGUCAAGGUGCAGCUUAUAUUAAGAGGAGGUGGGUUACAAUAAAUUUAGUUAUACGUAUUUAAUGGUGAAAGACUAUUAAUAAAGGUGGAUUUAAUAGUAAUUUGAUUUAUUUAAUUCAAUUGAUUUUGGCUCUGAGGUGUGUACACAUCGCCCGUCACUCUCAUUAUUGAUUAAUCUAUUUUAAUUUAAAGUUAGUUUCAGUUUAGAUGAGAUAAGUCGUAACAUAGUAGAUGUACUGGAAAGUGUAUCUAGAAAGUUUAC 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AAAAUUUUGAGUUUGAUGAUGGCUCUGAUUGAACGCUGUCCAAGUACUUGACACAUGCUAAUCGAACGACUAAUUAGUUAUUAAACUAAGUAGUAGUGGUGUACAGGUGAGUAAAAGAUAAUUUGGCUACCUUAAAGUAAGGGGAAAAAUCCCUUAUAAAAAGAAAGGAAAAAGAAGGUCCGCUUUAAGAUGUUAAUUAUUAUCACGGUGAGUAGUAGUAAAGGUAAUGACUUUACUAGCUAAAUCCGUAGUCGUGACUGAGAGGUCGAUCGACCACAUUGGGUCUGAAAAAACCCCAAUGCGUUUUAGUACAGCAGUGAGGAAUAUUGGUCAAUGGCCGAAAGGCGAACCAGUAACUUGGAAGAAUGAAAGUGUAUUAUAAUAAUACAAUAACGAUUAUAUCGUAUAAAAUUCUAAAUAGAAUAAUGAUAAUGACAAUUUUCUAUUUAUAAGUCUUGACCAAACUACCUGCCAGCAGUCGCGGUAAUACGUAGAAGACUAGUGUUAAUCAUCUUUAUUAGGUUUAAAGGGUACCUAGACGGUAAAUUAAACUCUAAAUGAGUACUUAUUUACUAGAGUUUUAUGUAAGAAGGAAGAAGCUCUGGAGUAGUGAUAUAAUACGUAUAUACCAGAGAGACUGGUAACGGCGAAGGCAUCCUUCUAUGUAAAAACUGACGUUGAGGGACGAAGGCUUGGGUAGCAAGAAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCAAGCAGACAAUGAUGAAUGUCAUAGACUAGAAAAAGUCGUUUAGACUAUAAAUUUAGUCUAUAAAUGAAAGUGUAAGCAUUCCACCUCAAGAGUAAUAUGGCAACAUAUAAACUGAAAUCAUUAGACCGUUUCUGAGACCAGUAGUGAAGUAUGUUAUUUAAUUCGAUGAUCCGCGAAAAACCUUACCACAGUUUGAAUAUUUUACAAGCGCUGCACGGCUGUUUUUAGUUAAUGUCGUGAGAUCUGGUUAAGUCCUUUAAUUAACGAAAACCCUCACUUUAUUUGCAUUUAUAAAGUUGAUCGCCUUUAUAUUGGUUAGAUAAUAGGGAUUAAGACAAGUCAUCAUGGCCUUAAUACUGUGGGCUAUAGACGUGCCACAUAUGCCUUUACAAAGGGAUGCGAUUUUGUGAAAUUGAGCUAAUCCCCCAAAAAAGGAUAUAAUAUGGAUUGUAGUCUGUAACUCGACUACAUGAAUAAGGAAUUACUAGUAAUCGUGAAUCACCAUCGUCACGGUGAAUUAAAAAUCAGCUGGGUACUAACCACUCGUCAGGCGCUGAAAGAAGUAUGUGCAAGAAGUUUGAUUUACUUAUAUUUAUAAUAUAUAUAAUCAGUUAUAUAUAUUUAUAAGUUAAAUUUUCGCAUGCAUGACUUUGAUUGGUGUUAAGUCGAAAUAUGGUUCGUGUAAUGGAAAUUGCACGGGAUGAAUUA 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> SSTRAND_ID=CRW_01344; TYPE=16S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.16.e.V.corneae; ORGANISM=Vittaforma corneae CACCAGGUUGAUUCUGCCUGACGUAGAUGCUAGUCUCUAAGAUUAAGCCAUGCAUGUUUCCUCAAUCAGGGACGAAUAGCUCAGUAAAACUGCGAUGAUUUAGUCUGGCUGUGUAGAUAACACGUGAAAAUGUAGCUAAGGGAAGGCAGAAUAAGACGCAGGACUAUCAGUUAGUUGGUAGUGUAAUGGACUACCAAGACAGUGACGGUUGACGGGAAAUUAGGGUUUUGUACCGGAGAGGGAGCCUGAGAGAUUGCUCCCACGUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGAAAAUUGCCCACUCUUUGCAGGAGGCAGUUAUGAGACGUGAAGAUGAGUAUCUUGUAAAGAGGGAUAGGAGAAUUGGAGGGCAAGUUUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACCGACUCCAAGAGUGUGUAUGAGAGAUGCUGCAGUUAAAAAGUCCGUAGUCAUAGAAGGGCAAAGAGAGAUGCGAGGUCUCACAGUGCGAUGAUGGAGGAGCCGAUGGGGAACAUAGUAUACCAGGGCGAGAGAUGAAAUGCCAAGACCCCUGGUGGACUGAGCGAGGCGAAGGCGAUGUUCUUGUAGGCAUUCGGUGAUCAAGGACGAAGGCUGGAGUAUCGAAAGUCAUUAGAUACCGCAGUAGUUCCAGCAGUAAAAGAUGCCGACAUGCUCAUUGGACACAGUGGGCAGGGAGAAAUCUUAGAGUUCGGGCUCUGGGGAUAGUAUGCUCGCAAGGGUGAAAAUUAAAGAAAUUGACGGAGCUACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUUAAUUUGACUCAACGCGAGGAAACUUACCAGGGCCAAGUACUUGUGUAGAAACGAGCAAUACAGGAGUGGUGCAUGGUCGUUGGAAAUUGAUGGGAUGACUUUGACCUUAAAUGGUUGAAUGAGUGAGAUCUUUUGGACAUGUUCCGCACGGAACAGGAAGGAAAAGGCUAUAACAGAUCCGAGAUGCCCUCAGAUGCCCUGGGCUGCACGCGCAAUACAAUAGCAGGUAGAGAGAGAGACAGGAAGGUGCUCAGAUGGACUAUGUGCUGUAAGGCACAUACGAAAGAGGAAUUCCUAGUAAGUGUGUAUCAACAAUGGAUAUUGAAUAAGUCCCUGUAGCUUGUACACACCGCCCGUCACUAUCUCAGAUGUUUUUCAGGAUGAAGAGUCCAGGCUCUGAAUAAUGAAAAGUAGAUAAGAUGUAAGUCGUAACAAGGUUGCGGUUGGUGAACCAUUAGCAGGAUCAUAA 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(((((((((......((((((.......(((..............)))........))))))...((((((......(((((.(((....))).)))))....))))))))))))))).. > SSTRAND_ID=CRW_01572; TYPE=5S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.5.e.H.sapiens.1; ORGANISM=Homo sapiens AUCUAUGGCUGUACCGCUCUGAACGUGCACUAUCUCUUCUGAUCUCAAAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUGGAAUGGGAGACCACAUGGGAAAACUGGGUGCUGUAGGCU .((((((((....(.((((((.....((...(............).....))....))))))..).(((((......(((...(((....)))..))).....))))).)))))))).. .(((((((((((((..........))))).........(((((((.............)))))))((((((((....(((...(((....)))..)))...)))))))))))))))).. .((((((((......((.........))..........(((((((.............))))))).(((((((....(((...(((....)))..)))...))))))).)))))))).. .((((((((.((((..........)))).....(((......(((((...(((((.((((......)))).))))).......(((....)))..))))).....))).)))))))).. ..(((((((...(((...(....((((.......(((((((((((.(...((((((((((......))))))))))..))))))))))))...))))........)))))))))))... .((((((((......((.........))..........(((((((.............))))))).(((((((....(((...(((....)))..)))...))))))).)))))))).. .((((((((......((.........))..........(((((((.............))))))).(((((((....(((...(((....)))..)))...))))))).)))))))).. .((((((((....(((.......((((.......((((((.((.(((...(((((.((((......)))).)))))..))).))))))))...)))).......)))..)))))))).. .((((((((.((((.(.......)))))......(((((((.((.((...(((((.((((......)))).)))))..)))).)))))))......((.....))....)))))))).. ..(((((((.............................(...........(((((.((((......)))).))))).........).......................)))))))... ...................................................((((.((((......)))).))))............................................ > SSTRAND_ID=CRW_01578; TYPE=5S Ribosomal RNA; EXT_SOURCE=Gutell Lab CRW; EXT_ID=d.5.e.Hemicentrotus.sp; ORGANISM=Hemicentrotus sp. 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((((((((....(((.(((((................(((((.....)))))............))))).)))......)))))))).. > SSTRAND_ID=RFA_00606; TYPE=Ciliate Telomerase RNA; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00025 M33461.1/346-140; ORGANISM=Moneuplotes crassus GGAUAUAGGGUAGUUCUCCAUUGACUAAUCCGUCAAAUCUGUCAAACAAAACCCCAAAACCGAUCAAUAGGUGCGUUUAGCUUGAUUACACCUCUUAAAUGAAAUCUUGCAAUUCUGGAGAGCUUGAGAGGUGAAACCCCCACAGUUAGGUCAAACAUAGUUUGAGAUUUGUAUCUCAUAUGCUCUAGCUGUCCUCUCAUCUUUUUG .....(((((........((.(((........)))....))..........................................((((.((.........)).))))......))))).........(((((..........((((((.((.((..........((((......))))...)).)).))))))))))).......... ...........((((((((((((((......)))))......................(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))........ ...........(((((((((.((((......)))).......................(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...(((((......))))))))).))))))))))))))))........ ...........((((((((((((((......)))))......................(((........))).......((..((((.((.........)).))))..)).....)))))))))(((((((..........(((((((((.....((((...((((((....)))))))))).))))))))))))))))........ ...........((((((((((((((......)))))...............................................................................)))))))))(((((((..........((((((((((....((((...((((((....)))))))))))))))))))))))))))........ ............(((((((.(((((......)))))......................(((........))).......((..((((.((.........)).))))..))......))))))).(((((((..........((((((((((........((.((((((....)))))).)))).)))))))))))))))........ 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(((((((((((.(((..........))).......................................(.(((((((...((....))...))))))).).)))))))))))...(((((.......(((((((((((...........(((((...)))))..)))))))))))..)))))......... > SSTRAND_ID=RFA_00617; TYPE=Ciliate Telomerase RNA; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00025 U45434.1/327-113; ORGANISM=Paramecium primaurelia UGACAAUCAUUAUGUUCAUUCUUCCUCUCCAAUAGGAAAGGAAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUAAACACACCCUGAGUAUUGCUACAUUCAUUGUAGCGUUAAUCCUCUUGGCUAUUCUCGUAACGAUUGUCAAAUUUAGAGUGCUUAUCGUCAAAAACCAGCAAAUCAUGACGAGUCAUAAGUGCUCUAAAUAGUUAUUUUUAUAUUUUUU ......(((...........(((..(((......)))....))).....................................