## RNAfold parameter file # stack_energies /* CG GC GU UG AU UA @ */ -144 -220 -136 -61 -140 -128 NST -220 -225 -132 -102 -128 -138 NST -136 -132 -19 -66 -63 -42 NST -61 -102 -66 -54 -16 -19 NST -140 -128 -63 -16 -80 -55 NST -128 -138 -42 -19 -55 -60 NST NST NST NST NST NST NST NST # mismatch_hairpin 0 0 0 0 0 -90 -115 -100 -98 -127 -90 -89 -96 -250 -89 -90 -115 -161 -104 -138 -90 -160 -116 -205 -144 0 0 0 0 0 -70 -100 -93 -150 -99 -70 -66 -87 -178 -72 -70 -132 -238 -133 -122 -70 -129 -100 -180 -114 0 0 0 0 0 0 -56 -100 -99 8 0 -107 -119 -94 -119 0 -123 -138 -100 -12 0 -96 -92 -73 -100 0 0 0 0 0 0 -22 -89 -79 -45 0 -75 -78 -174 -55 0 -101 -136 -113 -78 0 -76 -100 -128 -95 0 0 0 0 0 0 -38 -11 -19 -44 0 -46 -125 -143 -32 0 -106 -163 -69 -42 0 -92 72 -91 -65 0 0 0 0 0 0 -42 -55 -38 -73 0 -47 -57 -138 -44 0 -106 -148 -62 -53 0 -78 -75 -73 -63 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 # mismatch_interior 0 0 0 0 0 0 0 0 -34 0 0 0 0 0 0 0 -34 0 0 0 0 0 0 0 -21 0 0 0 0 0 0 0 0 -34 0 0 0 0 0 0 0 -34 0 0 0 0 0 0 0 -21 0 0 0 0 0 0 41 41 7 41 0 41 41 41 41 0 7 41 41 41 0 41 41 41 20 0 0 0 0 0 0 41 41 7 41 0 41 41 41 41 0 7 41 41 41 0 41 41 41 20 0 0 0 0 0 0 41 41 7 41 0 41 41 41 41 0 7 41 41 41 0 41 41 41 20 0 0 0 0 0 0 41 41 7 41 0 41 41 41 41 0 7 41 41 41 0 41 41 41 20 90 90 90 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 90 20 # dangle5 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF -16 -28 -13 -10 INF -32 -15 -37 -10 INF 0 0 -50 0 INF 0 -28 0 0 INF -6 0 0 0 INF 0 0 0 0 0 0 0 0 0 # dangle3 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF -60 -56 -101 -77 INF -93 -37 -83 -86 INF -32 -28 -50 -51 INF -32 -50 -63 -10 INF -38 -40 -50 -35 INF -46 -51 -65 -43 0 0 0 0 0 # int11_energies /* CG..CG */ 89 89 89 89 89 89 89 -17 75 -20 89 -17 34 -20 26 89 75 -20 18 -20 89 -20 26 -20 26 /* CG..GC */ 89 89 89 89 89 89 35 -16 -15 -20 89 0 42 -20 51 89 17 -20 -97 -20 89 -20 15 -20 -37 /* CG..GU */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* CG..UG */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* CG..AU */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 13 /* CG..UA */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 18 /* CG.. @ */ 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 /* GC..CG */ 89 89 89 89 89 89 35 0 17 -20 89 -16 42 -20 15 89 -15 -20 -97 -20 89 -20 51 -20 -37 /* GC..GC */ 89 89 89 89 89 89 22 -36 -58 -20 89 -36 19 -20 -57 89 -58 -20 -166 -20 89 -20 -57 -20 -114 /* GC..GU */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* GC..UG */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* GC..AU */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 -14 /* GC..UA */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 58 /* GC.. @ */ 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 /* GU..CG */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* GU..GC */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* GU..GU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* GU..UG */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* GU..AU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* GU..UA */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* GU.. @ */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* UG..CG */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* UG..GC */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 21 /* UG..GU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* UG..UG */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* UG..AU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* UG..UA */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* UG.. @ */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* AU..CG */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 13 /* AU..GC */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 -14 /* AU..GU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* AU..UG */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* AU..AU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 54 /* AU..UA */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 43 /* AU.. @ */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* UA..CG */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 18 /* UA..GC */ 89 89 89 89 89 89 21 21 21 21 89 21 21 21 21 89 21 21 -20 21 89 21 21 21 58 /* UA..GU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* UA..UG */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 62 /* UA..AU */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 43 /* UA..UA */ 149 149 149 149 149 149 62 62 62 62 149 62 62 62 62 149 62 62 21 62 149 62 62 62 149 /* UA.. @ */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* @..CG */ 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 /* @..GC */ 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 89 /* @..GU */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* @..UG */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* @..AU */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* @..UA */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 /* @.. @ */ 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 149 # int21_energies /* CG.@..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.A..CG */ 412 412 412 412 412 412 153 131 121 400 412 163 133 153 400 412 85 87 73 400 412 400 400 400 400 /* CG.C..CG */ 412 412 412 412 412 412 90 188 400 204 412 198 172 400 214 412 400 400 400 400 412 153 136 400 208 /* CG.G..CG */ 412 412 412 412 412 412 96 400 77 400 412 400 400 400 400 412 95 400 179 400 412 400 400 400 400 /* CG.U..CG */ 412 412 412 412 412 412 400 400 400 400 412 400 176 400 161 412 400 400 400 400 412 400 99 400 90 /* CG.@..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.A..GC */ 412 412 412 412 412 412 148 132 71 400 412 171 97 151 400 412 57 84 123 400 412 400 400 400 400 /* CG.C..GC */ 412 412 412 412 412 412 108 178 400 199 412 198 172 400 215 412 400 400 400 400 412 183 113 400 209 /* CG.G..GC */ 412 412 412 412 412 412 88 400 14 400 412 400 400 400 400 412 73 400 188 400 412 400 400 400 400 /* CG.U..GC */ 412 412 412 412 412 412 400 400 400 400 412 400 145 400 122 412 400 400 400 400 412 400 7 400 -1 /* CG.@..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.A..GU */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* CG.C..GU */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* CG.G..GU */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* CG.U..GU */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* CG.@..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.A..UG */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* CG.C..UG */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* CG.G..UG */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* CG.U..UG */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* CG.@..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.A..AU */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* CG.C..AU */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* CG.G..AU */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* CG.U..AU */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* CG.@..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.A..UA */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* CG.C..UA */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* CG.G..UA */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* CG.U..UA */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* CG.@.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.A.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.C.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.G.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* CG.U.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.@..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.A..CG */ 412 412 412 412 412 412 159 131 173 400 412 157 170 156 400 412 114 91 24 400 412 400 400 400 400 /* GC.C..CG */ 412 412 412 412 412 412 72 199 400 210 412 198 173 400 214 412 400 400 400 400 412 125 160 400 208 /* GC.G..CG */ 412 412 412 412 412 412 105 400 141 400 412 400 400 400 400 412 119 400 170 400 412 400 400 400 400 /* GC.U..CG */ 412 412 412 412 412 412 400 400 400 400 412 400 209 400 200 412 400 400 400 400 412 400 193 400 180 /* GC.@..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.A..GC */ 412 412 412 412 412 412 153 131 121 400 412 163 133 153 400 412 85 87 73 400 412 400 400 400 400 /* GC.C..GC */ 412 412 412 412 412 412 90 188 400 204 412 198 172 400 214 412 400 400 400 400 412 153 136 400 208 /* GC.G..GC */ 412 412 412 412 412 412 96 400 77 400 412 400 400 400 400 412 95 400 179 400 412 400 400 400 400 /* GC.U..GC */ 412 412 412 412 412 412 400 400 400 400 412 400 176 400 161 412 400 400 400 400 412 400 99 400 90 /* GC.@..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.A..GU */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* GC.C..GU */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* GC.G..GU */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* GC.U..GU */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* GC.@..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.A..UG */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* GC.C..UG */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* GC.G..UG */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* GC.U..UG */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* GC.@..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.A..AU */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* GC.C..AU */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* GC.G..AU */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* GC.U..AU */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* GC.@..