## RNAfold parameter file # stack_energies /* CG GC GU UG AU UA @ */ -185 -264 -164 -69 -178 -165 NST -264 -273 -171 -122 -169 -179 NST -164 -171 -33 -80 -87 -51 NST -69 -122 -80 -88 -14 -10 NST -178 -169 -87 -14 -106 -72 NST -165 -179 -51 -10 -72 -76 NST NST NST NST NST NST NST NST # mismatch_hairpin 0 0 0 0 0 -90 -172 -141 -141 -182 -90 -160 -135 -294 -118 -90 -187 -191 -151 -207 -90 -213 -168 -267 -210 0 0 0 0 0 -70 -140 -141 -245 -70 -70 -138 -134 -219 -115 -70 -225 -296 -180 -136 -70 -174 -161 -236 -191 0 0 0 0 0 0 -101 -141 -147 34 0 -157 -169 -87 -161 0 -190 -216 -150 -32 0 -141 -138 -56 -144 0 0 0 0 0 0 -68 -117 -100 -24 0 -95 -102 -193 -70 0 -135 -155 -143 -140 0 -106 -137 -106 -122 0 0 0 0 0 0 -82 -41 -44 -78 0 -117 -196 -176 -68 0 -184 -269 -115 -141 0 -168 76 -142 -110 0 0 0 0 0 0 -83 -117 -81 -95 0 -98 -97 -243 -97 0 -163 -200 -105 -93 0 -103 -140 -94 -100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 # mismatch_interior 0 0 0 0 0 0 0 0 -51 0 0 0 0 0 0 0 -51 0 0 0 0 0 0 0 -32 0 0 0 0 0 0 0 0 -51 0 0 0 0 0 0 0 -51 0 0 0 0 0 0 0 -32 0 0 0 0 0 0 54 54 3 54 0 54 54 54 54 0 3 54 54 54 0 54 54 54 22 0 0 0 0 0 0 54 54 3 54 0 54 54 54 54 0 3 54 54 54 0 54 54 54 22 0 0 0 0 0 0 54 54 3 54 0 54 54 54 54 0 3 54 54 54 0 54 54 54 22 0 0 0 0 0 0 54 54 3 54 0 54 54 54 54 0 3 54 54 54 0 54 54 54 22 90 90 90 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 90 20 # dangle5 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF -8 -16 -17 0 INF -44 -31 -32 0 INF 0 -12 -16 0 INF 0 -32 0 0 INF 0 -12 0 0 INF 0 0 0 0 0 0 0 0 0 # dangle3 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF -67 -90 -124 -111 INF -105 -48 -113 -120 INF -44 -37 -80 0 INF -44 -32 -32 0 INF -51 -59 -63 -51 INF -61 -69 -88 -67 0 0 0 0 0 # int11_energies /* CG..CG */ 120 120 120 120 120 120 120 -5 106 -1 120 -5 72 -1 81 120 106 -1 60 -1 120 -1 81 -1 0 /* CG..GC */ 120 120 120 120 120 120 70 12 -46 -1 120 42 45 -1 59 120 35 -1 -76 -1 120 -1 -3 -1 -40 /* CG..GU */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* CG..UG */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* CG..AU */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 35 /* CG..UA */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 61 /* CG.. @ */ 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 /* GC..CG */ 120 120 120 120 120 120 70 42 35 -1 120 12 45 -1 -3 120 -46 -1 -76 -1 120 -1 59 -1 -40 /* GC..GC */ 120 120 120 120 120 120 25 -51 -57 -1 120 -51 23 -1 -47 120 -57 -1 -184 -1 120 -1 -47 -1 -144 /* GC..GU */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* GC..UG */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* GC..AU */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 -3 /* GC..UA */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 65 /* GC.. @ */ 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 /* GU..CG */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* GU..GC */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* GU..GU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* GU..UG */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* GU..AU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* GU..UA */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* GU.. @ */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* UG..CG */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* UG..GC */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 53 /* UG..GU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* UG..UG */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* UG..AU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* UG..UA */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* UG.. @ */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* AU..CG */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 35 /* AU..GC */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 -3 /* AU..GU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* AU..UG */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* AU..AU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 39 /* AU..UA */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 26 /* AU.. @ */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* UA..CG */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 61 /* UA..GC */ 120 120 120 120 120 120 53 53 53 53 120 53 53 53 53 120 53 53 28 53 120 53 53 53 65 /* UA..GU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* UA..UG */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 107 /* UA..AU */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 26 /* UA..UA */ 136 136 136 136 136 136 107 107 107 107 136 107 107 107 107 136 107 107 82 107 136 107 107 107 136 /* UA.. @ */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* @..CG */ 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 /* @..GC */ 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 120 /* @..GU */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* @..UG */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* @..AU */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* @..UA */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 /* @.. @ */ 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 136 # int21_energies /* CG.@..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.A..CG */ 468 468 468 468 468 468 166 150 124 400 468 160 166 150 400 468 90 94 95 400 468 400 400 400 400 /* CG.C..CG */ 468 468 468 468 468 468 99 186 400 219 468 190 160 400 252 468 400 400 400 400 468 191 146 400 202 /* CG.G..CG */ 468 468 468 468 468 468 86 400 50 400 468 400 400 400 400 468 136 400 130 400 468 400 400 400 400 /* CG.U..CG */ 468 468 468 468 468 468 400 400 400 400 468 400 184 400 203 468 400 400 400 400 468 400 88 400 113 /* CG.@..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.A..GC */ 468 468 468 468 468 468 176 138 33 400 468 153 99 143 400 468 69 94 166 400 468 400 400 400 400 /* CG.C..GC */ 468 468 468 468 468 468 129 178 400 203 468 183 163 400 252 468 400 400 400 400 468 234 114 400 203 /* CG.G..GC */ 468 468 468 468 468 468 107 400 6 400 468 400 400 400 400 468 94 400 211 400 468 400 400 400 400 /* CG.U..GC */ 468 468 468 468 468 468 400 400 400 400 468 400 141 400 118 468 400 400 400 400 468 400 -30 400 8 /* CG.@..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.A..GU */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* CG.C..GU */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* CG.G..GU */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* CG.U..GU */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* CG.@..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.A..UG */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* CG.C..UG */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* CG.G..UG */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* CG.U..UG */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* CG.@..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.A..AU */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* CG.C..AU */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* CG.G..AU */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* CG.U..AU */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* CG.@..