(.((((((.......)))))).)........))).........(((.((((.....(((.(((((.......((((...............))))...........))))).))))))...).)))........ ((((((((.(((((......((((((.(((....))).)))))).............................((..(((.(((((((((.....))))))...))).)))..)).......))))).)))))))).((((((((((((((((((((...............)))))....)))))))))))))))................... 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((((((((.((((.......((((((.(((....))).)))))).......................................(((((((.....))))))).....................)))).)))))))).((((((((((((((((((((...............))))))....))))))))))))))................... > SSTRAND_ID=RFA_00621; TYPE=Ribonuclease MRP RNA; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00030 AY090598.1/305-1; ORGANISM=Saccharomyces bayanus AUCGUCACUAAUCGAAGCUUACAAAAAUGGAGUAAAGGAAUUUUUCUUCUUACUCAAUAUUAAUGCUUUGGGUUGAAAGUCUCCCACCAAUUCAUAUGCGGAAAACGUAAUGAGAUUUAAAAAAUUUAAAUUCUUUAAAUCAACUCAUUAAGAGAAAUAUCUUUAGAUAUUUCUCUUCUUGACCCAGUACUCUGUUACAGGAGCGCUGGUGUUUUCUUCGGUACUGGAUUCCUUAUAUAUGGAAUCUAAACCAUAGUUAUGACGAUUGCUCUUUCCCAUGCUGGAUCGAGUAACCCAAUGGAGCU (((((((....(((((((...........((((((..............)))))).........)))))))...................(((......))).....((((((((((((((((.(...).)).)))))))...))))))).(.((((((((....(.(.(........((......(........)....))).).))))))))).)...........((((........))))...............)))))))..(((..(((......)))..)))............... .((((((.......((((...........(((((((((((...))))).)))))).........))))((((..........)))).............(((((((.......((((((((.(((....))).))))))))...(((..((((((((((((....))))))))))))..))).(((((.((((......)))).))))).)))))))..(((..((((((((........)))))))).))).......))))))((((((..(((......)))..))))))............ 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TYPE=RNase E 5 UTR; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00040 AF259267.1/374-37; ORGANISM=Yersinia pseudotuberculosis AAUUCUACGUUGAUUCUCGUUAGACCAAGAGACUUGUGGAAUAAUAAACUUUGCCUGAUCACACAAAAACGCGGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGUGAAAUCAAGCAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAGUGGGUAAAGCUCUGUUGUCUUAAAUUCAGAAGCUACCCUUUAUAUAAAAGCGCUGUUUUUCAGAACGAAACACAGGCUUACCGAAAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGGCUUAGCUAGAAGACUCGGGGCCAUCGGUUUACCCGGUCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGUUCUAACGCCAA .(((((((.....((((..........))))....)))))))........((((.(((...((((...(((..((....))......)))..))))...))).)))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....((((............))))...)))))..........(((.((((.((((.....)))).))))))).(((((........(((((........((.(((((....))))).)).................)))))..)))))....)))))))............)))))))))))......... .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...((((.(((((......((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))............((((........)))).(((((....))))).))))).))))....(((.((((............))))))).............)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((.....((.(((((...((((.((.(((((....))))).)).))..)).((....)).))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((.....((.(((((...((((.((.(((((....))))).)).))..))..((....))))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))..)))))). .((((((((...(.((((..........)))).)))))))))........(((((((((((((.....((((.......)))).........))))..)))))))))(((..(((((((((((...(((((((((((..(..(((((..((((((............)))).))))))).).......((((.(((((((((.....)))))))))))))(((((.....((.(((((...(((((((((((((....)))))))).))).))..........))))))))))))....)))))))...)))).....))))))))))))))...... .((((((((.....((((..........))))..)))))))).........((((.................)))).((((((.........(((........)))......(((((((((((...((((.(((((......((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))............((((........)))).(((((....))))).))))).))))....(((.(((((((...)))...))))))).............)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((((............)).)))))((((((.(((................((.....))..(((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((.....((.(((((...((((.((.(((((....))))).)).))..)).((....)).))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))).)))))). .(((((((...((.((((..........)))).)))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...(((((((((((.....(((((..((((((............))).)))))))).........((((..((((((.......))))))...))))((((.....(((.(((((...((((((..(((((....)))))...)))).))..........))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..)))))))).........((((.................)))).((((((.((.((....((........))......)).(((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............)))).)))))))..........(((.((((.((((.....)))).))))))).(((((.....((.(((((...(((((((.(((((....))))).)).))).)).((....)).))))))))))))....)))))))...)))).....))))))))).)).)))))). ..((((((......((((..........))))...))))))......................................((((..........((........))........((((((((((.......(((((((.....((((..(((((((............)))).))))))).........((((.((((.((((.....)))).)))))))).((..........(((((...((.(.((.(((((....))))).)).)...))..........)))))....)).....)))))))............))))))))))...))))... ..((((((......((((..........))))...))))))...........((.(((.........................................))).))........((((((((((.......(((((((.....((((...((((((............)))).)).)))).........((((.((((.((((.....)))).)))))))).(((.........(((((........((.(((((....))))).)).................)))))...))).....)))))))............)))))))))).......... > SSTRAND_ID=RFA_00629; TYPE=RNase E 5 UTR; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00040 AJ414149.1/78440-78777; ORGANISM=NULL AAUUCUACGUUGAUUCUCGUUAGACCAAGAGACUUGUGGAAUAAUAAACUUUGCCUGAUCACACAAAAACGCGGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGUGAAAUCAAGCAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAGUGGGUAAAGCUCUGUUGUCUUAAAUUCAGAAGCUACCCUUUAUAUAAAAGCGCUGUUUUUCAGAACGAAACACAGGCUUACCGAAAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGGCUUAGCUAGAAGACUCGGGGCCAUCGGUUUAUCCGGUCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGUUCUAACGCCAA .(((((((.....((((..........))))....)))))))........((((.(((...((((...(((..((....))......)))..))))...))).)))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....((((............))))...)))))..........(((.((((.((((.....)))).))))))).(((((........(((((........((.(((((....))))).)).................)))))..)))))....)))))))............)))))))))))......... .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))((((.....(((.(((((...((((((..(((((....)))))...)))).))..........))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((.....((.(((((...((((.((.(((((....))))).)).))..)).((....)).))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((.....((.(((((...((((.((.(((((....))))).)).))..))..((....))))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))..)))))). .((((((((...(.((((..........)))).)))))))))........(((((((((((((.....((((.......)))).........))))..)))))))))(((..(((((((((((...(((((((((((.((..(((((..((((((............)))).))))))).))......((((.(((((((((.....)))))))))))))(((((.....((.(((((...(((((((((((((....)))))))).))).))..........))))))))))))....)))))))...)))).....))))))))))))))...... .((((((((.....((((..........))))..)))))))).........((((.................)))).((((((.........(((........)))......(((((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).))))))))..........(((.((((.((((.....)))).))))))).(((((.....((.(((((((.((((.((.(((((....))))).)).))..))))........))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..))))))))........(((((((............)).)))))((((((.(((................((.....))..