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.A..UA */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* GC.C..UA */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* GC.G..UA */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* GC.U..UA */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* GC.@.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.A.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.C.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.G.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GC.U.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.@..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.A..CG */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* GU.C..CG */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* GU.G..CG */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* GU.U..CG */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* GU.@..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.A..GC */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* GU.C..GC */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* GU.G..GC */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* GU.U..GC */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* GU.@..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.A..GU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* GU.C..GU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* GU.G..GU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* GU.U..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* GU.@..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.A..UG */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* GU.C..UG */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* GU.G..UG */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* GU.U..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* GU.@..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.A..AU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* GU.C..AU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* GU.G..AU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* GU.U..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* GU.@..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.A..UA */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* GU.C..UA */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* GU.G..UA */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* GU.U..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* GU.@.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.A.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.C.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.G.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* GU.U.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.@..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.A..CG */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* UG.C..CG */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* UG.G..CG */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* UG.U..CG */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* UG.@..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.A..GC */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* UG.C..GC */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* UG.G..GC */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* UG.U..GC */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* UG.@..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.A..GU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UG.C..GU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UG.G..GU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UG.U..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UG.@..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.A..UG */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UG.C..UG */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UG.G..UG */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UG.U..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UG.@..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.A..AU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UG.C..AU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UG.G..AU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UG.U..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UG.@..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.A..UA */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UG.C..UA */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UG.G..UA */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UG.U..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UG.@.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.A.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.C.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.G.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UG.U.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.@..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.A..CG */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* AU.C..CG */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* AU.G..CG */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* AU.U..CG */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* AU.@..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.A..GC */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* AU.C..GC */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* AU.G..GC */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* AU.U..GC */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* AU.@..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.A..GU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* AU.C..GU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* AU.G..GU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* AU.U..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* AU.@..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.A..UG */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* AU.C..UG */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* AU.G..UG */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* AU.U..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* AU.@..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.A..AU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* AU.C..AU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* AU.G..AU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* AU.U..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* AU.@..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.A..UA */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* AU.C..UA */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* AU.G..UA */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* AU.U..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* AU.@.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.A.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.C.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.G.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* AU.U.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.@..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.A..CG */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* UA.C..CG */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* UA.G..CG */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* UA.U..CG */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* UA.@..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.A..GC */ 412 412 412 412 412 412 159 137 127 406 412 169 139 159 406 412 91 93 79 406 412 406 406 406 406 /* UA.C..GC */ 412 412 412 412 412 412 96 194 406 210 412 204 178 406 220 412 406 406 406 406 412 159 142 406 214 /* UA.G..GC */ 412 412 412 412 412 412 102 406 83 406 412 406 406 406 406 412 101 406 185 406 412 406 406 406 406 /* UA.U..GC */ 412 412 412 412 412 412 406 406 406 406 412 406 182 406 167 412 406 406 406 406 412 406 105 406 96 /* UA.@..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.A..GU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UA.C..GU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UA.G..GU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UA.U..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UA.@..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.A..UG */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UA.C..UG */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UA.G..UG */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UA.U..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UA.@..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.A..AU */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UA.C..AU */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UA.G..AU */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UA.U..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UA.@..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.A..UA */ 412 412 412 412 412 412 165 143 133 412 412 175 145 165 412 412 97 99 85 412 412 412 412 412 412 /* UA.C..UA */ 412 412 412 412 412 412 102 200 412 216 412 210 184 412 226 412 412 412 412 412 412 165 148 412 220 /* UA.G..UA */ 412 412 412 412 412 412 108 412 89 412 412 412 412 412 412 412 107 412 191 412 412 412 412 412 412 /* UA.U..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 188 412 173 412 412 412 412 412 412 412 111 412 102 /* UA.@.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.A.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.C.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.G.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* UA.U.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.@..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.A..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.C..