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.A..UA */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* CG.C..UA */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* CG.G..UA */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* CG.U..UA */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* CG.@.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.A.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.C.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.G.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* CG.U.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.@..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.A..CG */ 468 468 468 468 468 468 157 163 217 400 468 169 234 159 400 468 112 94 25 400 468 400 400 400 400 /* GC.C..CG */ 468 468 468 468 468 468 71 194 400 236 468 199 159 400 252 468 400 400 400 400 468 148 178 400 203 /* GC.G..CG */ 468 468 468 468 468 468 67 400 95 400 468 400 400 400 400 468 178 400 50 400 468 400 400 400 400 /* GC.U..CG */ 468 468 468 468 468 468 400 400 400 400 468 400 228 400 289 468 400 400 400 400 468 400 207 400 218 /* GC.@..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.A..GC */ 468 468 468 468 468 468 166 150 124 400 468 160 166 150 400 468 90 94 95 400 468 400 400 400 400 /* GC.C..GC */ 468 468 468 468 468 468 99 186 400 219 468 190 160 400 252 468 400 400 400 400 468 191 146 400 202 /* GC.G..GC */ 468 468 468 468 468 468 86 400 50 400 468 400 400 400 400 468 136 400 130 400 468 400 400 400 400 /* GC.U..GC */ 468 468 468 468 468 468 400 400 400 400 468 400 184 400 203 468 400 400 400 400 468 400 88 400 113 /* GC.@..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.A..GU */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* GC.C..GU */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* GC.G..GU */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* GC.U..GU */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* GC.@..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.A..UG */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* GC.C..UG */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* GC.G..UG */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* GC.U..UG */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* GC.@..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.A..AU */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* GC.C..AU */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* GC.G..AU */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* GC.U..AU */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* GC.@..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.A..UA */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* GC.C..UA */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* GC.G..UA */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* GC.U..UA */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* GC.@.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.A.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.C.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.G.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GC.U.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.@..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.A..CG */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* GU.C..CG */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* GU.G..CG */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* GU.U..CG */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* GU.@..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.A..GC */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* GU.C..GC */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* GU.G..GC */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* GU.U..GC */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* GU.@..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.A..GU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* GU.C..GU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* GU.G..GU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* GU.U..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* GU.@..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.A..UG */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* GU.C..UG */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* GU.G..UG */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* GU.U..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* GU.@..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.A..AU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* GU.C..AU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* GU.G..AU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* GU.U..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* GU.@..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.A..UA */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* GU.C..UA */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* GU.G..UA */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* GU.U..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* GU.@.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.A.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.C.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.G.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* GU.U.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.@..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.A..CG */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* UG.C..CG */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* UG.G..CG */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* UG.U..CG */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* UG.@..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.A..GC */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* UG.C..GC */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* UG.G..GC */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* UG.U..GC */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* UG.@..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.A..GU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UG.C..GU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UG.G..GU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UG.U..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UG.@..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.A..UG */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UG.C..UG */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UG.G..UG */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UG.U..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UG.@..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.A..AU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UG.C..AU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UG.G..AU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UG.U..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UG.@..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.A..UA */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UG.C..UA */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UG.G..UA */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UG.U..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UG.@.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.A.