(((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............))).)))))))).........((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((.....((.(((((...((((.((.(((((....))))).)).))..)).((....)).))))))))))))....)))))))...)))).....)))))))))))).)))))). .(((((((...((.((((..........)))).)))))))))........(((((.................)))))((((((.........(((........)))......(((((((((((...((((.(((((......(((((..((((((............))).)))))))).........((((..((((((.......))))))...))))............((((........)))).(((((....))))).))))).))))......((((.((((...((.....)))))).))))........)))))))))))..)))))). .((((((((.....((((..........))))..)))))))).........((((.................)))).((((((.((.((....((........))......)).(((((((((...(((((((((((.....((((..(((((((............)))).)))))))..........(((.((((.((((.....)))).))))))).(((((.....((.(((((...(((((((.(((((....))))).)).))).)).((....)).))))))))))))....)))))))...)))).....))))))))).)).)))))). ..((((((......((((..........))))...))))))......................................((((..........((........))........((((((((((.......(((((((.....((((..(((((((............)))).))))))).........((((.((((.((((.....)))).)))))))).((((........(((((...((.(.((.(((((....))))).)).)...))..........)))))..)))).....)))))))............))))))))))...))))... ..((((((......((((..........))))...))))))...........((.(((.........................................))).))........((((((((((.......(((((((.....(((((..((((((............)))).))))))).........((((.((((.((((.....)))).)))))))).((((........(((((........((.(((((....))))).)).................)))))..)))).....)))))))............)))))))))).......... > SSTRAND_ID=RFA_00630; TYPE=RNase E 5 UTR; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00040 AL627269.1/129570-129907; ORGANISM=Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi GUUUCCGCACCGAAACUUGUUAAAACAAAAAGUUUAGCGGAAUAACCCAUUUUGUCUGACCGAUCAUCAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUUUUUCAGACAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUAGGAUCUUCUCUGGAGAGUAAUGCCCAGGCUGCUUCCCUGAUAAUUGCGCUGUGUUUCCGUAUGAAAUACAGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGAAAUAGUCACGAGGCCAUCGGUUCAUGCCCGGUAAGGCGUCACCAUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA ..((((((........((((....))))........)))))).........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((......(((.....(((((..........)))))....))).........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((.(((((....))))).))...............)))))..)))))......)))))))...........)))))))))))......... ..((((((....((((((...........)))))).))))))..........(((((((..(((((..(((((.......))))......)..)))))..)))))))......(((((((((((......(((((((((......(((..(..(((((..........)))))..)..))).......((((.(((((((((.....)))))))))))))((((.....((.(((((.............(((((....)))))..(((........)))..))))))))))).......))))))))).........)))))))))))......... 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TYPE=Hepatitis Delta Virus Ribozyme; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00094 L22063.1/781-691; ORGANISM=Hepatitis delta virus GUGGCCGGCAUGGCCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACGAUCCGAGGGAGCUACUCCUCUCGAGAAUCGGCAAAUGGGGCCCC ............(((((((((........))).............(((((.(((((.(...)..)))))..).)))).....))))))... .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).))......((((((((...)))).))))......(((.......))).. .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).))....(((((((((.....))).)))).))...(((.......))).. .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...)))).)))).).))))......((....)) .((((((((.((((((((((......)))))))))))))))))).(((((((((((((...)))).)))).).))))......(((()))) .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).))....((((((((((...)))).)))).))...(((.......))).. .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...)))).)))).).))))......((....)) ..(((((((......(((((......))))).)))))))((((..((((.(..(((((......)))))..).)))).........)))). .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...)))).)))).)).)))((.......))... ...........(((.(((((......)))))..............(((..((((((........))))))....))).........))).. ...........(((((((((......))))...............((((.((((............))))...)))).......))))).. > SSTRAND_ID=RFA_00637; TYPE=Hepatitis Delta Virus Ribozyme; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00094 M92448.1/769-681; ORGANISM=Hepatitis delta virus AUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAAGGGACCGUCCCUUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA ............(((((((((........))).............(((((((((((((...))))))))).)))).....))))))... .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...))))))))).)))).............. .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...))))))))).)))).............. .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).((((((((((((.....)))))))).)))).............. ..(.(((((.((((((((((......))))))))))))))).)..((((((((((((((.)))))))))).)))).....((((.)))) .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...))))))))).)))).............. .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...))))))))).)))).....(((...))) ..(((((((......(((((......))))).)))))))(((...(((((((((((((...)))))))))........))))...))). .((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).(((((((((((((...))))))))).))))......((...)). ...........(((((((........(((((()))))).......(((.((((((((.....))))))))..))).....))))))).. ...........(((((((((......((((....)))).......(((((((((((((...))))))))).))))))...))))))).. > SSTRAND_ID=RFA_00640; TYPE=Cis-regulatory element; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00109 AB169770.1/1705-1641; ORGANISM=Macaca fascicularis (crab-eating macaque) UCCAUAUCUUAAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU ....(((((((((........)))...((((.(((.((........))))))))))))))).... ....................((.((..((((..(((((........)))))))))..)).))... ....(((((....((((....))))..((((..(((((........))))))))).))))).... ....(((((....((((....))))..((((..(((((........))))))))).))))).... ....(((((....((((....))))...((((((((((........))))))))))))))).... ....(((((....((((....))))..((((..(((((........))))))))).))))).... ....(((((....((((....))))..((((..(((((........))))))))).))))).... ....((((((((((......))))...((((..(((((........))))))))))))))).... ....(((((....(((......)))..((((..(((((........))))))))).))))).... ......((.................................................))...... ...................................(((........)))................ > SSTRAND_ID=RFA_00649; TYPE=Cis-regulatory element; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00109 K00927.1/294-229; ORGANISM=Mesocricetus auratus (golden hamster) UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU ....(((((((((........)))...((((.(((..((........))))))))))))))).... ....................((.((..((((.....(((........)))..))))..)).))... .((.(((((....((((....))))..((((.....(((........)))..)))).))))))).. .((.((((((..(....).(((((.((.(((.......))).)).....)))))..)))))))).. ....((((((...(((((.((......((......)).)).)))))..........)))))).... .((.(((((....((((....))))..((((.....(((........)))..)))).))))))).. .((.(((((....((((....))))..((((.....(((........)))..)))).))))))).. ....((((((.........(((((.......((.......)).......)))))..)))))).... .((.(((((....(..........)..((((.((..(((........))))))))).))))))).. .................................................................. .................................................................. > SSTRAND_ID=RFA_00667; TYPE=Hammerhead Ribozyme; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00163 AF036398.1/102-58; ORGANISM=Schistosoma haematobium AUCUUUCUGACGAGUUUCAAAUAGGACGAAACGCGUGUCAUGGAU ((((.