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.G..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.U..CG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.@..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.A..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.C..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.G..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.U..GC */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.@..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.A..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.C..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.G..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.U..GU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.@..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.A..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.C..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.G..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.U..UG */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.@..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.A..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.C..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.G..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.U..AU */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.@..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.A..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.C..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.G..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.U..UA */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.@.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.A.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.C.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.G.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 /* @.U.. @ */ 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 412 # int22_energies /* CG.AA..CG */ 128 129 22 200 113 134 19 200 20 33 -74 200 200 200 200 200 /* CG.AC..CG */ 129 171 35 200 147 160 98 200 200 200 200 200 108 121 59 200 /* CG.AG..CG */ 22 35 -61 200 200 200 200 200 95 108 1 200 -53 -85 -59 200 /* CG.AU..CG */ 200 200 200 200 131 144 82 200 62 30 56 200 97 65 91 200 /* CG.CA..CG */ 113 147 200 131 139 144 200 128 17 96 200 80 200 200 200 200 /* CG.CC..CG */ 134 160 200 144 144 190 200 162 200 200 200 200 105 139 200 123 /* CG.CG..CG */ 19 98 200 82 200 200 200 200 92 126 200 110 -101 -22 200 -38 /* CG.CU..CG */ 200 200 200 200 128 162 200 158 14 93 200 77 49 83 200 67 /* CG.GA..CG */ 20 200 95 62 17 200 92 14 -65 200 -1 54 200 200 200 200 /* CG.GC..CG */ 33 200 108 30 96 200 126 93 200 200 200 200 57 200 87 54 /* CG.GG..CG */ -74 200 1 56 200 200 200 200 -1 200 86 41 -61 200 -74 -197 /* CG.GU..CG */ 200 200 200 200 80 200 110 77 54 200 41 -71 89 200 76 86 /* CG.UA..CG */ 200 108 -53 97 200 105 -101 49 200 57 -61 89 200 200 200 200 /* CG.UC..CG */ 200 121 -85 65 200 139 -22 83 200 200 200 200 200 112 -61 44 /* CG.UG..CG */ 200 59 -59 91 200 200 200 200 200 87 -74 76 200 -61 -301 -29 /* CG.UU..CG */ 200 200 200 200 200 123 -38 67 200 54 -197 86 200 44 -29 -1 /* CG.AA..GC */ 116 129 22 200 93 114 -1 200 -32 -19 -126 200 200 200 200 200 /* CG.AC..GC */ 93 114 -1 200 84 97 35 200 200 200 200 200 73 86 24 200 /* CG.AG..GC */ 20 33 -74 200 200 200 200 200 35 48 -59 200 -47 -79 -53 200 /* CG.AU..GC */ 200 200 200 200 108 121 59 200 -41 -73 -47 200 70 38 64 200 /* CG.CA..GC */ 113 147 200 131 98 124 200 108 -35 44 200 28 200 200 200 200 /* CG.CC..GC */ 98 124 200 108 81 115 200 99 200 200 200 200 70 104 200 88 /* CG.CG..GC */ 17 96 200 80 200 200 200 200 32 66 200 50 -95 -16 200 -32 /* CG.CU..GC */ 200 200 200 200 105 139 200 123 -89 -10 200 -26 22 56 200 40 /* CG.GA..GC */ 20 200 95 62 -3 200 72 -6 -128 200 -53 2 200 200 200 200 /* CG.GC..GC */ -3 200 72 -6 33 200 63 30 200 200 200 200 22 200 52 19 /* CG.GG..GC */ -76 200 -1 54 200 200 200 200 -61 200 14 -19 -55 200 -68 -191 /* CG.GU..GC */ 200 200 200 200 57 200 87 54 -49 200 -62 -185 62 200 49 59 /* CG.UA..GC */ 200 108 -53 97 200 85 -121 29 200 5 -113 37 200 200 200 200 /* CG.UC..GC */ 200 85 -121 29 200 76 -85 20 200 200 200 200 200 65 -96 9 /* CG.UG..GC */ 200 57 -61 89 200 200 200 200 200 27 -134 16 200 -55 -306 -23 /* CG.UU..GC */ 200 200 200 200 200 100 -61 44 200 -49 -300 -17 200 17 -56 -39 /* CG.AA..GU */ 133 146 39 200 163 184 69 200 61 74 -33 200 200 200 200 200 /* CG.AC..GU */ 122 143 28 200 152 165 103 200 200 200 200 200 120 133 71 200 /* CG.AG..GU */ 113 126 19 200 200 200 200 200 102 115 8 200 51 19 45 200 /* CG.AU..GU */ 200 200 200 200 132 145 83 200 109 77 103 200 108 76 102 200 /* CG.CA..GU */ 130 164 200 148 168 194 200 178 58 137 200 121 200 200 200 200 /* CG.CC..GU */ 127 153 200 137 149 183 200 167 200 200 200 200 117 151 200 135 /* CG.CG..GU */ 110 189 200 173 200 200 200 200 99 133 200 117 3 82 200 66 /* CG.CU..GU */ 200 200 200 200 129 163 200 147 61 140 200 124 60 94 200 78 /* CG.GA..GU */ 37 200 112 79 67 200 142 64 -35 200 40 95 200 200 200 200 /* CG.GC..GU */ 26 200 101 23 101 200 131 98 200 200 200 200 69 200 99 66 /* CG.GG..GU */ 17 200 92 147 200 200 200 200 6 200 81 48 43 200 30 -93 /* CG.GU..GU */ 200 200 200 200 81 200 111 78 101 200 88 -35 100 200 87 97 /* CG.UA..GU */ 200 125 -36 114 200 155 -51 99 200 98 -20 130 200 200 200 200 /* CG.UC..GU */ 200 114 -92 58 200 144 -17 88 200 200 200 200 200 112 -49 56 /* CG.UG..GU */ 200 150 32 182 200 200 200 200 200 94 -67 83 200 43 -208 75 /* CG.UU..GU */ 200 200 200 200 200 124 -37 68 200 101 -150 133 200 55 -18 -1 /* CG.AA..UG */ 157 170 63 200 137 158 43 200 69 82 -25 200 200 200 200 200 /* CG.AC..UG */ 149 170 55 200 166 179 117 200 200 200 200 200 134 147 85 200 /* CG.AG..UG */ 112 125 18 200 200 200 200 200 121 134 27 200 40 8 34 200 /* CG.AU..UG */ 200 200 200 200 179 192 130 200 103 71 97 200 122 90 116 200 /* CG.CA..UG */ 154 188 200 172 142 168 200 152 66 145 200 129 200 200 200 200 /* CG.CC..UG */ 154 180 200 164 163 197 200 181 200 200 200 200 131 165 200 149 /* CG.CG..UG */ 109 188 200 172 200 200 200 200 118 152 200 136 -8 71 200 55 /* CG.CU..UG */ 200 200 200 200 176 210 200 194 55 134 200 118 74 108 200 92 /* CG.GA..UG */ 61 200 136 103 41 200 116 38 -27 200 48 103 200 200 200 200 /* CG.GC..UG */ 53 200 128 50 115 200 145 112 200 200 200 200 83 200 113 80 /* CG.GG..UG */ 16 200 91 146 200 200 200 200 25 200 100 67 32 200 19 -104 /* CG.GU..UG */ 200 200 200 200 128 200 158 125 95 200 82 -41 114 200 101 111 /* CG.UA..UG */ 200 149 -12 138 200 129 -77 73 200 106 -12 138 200 200 200 200 /* CG.UC..UG */ 200 141 -65 85 200 158 -3 102 200 200 200 200 200 126 -35 70 /* CG.UG..UG */ 200 149 31 181 200 200 200 200 200 113 -48 102 200 32 -219 64 /* CG.UU..UG */ 200 200 200 200 200 171 10 115 200 95 -156 127 200 69 -4 13 /* CG.AA..AU */ 133 146 39 200 163 184 69 200 61 74 -33 200 200 200 200 200 /* CG.AC..AU */ 122 143 28 200 152 165 103 200 200 200 200 200 120 133 71 200 /* CG.AG..AU */ 113 126 19 200 200 200 200 200 102 115 8 200 51 19 45 200 /* CG.AU..AU */ 200 200 200 200 132 145 83 200 109 77 103 200 108 76 102 200 /* CG.CA..AU */ 130 164 200 148 168 194 200 178 58 137 200 121 200 200 200 200 /* CG.CC..AU */ 127 153 200 137 149 183 200 167 200 200 200 200 117 151 200 135 /* CG.CG..AU */ 110 189 200 173 200 200 200 200 99 133 200 117 3 82 200 66 /* CG.CU..AU */ 200 200 200 200 129 163 200 147 61 140 200 124 60 94 200 78 /* CG.GA..AU */ 37 200 112 79 67 200 142 64 -35 200 40 95 200 200 200 200 /* CG.GC..AU */ 26 200 101 23 101 200 131 98 200 200 200 200 69 200 99 66 /* CG.GG..AU */ 17 200 92 147 200 200 200 200 6 200 81 48 43 200 30 -93 /* CG.GU..AU */ 200 200 200 200 81 200 111 78 101 200 88 -35 100 200 87 97 /* CG.UA..AU */ 200 125 -36 114 200 155 -51 99 200 98 -20 130 200 200 200 200 /* CG.UC..AU */ 200 114 -92 58 200 144 -17 88 200 200 200 200 200 112 -49 56 /* CG.UG..AU */ 200 150 32 182 200 200 200 200 200 94 -67 83 200 43 -208 75 /* CG.UU..AU */ 200 200 200 200 200 124 -37 68 200 101 -150 133 200 55 -18 -1 /* CG.AA..UA */ 157 170 63 200 137 158 43 200 69 82 -25 200 200 200 200 200 /* CG.AC..UA */ 149 170 55 200 166 179 117 200 200 200 200 200 134 147 85 200 /* CG.AG..UA */ 112 125 18 200 200 200 200 200 121 134 27 200 40 8 34 200 /* CG.AU..UA */ 200 200 200 200 179 192 130 200 103 71 97 200 122 90 116 200 /* CG.CA..UA */ 154 188 200 172 142 168 200 152 66 145 200 129 200 200 200 200 /* CG.CC..UA */ 154 180 200 164 163 197 200 181 200 200 200 200 131 165 200 149 /* CG.CG..UA */ 109 188 200 172 200 200 200 200 118 152 200 136 -8 71 200 55 /* CG.CU..UA */ 200 200 200 200 176 210 200 194 55 134 200 118 74 108 200 92 /* CG.GA..UA */ 61 200 136 103 41 200 116 38 -27 200 48 103 200 200 200 200 /* CG.GC..UA */ 53 200 128 50 115 200 145 112 200 200 200 200 83 200 113 80 /* CG.GG..UA */ 16 200 91 146 200 200 200 200 25 200 100 67 32 200 19 -104 /* CG.GU..UA */ 200 200 200 200 128 200 158 125 95 200 82 -41 114 200 101 111 /* CG.UA..UA */ 200 149 -12 138 200 129 -77 73 200 106 -12 138 200 200 200 200 /* CG.UC..UA */ 200 141 -65 85 200 158 -3 102 200 200 200 200 200 126 -35 70 /* CG.UG..UA */ 200 149 31 181 200 200 200 200 200 113 -48 102 200 32 -219 64 /* CG.UU..UA */ 200 200 200 200 200 171 10 115 200 95 -156 127 200 69 -4 13 /* CG.AA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.AC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.AG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.AU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.CA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.CC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.CG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.CU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.GA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.GC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.GG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.GU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.UA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.UC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.UG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* CG.UU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.AA..CG */ 116 93 20 200 113 98 17 200 20 -3 -76 200 200 200 200 200 /* GC.AC..CG */ 129 114 33 200 147 124 96 200 200 200 200 200 108 85 57 200 /* GC.AG..CG */ 22 -1 -74 200 200 200 200 200 95 72 -1 200 -53 -121 -61 200 /* GC.AU..CG */ 200 200 200 200 131 108 80 200 62 -6 54 200 97 29 89 200 /* GC.CA..CG */ 93 84 200 108 98 81 200 105 -3 33 200 57 200 200 200 200 /* GC.CC..CG */ 114 97 200 121 124 115 200 139 200 200 200 200 85 76 200 100 /* GC.CG..CG */ -1 35 200 59 200 200 200 200 72 63 200 87 -121 -85 200 -61 /* GC.CU..CG */ 200 200 200 200 108 99 200 123 -6 30 200 54 29 20 200 44 /* GC.GA..CG */ -32 200 35 -41 -35 200 32 -89 -128 200 -61 -49 200 200 200 200 /* GC.GC..CG */ -19 200 48 -73 44 200 66 -10 200 200 200 200 5 200 27 -49 /* GC.GG..CG */ -126 200 -59 -47 200 200 200 200 -53 200 14 -62 -113 200 -134 -300 /* GC.GU..CG */ 200 200 200 200 28 200 50 -26 2 200 -19 -185 37 200 16 -17 /* GC.UA..CG */ 200 73 -47 70 200 70 -95 22 200 22 -55 62 200 200 200 200 /* GC.UC..CG */ 200 86 -79 38 200 104 -16 56 200 200 200 200 200 65 -55 17 /* GC.UG..CG */ 200 24 -53 64 200 200 200 200 200 52 -68 49 200 -96 -306 -56 /* GC.UU..CG */ 200 200 200 200 200 88 -32 40 200 19 -191 59 200 9 -23 -39 /* GC.AA..GC */ 128 93 20 200 93 78 -3 200 -32 -55 -128 200 200 200 200 200 /* GC.AC..GC */ 93 98 -3 200 84 61 33 200 200 200 200 200 73 50 22 200 /* GC.AG..GC */ 20 -3 -64 200 200 200 200 200 35 12 -61 200 -47 -115 -55 200 /* GC.AU..GC */ 200 200 200 200 108 85 57 200 -41 -109 -49 200 70 2 62 200 /* GC.CA..GC */ 93 84 200 108 98 61 200 85 -55 -19 200 5 200 200 200 200 /* GC.CC..GC */ 78 61 200 85 61 65 200 76 200 200 200 200 50 41 200 65 /* GC.CG..GC */ -3 33 200 57 200 200 200 200 12 3 200 27 -115 -79 200 -55 /* GC.CU..GC */ 200 200 200 200 85 76 200 112 -109 -73 200 -49 2 -7 200 17 /* GC.GA..GC */ -32 200 35 -41 -55 200 12 -109 -169 200 -113 -101 200 200 200 200 /* GC.GC..GC */ -55 200 12 -109 -19 200 3 -73 200 200 200 200 -30 200 -8 -84 /* GC.GG..GC */ -128 200 -61 -49 200 200 200 200 -113 200 -34 -122 -107 200 -128 -294 /* GC.GU..GC */ 200 200 200 200 5 200 27 -49 -101 200 -122 -277 10 200 -11 -44 /* GC.UA..GC */ 200 73 -47 70 200 50 -115 2 200 -30 -107 10 200 200 200 200 /* GC.UC..GC */ 200 50 -115 2 200 41 -79 -7 200 200 200 200 200 42 -90 -18 /* GC.UG..GC */ 200 22 -55 62 200 200 200 200 200 -8 -128 -11 200 -90 -289 -50 /* GC.UU..GC */ 200 200 200 200 200 65 -55 17 200 -84 -294 -44 200 -18 -50 -54 /* GC.AA..GU */ 133 110 37 200 163 148 67 200 61 38 -35 200 200 200 200 200 /* GC.AC..GU */ 122 107 26 200 152 129 101 200 200 200 200 200 120 97 69 200 /* GC.AG..GU */ 113 90 17 200 200 200 200 200 102 79 6 200 51 -17 43 200 /* GC.AU..GU */ 200 200 200 200 132 109 81 200 109 41 101 200 108 40 100 200 /* GC.CA..GU */ 110 101 200 125 148 131 200 155 38 74 200 98 200 200 200 200 /* GC.CC..GU */ 107 90 200 114 129 120 200 144 200 200 200 200 97 88 200 112 /* GC.CG..GU */ 90 126 200 150 200 200 200 200 79 70 200 94 -17 19 200 43 /* GC.CU..GU */ 200 200 200 200 109 100 200 124 41 77 200 101 40 31 200 55 /* GC.GA..GU */ -15 200 52 -24 15 200 82 -39 -87 200 -20 -8 200 200 200 200 /* GC.GC..GU */ -26 200 41 -80 49 200 71 -5 200 200 200 200 17 200 39 -37 /* GC.GG..GU */ -35 200 32 44 200 200 200 200 -46 200 21 -55 -9 200 -30 -196 /* GC.GU..GU */ 200 200 200 200 29 200 51 -25 49 200 28 -138 48 200 27 -6 /* GC.UA..GU */ 200 90 -30 87 200 120 -45 72 200 63 -14 103 200 200 200 200 /* GC.UC..GU */ 200 79 -86 31 200 109 -11 61 200 200 200 200 200 77 -43 29 /* GC.UG..GU */ 200 115 38 155 200 200 200 200 200 59 -61 56 200 8 -202 48 /* GC.UU..GU */ 200 200 200 200 200 89 -31 41 200 66 -144 106 200 20 -12 -28 /* GC.AA..UG */ 157 134 61 200 137 122 41 200 69 46 -27 200 200 200 200 200 /* GC.AC..UG */ 149 134 53 200 166 143 115 200 200 200 200 200 134 111 83 200 /* GC.AG..UG */ 112 89 16 200 200 200 200 200 121 98 25 200 40 -28 32 200 /* GC.AU..UG */ 200 200 200 200 179 156 128 200 103 35 95 200 122 54 114 200 /* GC.CA..UG */ 134 125 200 149 122 105 200 129 46 82 200 106 200 200 200 200 /* GC.CC..UG */ 134 117 200 141 143 134 200 158 200 200 200 200 111 102 200 126 /* GC.CG..UG */ 89 125 200 149 200 200 200 200 98 89 200 113 -28 8 200 32 /* GC.CU..UG */ 200 200 200 200 156 147 200 171 35 71 200 95 54 45 200 69 /* GC.GA..UG */ 9 200 76 0 -11 200 56 -65 -79 200 -12 0 200 200 200 200 /* GC.GC..UG */ 1 200 68 -53 63 200 85 9 200 200 200 200 31 200 53 -23 /* GC.GG..UG */ -36 200 31 43 200 200 200 200 -27 200 40 -36 -20 200 -41 -207 /* GC.GU..UG */ 200 200 200 200 76 200 98 22 43 200 22 -144 62 200 41 8 /* GC.UA..UG */ 200 114 -6 111 200 94 -71 46 200 71 -6 111 200 200 200 200 /* GC.UC..UG */ 200 106 -59 58 200 123 3 75 200 200 200 200 200 91 -29 43 /* GC.UG..UG */ 200 114 37 154 200 200 200 200 200 78 -42 75 200 -3 -213 37 /* GC.UU..UG */ 200 200 200 200 200 136 16 88 200 60 -150 100 200 34 2 -14 /* GC.AA..AU */ 133 110 37 200 163 148 67 200 61 38 -35 200 200 200 200 200 /* GC.AC..AU */ 122 107 26 200 152 129 101 200 200 200 200 200 120 97 69 200 /* GC.AG..AU */ 113 90 17 200 200 200 200 200 102 79 6 200 51 -17 43 200 /* GC.AU..AU */ 200 200 200 200 132 109 81 200 109 41 101 200 108 40 100 200 /* GC.CA..AU */ 110 101 200 125 148 131 200 155 38 74 200 98 200 200 200 200 /* GC.CC..AU */ 107 90 200 114 129 120 200 144 200 200 200 200 97 88 200 112 /* GC.CG..AU */ 90 126 200 150 200 200 200 200 79 70 200 94 -17 19 200 43 /* GC.CU..AU */ 200 200 200 200 109 100 200 124 41 77 200 101 40 31 200 55 /* GC.GA..AU */ -15 200 52 -24 15 200 82 -39 -87 200 -20 -8 200 200 200 200 /* GC.GC..AU */ -26 200 41 -80 49 200 71 -5 200 200 200 200 17 200 39 -37 /* GC.GG..AU */ -35 200 32 44 200 200 200 200 -46 200 21 -55 -9 200 -30 -196 /* GC.GU..AU */ 200 200 200 200 29 200 51 -25 49 200 28 -138 48 200 27 -6 /* GC.UA..AU */ 200 90 -30 87 200 120 -45 72 200 63 -14 103 200 200 200 200 /* GC.UC..AU */ 200 79 -86 31 200 109 -11 61 200 200 200 200 200 77 -43 29 /* GC.UG..AU */ 200 115 38 155 200 200 200 200 200 59 -61 56 200 8 -202 48 /* GC.UU..AU */ 200 200 200 200 200 89 -31 41 200 66 -144 106 200 20 -12 -28 /* GC.AA..UA */ 157 134 61 200 137 122 41 200 69 46 -27 200 200 200 200 200 /* GC.AC..UA */ 149 134 53 200 166 143 115 200 200 200 200 200 134 111 83 200 /* GC.AG..UA */ 112 89 16 200 200 200 200 200 121 98 25 200 40 -28 32 200 /* GC.AU..UA */ 200 200 200 200 179 156 128 200 103 35 95 200 122 54 114 200 /* GC.CA..UA */ 134 125 200 149 122 105 200 129 46 82 200 106 200 200 200 200 /* GC.CC..UA */ 134 117 200 141 143 134 200 158 200 200 200 200 111 102 200 126 /* GC.CG..UA */ 89 125 200 149 200 200 200 200 98 89 200 113 -28 8 200 32 /* GC.CU..UA */ 200 200 200 200 156 147 200 171 35 71 200 95 54 45 200 69 /* GC.GA..UA */ 9 200 76 0 -11 200 56 -65 -79 200 -12 0 200 200 200 200 /* GC.GC..UA */ 1 200 68 -53 63 200 85 9 200 200 200 200 31 200 53 -23 /* GC.GG..UA */ -36 200 31 43 200 200 200 200 -27 200 40 -36 -20 200 -41 -207 /* GC.GU..UA */ 200 200 200 200 76 200 98 22 43 200 22 -144 62 200 41 8 /* GC.UA..UA */ 200 114 -6 111 200 94 -71 46 200 71 -6 111 200 200 200 200 /* GC.UC..UA */ 200 106 -59 58 200 123 3 75 200 200 200 200 200 91 -29 43 /* GC.UG..UA */ 200 114 37 154 200 200 200 200 200 78 -42 75 200 -3 -213 37 /* GC.UU..UA */ 200 200 200 200 200 136 16 88 200 60 -150 100 200 34 2 -14 /* GC.AA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.AC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.AG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.AU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.CA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.CC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.CG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.CU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.GA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.GC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.GG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.GU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.UA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.UC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.UG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GC.UU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.AA..CG */ 133 122 113 200 130 127 110 200 37 26 17 200 200 200 200 200 /* GU.AC..CG */ 146 143 126 200 164 153 189 200 200 200 200 200 125 114 150 200 /* GU.AG..CG */ 39 28 19 200 200 200 200 200 112 101 92 200 -36 -92 32 200 /* GU.AU..CG */ 200 200 200 200 148 137 173 200 79 23 147 200 114 58 182 200 /* GU.CA..CG */ 163 152 200 132 168 149 200 129 67 101 200 81 200 200 200 200 /* GU.CC..CG */ 184 165 200 145 194 183 200 163 200 200 200 200 155 144 200 124 /* GU.CG..CG */ 69 103 200 83 200 200 200 200 142 131 200 111 -51 -17 200 -37 /* GU.CU..CG */ 200 200 200 200 178 167 200 147 64 98 200 78 99 88 200 68 /* GU.GA..CG */ 61 200 102 109 58 200 99 61 -35 200 6 101 200 200 200 200 /* GU.GC..CG */ 74 200 115 77 137 200 133 140 200 200 200 200 98 200 94 101 /* GU.GG..CG */ -33 200 8 103 200 200 200 200 40 200 81 88 -20 200 -67 -150 /* GU.GU..CG */ 200 200 200 200 121 200 117 124 95 200 48 -35 130 200 83 133 /* GU.UA..CG */ 200 120 51 108 200 117 3 60 200 69 43 100 200 200 200 200 /* GU.UC..CG */ 200 133 19 76 200 151 82 94 200 200 200 200 200 112 43 55 /* GU.UG..CG */ 200 71 45 102 200 200 200 200 200 99 30 87 200 -49 -208 -18 /* GU.UU..CG */ 200 200 200 200 200 135 66 78 200 66 -93 97 200 56 75 -1 /* GU.AA..GC */ 133 122 113 200 110 107 90 200 -15 -26 -35 200 200 200 200 200 /* GU.AC..GC */ 110 107 90 200 101 90 126 200 200 200 200 200 90 79 115 200 /* GU.AG..GC */ 37 26 17 200 200 200 200 200 52 41 32 200 -30 -86 38 200 /* GU.AU..GC */ 200 200 200 200 125 114 150 200 -24 -80 44 200 87 31 155 200 /* GU.CA..GC */ 163 152 200 132 148 129 200 109 15 49 200 29 200 200 200 200 /* GU.CC..GC */ 148 129 200 109 131 120 200 100 200 200 200 200 120 109 200 89 /* GU.CG..GC */ 67 101 200 81 200 200 200 200 82 71 200 51 -45 -11 200 -31 /* GU.CU..GC */ 200 200 200 200 155 144 200 124 -39 -5 200 -25 72 61 200 41 /* GU.GA..GC */ 61 200 102 109 38 200 79 41 -87 200 -46 49 200 200 200 200 /* GU.GC..GC */ 38 200 79 41 74 200 70 77 200 200 200 200 63 200 59 66 /* GU.GG..GC */ -35 200 6 101 200 200 200 200 -20 200 21 28 -14 200 -61 -144 /* GU.GU..GC */ 200 200 200 200 98 200 94 101 -8 200 -55 -138 103 200 56 106 /* GU.UA..GC */ 200 120 51 108 200 97 -17 40 200 17 -9 48 200 200 200 200 /* GU.UC..GC */ 200 97 -17 40 200 88 19 31 200 200 200 200 200 77 8 20 /* GU.UG..GC */ 200 69 43 100 200 200 200 200 200 39 -30 27 200 -43 -202 -12 /* GU.UU..GC */ 200 200 200 200 200 112 43 55 200 -37 -196 -6 200 29 48 -28 /* GU.AA..GU */ 163 139 130 200 180 177 160 200 78 67 58 200 200 200 200 200 /* GU.AC..GU */ 139 156 119 200 169 158 194 200 200 200 200 200 137 126 162 200 /* GU.AG..GU */ 130 119 122 200 200 200 200 200 119 108 99 200 68 12 136 200 /* GU.AU..GU */ 200 200 200 200 149 138 174 200 126 70 194 200 125 69 193 200 /* GU.CA..GU */ 180 169 200 149 239 199 200 179 108 142 200 122 200 200 200 200 /* GU.CC..GU */ 177 158 200 138 199 201 200 168 200 200 200 200 167 156 200 136 /* GU.CG..GU */ 160 194 200 174 200 200 200 200 149 138 200 118 53 87 200 67 /* GU.CU..GU */ 200 200 200 200 179 168 200 160 111 145 200 125 110 99 200 79 /* GU.GA..GU */ 78 200 119 126 108 200 149 111 18 200 47 142 200 200 200 200 /* GU.GC..GU */ 67 200 108 70 142 200 138 145 200 200 200 200 110 200 106 113 /* GU.GG..GU */ 58 200 99 194 200 200 200 200 47 200 100 95 84 200 37 -46 /* GU.GU..GU */ 200 200 200 200 122 200 118 125 142 200 95 25 141 200 94 144 /* GU.UA..GU */ 200 137 68 125 200 167 53 110 200 110 84 141 200 200 200 200 /* GU.UC..GU */ 200 126 12 69 200 156 87 99 200 200 200 200 200 137 55 67 /* GU.UG..GU */ 200 162 136 193 200 200 200 200 200 106 37 94 200 55 -92 86 /* GU.UU..GU */ 200 200 200 200 200 136 67 79 200 113 -46 144 200 67 86 22 /* GU.AA..UG */ 174 163 154 200 154 151 134 200 86 75 66 200 200 200 200 200 /* GU.AC..UG */ 166 163 146 200 183 172 208 200 200 200 200 200 151 140 176 200 /* GU.AG..UG */ 129 118 109 200 200 200 200 200 138 127 118 200 57 1 125 200 /* GU.AU..UG */ 200 200 200 200 196 185 221 200 120 64 188 200 139 83 207 200 /* GU.CA..UG */ 204 193 200 173 192 173 200 153 116 150 200 130 200 200 200 200 /* GU.CC..UG */ 204 185 200 165 213 202 200 182 200 200 200 200 181 170 200 150 /* GU.CG..UG */ 159 193 200 173 200 200 200 200 168 157 200 137 42 76 200 56 /* GU.CU..UG */ 200 200 200 200 226 215 200 195 105 139 200 119 124 113 200 93 /* GU.GA..UG */ 102 200 143 150 82 200 123 85 14 200 55 150 200 200 200 200 /* GU.GC..UG */ 94 200 135 97 156 200 152 159 200 200 200 200 124 200 120 127 /* GU.GG..UG */ 57 200 98 193 200 200 200 200 66 200 107 114 73 200 26 -57 /* GU.GU..UG */ 200 200 200 200 169 200 165 172 136 200 89 6 155 200 108 158 /* GU.UA..UG */ 200 161 92 149 200 141 27 84 200 118 92 149 200 200 200 200 /* GU.UC..UG */ 200 153 39 96 200 170 101 113 200 200 200 200 200 138 69 81 /* GU.UG..UG */ 200 161 135 192 200 200 200 200 200 125 56 113 200 44 -115 75 /* GU.UU..UG */ 200 200 200 200 200 183 114 126 200 107 -52 138 200 81 100 24 /* GU.AA..AU */ 163 139 130 200 180 177 160 200 78 67 58 200 200 200 200 200 /* GU.AC..AU */ 139 156 119 200 169 158 194 200 200 200 200 200 137 126 162 200 /* GU.AG..AU */ 130 119 122 200 200 200 200 200 119 108 99 200 68 12 136 200 /* GU.AU..AU */ 200 200 200 200 149 138 174 200 126 70 194 200 125 69 193 200 /* GU.CA..AU */ 180 169 200 149 239 199 200 179 108 142 200 122 200 200 200 200 /* GU.CC..AU */ 177 158 200 138 199 201 200 168 200 200 200 200 167 156 200 136 /* GU.CG..AU */ 160 194 200 174 200 200 200 200 149 138 200 118 53 87 200 67 /* GU.CU..AU */ 200 200 200 200 179 168 200 160 111 145 200 125 110 99 200 79 /* GU.GA..AU */ 78 200 119 126 108 200 149 111 18 200 47 142 200 200 200 200 /* GU.GC..AU */ 67 200 108 70 142 200 138 145 200 200 200 200 110 200 106 113 /* GU.GG..AU */ 58 200 99 194 200 200 200 200 47 200 100 95 84 200 37 -46 /* GU.GU..AU */ 200 200 200 200 122 200 118 125 142 200 95 25 141 200 94 144 /* GU.UA..AU */ 200 137 68 125 200 167 53 110 200 110 84 141 200 200 200 200 /* GU.UC..AU */ 200 126 12 69 200 156 87 99 200 200 200 200 200 137 55 67 /* GU.UG..AU */ 200 162 136 193 200 200 200 200 200 106 37 94 200 55 -92 86 /* GU.UU..AU */ 200 200 200 200 200 136 67 79 200 113 -46 144 200 67 86 22 /* GU.AA..UA */ 174 163 154 200 154 151 134 200 86 75 66 200 200 200 200 200 /* GU.AC..UA */ 166 163 146 200 183 172 208 200 200 200 200 200 151 140 176 200 /* GU.AG..UA */ 129 118 109 200 200 200 200 200 138 127 118 200 57 1 125 200 /* GU.AU..UA */ 200 200 200 200 196 185 221 200 120 64 188 200 139 83 207 200 /* GU.CA..UA */ 204 193 200 173 192 173 200 153 116 150 200 130 200 200 200 200 /* GU.CC..UA */ 204 185 200 165 213 202 200 182 200 200 200 200 181 170 200 150 /* GU.CG..UA */ 159 193 200 173 200 200 200 200 168 157 200 137 42 76 200 56 /* GU.CU..UA */ 200 200 200 200 226 215 200 195 105 139 200 119 124 113 200 93 /* GU.GA..UA */ 102 200 143 150 82 200 123 85 14 200 55 150 200 200 200 200 /* GU.GC..UA */ 94 200 135 97 156 200 152 159 200 200 200 200 124 200 120 127 /* GU.GG..UA */ 57 200 98 193 200 200 200 200 66 200 107 114 73 200 26 -57 /* GU.GU..UA */ 200 200 200 200 169 200 165 172 136 200 89 6 155 200 108 158 /* GU.UA..UA */ 200 161 92 149 200 141 27 84 200 118 92 149 200 200 200 200 /* GU.UC..UA */ 200 153 39 96 200 170 101 113 200 200 200 200 200 138 69 81 /* GU.UG..UA */ 200 161 135 192 200 200 200 200 200 125 56 113 200 44 -115 75 /* GU.UU..UA */ 200 200 200 200 200 183 114 126 200 107 -52 138 200 81 100 24 /* GU.AA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.AC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.AG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.AU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.CA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.CC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.CG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.CU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.GA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.GC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.GG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.GU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.UA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.UC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.UG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* GU.UU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.AA..CG */ 157 149 112 200 154 154 109 200 61 53 16 200 200 200 200 200 /* UG.AC..CG */ 170 170 125 200 188 180 188 200 200 200 200 200 149 141 149 200 /* UG.AG..CG */ 63 55 18 200 200 200 200 200 136 128 91 200 -12 -65 31 200 /* UG.AU..CG */ 200 200 200 200 172 164 172 200 103 50 146 200 138 85 181 200 /* UG.CA..CG */ 137 166 200 179 142 163 200 176 41 115 200 128 200 200 200 200 /* UG.CC..CG */ 158 179 200 192 168 197 200 210 200 200 200 200 129 158 200 171 /* UG.CG..CG */ 43 117 200 130 200 200 200 200 116 145 200 158 -77 -3 200 10 /* UG.CU..CG */ 200 200 200 200 152 181 200 194 38 112 200 125 73 102 200 115 /* UG.GA..CG */ 69 200 121 103 66 200 118 55 -27 200 25 95 200 200 200 200 /* UG.GC..CG */ 82 200 134 71 145 200 152 134 200 200 200 200 106 200 113 95 /* UG.GG..CG */ -25 200 27 97 200 200 200 200 48 200 100 82 -12 200 -48 -156 /* UG.GU..CG */ 200 200 200 200 129 200 136 118 103 200 67 -41 138 200 102 127 /* UG.UA..CG */ 200 134 40 122 200 131 -8 74 200 83 32 114 200 200 200 200 /* UG.UC..CG */ 200 147 8 90 200 165 71 108 200 200 200 200 200 126 32 69 /* UG.UG..CG */ 200 85 34 116 200 200 200 200 200 113 19 101 200 -35 -219 -4 /* UG.UU..CG */ 200 200 200 200 200 149 55 92 200 80 -104 111 200 70 64 13 /* UG.AA..GC */ 157 149 112 200 134 134 89 200 9 1 -36 200 200 200 200 200 /* UG.AC..GC */ 134 134 89 200 125 117 125 200 200 200 200 200 114 106 114 200 /* UG.AG..GC */ 61 53 16 200 200 200 200 200 76 68 31 200 -6 -59 37 200 /* UG.AU..GC */ 200 200 200 200 149 141 149 200 0 -53 43 200 111 58 154 200 /* UG.CA..GC */ 137 166 200 179 122 143 200 156 -11 63 200 76 200 200 200 200 /* UG.CC..GC */ 122 143 200 156 105 134 200 147 200 200 200 200 94 123 200 136 /* UG.CG..GC */ 41 115 200 128 200 200 200 200 56 85 200 98 -71 3 200 16 /* UG.CU..GC */ 200 200 200 200 129 158 200 171 -65 9 200 22 46 75 200 88 /* UG.GA..GC */ 69 200 121 103 46 200 98 35 -79 200 -27 43 200 200 200 200 /* UG.GC..GC */ 46 200 98 35 82 200 89 71 200 200 200 200 71 200 78 60 /* UG.GG..GC */ -27 200 25 95 200 200 200 200 -12 200 40 22 -6 200 -42 -150 /* UG.GU..GC */ 200 200 200 200 106 200 113 95 0 200 -36 -144 111 200 75 100 /* UG.UA..GC */ 200 134 40 122 200 111 -28 54 200 31 -20 62 200 200 200 200 /* UG.UC..GC */ 200 111 -28 54 200 102 8 45 200 200 200 200 200 91 -3 34 /* UG.UG..GC */ 200 83 32 114 200 200 200 200 200 53 -41 41 200 -29 -213 2 /* UG.UU..GC */ 200 200 200 200 200 126 32 69 200 -23 -207 8 200 43 37 -14 /* UG.AA..GU */ 174 166 129 200 204 204 159 200 102 94 57 200 200 200 200 200 /* UG.AC..GU */ 163 163 118 200 193 185 193 200 200 200 200 200 161 