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.C.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.G.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UG.U.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.@..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.A..CG */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* AU.C..CG */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* AU.G..CG */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* AU.U..CG */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* AU.@..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.A..GC */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* AU.C..GC */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* AU.G..GC */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* AU.U..GC */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* AU.@..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.A..GU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* AU.C..GU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* AU.G..GU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* AU.U..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* AU.@..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.A..UG */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* AU.C..UG */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* AU.G..UG */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* AU.U..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* AU.@..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.A..AU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* AU.C..AU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* AU.G..AU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* AU.U..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* AU.@..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.A..UA */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* AU.C..UA */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* AU.G..UA */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* AU.U..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* AU.@.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.A.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.C.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.G.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* AU.U.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.@..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.A..CG */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* UA.C..CG */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* UA.G..CG */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* UA.U..CG */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* UA.@..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.A..GC */ 468 468 468 468 468 468 200 184 158 434 468 194 200 184 434 468 124 128 129 434 468 434 434 434 434 /* UA.C..GC */ 468 468 468 468 468 468 133 220 434 253 468 224 194 434 286 468 434 434 434 434 468 225 180 434 236 /* UA.G..GC */ 468 468 468 468 468 468 120 434 84 434 468 434 434 434 434 468 170 434 164 434 468 434 434 434 434 /* UA.U..GC */ 468 468 468 468 468 468 434 434 434 434 468 434 218 434 237 468 434 434 434 434 468 434 122 434 147 /* UA.@..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.A..GU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UA.C..GU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UA.G..GU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UA.U..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UA.@..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.A..UG */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UA.C..UG */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UA.G..UG */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UA.U..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UA.@..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.A..AU */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UA.C..AU */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UA.G..AU */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UA.U..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UA.@..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.A..UA */ 468 468 468 468 468 468 234 218 192 468 468 228 234 218 468 468 158 162 163 468 468 468 468 468 468 /* UA.C..UA */ 468 468 468 468 468 468 167 254 468 287 468 258 228 468 320 468 468 468 468 468 468 259 214 468 270 /* UA.G..UA */ 468 468 468 468 468 468 154 468 118 468 468 468 468 468 468 468 204 468 198 468 468 468 468 468 468 /* UA.U..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 252 468 271 468 468 468 468 468 468 468 156 468 181 /* UA.@.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.A.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.C.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.G.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* UA.U.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.@..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.A..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.C..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.G..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.U..CG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.@..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.A..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.C..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.G..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.U..GC */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.@..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.A..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.C..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.G..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.U..GU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.@..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.A..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.C..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.G..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.U..UG */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.@..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.A..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.C..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.G..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.U..AU */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.@..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.A..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.C..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.G..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.U..UA */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.@.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.A.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.C.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.G.