(.......((((......))))...((....)).).)))) 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((((((((((....))))...................)))))) > SSTRAND_ID=RFA_00756; TYPE=Other RNA; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00164 AY536760.3/1587-1545; ORGANISM=SARS coronavirus BJ01 UUUCAUCGUGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGUGAAU .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))). .(((((.(((.((.((((.....))..)).)).))).))))). .(((((.(((.((.((((.....))..)).)).))).))))). .(((((.(((.((.((((.....))..)).)).))).))))). .(((((((((()))))....((((........)))).))))). .(((((.(((.((...(((.......)))..))))).))))). .(((((.(((.((.((((.....))..)).)).))).))))). .(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))). .(((((.(((.((.((((.....))..)).)).))).))))). ...(...................................)... ........................................... > SSTRAND_ID=RFA_00793; TYPE=Cis-regulatory element; EXT_SOURCE=Rfam Database; EXT_ID=RF00374 M64095.1/772-673; ORGANISM=Murine leukemia virus AUCUGUACUAGUUAGCUAACUAGAUCUGUAUCUGGCGGUUCCGUGGAAGAACUGACGUGUUCAUAUUCCCGACCGCAGCCCUGGGAGACGUCUCAGAGGC ..(.(..((((((....))))))..).)......((((...((.((((((((......))))...)))))).))))..((((((((....)))))).)). .......((((((....))))))...........(((((..((.((((((((......))))...))))))))))).(((((((((....)))))).))) 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GCUGCCGAGUUUUUUAAUGCAUUUUCUACUGACAUAAACUGAAGUGCCAUUAUUUGGAAACUUUAUUUGUAAAGCGUUCUUUGAUCUCAACGCUGUCUGGCUGGACAUUUGCCAAAGCCCAUGAAUGCCCAACCAGACACUGUUGAGACGAAUAUGGGCUUUAAUUGAACGCUUUACAGAAGAAGUUUAUAAAUACACAUAAAAUGCAUUUCUUUCUUAUAACUCAGGCCAACUGGCAUAGCAAGUAAAACUGUACUGAUCUAAAUGAAAAAUGUUUCUCUUCCUGAUAAUCGCACGUCCUUCUAUGGACAUUAUAUGCCAUUAUCAGUCGAAGAUCGAACGUUUAACCAAUAAUGUUCUUCAGAAUAUUUUUAAGCUUUGUUAUGCCACAGUUUGCAUGUUGCAAUUAAACAUUCUUCACGUGAGAAUUGUUUACAAAUUGUCUCUAAACACAUGUGAACCACAGGCCUCACUUAUCUAAACGAAAUCUGUACUUACUUUCAGAAUGUAAGAUAGUUUUAUCAAUUGAAAAUGCAUUCCAAAUAUGUAUCUC 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GCCCCCGUGGUGUAGCCAGGUCUAGCAUACGGGGUUCUCGUCCCCGUGACCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGGGCACCA (((((((..((((...........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... ((((((((..........((((......((((((.......))))))))))((((.......)))))))))))).... ((((((.(((.....)))..........((((((.......))))))...(((((.......))))).)))))).... ((((((((((((.((((.((((......((((((.......))))))))))..))))))....)).)))))))).... (((((((((((...))).((((......((((((.......))))))))))((((.......)))))))))))).... ((((((((((((...((.((((......((((((.......)))))))))).))...))...))..)))))))).... ((((((((((((...((.((((......((((((.......)))))))))).))...))...))..)))))))).... ((((((((..........((((......((((((.......))))))))))((((.......)))))))))))).... (((((((.(((...)))..(((......((((((.......)))))))))(((((.......)))))))))))).... ((((((((....................((((((.......))))))....((((.......)))))))))))).... 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TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=BAC.MAC.; ORGANISM=Bacillus macerans UUUGCCGUGCUAAGCAGGCGAGGUAGCGGUGCCCCAUACCCGCAAUCCGCUCUAGGAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGCGUUGACGUCUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCUGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGAGCACGGUA ..(((((((((..((.((.(.(.(...).).).))...((..(...........)..))))......((((((...((((((.(((((.((((...(((.((((((.((((((......((((((((((((((((.(((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))...))))))...))))))))...))).))))))))))))...)))).)))))))))))...))))))))))))))) ...((((((((.....((((.(((.((((..........)))).)))))))...((....)).....((((((...((((((((.(((.((((((....(((((((...((((......((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).))))))...))))))))...))))...)))))))..)).)))).)))))))))))...)))))))))))))). ...((((((((.....((((.(((.((((..........)))).)))))))...((....)).....((((((...((((((((.(((.((((((....(((((((...((((.(((..((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).))))))...)))))))))))))))...)))))))..)).)))).)))))))))))...)))))))))))))). ..(((((((((......(((.((((..((....)).)))))))..((.((((.....)))).))...((((((...((((((((.(((.((((((.(((.(((((((..((((......(((..(((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).))))))...)))..)))...))))..)))))))))))).)))).)))))))))))...))))))))))))))) ..(((((((((......(((.(((((((((.......).)))))))))))(((...)))(......)(((((((..(((((((.(((((((((((.((.((((((((.(((((.((...((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).))))))...)))))))).)))))).))))))))))))).)))))))))))))))))..))))))))))))))) ...((((((((.....((((.(((.((((..........)))).)))))))..(((((((......)))))))...((((((((.(((.((((((....(((((((...((((.(((..((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).))))))...)))))))))))))))...)))))))..)).)))).))))))))))).........)))))))). ...((((((((.....((((.(((.((((..........)))).)))))))...((....)).....((((((...((((((((.(((.((((((....(((((((...((((.(((..((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).))))))...)))))))))))))))...)))))))..)).)))).)))))))))))...)))))))))))))). ..(((((((((.....(((.....((((((((.........)))..)))))........))).....((((((...((((((((.(((.((((......(((((((.((((((......((((((((((((((..((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...))))))....))))))...))))))))...))).)))))))))).....)))).)))))))))))...))))))))))))))) ..(((((((((......(((.((((..((....)).)))))))..((.(((((...))))).))...((((((...(((((((.((((.((((((.((.((((((((..((((..(...((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).))))))...)))))))).).))))..)))))))))))).)))).)))))))))))...))))))))))))))) ...((((((((......(((.((..((((..........))))..)))))....((((((......))))))....(((((((..(((.((((......(((((((.((((((......(((((((((((((((.((((((.(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))...))))))..).))))))...))))))))...))).)))))))))).....)))).))).))))))).........)))))))). ..(((((((((......((...((.((((..........)))).))..))........((......))(((((...((((((((.(((.((((......(((((((.((((((......((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).)))))))...)))))))...))).)))))))))).....)))).)))))))))))...))))).))))))))) > SSTRAND_ID=SRP_00037; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=BAC.THU.; ORGANISM=Bacillus thuringiensis UUUGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUAUACUCGCAAUCCGCUCUAGCAGGCCGAAUCCCCUCUCGAGGUUAUGUUGCUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAACGGGACCCCGUGAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUAAGCGGGUCUUCUCGUGUGCCGCAGGAGUGCCUGAACCGAGCUAACUGCUUGCGUAACGCUUAUGGCUACGCAAUCGACAGAAGGUGCACGGUA ..((((((((...((((((.(.(...).).))))...((.((...........))))))......((.(((...((((.(((.((((((((...(((..(((((.((((((......((((((((((((((((.(((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))...))))))...))))))))...))).)))))))).)))...)))))))).))).))))...))).)).)))))))) ...(((((((..((.((((((((((((((((.........)))..))))).......)))...))))).))...((((.(((.((((((((...(((.....(((((((((......(((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))....))))).)).))))))...)))))))).......))))))))))))...)))))))).))).))))..........))))))). ...(((((((.....((((((((((((((((.........)))..))))).......)))...)))))..((((.........(((.(((((....))))))))..(((((((....(((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))....))))).)).)))))))...)))))))...))..))))).((((((..((.....)))))))).))))........))))))). ..((((((((...(((((..((((....)))).....))))).....((((...(((((.....(((..(((((.(..((.(((((.(((((....))))))))))))..).)))).)...)))