153 161 200 /* UG.AG..GU */ 154 146 109 200 200 200 200 200 143 135 98 200 92 39 135 200 /* UG.AU..GU */ 200 200 200 200 173 165 173 200 150 97 193 200 149 96 192 200 /* UG.CA..GU */ 154 183 200 196 192 213 200 226 82 156 200 169 200 200 200 200 /* UG.CC..GU */ 151 172 200 185 173 202 200 215 200 200 200 200 141 170 200 183 /* UG.CG..GU */ 134 208 200 221 200 200 200 200 123 152 200 165 27 101 200 114 /* UG.CU..GU */ 200 200 200 200 153 182 200 195 85 159 200 172 84 113 200 126 /* UG.GA..GU */ 86 200 138 120 116 200 168 105 14 200 66 136 200 200 200 200 /* UG.GC..GU */ 75 200 127 64 150 200 157 139 200 200 200 200 118 200 125 107 /* UG.GG..GU */ 66 200 118 188 200 200 200 200 55 200 107 89 92 200 56 -52 /* UG.GU..GU */ 200 200 200 200 130 200 137 119 150 200 114 6 149 200 113 138 /* UG.UA..GU */ 200 151 57 139 200 181 42 124 200 124 73 155 200 200 200 200 /* UG.UC..GU */ 200 140 1 83 200 170 76 113 200 200 200 200 200 138 44 81 /* UG.UG..GU */ 200 176 125 207 200 200 200 200 200 120 26 108 200 69 -115 100 /* UG.UU..GU */ 200 200 200 200 200 150 56 93 200 127 -57 158 200 81 75 24 /* UG.AA..UG */ 210 190 153 200 178 178 133 200 110 102 65 200 200 200 200 200 /* UG.AC..UG */ 190 211 145 200 207 199 207 200 200 200 200 200 175 167 175 200 /* UG.AG..UG */ 153 145 120 200 200 200 200 200 162 154 117 200 81 28 124 200 /* UG.AU..UG */ 200 200 200 200 220 212 220 200 144 91 187 200 163 110 206 200 /* UG.CA..UG */ 178 207 200 220 187 187 200 200 90 164 200 177 200 200 200 200 /* UG.CC..UG */ 178 199 200 212 187 229 200 229 200 200 200 200 155 184 200 197 /* UG.CG..UG */ 133 207 200 220 200 200 200 200 142 171 200 184 16 90 200 103 /* UG.CU..UG */ 200 200 200 200 200 229 200 254 79 153 200 166 98 127 200 140 /* UG.GA..UG */ 110 200 162 144 90 200 142 79 34 200 74 144 200 200 200 200 /* UG.GC..UG */ 102 200 154 91 164 200 171 153 200 200 200 200 132 200 139 121 /* UG.GG..UG */ 65 200 117 187 200 200 200 200 74 200 139 108 81 200 45 -63 /* UG.GU..UG */ 200 200 200 200 177 200 184 166 144 200 108 12 163 200 127 152 /* UG.UA..UG */ 200 175 81 163 200 155 16 98 200 132 81 163 200 200 200 200 /* UG.UC..UG */ 200 167 28 110 200 184 90 127 200 200 200 200 200 164 58 95 /* UG.UG..UG */ 200 175 124 206 200 200 200 200 200 139 45 127 200 58 -115 89 /* UG.UU..UG */ 200 200 200 200 200 197 103 140 200 121 -63 152 200 95 89 51 /* UG.AA..AU */ 174 166 129 200 204 204 159 200 102 94 57 200 200 200 200 200 /* UG.AC..AU */ 163 163 118 200 193 185 193 200 200 200 200 200 161 153 161 200 /* UG.AG..AU */ 154 146 109 200 200 200 200 200 143 135 98 200 92 39 135 200 /* UG.AU..AU */ 200 200 200 200 173 165 173 200 150 97 193 200 149 96 192 200 /* UG.CA..AU */ 154 183 200 196 192 213 200 226 82 156 200 169 200 200 200 200 /* UG.CC..AU */ 151 172 200 185 173 202 200 215 200 200 200 200 141 170 200 183 /* UG.CG..AU */ 134 208 200 221 200 200 200 200 123 152 200 165 27 101 200 114 /* UG.CU..AU */ 200 200 200 200 153 182 200 195 85 159 200 172 84 113 200 126 /* UG.GA..AU */ 86 200 138 120 116 200 168 105 14 200 66 136 200 200 200 200 /* UG.GC..AU */ 75 200 127 64 150 200 157 139 200 200 200 200 118 200 125 107 /* UG.GG..AU */ 66 200 118 188 200 200 200 200 55 200 107 89 92 200 56 -52 /* UG.GU..AU */ 200 200 200 200 130 200 137 119 150 200 114 6 149 200 113 138 /* UG.UA..AU */ 200 151 57 139 200 181 42 124 200 124 73 155 200 200 200 200 /* UG.UC..AU */ 200 140 1 83 200 170 76 113 200 200 200 200 200 138 44 81 /* UG.UG..AU */ 200 176 125 207 200 200 200 200 200 120 26 108 200 69 -115 100 /* UG.UU..AU */ 200 200 200 200 200 150 56 93 200 127 -57 158 200 81 75 24 /* UG.AA..UA */ 210 190 153 200 178 178 133 200 110 102 65 200 200 200 200 200 /* UG.AC..UA */ 190 211 145 200 207 199 207 200 200 200 200 200 175 167 175 200 /* UG.AG..UA */ 153 145 120 200 200 200 200 200 162 154 117 200 81 28 124 200 /* UG.AU..UA */ 200 200 200 200 220 212 220 200 144 91 187 200 163 110 206 200 /* UG.CA..UA */ 178 207 200 220 187 187 200 200 90 164 200 177 200 200 200 200 /* UG.CC..UA */ 178 199 200 212 187 229 200 229 200 200 200 200 155 184 200 197 /* UG.CG..UA */ 133 207 200 220 200 200 200 200 142 171 200 184 16 90 200 103 /* UG.CU..UA */ 200 200 200 200 200 229 200 254 79 153 200 166 98 127 200 140 /* UG.GA..UA */ 110 200 162 144 90 200 142 79 34 200 74 144 200 200 200 200 /* UG.GC..UA */ 102 200 154 91 164 200 171 153 200 200 200 200 132 200 139 121 /* UG.GG..UA */ 65 200 117 187 200 200 200 200 74 200 139 108 81 200 45 -63 /* UG.GU..UA */ 200 200 200 200 177 200 184 166 144 200 108 12 163 200 127 152 /* UG.UA..UA */ 200 175 81 163 200 155 16 98 200 132 81 163 200 200 200 200 /* UG.UC..UA */ 200 167 28 110 200 184 90 127 200 200 200 200 200 164 58 95 /* UG.UG..UA */ 200 175 124 206 200 200 200 200 200 139 45 127 200 58 -115 89 /* UG.UU..UA */ 200 200 200 200 200 197 103 140 200 121 -63 152 200 95 89 51 /* UG.AA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.AC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.AG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.AU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.CA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.CC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.CG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.CU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.GA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.GC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.GG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.GU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.UA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.UC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.UG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UG.UU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.AA..CG */ 133 122 113 200 130 127 110 200 37 26 17 200 200 200 200 200 /* AU.AC..CG */ 146 143 126 200 164 153 189 200 200 200 200 200 125 114 150 200 /* AU.AG..CG */ 39 28 19 200 200 200 200 200 112 101 92 200 -36 -92 32 200 /* AU.AU..CG */ 200 200 200 200 148 137 173 200 79 23 147 200 114 58 182 200 /* AU.CA..CG */ 163 152 200 132 168 149 200 129 67 101 200 81 200 200 200 200 /* AU.CC..CG */ 184 165 200 145 194 183 200 163 200 200 200 200 155 144 200 124 /* AU.CG..CG */ 69 103 200 83 200 200 200 200 142 131 200 111 -51 -17 200 -37 /* AU.CU..CG */ 200 200 200 200 178 167 200 147 64 98 200 78 99 88 200 68 /* AU.GA..CG */ 61 200 102 109 58 200 99 61 -35 200 6 101 200 200 200 200 /* AU.GC..CG */ 74 200 115 77 137 200 133 140 200 200 200 200 98 200 94 101 /* AU.GG..CG */ -33 200 8 103 200 200 200 200 40 200 81 88 -20 200 -67 -150 /* AU.GU..CG */ 200 200 200 200 121 200 117 124 95 200 48 -35 130 200 83 133 /* AU.UA..CG */ 200 120 51 108 200 117 3 60 200 69 43 100 200 200 200 200 /* AU.UC..CG */ 200 133 19 76 200 151 82 94 200 200 200 200 200 112 43 55 /* AU.UG..CG */ 200 71 45 102 200 200 200 200 200 99 30 87 200 -49 -208 -18 /* AU.UU..CG */ 200 200 200 200 200 135 66 78 200 66 -93 97 200 56 75 -1 /* AU.AA..GC */ 133 122 113 200 110 107 90 200 -15 -26 -35 200 200 200 200 200 /* AU.AC..GC */ 110 107 90 200 101 90 126 200 200 200 200 200 90 79 115 200 /* AU.AG..GC */ 37 26 17 200 200 200 200 200 52 41 32 200 -30 -86 38 200 /* AU.AU..GC */ 200 200 200 200 125 114 150 200 -24 -80 44 200 87 31 155 200 /* AU.CA..GC */ 163 152 200 132 148 129 200 109 15 49 200 29 200 200 200 200 /* AU.CC..GC */ 148 129 200 109 131 120 200 100 200 200 200 200 120 109 200 89 /* AU.CG..GC */ 67 101 200 81 200 200 200 200 82 71 200 51 -45 -11 200 -31 /* AU.CU..GC */ 200 200 200 200 155 144 200 124 -39 -5 200 -25 72 61 200 41 /* AU.GA..GC */ 61 200 102 109 38 200 79 41 -87 200 -46 49 200 200 200 200 /* AU.GC..GC */ 38 200 79 41 74 200 70 77 200 200 200 200 63 200 59 66 /* AU.GG..GC */ -35 200 6 101 200 200 200 200 -20 200 21 28 -14 200 -61 -144 /* AU.GU..GC */ 200 200 200 200 98 200 94 101 -8 200 -55 -138 103 200 56 106 /* AU.UA..GC */ 200 120 51 108 200 97 -17 40 200 17 -9 48 200 200 200 200 /* AU.UC..GC */ 200 97 -17 40 200 88 19 31 200 200 200 200 200 77 8 20 /* AU.UG..GC */ 200 69 43 100 200 200 200 200 200 39 -30 27 200 -43 -202 -12 /* AU.UU..GC */ 200 200 200 200 200 112 43 55 200 -37 -196 -6 200 29 48 -28 /* AU.AA..GU */ 163 139 130 200 180 177 160 200 78 67 58 200 200 200 200 200 /* AU.AC..GU */ 139 156 119 200 169 158 194 200 200 200 200 200 137 126 162 200 /* AU.AG..GU */ 130 119 122 200 200 200 200 200 119 108 99 200 68 12 136 200 /* AU.AU..GU */ 200 200 200 200 149 138 174 200 126 70 194 200 125 69 193 200 /* AU.CA..GU */ 180 169 200 149 239 199 200 179 108 142 200 122 200 200 200 200 /* AU.CC..GU */ 177 158 200 138 199 201 200 168 200 200 200 200 167 156 200 136 /* AU.CG..GU */ 160 194 200 174 200 200 200 200 149 138 200 118 53 87 200 67 /* AU.CU..GU */ 200 200 200 200 179 168 200 160 111 145 200 125 110 99 200 79 /* AU.GA..GU */ 78 200 119 126 108 200 149 111 18 200 47 142 200 200 200 200 /* AU.GC..GU */ 67 200 108 70 142 200 138 145 200 200 200 200 110 200 106 113 /* AU.GG..GU */ 58 200 99 194 200 200 200 200 47 200 100 95 84 200 37 -46 /* AU.GU..GU */ 200 200 200 200 122 200 118 125 142 200 95 25 141 200 94 144 /* AU.UA..GU */ 200 137 68 125 200 167 53 110 200 110 84 141 200 200 200 200 /* AU.UC..GU */ 200 126 12 69 200 156 87 99 200 200 200 200 200 137 55 67 /* AU.UG..GU */ 200 162 136 193 200 200 200 200 200 106 37 94 200 55 -92 86 /* AU.UU..GU */ 200 200 200 200 200 136 67 79 200 113 -46 144 200 67 86 22 /* AU.AA..UG */ 174 163 154 200 154 151 134 200 86 75 66 200 200 200 200 200 /* AU.AC..UG */ 166 163 146 200 183 172 208 200 200 200 200 200 151 140 176 200 /* AU.AG..UG */ 129 118 109 200 200 200 200 200 138 127 118 200 57 1 125 200 /* AU.AU..UG */ 200 200 200 200 196 185 221 200 120 64 188 200 139 83 207 200 /* AU.CA..UG */ 204 