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 /* @.U.. @ */ 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 468 # int22_energies /* CG.AA..CG */ 109 129 40 200 145 145 51 200 27 22 -67 200 200 200 200 200 /* CG.AC..CG */ 129 108 35 200 148 143 95 200 200 200 200 200 112 107 59 200 /* CG.AG..CG */ 40 35 -81 200 200 200 200 200 95 90 1 200 -26 -72 -47 200 /* CG.AU..CG */ 200 200 200 200 141 136 88 200 68 22 47 200 99 53 78 200 /* CG.CA..CG */ 145 148 200 141 141 159 200 152 38 82 200 75 200 200 200 200 /* CG.CC..CG */ 145 143 200 136 159 137 200 155 200 200 200 200 123 126 200 119 /* CG.CG..CG */ 51 95 200 88 200 200 200 200 106 109 200 102 -56 -12 200 -19 /* CG.CU..CG */ 200 200 200 200 152 155 200 122 38 82 200 75 69 72 200 65 /* CG.GA..CG */ 27 200 95 68 38 200 106 38 -106 200 -12 34 200 200 200 200 /* CG.GC..CG */ 22 200 90 22 82 200 109 82 200 200 200 200 46 200 73 46 /* CG.GG..CG */ -67 200 1 47 200 200 200 200 -12 200 30 29 -60 200 -65 -174 /* CG.GU..CG */ 200 200 200 200 75 200 102 75 34 200 29 -106 65 200 60 65 /* CG.UA..CG */ 200 112 -26 99 200 123 -56 69 200 46 -60 65 200 200 200 200 /* CG.UC..CG */ 200 107 -72 53 200 126 -12 72 200 200 200 200 200 64 -48 36 /* CG.UG..CG */ 200 59 -47 78 200 200 200 200 200 73 -65 60 200 -48 -295 -29 /* CG.UU..CG */ 200 200 200 200 200 119 -19 65 200 46 -174 65 200 36 -29 -44 /* CG.AA..GC */ 120 115 26 200 98 98 4 200 -21 -26 -115 200 200 200 200 200 /* CG.AC..GC */ 124 124 30 200 107 102 54 200 200 200 200 200 96 91 43 200 /* CG.AG..GC */ 26 21 -68 200 200 200 200 200 28 23 -66 200 -24 -70 -45 200 /* CG.AU..GC */ 200 200 200 200 123 118 70 200 -41 -87 -62 200 62 16 41 200 /* CG.CA..GC */ 131 134 200 127 114 112 200 105 -10 34 200 27 200 200 200 200 /* CG.CC..GC */ 140 138 200 131 118 121 200 114 200 200 200 200 107 110 200 103 /* CG.CG..GC */ 37 81 200 74 200 200 200 200 39 42 200 35 -54 -10 200 -17 /* CG.CU..GC */ 200 200 200 200 134 137 200 130 -71 -27 200 -34 32 35 200 28 /* CG.GA..GC */ 13 200 81 54 -9 200 59 -9 -128 200 -60 -14 200 200 200 200 /* CG.GC..GC */ 17 200 85 17 41 200 68 41 200 200 200 200 30 200 57 30 /* CG.GG..GC */ -81 200 -13 33 200 200 200 200 -79 200 -11 -38 -58 200 -63 -172 /* CG.GU..GC */ 200 200 200 200 57 200 84 57 -75 200 -80 -189 28 200 23 28 /* CG.UA..GC */ 200 98 -40 85 200 76 -103 22 200 -2 -108 17 200 200 200 200 /* CG.UC..GC */ 200 102 -77 48 200 85 -53 31 200 200 200 200 200 74 -64 20 /* CG.UG..GC */ 200 45 -61 64 200 200 200 200 200 6 -132 -7 200 -46 -266 -27 /* CG.UU..GC */ 200 200 200 200 200 101 -37 47 200 -63 -283 -44 200 -1 -66 -55 /* CG.AA..GU */ 154 149 60 200 200 200 106 200 90 85 -4 200 200 200 200 200 /* CG.AC..GU */ 144 144 50 200 178 173 125 200 200 200 200 200 143 138 90 200 /* CG.AG..GU */ 138 133 44 200 200 200 200 200 134 129 40 200 116 70 95 200 /* CG.AU..GU */ 200 200 200 200 183 178 130 200 144 98 123 200 130 84 109 200 /* CG.CA..GU */ 165 168 200 161 216 214 200 207 101 145 200 138 200 200 200 200 /* CG.CC..GU */ 160 158 200 151 189 192 200 185 200 200 200 200 154 157 200 150 /* CG.CG..GU */ 149 193 200 186 200 200 200 200 145 148 200 141 86 130 200 123 /* CG.CU..GU */ 200 200 200 200 194 197 200 190 114 158 200 151 100 103 200 96 /* CG.GA..GU */ 47 200 115 88 93 200 161 93 -17 200 51 97 200 200 200 200 /* CG.GC..GU */ 37 200 105 37 112 200 139 112 200 200 200 200 77 200 104 77 /* CG.GG..GU */ 31 200 99 145 200 200 200 200 27 200 95 68 82 200 77 -32 /* CG.GU..GU */ 200 200 200 200 117 200 144 117 110 200 105 -4 96 200 91 96 /* CG.UA..GU */ 200 132 -6 119 200 178 -1 124 200 109 3 128 200 200 200 200 /* CG.UC..GU */ 200 122 -57 68 200 156 18 102 200 200 200 200 200 121 -17 67 /* CG.UG..GU */ 200 157 51 176 200 200 200 200 200 112 -26 99 200 94 -126 113 /* CG.UU..GU */ 200 200 200 200 200 161 23 107 200 122 -98 141 200 67 2 13 /* CG.AA..UG */ 193 188 99 200 168 168 74 200 89 84 -5 200 200 200 200 200 /* CG.AC..UG */ 190 190 96 200 206 201 153 200 200 200 200 200 162 157 109 200 /* CG.AG..UG */ 156 151 62 200 200 200 200 200 159 154 65 200 76 30 55 200 /* CG.AU..UG */ 200 200 200 200 212 207 159 200 206 160 185 200 148 102 127 200 /* CG.CA..UG */ 204 207 200 200 184 182 200 175 100 144 200 137 200 200 200 200 /* CG.CC..UG */ 206 204 200 197 217 220 200 213 200 200 200 200 173 176 200 169 /* CG.CG..UG */ 167 211 200 204 200 200 200 200 170 173 200 166 46 90 200 83 /* CG.CU..UG */ 200 200 200 200 223 226 200 219 176 220 200 213 118 121 200 114 /* CG.GA..UG */ 86 200 154 127 61 200 129 61 -18 200 50 96 200 200 200 200 /* CG.GC..UG */ 83 200 151 83 140 200 167 140 200 200 200 200 96 200 123 96 /* CG.GG..UG */ 49 200 117 163 200 200 200 200 52 200 120 93 42 200 37 -72 /* CG.GU..UG */ 200 200 200 200 146 200 173 146 172 200 167 58 114 200 109 114 /* CG.UA..UG */ 200 171 33 158 200 146 -33 92 200 108 2 127 200 200 200 200 /* CG.UC..UG */ 200 168 -11 114 200 184 46 130 200 200 200 200 200 140 2 86 /* CG.UG..UG */ 200 175 69 194 200 200 200 200 200 137 -1 124 200 54 -166 73 /* CG.UU..UG */ 200 200 200 200 200 190 52 136 200 184 -36 203 200 85 20 31 /* CG.AA..AU */ 154 149 60 200 200 200 106 200 90 85 -4 200 200 200 200 200 /* CG.AC..AU */ 144 144 50 200 178 173 125 200 200 200 200 200 143 138 90 200 /* CG.AG..AU */ 138 133 44 200 200 200 200 200 134 129 40 200 116 70 95 200 /* CG.AU..AU */ 200 200 200 200 183 178 130 200 144 98 123 200 130 84 109 200 /* CG.CA..AU */ 165 168 200 161 216 214 200 207 101 145 200 138 200 200 200 200 /* CG.CC..AU */ 160 158 200 151 189 192 200 185 200 200 200 200 154 157 200 150 /* CG.CG..AU */ 149 193 200 186 200 200 200 200 145 148 200 141 86 130 200 123 /* CG.CU..AU */ 200 200 200 200 194 197 200 190 114 158 200 151 100 103 200 96 /* CG.GA..AU */ 47 200 115 88 93 200 161 93 -17 200 51 97 200 200 200 200 /* CG.GC..AU */ 37 200 105 37 112 200 139 112 200 200 200 200 77 200 104 77 /* CG.GG..AU */ 31 200 99 145 200 200 200 200 27 200 95 68 82 200 77 -32 /* CG.GU..AU */ 200 200 200 200 117 200 144 117 110 200 105 -4 96 200 91 96 /* CG.UA..AU */ 200 132 -6 119 200 178 -1 124 200 109 3 128 200 200 200 200 /* CG.UC..AU */ 200 122 -57 68 200 156 18 102 200 200 200 200 200 121 -17 67 /* CG.UG..AU */ 200 157 51 176 200 200 200 200 200 112 -26 99 200 94 -126 113 /* CG.UU..AU */ 200 200 200 200 200 161 23 107 200 122 -98 141 200 67 2 13 /* CG.AA..UA */ 193 188 99 200 168 168 74 200 89 84 -5 200 200 200 200 200 /* CG.AC..UA */ 190 190 96 200 206 201 153 200 200 200 200 200 162 157 109 200 /* CG.AG..UA */ 156 151 62 200 200 200 200 200 159 154 65 200 76 30 55 200 /* CG.AU..UA */ 200 200 200 200 212 207 159 200 206 160 185 200 148 102 127 200 /* CG.CA..UA */ 204 207 200 200 184 182 200 175 100 144 200 137 200 200 200 200 /* CG.CC..UA */ 206 204 200 197 217 220 200 213 200 200 200 200 173 176 200 169 /* CG.CG..UA */ 167 211 200 204 200 200 200 200 170 173 200 166 46 90 200 83 /* CG.CU..UA */ 200 200 200 200 223 226 200 219 176 220 200 213 118 121 200 114 /* CG.GA..UA */ 86 200 154 127 61 200 129 61 -18 200 50 96 200 200 200 200 /* CG.GC..UA */ 83 200 151 83 140 200 167 140 200 200 200 200 96 200 123 96 /* CG.GG..UA */ 49 200 117 163 200 200 200 200 52 200 120 93 42 200 37 -72 /* CG.GU..UA */ 200 200 200 200 146 200 173 146 172 200 167 58 114 200 109 114 /* CG.UA..UA */ 200 171 33 158 200 146 -33 92 200 108 2 127 200 200 200 200 /* CG.UC..UA */ 200 168 -11 114 200 184 46 130 200 200 200 200 200 140 2 86 /* CG.UG..UA */ 200 175 69 194 200 200 200 200 200 137 -1 124 200 54 -166 73 /* CG.UU..UA */ 200 200 200 200 200 190 52 136 200 184 -36 203 200 85 20 31 /* CG.AA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.AC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.AG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.AU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.CA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.CC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.CG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.CU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.GA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.GC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.GG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.GU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.UA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.UC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.UG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* CG.UU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.AA..CG */ 120 124 26 200 131 140 37 200 13 17 -81 200 200 200 200 200 /* GC.AC..CG */ 115 124 21 200 134 138 81 200 200 200 200 200 98 102 45 200 /* GC.AG..CG */ 26 30 -68 200 200 200 200 200 81 85 -13 200 -40 -77 -61 200 /* GC.AU..CG */ 200 200 200 200 127 131 74 200 54 17 33 200 85 48 64 200 /* GC.CA..CG */ 98 107 200 123 114 118 200 134 -9 41 200 57 200 200 200 200 /* GC.CC..CG */ 98 102 200 118 112 121 200 137 200 200 200 200 76 85 200 101 /* GC.CG..CG */ 4 54 200 70 200 200 200 200 59 68 200 84 -103 -53 200 -37 /* GC.CU..CG */ 200 200 200 200 105 114 200 130 -9 41 200 57 22 31 200 47 /* GC.GA..CG */ -21 200 28 -41 -10 200 39 -71 -128 200 -79 -75 200 200 200 200 /* GC.GC..CG */ -26 200 23 -87 34 200 42 -27 200 200 200 200 -2 200 6 -63 /* GC.GG..CG */ -115 200 -66 -62 200 200 200 200 -60 200 -11 -80 -108 200 -132 -283 /* GC.GU..CG */ 200 200 200 200 27 200 35 -34 -14 200 -38 -189 17 200 -7 -44 /* GC.UA..CG */ 200 96 -24 62 200 107 -54 32 200 30 -58 28 200 200 200 200 /* GC.UC..CG */ 200 91 -70 16 200 110 -10 35 200 200 200 200 200 74 -46 -1 /* GC.UG..CG */ 200 43 -45 41 200 200 200 200 200 57 -63 23 200 -64 -266 -66 /* GC.UU..CG */ 200 200 200 200 200 103 -17 28 200 30 -172 28 200 20 -27 -55 /* GC.AA..GC */ 80 110 12 200 84 93 -10 200 -35 -31 -129 200 200 200 200 200 /* GC.AC..GC */ 110 99 16 200 93 97 40 200 200 200 200 200 82 86 29 200 /* GC.AG..GC */ 12 16 -109 200 200 200 200 200 14 18 -80 200 -38 -75 -59 200 /* GC.AU..GC */ 200 200 200 200 109 113 56 200 -55 -92 -76 200 48 11 27 200 /* GC.CA..GC */ 84 93 200 109 46 71 200 87 -57 -7 200 9 200 200 200 200 /* GC.CC..GC */ 93 97 200 113 71 55 200 96 200 200 200 200 60 69 200 85 /* GC.CG..GC */ -10 40 200 56 200 200 200 200 -8 1 200 17 -101 -51 200 -35 /* GC.CU..GC */ 200 200 200 200 87 96 200 87 -118 -68 200 -52 -15 -6 200 10 /* GC.GA..GC */ -35 200 14 -55 -57 200 -8 -118 -202 200 -127 -123 200 200 200 200 /* GC.GC..GC */ -31 200 18 -92 -7 200 1 -68 200 200 200 200 -18 200 -10 -79 /* GC.GG..GC */ -129 200 -80 -76 200 200 200 200 -127 200 -105 -147 -106 200 -130 -281 /* GC.GU..GC */ 200 200 200 200 9 200 17 -52 -123 200 -147 -324 -20 200 -44 -81 /* GC.UA..GC */ 200 82 -38 48 200 60 -101 -15 200 -18 -106 -20 200 200 200 200 /* GC.UC..GC */ 200 86 -75 11 200 69 -51 -6 200 200 200 200 200 32 -62 -17 /* GC.UG..GC */ 200 29 -59 27 200 200 200 200 200 -10 -130 -44 200 -62 -290 -64 /* GC.UU..GC */ 200 200 200 200 200 85 -35 10 200 -79 -281 -81 200 -17 -64 -119 /* GC.AA..GU */ 140 144 46 200 186 195 92 200 76 80 -18 200 200 200 200 200 /* GC.AC..GU */ 130 139 36 200 164 168 111 200 200 200 200 200 129 133 76 200 /* GC.AG..GU */ 124 128 30 200 200 200 200 200 120 124 26 200 102 65 81 200 /* GC.AU..GU */ 200 200 200 200 169 173 116 200 130 93 109 200 116 79 95 200 /* GC.CA..GU */ 118 127 200 143 169 173 200 189 54 104 200 120 200 200 200 200 /* GC.CC..GU */ 113 117 200 133 142 151 200 167 200 200 200 200 107 116 200 132 /* GC.CG..GU */ 102 152 200 168 200 200 200 200 98 107 200 123 39 89 200 105 /* GC.CU..GU */ 200 200 200 200 147 156 200 172 67 117 200 133 53 62 200 78 /* GC.GA..GU */ -1 200 48 -21 45 200 94 -16 -65 200 -16 -12 200 200 200 200 /* GC.GC..GU */ -11 200 38 -72 64 200 72 3 200 200 200 200 29 200 37 -32 /* GC.GG..GU */ -17 200 32 36 200 200 200 200 -21 200 28 -41 34 200 10 -141 /* GC.GU..GU */ 200 200 200 200 69 200 77 8 62 200 38 -113 48 200 24 -13 /* GC.UA..GU */ 200 116 -4 82 200 162 1 87 200 93 5 91 200 200 200 200 /* GC.UC..GU */ 200 106 -55 31 200 140 20 65 200 200 200 200 200 105 -15 30 /* GC.UG..GU */ 200 141 53 139 200 200 200 200 200 96 -24 62 200 78 -124 76 /* GC.UU..GU */ 200 200 200 200 200 145 25 70 200 106 -96 104 200 51 4 -24 /* GC.AA..UG */ 179 183 85 200 154 163 60 200 75 79 -19 200 200 200 200 200 /* GC.AC..UG */ 176 185 82 200 192 196 139 200 200 200 200 200 148 152 95 200 /* GC.AG..UG */ 142 146 48 200 200 200 200 200 145 149 51 200 62 25 41 200 /* GC.AU..UG */ 200 200 200 200 198 202 145 200 192 155 171 200 134 97 113 200 /* GC.CA..UG */ 157 166 200 182 137 141 200 157 53 103 200 119 200 200 200 200 /* GC.CC..UG */ 159 163 200 179 170 179 200 195 200 200 200 200 126 135 200 151 /* GC.CG..UG */ 120 170 200 186 200 200 200 200 123 132 200 148 -1 49 200 65 /* GC.CU..UG */ 200 200 200 200 176 185 200 201 129 179 200 195 71 80 200 96 /* GC.GA..UG */ 38 200 87 18 13 200 62 -48 -66 200 -17 -13 200 200 200 200 /* GC.GC..UG */ 35 200 84 -26 92 200 100 31 200 200 200 200 48 200 56 -13 /* GC.GG..UG */ 1 200 50 54 200 200 200 200 4 200 53 -16 -6 200 -30 -181 /* GC.GU..UG */ 200 200 200 200 98 200 106 37 124 200 100 -51 66 200 42 5 /* GC.UA..UG */ 200 155 35 121 200 130 -31 55 200 92 4 90 200 200 200 200 /* GC.UC..UG */ 200 152 -9 77 200 168 48 93 200 200 200 200 200 124 4 49 /* GC.UG..UG */ 200 159 71 157 200 200 200 200 200 121 1 87 200 38 -164 36 /* GC.UU..UG */ 200 200 200 200 200 174 54 99 200 168 -34 166 200 69 22 -6 /* GC.AA..AU */ 140 144 46 200 186 195 92 200 76 80 -18 200 200 200 200 200 /* GC.AC..AU */ 130 139 36 200 164 168 111 200 200 200 200 200 129 133 76 200 /* GC.AG..AU */ 124 128 30 200 200 200 200 200 120 124 26 200 102 65 81 200 /* GC.AU..AU */ 200 200 200 200 169 173 116 200 130 93 109 200 116 79 95 200 /* GC.CA..AU */ 118 127 200 143 169 173 200 189 54 104 200 120 200 200 200 200 /* GC.CC..AU */ 113 117 200 133 142 151 200 167 200 200 200 200 107 116 200 132 /* GC.CG..AU */ 102 152 200 168 200 200 200 200 98 107 200 123 39 89 200 105 /* GC.CU..AU */ 200 200 200 200 147 156 200 172 67 117 200 133 53 62 200 78 /* GC.GA..AU */ -1 200 48 -21 45 200 94 -16 -65 200 -16 -12 200 200 200 200 /* GC.GC..AU */ -11 200 38 -72 64 200 72 3 200 200 200 200 29 200 37 -32 /* GC.GG..AU */ -17 200 32 36 200 200 200 200 -21 200 28 -41 34 200 10 -141 /* GC.GU..AU */ 200 200 200 200 69 200 77 8 62 200 38 -113 48 200 24 -13 /* GC.UA..AU */ 200 116 -4 82 200 162 1 87 200 93 5 91 200 200 200 200 /* GC.UC..AU */ 200 106 -55 31 200 140 20 65 200 200 200 200 200 105 -15 30 /* GC.UG..AU */ 200 141 53 139 200 200 200 200 200 96 -24 62 200 78 -124 76 /* GC.UU..AU */ 200 200 200 200 200 145 25 70 200 106 -96 104 200 51 4 -24 /* GC.AA..UA */ 179 183 85 200 154 163 60 200 75 79 -19 200 200 200 200 200 /* GC.AC..UA */ 176 185 82 200 192 196 139 200 200 200 200 200 148 152 95 200 /* GC.AG..UA */ 142 146 48 200 200 200 200 200 145 149 51 200 62 25 41 200 /* GC.AU..UA */ 200 200 200 200 198 202 145 200 192 155 171 200 134 97 113 200 /* GC.CA..UA */ 157 166 200 182 137 141 200 157 53 103 200 119 200 200 200 200 /* GC.CC..UA */ 159 163 200 179 170 179 200 195 200 200 200 200 126 135 200 151 /* GC.CG..UA */ 120 170 200 186 200 200 200 200 123 132 200 148 -1 49 200 65 /* GC.CU..UA */ 200 200 200 200 176 185 200 201 129 179 200 195 71 80 200 96 /* GC.GA..UA */ 38 200 87 18 13 200 62 -48 -66 200 -17 -13 200 200 200 200 /* GC.GC..UA */ 35 200 84 -26 92 200 100 31 200 200 200 200 48 200 56 -13 /* GC.GG..UA */ 1 200 50 54 200 200 200 200 4 200 53 -16 -6 200 -30 -181 /* GC.GU..UA */ 200 200 200 200 98 200 106 37 124 200 100 -51 66 200 42 5 /* GC.UA..UA */ 200 155 35 121 200 130 -31 55 200 92 4 90 200 200 200 200 /* GC.UC..UA */ 200 152 -9 77 200 168 48 93 200 200 200 200 200 124 4 49 /* GC.UG..UA */ 200 159 71 157 200 200 200 200 200 121 1 87 200 38 -164 36 /* GC.UU..UA */ 200 200 200 200 200 174 54 99 200 168 -34 166 200 69 22 -6 /* GC.AA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.AC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.AG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.AU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.CA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.CC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.CG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.CU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.GA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.GC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.GG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.GU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.UA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.UC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.UG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GC.UU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.AA..CG */ 154 144 138 200 165 160 149 200 47 37 31 200 200 200 200 200 /* GU.AC..CG */ 149 144 133 200 168 158 193 200 200 200 200 200 132 122 157 200 /* GU.AG..CG */ 60 50 44 200 200 200 200 200 115 105 99 200 -6 -57 51 200 /* GU.AU..CG */ 200 200 200 200 161 151 186 200 88 37 145 200 119 68 176 200 /* GU.CA..CG */ 200 178 200 183 216 189 200 194 93 112 200 117 200 200 200 200 /* GU.CC..CG */ 200 173 200 178 214 192 200 197 200 200 200 200 178 156 200 161 /* GU.CG..CG */ 106 125 200 130 200 200 200 200 161 139 200 144 -1 18 200 23 /* GU.CU..CG */ 200 200 200 200 207 185 200 190 93 112 200 117 124 102 200 107 /* GU.GA..CG */ 90 200 134 144 101 200 145 114 -17 200 27 110 200 200 200 200 /* GU.GC..CG */ 85 200 129 98 145 200 148 158 200 200 200 200 109 200 112 122 /* GU.GG..CG */ -4 200 40 123 200 200 200 200 51 200 95 105 3 200 -26 -98 /* GU.GU..CG */ 200 200 200 200 138 200 141 151 97 200 68 -4 128 200 99 141 /* GU.UA..CG */ 200 143 116 130 200 154 86 100 200 77 82 96 200 200 200 200 /* GU.UC..CG */ 200 138 70 84 200 157 130 103 200 200 200 200 200 121 94 67 /* GU.UG..CG */ 200 90 95 109 200 200 200 200 200 104 77 91 200 -17 -126 2 /* GU.UU..CG */ 200 200 200 200 200 150 123 96 200 77 -32 96 200 67 113 13 /* GU.AA..GC */ 140 130 124 200 118 113 102 200 -1 -11 -17 200 200 200 200 200 /* GU.AC..GC */ 144 139 128 200 127 117 152 200 200 200 200 200 116 106 141 200 /* GU.AG..GC */ 46 36 30 200 200 200 200 200 48 38 32 200 -4 -55 53 200 /* GU.AU..GC */ 200 200 200 200 143 133 168 200 -21 -72 36 200 82 31 139 200 /* GU.CA..GC */ 186 164 200 169 169 142 200 147 45 64 200 69 200 200 200 200 /* GU.CC..GC */ 195 168 200 173 173 151 200 156 200 200 200 200 162 140 200 145 /* GU.CG..GC */ 92 111 200 116 200 200 200 200 94 72 200 77 1 20 200 25 /* GU.CU..GC */ 200 200 200 200 189 167 200 172 -16 3 200 8 87 65 200 70 /* GU.GA..GC */ 76 200 120 130 54 200 98 67 -65 200 -21 62 200 200 200 200 /* GU.GC..GC */ 80 200 124 93 104 200 107 117 200 200 200 200 93 200 96 106 /* GU.GG..GC */ -18 200 26 109 200 200 200 200 -16 200 28 38 5 200 -24 -96 /* GU.GU..GC */ 200 200 200 200 120 200 123 133 -12 200 -41 -113 91 200 62 104 /* GU.UA..GC */ 200 129 102 116 200 107 39 53 200 29 34 48 200 200 200 200 /* GU.UC..GC */ 200 133 65 79 200 116 89 62 200 200 200 200 200 105 78 51 /* GU.UG..GC */ 200 76 81 95 200 200 200 200 200 37 10 24 200 -15 -124 4 /* GU.UU..GC */ 200 200 200 200 200 132 105 78 200 -32 -141 -13 200 30 76 -24 /* GU.AA..GU */ 148 164 158 200 220 215 204 200 110 100 94 200 200 200 200 200 /* GU.AC..GU */ 164 138 148 200 198 188 223 200 200 200 200 200 163 153 188 200 /* GU.AG..GU */ 158 148 116 200 200 200 200 200 154 144 138 200 136 85 193 200 /* GU.AU..GU */ 200 200 200 200 203 193 228 200 164 113 221 200 150 99 207 200 /* GU.CA..GU */ 220 198 200 203 250 244 200 249 156 175 200 180 200 200 200 200 /* GU.CC..GU */ 215 188 200 193 244 197 200 227 200 200 200 200 209 187 200 192 /* GU.CG..GU */ 204 223 200 228 200 200 200 200 200 178 200 183 141 160 200 165 /* GU.CU..GU */ 200 200 200 200 249 227 200 206 169 188 200 193 155 133 200 138 /* GU.GA..GU */ 110 200 154 164 156 200 200 169 21 200 90 173 200 200 200 200 /* GU.GC..GU */ 100 200 144 113 175 200 178 188 200 200 200 200 140 200 143 153 /* GU.GG..GU */ 94 200 138 221 200 200 200 200 90 200 109 144 145 200 116 44 /* GU.GU..GU */ 200 200 200 200 180 200 183 193 173 200 144 46 159 200 130 172 /* GU.UA..GU */ 200 163 136 150 200 209 141 155 200 140 145 159 200 200 200 200 /* GU.UC..GU */ 200 153 85 99 200 187 160 133 200 200 200 200 200 127 125 98 /* GU.UG..GU */ 200 188 193 207 200 200 200 200 200 143 116 130 200 125 -10 144 /* GU.UU..GU */ 200 200 200 200 200 192 165 138 200 153 44 172 200 98 144 19 /* GU.AA..UG */ 213 203 197 200 188 183 172 200 109 99 93 200 200 200 200 200 /* GU.AC..UG */ 210 205 194 200 226 216 251 200 200 200 200 200 182 172 207 200 /* GU.AG..UG */ 176 166 160 200 200 200 200 200 179 169 163 200 96 45 153 200 /* GU.AU..UG */ 200 200 200 200 232 222 257 200 226 175 283 200 168 117 225 200 /* GU.CA..UG */ 259 237 200 242 239 212 200 217 155 174 200 179 200 200 200 200 /* GU.CC..UG */ 261 234 200 239 272 250 200 255 200 200 200 200 228 206 200 211 /* GU.CG..UG */ 222 241 200 246 200 200 200 200 225 203 200 208 101 120 200 125 /* GU.CU..UG */ 200 200 200 200 278 256 200 261 231 250 200 255 173 151 200 156 /* GU.GA..UG */ 149 200 193 203 124 200 168 137 45 200 89 172 200 200 200 200 /* GU.GC..UG */ 146 200 190 159 203 200 206 216 200 200 200 200 159 200 162 172 /* GU.GG..UG */ 112 200 156 239 200 200 200 200 115 200 159 169 105 200 76 4 /* GU.GU..UG */ 200 200 200 200 209 200 212 222 235 200 206 134 177 200 148 190 /* GU.UA..UG */ 200 202 175 189 200 177 109 123 200 139 144 158 200 200 200 200 /* GU.UC..UG */ 200 199 131 145 200 215 188 161 200 200 200 200 200 171 144 117 /* GU.UG..UG */ 200 206 211 225 200 200 200 200 200 168 141 155 200 85 -24 104 /* GU.UU..UG */ 200 200 200 200 200 221 194 167 200 215 106 234 200 116 162 62 /* GU.AA..AU */ 148 164 158 200 220 215 204 200 110 100 94 200 200 200 200 200 /* GU.AC..AU */ 164 138 148 200 198 188 223 200 200 200 200 200 163 153 188 200 /* GU.AG..AU */ 158 148 116 200 200 200 200 200 154 144 138 200 136 85 193 200 /* GU.AU..AU */ 200 200 200 200 203 193 228 200 164 113 221 200 150 99 207 200 /* GU.CA..AU */ 220 198 200 203 250 244 200 249 156 175 200 180 200 200 200 200 /* GU.CC..AU */ 215 188 200 193 244 197 200 227 200 200 200 200 209 187 200 192 /* GU.CG..AU */ 204 223 200 228 200 200 200 200 200 178 200 183 141 