(((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).)))))))..)))))....))))...(((((((((((..((.....)))))))))..).))).....)))))))) 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TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=BLO.FLO.; ORGANISM=Blochmannia floridanus UUAUACAUCGUAACUGUAGUUAACAGUUUUGUUGAUUUAGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCUAUAACAAAAUUGUAUACAGUUACGAUGAUGUGUGUUAUU ....(.(.(((((.(((((.((...((((((((....((((....(((....)))....)))).))))))).)...))...)))))....).)))).).). .....(((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).)))))))))))))............ .....(((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).)))))))))))))............ .(((((((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).))))))))))))).))))....... ..((((((((((((((((..(.((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))))))))))))))))).)))........ .....(((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).)))))))))))))............ .....(((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).)))))))))))))............ .....(((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).)))))))))))))............ .(((((((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).))))))))))))).))))....... .....(((((((((((((....(((((((((((....(((......((....))......))).))))))))))).)))))))))))))............ .....(((((((((((((....((((((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))).)))))))))))))............ > SSTRAND_ID=SRP_00062; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=CAE.EL-B; ORGANISM=Caenorhabditis elegans ACCGAGCGUCGUGGCGGGCGCUUGUGAGUCAGCUUCUUGACGGUAGAUAAGUGUGGAUGGAGUGAGAGGAGGAGUCCUGUGUAUGUCGUUGUCAACGUCGACCGAGCGUCCGUGCCAAGCGCUGCGUCACCAGGGGAUGACUGUCGGAAGAUGGUCAGUCCCGGGUGCAUAAGGAGUGGUGGAUGGUUCAGGACCGAAAGGUAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGUGCAGUGGCCGGACUGCGCUUGUGAGUUGACACGUAUACACAGCCUUCUCAAUACCUUCAGACCACUUGUUUUU ((((((((((......)))))))....(((........))))))(((((((((....(((((...(((((((....(((((((((.(((..(((((.((...(((((((((..((((.(((((((((((((.((((.((((((((....)))))))).)))).))))(.....).(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))).))...))))))).))))))).))))))))))))))))))).....)))))...))))))))).. ..((((((((......))))))))...(((((....)))))...(((((((((.(..(((((.(....((((((..(((((((((.(((.((((((.(((..((((((((((.((((.(((((((..((((..((((((((((((....)))))))).)))).))))........(((((((...(((....(((....)))....))).....))))))))))))))..)))))))))...)))))))))))))))))))))))))).))))))....))))))..)))))))))).. ..((((((((......))))))))...((((......))))...(((((((((.(..(((((.(....((((((..(((((((((.(((.((((((.(((..((((((((((.((((.((((((((.((((..((((((((((((....)))))))).)))).))))..........(((((...(((....(((....)))....))).....))))).))))))))..))))))))...))))))))))))))))))))))))))).))))))....))))))..)))))))))).. .(((((((((......)))))))).).(((((....)))))...(((((((((.(..(((((..(...((((((..(((((((((.(((.((((((.(((..((((((((((.((((.(((((((..((((.(((..((((((((....))))))))..))).))))........(((((((...(((....(((....)))....))).....))))))))))))))..)))))))))...)))))))))))))))))))))))))).))))))..)..)))))..)))))))))).. ..(((((((((...).))))))))...(((((....)))))...(((((((((..(.(((((((.(((((((....(((((((((.(((.((((((.(((..((((((((((.((((.(((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))..........(((((...(((....(((....)))....))).....))))))))))))))..)))))))))...)))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))..)))))))))).. ..((((((((......))))))))...(((((....)))))...(((((((((.(..(((((.(....((((((..(((((((((.(((.((((((.(((..((((((((((.((((.(((((((..((((..((((((((((((....)))))))).)))).))))........(((((((...(((....(((....)))....))).....))))))))))))))..)))))))))...)))))))))))))))))))))))))).))))))....))))))..)))))))))).. ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((.(..(((((.(....((((((..(((((((((.(((.((((((.(((..((((((((((.((((.((((((((.((((.((((.((((((((....)))))))).)))).))))..........(((((...(((....(((....)))....))).....))))).))))))))..))))))))...))))))))))))))))))))))))))).))))))....))))))..)))))))))... ..((((((((......))))))))...(((((....)))))...(((((((((....(((((...(((((((....(((((((((.(((.((((((......((((((((((.((((.(((((((((((((.((((.((((((((....)))))))).)))).))))........(((((.....(((.....((....)).....)))....))))).)))))))))..)))))))))...)))))...))))))))))))))))))))))))).....)))))...))))))))).. ..((((((((......))))))))...(((((....)))))...(((((((((....(((((((.(((((((....(((((((((.((.(((((((.(((..((((((((((.((((.((((((((.((((.((((.((((((((....)))))))).)))).)))).........((((((...(((....(((....)))....))).....))))))))))))))..))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))...))))))))).. ...(((((((......)))))))....(............)....((((((((....(((((...(((((((....((((((((..(((.((((((.......(((((((((.((((.(((((((((((((.((((.((((((((....)))))))).)))).))))..........(((((..........(((....)))............))))))))))))))..)))))))))...))))....))))))))).))))))))))))))).....)))))...))))))))... ..((((((((......))))))))...(((........)))....((((((((....(((((...(((((((....(((((((((.(((.((((((.((...((((((((((.((((.(((((((((((((.((((.((((((((....)))))))).)))).))))..........(((((..........(((....)))............))))))))))))))..)))))))))...))))).))))))))))))))))))))))))))).....)))))...))))))))... > SSTRAND_ID=SRP_00066; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=CAL.JAC.; ORGANISM=Callithrix jacchus GCCAGACGCGGUGGCACGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCGGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGUAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCGGAUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCAGAAAAAGAGCAGGUCAAAACUCCCAUGCUGAUCAGUAGUGGGAUUGCGCCUGUGAAUAGCCACAGCACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCAGGCUCUCUCUUUAAAA (((((.((((......)))).))....((((........)))))))(((((.(((((..(.(((...(((((((....(((((.(((.(((.(((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))((...)).(((((.....((((....(........)....))))...))))).))))))).)..)))))))...))))))).).)))))))).))).)))))))))))).....))).).))))).)))))... 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((((((((((..(((((....((...((.....))...))......................................))))))))))))))).................... > SSTRAND_ID=SRP_00073; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=CHA.GLO.; ORGANISM=Chaetomium globosum GACUGUAAUGGUCAGUUUGGUUUCGGAGGCACUUGAUUUUCUCGCUGUUUCUACUCCAUCCCCAUAAGAACCCCCCAGCGGCGCCCAGCACGAAUCUCGCGGUGGCCACCCACUCGCACGGGUAACCUGCGAUCGCUGCGUGUGGCCCUAAGCAAUGAAGAUGACACUUGAGGGAGGUCUCACUCUGCAGAGGCAUCUUCACCGUCAGAUGGCGCGCUGGAUCACGAUCGCUGGGGGCUUGGGGUAGAGCGGCGAGAUGGAGAUGUCGACUCCAAUUUUU (((.......))).....((((...........(.((.((.(.(((((((....(..((....))..).....((((((((.(.(((((.((.((((.((((....(.(..(.(((((.((....))))))))....).).......(...)...(((((((....(((....(((......)))....)))..))))))))))).))))..)).)))))....)..))))))))...........)))))))).......)).))..)....))))... 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((((((((((((.((((............(((((((.((......)).)))))))................................))))...)))))))))))) > SSTRAND_ID=SRP_00085; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=CIN.HYB.; ORGANISM=Cineraria hybrida ACCGGGCUUGGUAACGCUAGUCUAUAACUCAAGUGAGGGUAUCAAAGUGGUUGAACUUUGAGCUUGGCUUAGCUAGUUGGGUCUGUAGACACCGCACCUGGCUUGCCCGUUCCAAGUCGAGAGUGGGUUCAUGUUUCCUGAGCGAAGGCUCGGGUGAUGUGAGCUUUAGAAUCGGGGGGCAAUGCGUUAGGCUGGUUUCACAGAGCUGCGAAAACCUCUACCUCUCGACUGUGGAAGGAUUACAAGCCGGAGUGUCUUAGGCUCAUAUAACCAGCCUGGCUAGCCCAACAGGACACCCAUUU ((((((((.(......).)))))....(((....))))))....((((((.((..(((((.(((.(..((((......(((((((..(((((.....((((((((.((.((((((((((((((..((((((((((.(((((((....))))))).))))))))))