193 200 173 192 173 200 153 116 150 200 130 200 200 200 200 /* AU.CC..UG */ 204 185 200 165 213 202 200 182 200 200 200 200 181 170 200 150 /* AU.CG..UG */ 159 193 200 173 200 200 200 200 168 157 200 137 42 76 200 56 /* AU.CU..UG */ 200 200 200 200 226 215 200 195 105 139 200 119 124 113 200 93 /* AU.GA..UG */ 102 200 143 150 82 200 123 85 14 200 55 150 200 200 200 200 /* AU.GC..UG */ 94 200 135 97 156 200 152 159 200 200 200 200 124 200 120 127 /* AU.GG..UG */ 57 200 98 193 200 200 200 200 66 200 107 114 73 200 26 -57 /* AU.GU..UG */ 200 200 200 200 169 200 165 172 136 200 89 6 155 200 108 158 /* AU.UA..UG */ 200 161 92 149 200 141 27 84 200 118 92 149 200 200 200 200 /* AU.UC..UG */ 200 153 39 96 200 170 101 113 200 200 200 200 200 138 69 81 /* AU.UG..UG */ 200 161 135 192 200 200 200 200 200 125 56 113 200 44 -115 75 /* AU.UU..UG */ 200 200 200 200 200 183 114 126 200 107 -52 138 200 81 100 24 /* AU.AA..AU */ 163 139 130 200 180 177 160 200 78 67 58 200 200 200 200 200 /* AU.AC..AU */ 139 156 119 200 169 158 194 200 200 200 200 200 137 126 162 200 /* AU.AG..AU */ 130 119 122 200 200 200 200 200 119 108 99 200 68 12 136 200 /* AU.AU..AU */ 200 200 200 200 149 138 174 200 126 70 194 200 125 69 193 200 /* AU.CA..AU */ 180 169 200 149 239 199 200 179 108 142 200 122 200 200 200 200 /* AU.CC..AU */ 177 158 200 138 199 201 200 168 200 200 200 200 167 156 200 136 /* AU.CG..AU */ 160 194 200 174 200 200 200 200 149 138 200 118 53 87 200 67 /* AU.CU..AU */ 200 200 200 200 179 168 200 160 111 145 200 125 110 99 200 79 /* AU.GA..AU */ 78 200 119 126 108 200 149 111 18 200 47 142 200 200 200 200 /* AU.GC..AU */ 67 200 108 70 142 200 138 145 200 200 200 200 110 200 106 113 /* AU.GG..AU */ 58 200 99 194 200 200 200 200 47 200 100 95 84 200 37 -46 /* AU.GU..AU */ 200 200 200 200 122 200 118 125 142 200 95 25 141 200 94 144 /* AU.UA..AU */ 200 137 68 125 200 167 53 110 200 110 84 141 200 200 200 200 /* AU.UC..AU */ 200 126 12 69 200 156 87 99 200 200 200 200 200 137 55 67 /* AU.UG..AU */ 200 162 136 193 200 200 200 200 200 106 37 94 200 55 -92 86 /* AU.UU..AU */ 200 200 200 200 200 136 67 79 200 113 -46 144 200 67 86 22 /* AU.AA..UA */ 174 163 154 200 154 151 134 200 86 75 66 200 200 200 200 200 /* AU.AC..UA */ 166 163 146 200 183 172 208 200 200 200 200 200 151 140 176 200 /* AU.AG..UA */ 129 118 109 200 200 200 200 200 138 127 118 200 57 1 125 200 /* AU.AU..UA */ 200 200 200 200 196 185 221 200 120 64 188 200 139 83 207 200 /* AU.CA..UA */ 204 193 200 173 192 173 200 153 116 150 200 130 200 200 200 200 /* AU.CC..UA */ 204 185 200 165 213 202 200 182 200 200 200 200 181 170 200 150 /* AU.CG..UA */ 159 193 200 173 200 200 200 200 168 157 200 137 42 76 200 56 /* AU.CU..UA */ 200 200 200 200 226 215 200 195 105 139 200 119 124 113 200 93 /* AU.GA..UA */ 102 200 143 150 82 200 123 85 14 200 55 150 200 200 200 200 /* AU.GC..UA */ 94 200 135 97 156 200 152 159 200 200 200 200 124 200 120 127 /* AU.GG..UA */ 57 200 98 193 200 200 200 200 66 200 107 114 73 200 26 -57 /* AU.GU..UA */ 200 200 200 200 169 200 165 172 136 200 89 6 155 200 108 158 /* AU.UA..UA */ 200 161 92 149 200 141 27 84 200 118 92 149 200 200 200 200 /* AU.UC..UA */ 200 153 39 96 200 170 101 113 200 200 200 200 200 138 69 81 /* AU.UG..UA */ 200 161 135 192 200 200 200 200 200 125 56 113 200 44 -115 75 /* AU.UU..UA */ 200 200 200 200 200 183 114 126 200 107 -52 138 200 81 100 24 /* AU.AA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.AC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.AG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.AU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.CA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.CC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.CG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.CU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.GA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.GC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.GG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.GU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.UA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.UC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.UG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* AU.UU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.AA..CG */ 157 149 112 200 154 154 109 200 61 53 16 200 200 200 200 200 /* UA.AC..CG */ 170 170 125 200 188 180 188 200 200 200 200 200 149 141 149 200 /* UA.AG..CG */ 63 55 18 200 200 200 200 200 136 128 91 200 -12 -65 31 200 /* UA.AU..CG */ 200 200 200 200 172 164 172 200 103 50 146 200 138 85 181 200 /* UA.CA..CG */ 137 166 200 179 142 163 200 176 41 115 200 128 200 200 200 200 /* UA.CC..CG */ 158 179 200 192 168 197 200 210 200 200 200 200 129 158 200 171 /* UA.CG..CG */ 43 117 200 130 200 200 200 200 116 145 200 158 -77 -3 200 10 /* UA.CU..CG */ 200 200 200 200 152 181 200 194 38 112 200 125 73 102 200 115 /* UA.GA..CG */ 69 200 121 103 66 200 118 55 -27 200 25 95 200 200 200 200 /* UA.GC..CG */ 82 200 134 71 145 200 152 134 200 200 200 200 106 200 113 95 /* UA.GG..CG */ -25 200 27 97 200 200 200 200 48 200 100 82 -12 200 -48 -156 /* UA.GU..CG */ 200 200 200 200 129 200 136 118 103 200 67 -41 138 200 102 127 /* UA.UA..CG */ 200 134 40 122 200 131 -8 74 200 83 32 114 200 200 200 200 /* UA.UC..CG */ 200 147 8 90 200 165 71 108 200 200 200 200 200 126 32 69 /* UA.UG..CG */ 200 85 34 116 200 200 200 200 200 113 19 101 200 -35 -219 -4 /* UA.UU..CG */ 200 200 200 200 200 149 55 92 200 80 -104 111 200 70 64 13 /* UA.AA..GC */ 157 149 112 200 134 134 89 200 9 1 -36 200 200 200 200 200 /* UA.AC..GC */ 134 134 89 200 125 117 125 200 200 200 200 200 114 106 114 200 /* UA.AG..GC */ 61 53 16 200 200 200 200 200 76 68 31 200 -6 -59 37 200 /* UA.AU..GC */ 200 200 200 200 149 141 149 200 0 -53 43 200 111 58 154 200 /* UA.CA..GC */ 137 166 200 179 122 143 200 156 -11 63 200 76 200 200 200 200 /* UA.CC..GC */ 122 143 200 156 105 134 200 147 200 200 200 200 94 123 200 136 /* UA.CG..GC */ 41 115 200 128 200 200 200 200 56 85 200 98 -71 3 200 16 /* UA.CU..GC */ 200 200 200 200 129 158 200 171 -65 9 200 22 46 75 200 88 /* UA.GA..GC */ 69 200 121 103 46 200 98 35 -79 200 -27 43 200 200 200 200 /* UA.GC..GC */ 46 200 98 35 82 200 89 71 200 200 200 200 71 200 78 60 /* UA.GG..GC */ -27 200 25 95 200 200 200 200 -12 200 40 22 -6 200 -42 -150 /* UA.GU..GC */ 200 200 200 200 106 200 113 95 0 200 -36 -144 111 200 75 100 /* UA.UA..GC */ 200 134 40 122 200 111 -28 54 200 31 -20 62 200 200 200 200 /* UA.UC..GC */ 200 111 -28 54 200 102 8 45 200 200 200 200 200 91 -3 34 /* UA.UG..GC */ 200 83 32 114 200 200 200 200 200 53 -41 41 200 -29 -213 2 /* UA.UU..GC */ 200 200 200 200 200 126 32 69 200 -23 -207 8 200 43 37 -14 /* UA.AA..GU */ 174 166 129 200 204 204 159 200 102 94 57 200 200 200 200 200 /* UA.AC..GU */ 163 163 118 200 193 185 193 200 200 200 200 200 161 153 161 200 /* UA.AG..GU */ 154 146 109 200 200 200 200 200 143 135 98 200 92 39 135 200 /* UA.AU..GU */ 200 200 200 200 173 165 173 200 150 97 193 200 149 96 192 200 /* UA.CA..GU */ 154 183 200 196 192 213 200 226 82 156 200 169 200 200 200 200 /* UA.CC..GU */ 151 172 200 185 173 202 200 215 200 200 200 200 141 170 200 183 /* UA.CG..GU */ 134 208 200 221 200 200 200 200 123 152 200 165 27 101 200 114 /* UA.CU..GU */ 200 200 200 200 153 182 200 195 85 159 200 172 84 113 200 126 /* UA.GA..GU */ 86 200 138 120 116 200 168 105 14 200 66 136 200 200 200 200 /* UA.GC..GU */ 75 200 127 64 150 200 157 139 200 200 200 200 118 200 125 107 /* UA.GG..GU */ 66 200 118 188 200 200 200 200 55 200 107 89 92 200 56 -52 /* UA.GU..GU */ 200 200 200 200 130 200 137 119 150 200 114 6 149 200 113 138 /* UA.UA..GU */ 200 151 57 139 200 181 42 124 200 124 73 155 200 200 200 200 /* UA.UC..GU */ 200 140 1 83 200 170 76 113 200 200 200 200 200 138 44 81 /* UA.UG..GU */ 200 176 125 207 200 200 200 200 200 120 26 108 200 69 -115 100 /* UA.UU..GU */ 200 200 200 200 200 150 56 93 200 127 -57 158 200 81 75 24 /* UA.AA..UG */ 210 190 153 200 178 178 133 200 110 102 65 200 200 200 200 200 /* UA.AC..UG */ 190 211 145 200 207 199 207 200 200 200 200 200 175 167 175 200 /* UA.AG..UG */ 153 145 120 200 200 200 200 200 162 154 117 200 81 28 124 200 /* UA.AU..UG */ 200 200 200 200 220 212 220 200 144 91 187 200 163 110 206 200 /* UA.CA..UG */ 178 207 200 220 187 187 200 200 90 164 200 177 200 200 200 200 /* UA.CC..UG */ 178 199 200 212 187 229 200 229 200 200 200 200 155 184 200 197 /* UA.CG..UG */ 133 207 200 220 200 200 200 200 142 171 200 184 16 90 200 103 /* UA.CU..UG */ 200 200 200 200 200 229 200 254 79 153 200 166 98 127 200 140 /* UA.GA..UG */ 110 200 162 144 90 200 142 79 34 200 74 144 200 200 200 200 /* UA.GC..UG */ 102 200 154 91 164 200 171 153 200 200 200 200 132 200 139 121 /* UA.GG..UG */ 65 200 117 187 200 200 200 200 74 200 139 108 81 200 45 -63 /* UA.GU..UG */ 200 200 200 200 177 200 184 166 144 200 108 12 163 200 127 152 /* UA.UA..UG */ 200 175 81 163 200 155 16 98 200 132 81 163 200 200 200 200 /* UA.UC..UG */ 200 167 28 110 200 184 90 127 200 200 200 200 200 164 58 95 /* UA.UG..UG */ 200 175 124 206 200 200 200 200 200 139 45 127 200 58 -115 89 /* UA.UU..UG */ 200 200 200 200 200 197 103 140 200 121 -63 152 200 95 89 51 /* UA.AA..AU */ 174 166 129 200 204 204 159 200 102 94 57 200 200 200 200 200 /* UA.AC..AU */ 163 163 118 200 193 185 193 200 200 200 200 200 161 153 161 200 /* UA.AG..AU */ 154 146 109 200 200 200 200 200 143 135 98 200 92 39 135 200 /* UA.AU..AU */ 200 200 200 200 173 165 173 200 150 97 193 200 149 96 192 200 /* UA.CA..AU */ 154 183 200 196 192 213 200 226 82 156 200 169 200 200 200 200 /* UA.CC..AU */ 151 172 200 185 173 202 200 215 200 200 200 200 141 170 200 183 /* UA.CG..AU */ 134 208 200 221 200 200 200 