(....)..(((((....(.(((....(((......)))....))).)..)))))..))))))))).)))))))....)))))))).))))).)))))))...........))))).))).))).))..)).)))))) ...(((((((.....(((((((....((((......)))).(((((((......)))))))....((((........((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))))........(((((.....(((....(((......)))....)))....)))))..))))))))).)))))))....)))))))).)))))))))))))).......)))).)))))))....))))...))).... .(((((((.(((...(((((.(((....((((((.......(((((((......)))))))))))))..))))))))((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))))........(((((.....(((..((((..........)))))))....)))))..))))))))).)))))))....)))))))).))))))))))))))....))))))))))...(.((....)).)........ .(((((((.(((...(((((.(((....((((((.......(((((((......)))))))))))))..))))))))((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).))))))))))).......(((((......(((....(((......)))....)))....)))))..))))))))).)))))))....)))))))).))))))))))))))....))))))))))...........((....)).... .(((((((.(((...(((((.((..(((((((((.......(((((((......)))))))))))))))))))))))((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).......(((((......(((..(((((......)))..)))))....)))))).))))))))).)))))))....)))))))).))))))))))))))....))))))))))....................... .(((((((.(((....((((.(((....((((((.......(((((((......)))))))))))))..))))))).((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((..((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))).........(((((.....(((..((((..........)))))))....)))))..))))))))).)))))))....)))))))).))))))))))))))....))))))))))...(.((....)).)........ .(((((((.(((...(((((.(((....((((((.......(((((((......)))))))))))))..))))))))((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))))........(((((.....(((..((((..........)))))))....)))))..))))))))).)))))))....)))))))).))))))))))))))....))))))))))...(.((....)).)........ ...(((((((.....(((((((..............((((.(((((((......)))))))))))((((........((((((((..(((((.....((((((((((..(((((.((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))))........(((((.....(((..((((..........)))))))....)))))..))))))))..)))))))....)))))))).))))).)))))))).......)))).)))))))....))))...))).... .((((((.((((...(((((.((..........(.......(((((((......))))))).....)...)))))))((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).))))))))))).......(((((......(((..(.(((......)))..).)))....)))))..))))))))).)))))))....)))))))).))))))))))))))....))))))))))...........((....)).... .((((((...(...........................(..(((((((......))))))).)..............(((((((..((((((.....((((((((.((.((((((((((((((..((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))).........((((......((...(((............))).))....))))...))))))))).)))))))....)))))))).)))))).))))))).....)..))))))....................... ..(((((..................................(((((((......)))))))................((((((((.((((((.....((((((((.((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((((....))))))).)))))))))))..................(((...((............)).)))...........))))))))).)))))))....)))))))).))))))))))))))........)))))........................ > SSTRAND_ID=SRP_00089; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=CLO.PER.; ORGANISM=Clostridium perfringens GCCGUGCUAGAUGGGGAGUUAGCGGUGCCCUGUAACCUGCAAUCCGCUACAGCAGGAUCGAAGUCCUCAUAGAGGCUCUAACUUGUGGAGUCUGCCCUAUGUAAGUGGUGUUGAGAGUUGGGCCCCACGCAAUGGAAACCUGUGAACCUCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGAUAAGCAGUCAUUUUCAUGUGCCGUGGAUACGUCUGGCUUGAGCUAACUGCAUAGGUAACGUUCAUAAGUUAUUGUCGAAGUGAGGUGCACGGUU (((((((..(((((((.(((...))).))))....(((((...........)))))))).....((((((...(((..(((((((((((...((.(((((((.((((((.....(((((((((.(((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))))...)))))....)))))))))..))).))))))))))...)))))))))))))..)))...)))))).))))))). 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TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=CRY.PAR.; ORGANISM=Cryptosporidium parvum Iowa II GACUGGCUGGGAUAACGCCCAGCUGUAACCAAGUGGAGUCGUUAAAGGUUUAGGAUGGGAUACUGUGUCACUACAUCCCGGAAGUAACAUUGCACGAUGGCUGCCCAUUACAAGGCUGCAGUCUCUAGAGUUGCCUUGGUGGAGACCGAGGUGACUUGUGAGAUAGUGAAACCCGUACCGCCGGAGGCUGGAAACAGAGCACGGAAAAGGGUUCGCUGUAGUACGGUGUAAGGAUAACAGUAGUUGUGUAACUUCCUGGCAUCUCAGUGAUUCGCGAGAUUCAUCUCGGACUAAAUUUUU (((((((((((......)))))))....((....))))))(.....(((((.(((((((.(..((....(.(((.....(..((.(...(((((((((.((((.((.(.(((.((((((((((((..(((((((((((((....)))))))))))))..)))(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))).)..)))).))....)))).))))))))).).).)..)......))).).))..)..))))))).))))).....).. ....(((((((......)))))))...................((((((((((..((((((.....((((((....((.((((((.....((((((((.((((.((.(((((..(((((((((((..(((((((((((((....)))))))))))))..))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))))....)))))))....)))).)))))))))))))).))......))))))((....))...))))))..)))))))))) 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((((........................................(((((((((((((.(......((....)).........).))))))))))))).)))).... > SSTRAND_ID=SRP_00115; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=DRO.VIR.; ORGANISM=Drosophila virilis GACUGGAAGGUUGGCAGCUUCUGUAAUCACGCUUCUGUGAGGUCUGAUUGUGGGAUGGCCUGAGGCUGGGGAUCACUGUGUAGUGGACCAGCCAUGUUGACGGAACGUCCGCACUAAGCUUGCCAUCAAUAUGGGUGCCGCGGAGGAGUCCACGGCAUUCAGGUUGGCUAAGGAGGGAUGAACCGGGCCAGGGGUGAAAACCAGCAGCCAAGAGUUCCCGUGGUAAGCAGUAGUGGGAUAGCGUACCGGAGUGGACUGCCACUAUCAGCCUAGCCAAUUGUUGGACCACAAUCUUUU (((((((((.(....).)))))....(((........))))))).((((((((..((((....(((((((.....(((.((((((...(((((((.((..(((.((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((.(((....))).))))))))).)))).(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...)))).))))))))).))).))))))))))))))))....))))..)))))))).... 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CAAGUGGGGAUGUUAAGGUGGUGGAAUAUUGGGCUGUCCCAGAUGGCUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCACAGAGUUGGAUCACGAGGCCCAAAUGAAAAUAUGGGCUUCUUGAUUCCUAAAGUGGGGCGGACCGCAUGAGGCUGGCUUCACAGAGCAGUGAACAGCUCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAAUGGGUCGGUGUCUUAUCAAGUUCAGUAACGCCUAAUGGGUUGCUCCAAUAAACAACCACCUUU (....)........((((((((.(..((((((((.((.(((...(((.((((((((((((.((....((((((((.((..((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).))))))(....).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....)))))))))).))))))))))))......)))...))))).))).)))))..).)))))))). ..............((((((((....((((((((...((((...((((((((((((((((.......(((((((..(((.((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))))).....(((((((...((......))...))))))).((((........))))..)))))))))..))))))).....)))))))...))))))))))))).....)))...))))..)).))))))....)))))))). 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GCCGAGCUUAGUAACGUGGGCUUGUAACCCAAGUGGGGAUGUUAAGGUGGUGGAAUAUUGGGCUGUCCCAGAUGGCUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGGCCUGCCCUAUCCAAGCACAGAGUUGGAUCAUGUGGUCCAAUUGAAAGAAUGGGCUACUAGAUUCCUAAAGUGGGGUGGACCGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAAAAACUUCCGCUUUGUGCAGUGGAAGGAUAACGGACCGGUGCCUUCCAAGUUCCAUUAAUGCCUGAUGGGCUGCUCCAAUUAAACCACCACUUU (.((((((((......)))))))....(((....)))).)...((((((((((..((((((((.((.(((...(((.((((((((.(((.((....((((.(((.((..((((.(((((((((.(((((..((((((((.((....)).))))))))..)))))(....).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....))).)))))).))))))))))).......)))...))))).))).))).))..)))))))))) ..((((((((......))))))))...(((....)))......((((((((((...(((((((.(.((((...((((((((((((.((((........((.(((((((((((((........))))))...((((((((.((....)).))))))))..............))))))).)).......(((((((...........((.....((((((((......)))))))).....))))))))))))).))))).)))).....)))...))))).)).)))))....)))))))))) 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EXT_ID=MAC.MUL.; ORGANISM=Macaca mulatta GCCGGGCGCGGUGGCGCGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUAGGGAGGCUGAGGCUGGAGGAUCGCUUGAGUCCAGGAGUUCUGGGCUGUAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCGAGACCCUGUCUCUUUU ((((((((((......)))))))....((((........))))))).(((((.((....(((((...(((((((....(((((.(((((((.(((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))((...)).(((((.....((((....(((....)))....))))...))))).))))))).)..)))))))...))))))).).)))))))))))).)))))))))))).....)))))...)).))))).... ..((((((((......))))))))...((((........))))....(((((.((.(..(((((((.(((((((....(((((.(((((((.(((((......(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))........(((((.....((((....(((....)))....))))...))))).))))))).)..)))))))...)))))))...)))))))))))).))))))))))))..)).)))))..))).))))).... 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((((..((((((((...((((.....(((....................)))...))))....))))).)))..))))..... > SSTRAND_ID=SRP_00228; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=NEM.VEC.; ORGANISM=Nematostella vectensis GCCGGGCAUUGUGGCGCAUGCCUGUAAUCCAGCUGCUUGGAGGCUAGAGAUGUUGAAUGGCUUGAGGUGUGGAUUCCUGAUGGCGGUCGUGCUAUGUCGAUCGGGUGUCCGCGCUAAGUCGGGCGUCAAUAUGGUGCCUUAAGAGGAGUCUCGAGUCACCAGGUUGGUUAAAGAGGAGCGUACCGGCCCAGGGUGGAAACACAGCAGGCAAAAGCUCCCGCGUUCGACAGUAGUGGGAUAGCACCUGUGAAUAGACGGCCGUCAACAGCCAUGCCAAGAUAGUCGAACUCAUCUCUCUUUUU (((((((((........))))))....(((........)))))).(((((((.....(((((...(((((((....(((.((((((((((......(....(((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).)))).(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))).).....)))))))))).)))))))))).....)))))....)))))))...... ..(((((((........)))))))......((((.......))))(((((((......((((...(((((((....(((.((((((((((.((((......(((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((.(((.(((....))).))).))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...)))))))...)))))))))))))).)))))))))).....)))).....)))))))...... 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((((((((((((........(((((.............(((....)))...........)))))..........))))))))))))...... > SSTRAND_ID=SRP_00233; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=NOS.SPE.; ORGANISM=Nostoc sp. GACCUGGAUCUAUGCGACUGCAACGCCUAAACCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAACACAGGAUGCUUGUGGUAGGCGUAGUCUCCGGGUCGCCCUAUU ((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))........ ((((((((.((((((.(((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))....)))))))..))))))..))))))))........ ((((((((.((((((.(((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))....)))))))..))))))..))))))))........ ((((((((.((((((.((..((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))..))..))))))..))))))))........ ((((((((.((((((.(((((((.((((..(((((((....))...)))))...........)))...))))))))..))))))..))))))))........ ((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))........ 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((((((((.((((((.(((((((..................(((....)))..................)))))))..))))))..))))))))........ > SSTRAND_ID=SRP_00241; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=OXY.TRI.; ORGANISM=Oxytricha trifallax GCUCAGGAGGAUUUAUUCUCUGUAACAUCGUGGGUUCGGUUCUGCGUGUGCUUGUAGGACUAAGAGUGAACCUGUUAUGACGCUGUGCUUUGGCUUGUCCAUUUCAAAUUAGGUGUCAACAAUGUGGGCUUAGAGUAGUCUUCGCUUUCAUGGUUGUCAAAGAAGUCGGGAAUGCCUCAGGCUGGCAACAGAGCAGGGAAAACGACUCGCACUUAAUAGUGAAAGGAUAGCAAGCCUUUAUAGCGUCGAAGGUUAUCGCUUGGCUCCUAACUGGUAUUCGCAUGGCUGUGGCAUCAAUACCUUU ..((.((((((....)))))).....(((...)))..)).......(((((((..((.(((..(..((..........(...(.(((((..(((((((((.(((...(((((((((((((.(((.((((..(((....)))..)))).))).))))(...)..(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))))))))...))).))...))))))).....))))).)....)..............))..)))).)).........).)))).))........ .....((((((....)))))).........(((((((((((.((((.(((((..((((((((((....(((((.....(((((((((....(((((((((.(((((.(((((((((((((.(((.((((..(((....)))..)))).))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...)))))))..)))))))))..)))))....))))).)))))...))))).)))).))))).))).)))........ 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EXT_ID=PLA.YOE.; ORGANISM=Plasmodium yoelii GUCUGGCUGUAUGCUCCUCGGGGUAUGCAGCUGUAACCGUAAGGGGAAAGCAAAGCAAUUUGCGCAGCCUUUAAGGGAUGUUAUCCAUGUUACGAGAAAUUCAAUAUAUAAGAGCUCUCGUCUGUUGCAAGAUAUAAGUUGCUGAGCAUGUUAUGUUGGAAAGAUAACAUGCUGGAGUAAUAAUGAAUUGCGGAACGCCUUAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUUAGCAAUCGCUUGUAUACGGUGCAAAGUUUGCGAUGAGCGAUUAGUAUAUCUCGAAUCUCGUCAAGCAUGGUAAGCACACCA ((((((((((((((((....)))))))))))).....(.((((((....(((((....)))))....)))))).)))))(((((.((((((((((((..(((.((((((.((.((((((((((.(((((..((((((((((((.((((((((((.((....))))))))))))..))))(...)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).))))))))....)))))))...)))).))))..)).))))))...))))))))).)).))))))).))...... ....((((((((((((....))))))))))))....((.((((((....(((((....)))))....)))))).))..(((...(((((((((((((......((((((((..((((((((...(((((..((((((((.(((.((((((((((.........))))))))))..)))........(((((.....(((((...(((....)))...)))))..))))).))))))))....))))).....)))).))))..))).)))))......))))))..)))))))...)))..... ...(((((((((((((....)))))))))))))...((.((((((....(((((....)))))....)))))).))..(((...(((((((((((((..(((...(((((...((((((((...(((((..((((((((((((.((((((((((.........))))))))))..)))).......(((((..(((.(((....(((....)))...)))))).))))).))))))))....))))).....)))).))))......)))))...)))))))))..)))))))...)))..... ....((((((((((((....)))))))))))).......((((((....(((((....)))))....)))))).((..((((..(((((((((((((......((((((((..((((((((...(((((..((((((((((((.((((((((((.((....)))))))))))).).))).......(((((..(((.(((....(((....)))...)))))).))))).))))))))....))))).....)))).))))..)).))))))......))))))..)))))))..))))..)). ...((((((((((((((..))))))))))))))...(((((((((....(((((....)))))....)))))))))..(((((.(((((((((((((..(((.((((((((..((((((((((.(((((..((((((((((((.(((((((((((((...)))))))))))))..)))))....(.(((((..(..(((((..((((....)))..))))))).)))))).)))))))....)))))))...)))).))))..)).))))))...)))))))))..)))))))).))))..... ...(((((((((((((....)))))))))))))...((.((((((....(((((....)))))....)))))).))..(((...(((((((((((((......((((((((..((((((((...(((((..((((((((.....((((((((((.........)))))))))).............(((((..(((.(((....(((....)))...)))))).))))).))))))))....))))).....)))).))))..))).)))))......))))))..)))))))...)))..... ...(((((((((((((....)))))))))))))...((.((((((....(((((....)))))....)))))).))..(((...(((((((((((((......((((((((..((((((((...(((((..((((((((.....((((((((((.........)))))))))).............(((((..(((.(((....(((....)))...)))))).))))).))))))))....))))).....)))).))))..))).)))))......))))))..)))))))...)))..... ...(((((((((((((....)))))))))))))...((.((((((....(((((....)))))....)))))).))..((((..(((((((((((((......((((((....((((((((...(((((.(((((((((..((.((((((((((.........))))))))))))...........(((((......(((....(((....)))...)))....))))).)))))))).)..))))).....)))).)))).....))))))......))))))..)))))))..))))..... ....((((((((((((....)))))))))))).......((((((....(((((....)))))....)))))).((..((((..(((((((((((((..(((.((((((((..((((((((...(((((..((((((((((((.((((((((((.((...)).))))))))))..)))).......(((((...((.(((....(((....)))...)))))..))))).))))))))....))))).....)))).))))..)).))))))...)))))))))..)))))))..))))..)). ....((((((((((((....))))))))))))....((..(((((....(((((....)))))....)))))..))..((((..(((((((((((((..((..((((((....((((((((.....((.....((.(((((((.((((((((((.........))))))))))..))))).......