200 123 152 200 165 27 101 200 114 /* UA.CU..AU */ 200 200 200 200 153 182 200 195 85 159 200 172 84 113 200 126 /* UA.GA..AU */ 86 200 138 120 116 200 168 105 14 200 66 136 200 200 200 200 /* UA.GC..AU */ 75 200 127 64 150 200 157 139 200 200 200 200 118 200 125 107 /* UA.GG..AU */ 66 200 118 188 200 200 200 200 55 200 107 89 92 200 56 -52 /* UA.GU..AU */ 200 200 200 200 130 200 137 119 150 200 114 6 149 200 113 138 /* UA.UA..AU */ 200 151 57 139 200 181 42 124 200 124 73 155 200 200 200 200 /* UA.UC..AU */ 200 140 1 83 200 170 76 113 200 200 200 200 200 138 44 81 /* UA.UG..AU */ 200 176 125 207 200 200 200 200 200 120 26 108 200 69 -115 100 /* UA.UU..AU */ 200 200 200 200 200 150 56 93 200 127 -57 158 200 81 75 24 /* UA.AA..UA */ 210 190 153 200 178 178 133 200 110 102 65 200 200 200 200 200 /* UA.AC..UA */ 190 211 145 200 207 199 207 200 200 200 200 200 175 167 175 200 /* UA.AG..UA */ 153 145 120 200 200 200 200 200 162 154 117 200 81 28 124 200 /* UA.AU..UA */ 200 200 200 200 220 212 220 200 144 91 187 200 163 110 206 200 /* UA.CA..UA */ 178 207 200 220 187 187 200 200 90 164 200 177 200 200 200 200 /* UA.CC..UA */ 178 199 200 212 187 229 200 229 200 200 200 200 155 184 200 197 /* UA.CG..UA */ 133 207 200 220 200 200 200 200 142 171 200 184 16 90 200 103 /* UA.CU..UA */ 200 200 200 200 200 229 200 254 79 153 200 166 98 127 200 140 /* UA.GA..UA */ 110 200 162 144 90 200 142 79 34 200 74 144 200 200 200 200 /* UA.GC..UA */ 102 200 154 91 164 200 171 153 200 200 200 200 132 200 139 121 /* UA.GG..UA */ 65 200 117 187 200 200 200 200 74 200 139 108 81 200 45 -63 /* UA.GU..UA */ 200 200 200 200 177 200 184 166 144 200 108 12 163 200 127 152 /* UA.UA..UA */ 200 175 81 163 200 155 16 98 200 132 81 163 200 200 200 200 /* UA.UC..UA */ 200 167 28 110 200 184 90 127 200 200 200 200 200 164 58 95 /* UA.UG..UA */ 200 175 124 206 200 200 200 200 200 139 45 127 200 58 -115 89 /* UA.UU..UA */ 200 200 200 200 200 197 103 140 200 121 -63 152 200 95 89 51 /* UA.AA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.AC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.AG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.AU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.CA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.CC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.CG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.CU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.GA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.GC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.GG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.GU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.UA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.UC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.UG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* UA.UU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AA..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AC..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AG..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AU..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CA..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CC..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CG..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CU..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GA..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GC..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GG..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GU..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UA..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UC..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UG..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UU..CG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AA..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AC..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AG..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AU..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CA..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CC..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CG..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CU..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GA..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GC..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GG..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GU..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UA..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UC..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UG..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UU..GC */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AA..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AC..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AG..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AU..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CA..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CC..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CG..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CU..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GA..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GC..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GG..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GU..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UA..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UC..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UG..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UU..GU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AA..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AC..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AG..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AU..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CA..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CC..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CG..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CU..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GA..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GC..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GG..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GU..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UA..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UC..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UG..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UU..UG */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AA..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AC..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AG..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AU..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CA..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CC..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CG..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CU..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GA..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GC..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GG..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GU..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UA..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UC..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UG..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UU..AU */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AA..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AC..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AG..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AU..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CA..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CC..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CG..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CU..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GA..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GC..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GG..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GU..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UA..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UC..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UG..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UU..UA */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.AU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.CU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.GU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UA.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UC.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UG.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 /* @.UU.. @ */ 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 254 # hairpin INF INF INF 315 357 341 325 313 302 284 295 305 315 323 331 339 346 352 358 364 370 375 380 385 389 394 398 402 406 410 413 # bulge INF 210 133 180 249 273 211 227 242 254 266 276 285 294 302 309 316 323 329 335 340 346 351 355 360 364 369 373 377 381 384 # internal_loop INF INF INF INF 38 22 -14 2 17 29 41 51 60 69 77 84 91 98 104 110 115 121 126 130 135 139 144 148 152 156 159 # ML_params /* F = cu*n_unpaired + cc + ci*loop_degree (+TermAU) */ /* cu cc ci TerminalAU */ -7 410 -18 5 # NINIO /* Ninio = MIN(max, m*|n1-n2| */ /* m max */ 50 300 # Tetraloops GGGGAC -210 GGUGAC -253 CGAAAG -173 GGAGAC -197 CGCAAG -197 GGAAAC -167 CGGAAG -173 CUUCGG -175 CGUGAG -198 CGAAGG -142 CUACGG -158 GGCAAC -208 CGCGAG -187 UGAGAG -233 CGAGAG -120 AGAAAU -97 CGUAAG -152 CUAACG -120 UGAAAG -153 GGAAGC -123 GGGAAC -136 UGAAAA -109 AGCAAU -120 AGUAAU -91 CGGGAG -127 AGUGAU -125 GGCGAC -145 GGGAGC -91 GUGAAC -98 UGGAAA -62 # Triloops #END