((((......(((....(((....)))...)))....))))...)).)).......)).......)))).)))).....))))))....))))))))..)))))))..))))..... ....((((((((((((....))))))))))))....((.((((((....(((((....)))))....)))))).))..((((..(((((((((((((..(((.((((((((..((((((((....(((....(((((((((((.((((((((((.........))))))))))..))))).......((((.......(.....(((....)))....).....))))...))))))......)))......)))).))))..)).))))))...)))))))))..)))))))..))))..... > SSTRAND_ID=SRP_00267; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=PRI.PAC.; ORGANISM=Pristionchus pacificus ACGGAGUGUCGUGGCGGGCACUUGUGAGCCAGCUUCUAGGCCGUAGAUUAUGGUGGAGAGAGUGAGGGAGGGAUCCCUGGUCGGAAUUCGGUCUACGACGACCGGGCGUCCGUGCCAAGCGAUGCGUCACUAGGGGGUAAGACUCGGAAGGGUCUCUCUCCCGGGUGGAAAAGGACAACCGUAUGGCUCAGGCCCGAAAGGGAGCAGGCAAAAGGUUGCGCGCGUUGACAGUGGCCGGAUAGCGUCUGCGAGUAGAUCGACCUGAACAGCCCUUCUAAUACCUCUCGACCCAUAAUCGU ((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((.((((..((.(.(((((..(...(((((((((..((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))..)..)))).))...))))))).).)))))).)).)))).)))))))))).....)))))...)))))))).. 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AGAGCUGUAAUGGCUUUUGGUGGAACCAGGUGUCUCGAGAGUUCUGGUCUGGGUUCGAAUCCUACGGCCGGACGUGGUUGCAAUUAUACAACUCUUUGUGGGUUGGCGCCGCGCCCAAGCUCAACUGCACUUCCUCGUAAGAGGAGCCGAGUUUUAGACGUGUCCCGGAUUAUAUCGAUCUUUGCGGGGAGUCCUGGGCGAGACAUGAGAAGUCUGUCUUCGCUUAGGUACGGCAAUGGUACCACACGACGCACCUUGUGUCGUUGUGUGGUUUUCGCAUGCUCCUUCCGCUGAAGGGGAGUUUCAUCCAGCACAGCAGGAGUCACCCGUGAGGAGGCGGCCGGGAUGGCACUCGUCCUCGGUAUCAUUAAGCACGGCGGUGGGUUGGGAUUUCCUCGGGGCAUUUAGCCUCUGUUGGACACCUUAGGAACUACCAAAGUAUUUUUUUU (((((.......)))))((((((..(.((((((((.(..((((((((((..((........))..)))))))((((((..........((((((.....))))))..))))))...................((((....)))).((((((...(.((.(((((((((.(........((((((((((....(((((((((((((.((....)))))))).))))))).............(((((((((((((...))).)))))))))).........(((((....((((....(((......)))....)))).)))))..))))))))))...).)))))...)))))))..))))))...)))...)..(((((.((((((((..(((....)))..)))))))))))))))))))))..)...))))))............. 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EXT_ID=SAC.MI-B; ORGANISM=Saccharomyces mikatae AGGCUGUAAUGGCUUUCUGGUGGAAUGGGAUACGUUGAGAAUUUUGGCCGAGGAACAAAUCCUUCCUCACGGCCGGACACGGAUUGCACGCCCUUUGGGCAAGGGGUAGAAUUUCUAUUUCGCGCCGUGCCCUGUUGUGGCAACCGUCUUUCCCCCGUCGUUGGUUUGUCCUGGGCAGAGCUGUCUGCCCGGAGGCGGGGGAGUCCUAUCUAAAGUGUCCCGGCUUAAAUAAAUCGAUCUUUGCGGGCAGCCCAUUGGCAGGAGGCGUGAGGAAUCCGUCUCUCUGUCUGGUGCGGCAAUGUAGUUCUGGGUCCCUUAGGGGCUCCACCUUCACCGCUGUUAGGGGAGUUUUAUCCAGCGUCAGCAAAGGUGACCCGUGAUGGAGGCGGCCGGGAUAGCACAUAUUAGUAGGAUAAUCGUGCAAAUUUAUCGCUUCGGUGGUUUAAAUUGGCGGUACCAUCAGGAUUUACUCUCACAUUGUGGUCAUACCUUCUGGUGUGAGUGUGUAUUCUAAACCAUUUUUUU 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(((((((((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))))))).)))))).... > SSTRAND_ID=SRP_00322; TYPE=Signal Recognition Particle RNA; EXT_SOURCE=SRP Database; EXT_ID=SUL.SO-B; ORGANISM=Sulfolobus solfataricus GGGGUCAGGGAGGGUGGGGGAUCUCGCCAAUCCCUAUUACCCGCAAGGCGUAAUGCGGGCACCAGUAACUCCUACCCUAUGGUGUCUCCUAUCUGUAGGUCCCAGUGGAGCGAUGAAGCCUGCCCAGCGGGGCUUGGCGGUCAUGGGCUUUCUCUCCGGAGGGAGAGAAAGUACCAUGAUAGCUGGGGGAAUCGGCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCGUGCCUGGACGCCAGCGUUCGCUGGUCAACAGCCAGAGUGAAACUGGGGUAAACCUAUAGAUAGGUAGGCCAUGGGGUAGGGGGUCUGGCCCCAU (((((((((...((((((((((.......))))))....((((((........)))))))))).....(((((((((((((((.(..(((((((((((((((((((...((......(.(((.((((((.(.((.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))))..(((.((....((((....(((....)))....))))..))))).)))))))...))))))....))).)...))...))))))))....))))))))))).).))))))))))))))).))))))))).. 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GGGAGCGACUUGGCUUCGACAGGAGUAAGUCUGCUUAGAUGGCAUGUCGCUUUGGGCAAAGCGUAAAAAGCCCAAAUAAAAUUAAACGCAAACAACGUUAAAUUCGCUCCUGCUUACGCUAAAGCUGCGUAAGUUCAGUUGAGCCUGAAAUUUAAGUCAUACUAUCUAGCUUAAUUUUCGGUCAUUUUUGAUAGUGUAGCCUUGCGUUUGACAAGCGUUGAGGUGAAAUAAAGUCUUAGCCUUGCUUUUGAGUUUUGGAAGAUGAGCGAAGUAGGGUGAAGUAGUCAUCUUUGCUAAGCAUGUAGAGGUCUUUGUGGGAUUAUUUUUGGACAGGGGUUCGAUUCCCCUCGCUUCCA (((((((............(((((((((...(((..((((..(((((.....(((((............)))))...........................................(((..(((((........))))).)))((((((.(((((.(..........)))))).)))))).................((((((((((.....))))).)))))..............(((((..(((....(.(..........).)))).)))))....................))))).....))))..)))...)))))))))...(((((.......)))))))))))). 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GGGGGUGACCCGGUUUCGACAGGGGAACUGAAGGUGAUGCUGCGUGUCGAGGUGCCGUUGGCCUCGUGAACAAACGGCAAAGCCAUUAACUGGCAACCAGAACUACGCUCUCGCUGCUUAAGUGAGACAGUGACCGCCGAGCCCGGCCUUUGGCGCGGCGCGAACUGAACCAAAAGAAGGCUAGCCCCGGCGAGGUUCCAUAGCCGCAGGCGAAACUCCAUGGAAAUACGGUCUGGGCGAGCCUGCCCGCUGGCGCUCCCCGACCCGACAACAAAAAAGCGGGCUACACACGUAGACGCACGCUGGAAGGACUCUUGGACGGCGGUUCGACUCCGCCCACCUCCACCA (((((((............((((((..((...((((.(((..(((((......((((((.............))))))..............................(((((((.....)))))))((((...((((..(((........)))..))))...))))............................((((((..................))))))...(((..((((.(.(((........))).)..))))..)))....................))))).....)))))))....)).))))))...(((((.......)))))))))))).... 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GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCAUAUUUUGCGACUCGUGUGGCGACGUAAACGCUCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUAACACUUCUUACGCUCUAGCUGCCUAAAAACCAGCAGGCGUGACCCGAUUUGGAUUGCUCGUGUUCAAUGACAGGUCUUAUUAUUAGCGAGAUACGAUUAAGCCUUGUCUAGCGGCUUGAUAAGAGAUUGAUAGACUCGCAGUUUCUAGACUUGAGUUAUGUGUCGAGGGGUUGUUAAAAUAAUACAUAACCUAUGGUUGUAGACAAAUAUGUUGGCAGGUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUUA (((((((............((((((((....(((((((((..(((((.....(((.........)))....................................((.((.((((.........)))).)).))((((.((((.((((.......)))))))..).))))...................((((((((.........)))))))).................(((((((((.(((...........))).)))))))))....................))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......)))))))))))).... 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GGGGCUGAAACGGCUUCGACGUCCUAGUGAAAGUUGGGCUGUGAUGCAGGUCGAGAGUGGACUAUCUCUCGUUAAUCCAGAGUCCAAGCCAAAAGUAACUGCGAACAACAUCGUUCCUUUCGCUCGUAAAGCUGCUGCGGUAGCCUAAGACCUCUAAACAGGUUCGAGCACUCGUUGUCCGACUCCGUUAAGGGCAGCGGGUUAACCCCAACGGAUGCGCUAGACAGUUCUCUCUGGUGGGCUGUUUAGCAAAGACUCGACCAGAGCAUCCUACUGUUCGGGAUAAGGAACAGUCCCCGCCUGAGGGUCAAAAAGGCUAAGCCUGUGAAAGAGCAGUCGAUGAAUAGCUAGGGCGGACACGGGUUCGACUCCCGUCAGCUCCAUUA (((((((............(((((((((.(..(((((....(..(.(((((......((((((.................))))))...........................((..((..(....(.(.((((......)))).).)....)..))..))........((((((.((((...........)))).))))))................((((((((((((........))))))))))))........................(((((........)))))......((((...........))))...)))))...)..)....)))))...).)))))))))...(((((.......)))))))))))).... 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GGGGGUGAAACGGUCUCGACGGGGGUCGCCGAGGGCGUGGCUGCGCGCCGAGGUGCGGGUGGCCUCGUAAAAACCCGCAACGGCAUAACUGCCAACACCAACUACGCUCUCGCGGCUUAAUGACCGCGACCUCGCCCGGUAGCCCUGCCGGGGGCUCACCGGAAGCGGGGACACAAACCCGGCUAGCCCGGGGCCACGCCCUCUAACCCCGGGCGAAGCUUGAAGGGGGCUCGCUCCUGGCCGCCCGUCCGCGGGCCAAGCCAGGAGGACACGCGAAACGCGGACUACGCGCGUAGAGGCCCGCCGUAGGGACCUUCGGACGGGGGUUCGACUCCCCCCACCUCCACCA (((((((............((((((((.((.(.((((.((((.(((((......((((((............))))))...............................((((((........))))))(((((.((((.((((........))))..))))...)))))...............((((((((.............))))))))...................((((((((.(((........)))...)))))))).....................)))))....)))))))).).))))))))))...(((((.......)))))))))))).... 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