160 200 165 /* GU.CU..AU */ 200 200 200 200 249 227 200 206 169 188 200 193 155 133 200 138 /* GU.GA..AU */ 110 200 154 164 156 200 200 169 21 200 90 173 200 200 200 200 /* GU.GC..AU */ 100 200 144 113 175 200 178 188 200 200 200 200 140 200 143 153 /* GU.GG..AU */ 94 200 138 221 200 200 200 200 90 200 109 144 145 200 116 44 /* GU.GU..AU */ 200 200 200 200 180 200 183 193 173 200 144 46 159 200 130 172 /* GU.UA..AU */ 200 163 136 150 200 209 141 155 200 140 145 159 200 200 200 200 /* GU.UC..AU */ 200 153 85 99 200 187 160 133 200 200 200 200 200 127 125 98 /* GU.UG..AU */ 200 188 193 207 200 200 200 200 200 143 116 130 200 125 -10 144 /* GU.UU..AU */ 200 200 200 200 200 192 165 138 200 153 44 172 200 98 144 19 /* GU.AA..UA */ 213 203 197 200 188 183 172 200 109 99 93 200 200 200 200 200 /* GU.AC..UA */ 210 205 194 200 226 216 251 200 200 200 200 200 182 172 207 200 /* GU.AG..UA */ 176 166 160 200 200 200 200 200 179 169 163 200 96 45 153 200 /* GU.AU..UA */ 200 200 200 200 232 222 257 200 226 175 283 200 168 117 225 200 /* GU.CA..UA */ 259 237 200 242 239 212 200 217 155 174 200 179 200 200 200 200 /* GU.CC..UA */ 261 234 200 239 272 250 200 255 200 200 200 200 228 206 200 211 /* GU.CG..UA */ 222 241 200 246 200 200 200 200 225 203 200 208 101 120 200 125 /* GU.CU..UA */ 200 200 200 200 278 256 200 261 231 250 200 255 173 151 200 156 /* GU.GA..UA */ 149 200 193 203 124 200 168 137 45 200 89 172 200 200 200 200 /* GU.GC..UA */ 146 200 190 159 203 200 206 216 200 200 200 200 159 200 162 172 /* GU.GG..UA */ 112 200 156 239 200 200 200 200 115 200 159 169 105 200 76 4 /* GU.GU..UA */ 200 200 200 200 209 200 212 222 235 200 206 134 177 200 148 190 /* GU.UA..UA */ 200 202 175 189 200 177 109 123 200 139 144 158 200 200 200 200 /* GU.UC..UA */ 200 199 131 145 200 215 188 161 200 200 200 200 200 171 144 117 /* GU.UG..UA */ 200 206 211 225 200 200 200 200 200 168 141 155 200 85 -24 104 /* GU.UU..UA */ 200 200 200 200 200 221 194 167 200 215 106 234 200 116 162 62 /* GU.AA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.AC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.AG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.AU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.CA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.CC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.CG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.CU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.GA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.GC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.GG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.GU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.UA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.UC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.UG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* GU.UU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.AA..CG */ 193 190 156 200 204 206 167 200 86 83 49 200 200 200 200 200 /* UG.AC..CG */ 188 190 151 200 207 204 211 200 200 200 200 200 171 168 175 200 /* UG.AG..CG */ 99 96 62 200 200 200 200 200 154 151 117 200 33 -11 69 200 /* UG.AU..CG */ 200 200 200 200 200 197 204 200 127 83 163 200 158 114 194 200 /* UG.CA..CG */ 168 206 200 212 184 217 200 223 61 140 200 146 200 200 200 200 /* UG.CC..CG */ 168 201 200 207 182 220 200 226 200 200 200 200 146 184 200 190 /* UG.CG..CG */ 74 153 200 159 200 200 200 200 129 167 200 173 -33 46 200 52 /* UG.CU..CG */ 200 200 200 200 175 213 200 219 61 140 200 146 92 130 200 136 /* UG.GA..CG */ 89 200 159 206 100 200 170 176 -18 200 52 172 200 200 200 200 /* UG.GC..CG */ 84 200 154 160 144 200 173 220 200 200 200 200 108 200 137 184 /* UG.GG..CG */ -5 200 65 185 200 200 200 200 50 200 120 167 2 200 -1 -36 /* UG.GU..CG */ 200 200 200 200 137 200 166 213 96 200 93 58 127 200 124 203 /* UG.UA..CG */ 200 162 76 148 200 173 46 118 200 96 42 114 200 200 200 200 /* UG.UC..CG */ 200 157 30 102 200 176 90 121 200 200 200 200 200 140 54 85 /* UG.UG..CG */ 200 109 55 127 200 200 200 200 200 123 37 109 200 2 -166 20 /* UG.UU..CG */ 200 200 200 200 200 169 83 114 200 96 -72 114 200 86 73 31 /* UG.AA..GC */ 179 176 142 200 157 159 120 200 38 35 1 200 200 200 200 200 /* UG.AC..GC */ 183 185 146 200 166 163 170 200 200 200 200 200 155 152 159 200 /* UG.AG..GC */ 85 82 48 200 200 200 200 200 87 84 50 200 35 -9 71 200 /* UG.AU..GC */ 200 200 200 200 182 179 186 200 18 -26 54 200 121 77 157 200 /* UG.CA..GC */ 154 192 200 198 137 170 200 176 13 92 200 98 200 200 200 200 /* UG.CC..GC */ 163 196 200 202 141 179 200 185 200 200 200 200 130 168 200 174 /* UG.CG..GC */ 60 139 200 145 200 200 200 200 62 100 200 106 -31 48 200 54 /* UG.CU..GC */ 200 200 200 200 157 195 200 201 -48 31 200 37 55 93 200 99 /* UG.GA..GC */ 75 200 145 192 53 200 123 129 -66 200 4 124 200 200 200 200 /* UG.GC..GC */ 79 200 149 155 103 200 132 179 200 200 200 200 92 200 121 168 /* UG.GG..GC */ -19 200 51 171 200 200 200 200 -17 200 53 100 4 200 1 -34 /* UG.GU..GC */ 200 200 200 200 119 200 148 195 -13 200 -16 -51 90 200 87 166 /* UG.UA..GC */ 200 148 62 134 200 126 -1 71 200 48 -6 66 200 200 200 200 /* UG.UC..GC */ 200 152 25 97 200 135 49 80 200 200 200 200 200 124 38 69 /* UG.UG..GC */ 200 95 41 113 200 200 200 200 200 56 -30 42 200 4 -164 22 /* UG.UU..GC */ 200 200 200 200 200 151 65 96 200 -13 -181 5 200 49 36 -6 /* UG.AA..GU */ 213 210 176 200 259 261 222 200 149 146 112 200 200 200 200 200 /* UG.AC..GU */ 203 205 166 200 237 234 241 200 200 200 200 200 202 199 206 200 /* UG.AG..GU */ 197 194 160 200 200 200 200 200 193 190 156 200 175 131 211 200 /* UG.AU..GU */ 200 200 200 200 242 239 246 200 203 159 239 200 189 145 225 200 /* UG.CA..GU */ 188 226 200 232 239 272 200 278 124 203 200 209 200 200 200 200 /* UG.CC..GU */ 183 216 200 222 212 250 200 256 200 200 200 200 177 215 200 221 /* UG.CG..GU */ 172 251 200 257 200 200 200 200 168 206 200 212 109 188 200 194 /* UG.CU..GU */ 200 200 200 200 217 255 200 261 137 216 200 222 123 161 200 167 /* UG.GA..GU */ 109 200 179 226 155 200 225 231 45 200 115 235 200 200 200 200 /* UG.GC..GU */ 99 200 169 175 174 200 203 250 200 200 200 200 139 200 168 215 /* UG.GG..GU */ 93 200 163 283 200 200 200 200 89 200 159 206 144 200 141 106 /* UG.GU..GU */ 200 200 200 200 179 200 208 255 172 200 169 134 158 200 155 234 /* UG.UA..GU */ 200 182 96 168 200 228 101 173 200 159 105 177 200 200 200 200 /* UG.UC..GU */ 200 172 45 117 200 206 120 151 200 200 200 200 200 171 85 116 /* UG.UG..GU */ 200 207 153 225 200 200 200 200 200 162 76 148 200 144 -24 162 /* UG.UU..GU */ 200 200 200 200 200 211 125 156 200 172 4 190 200 117 104 62 /* UG.AA..UG */ 227 249 215 200 227 229 190 200 148 145 111 200 200 200 200 200 /* UG.AC..UG */ 249 230 212 200 265 262 269 200 200 200 200 200 221 218 225 200 /* UG.AG..UG */ 215 212 153 200 200 200 200 200 218 215 181 200 135 91 171 200 /* UG.AU..UG */ 200 200 200 200 271 268 275 200 265 221 301 200 207 163 243 200 /* UG.CA..UG */ 227 265 200 271 187 240 200 246 123 202 200 208 200 200 200 200 /* UG.CC..UG */ 229 262 200 268 240 253 200 284 200 200 200 200 196 234 200 240 /* UG.CG..UG */ 190 269 200 275 200 200 200 200 193 231 200 237 69 148 200 154 /* UG.CU..UG */ 200 200 200 200 246 284 200 265 199 278 200 284 141 179 200 185 /* UG.GA..UG */ 148 200 218 265 123 200 193 199 18 200 114 234 200 200 200 200 /* UG.GC..UG */ 145 200 215 221 202 200 231 278 200 200 200 200 158 200 187 234 /* UG.GG..UG */ 111 200 181 301 200 200 200 200 114 200 158 231 104 200 101 66 /* UG.GU..UG */ 200 200 200 200 208 200 237 284 234 200 231 170 176 200 173 252 /* UG.UA..UG */ 200 221 135 207 200 196 69 141 200 158 104 176 200 200 200 200 /* UG.UC..UG */ 200 218 91 163 200 234 148 179 200 200 200 200 200 164 104 135 /* UG.UG..UG */ 200 225 171 243 200 200 200 200 200 187 101 173 200 104 -90 122 /* UG.UU..UG */ 200 200 200 200 200 240 154 185 200 234 66 252 200 135 122 55 /* UG.AA..AU */ 213 210 176 200 259 261 222 200 149 146 112 200 200 200 200 200 /* UG.AC..AU */ 203 205 166 200 237 234 241 200 200 200 200 200 202 199 206 200 /* UG.AG..AU */ 197 194 160 200 200 200 200 200 193 190 156 200 175 131 211 200 /* UG.AU..AU */ 200 200 200 200 242 239 246 200 203 159 239 200 189 145 225 200 /* UG.CA..AU */ 188 226 200 232 239 272 200 278 124 203 200 209 200 200 200 200 /* UG.CC..AU */ 183 216 200 222 212 250 200 256 200 200 200 200 177 215 200 221 /* UG.CG..AU */ 172 251 200 257 200 200 200 200 168 206 200 212 109 188 200 194 /* UG.CU..AU */ 200 200 200 200 217 255 200 261 137 216 200 222 123 161 200 167 /* UG.GA..AU */ 109 200 179 226 155 200 225 231 45 200 115 235 200 200 200 200 /* UG.GC..AU */ 99 200 169 175 174 200 203 250 200 200 200 200 139 200 168 215 /* UG.GG..AU */ 93 200 163 283 200 200 200 200 89 200 159 206 144 200 141 106 /* UG.GU..AU */ 200 200 200 200 179 200 208 255 172 200 169 134 158 200 155 234 /* UG.UA..AU */ 200 182 96 168 200 228 101 173 200 159 105 177 200 200 200 200 /* UG.UC..AU */ 200 172 45 117 200 206 120 151 200 200 200 200 200 171 85 116 /* UG.UG..AU */ 200 207 153 225 200 200 200 200 200 162 76 148 200 144 -24 162 /* UG.UU..AU */ 200 200 200 200 200 211 125 156 200 172 4 190 200 117 104 62 /* UG.AA..UA */ 227 249 215 200 227 229 190 200 148 145 111 200 200 200 200 200 /* UG.AC..UA */ 249 230 212 200 265 262 269 200 200 200 200 200 221 218 225 200 /* UG.AG..UA */ 215 212 153 200 200 200 200 200 218 215 181 200 135 91 171 200 /* UG.AU..UA */ 200 200 200 200 271 268 275 200 265 221 301 200 207 163 243 200 /* UG.CA..UA */ 227 265 200 271 187 240 200 246 123 202 200 208 200 200 200 200 /* UG.CC..UA */ 229 262 200 268 240 253 200 284 200 200 200 200 196 234 200 240 /* UG.CG..UA */ 190 269 200 275 200 200 200 200 193 231 200 237 69 148 200 154 /* UG.CU..UA */ 200 200 200 200 246 284 200 265 199 278 200 284 141 179 200 185 /* UG.GA..UA */ 148 200 218 265 123 200 193 199 18 200 114 234 200 200 200 200 /* UG.GC..UA */ 145 200 215 221 202 200 231 278 200 200 200 200 158 200 187 234 /* UG.GG..UA */ 111 200 181 301 200 200 200 200 114 200 158 231 104 200 101 66 /* UG.GU..UA */ 200 200 200 200 208 200 237 284 234 200 231 170 176 200 173 252 /* UG.UA..UA */ 200 221 135 207 200 196 69 141 200 158 104 176 200 200 200 200 /* UG.UC..UA */ 200 218 91 163 200 234 148 179 200 200 200 200 200 164 104 135 /* UG.UG..UA */ 200 225 171 243 200 200 200 200 200 187 101 173 200 104 -90 122 /* UG.UU..UA */ 200 200 200 200 200 240 154 185 200 234 66 252 200 135 122 55 /* UG.AA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.AC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.AG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.AU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.CA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.CC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.CG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.CU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.GA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.GC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.GG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.GU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.UA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.UC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.UG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UG.UU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.AA..CG */ 154 144 138 200 165 160 149 200 47 37 31 200 200 200 200 200 /* AU.AC..CG */ 149 144 133 200 168 158 193 200 200 200 200 200 132 122 157 200 /* AU.AG..CG */ 60 50 44 200 200 200 200 200 115 105 99 200 -6 -57 51 200 /* AU.AU..CG */ 200 200 200 200 161 151 186 200 88 37 145 200 119 68 176 200 /* AU.CA..CG */ 200 178 200 183 216 189 200 194 93 112 200 117 200 200 200 200 /* AU.CC..CG */ 200 173 200 178 214 192 200 197 200 200 200 200 178 156 200 161 /* AU.CG..CG */ 106 125 200 130 200 200 200 200 161 139 200 144 -1 18 200 23 /* AU.CU..CG */ 200 200 200 200 207 185 200 190 93 112 200 117 124 102 200 107 /* AU.GA..CG */ 90 200 134 144 101 200 145 114 -17 200 27 110 200 200 200 200 /* AU.GC..CG */ 85 200 129 98 145 200 148 158 200 200 200 200 109 200 112 122 /* AU.GG..CG */ -4 200 40 123 200 200 200 200 51 200 95 105 3 200 -26 -98 /* AU.GU..CG */ 200 200 200 200 138 200 141 151 97 200 68 -4 128 200 99 141 /* AU.UA..CG */ 200 143 116 130 200 154 86 100 200 77 82 96 200 200 200 200 /* AU.UC..CG */ 200 138 70 84 200 157 130 103 200 200 200 200 200 121 94 67 /* AU.UG..CG */ 200 90 95 109 200 200 200 200 200 104 77 91 200 -17 -126 2 /* AU.UU..CG */ 200 200 200 200 200 150 123 96 200 77 -32 96 200 67 113 13 /* AU.AA..GC */ 140 130 124 200 118 113 102 200 -1 -11 -17 200 200 200 200 200 /* AU.AC..GC */ 144 139 128 200 127 117 152 200 200 200 200 200 116 106 141 200 /* AU.AG..GC */ 46 36 30 200 200 200 200 200 48 38 32 200 -4 -55 53 200 /* AU.AU..GC */ 200 200 200 200 143 133 168 200 -21 -72 36 200 82 31 139 200 /* AU.CA..GC */ 186 164 200 169 169 142 200 147 45 64 200 69 200 200 200 200 /* AU.CC..GC */ 195 168 200 173 173 151 200 156 200 200 200 200 162 140 200 145 /* AU.CG..GC */ 92 111 200 116 200 200 200 200 94 72 200 77 1 20 200 25 /* AU.CU..GC */ 200 200 200 200 189 167 200 172 -16 3 200 8 87 65 200 70 /* AU.GA..GC */ 76 200 120 130 54 200 98 67 -65 200 -21 62 200 200 200 200 /* AU.GC..GC */ 80 200 124 93 104 200 107 117 200 200 200 200 93 200 96 106 /* AU.GG..GC */ -18 200 26 109 200 200 200 200 -16 200 28 38 5 200 -24 -96 /* AU.GU..GC */ 200 200 200 200 120 200 123 133 -12 200 -41 -113 91 200 62 104 /* AU.UA..GC */ 200 129 102 116 200 107 39 53 200 29 34 48 200 200 200 200 /* AU.UC..GC */ 200 133 65 79 200 116 89 62 200 200 200 200 200 105 78 51 /* AU.UG..GC */ 200 76 81 95 200 200 200 200 200 37 10 24 200 -15 -124 4 /* AU.UU..GC */ 200 200 200 200 200 132 105 78 200 -32 -141 -13 200 30 76 -24 /* AU.AA..GU */ 148 164 158 200 220 215 204 200 110 100 94 200 200 200 200 200 /* AU.AC..GU */ 164 138 148 200 198 188 223 200 200 200 200 200 163 153 188 200 /* AU.AG..GU */ 158 148 116 200 200 200 200 200 154 144 138 200 136 85 193 200 /* AU.AU..GU */ 200 200 200 200 203 193 228 200 164 113 221 200 150 99 207 200 /* AU.CA..GU */ 220 198 200 203 250 244 200 249 156 175 200 180 200 200 200 200 /* AU.CC..GU */ 215 188 200 193 244 197 200 227 200 200 200 200 209 187 200 192 /* AU.CG..GU */ 204 223 200 228 200 200 200 200 200 178 200 183 141 160 200 165 /* AU.CU..GU */ 200 200 200 200 249 227 200 206 169 188 200 193 155 133 200 138 /* AU.GA..GU */ 110 200 154 164 156 200 200 169 21 200 90 173 200 200 200 200 /* AU.GC..GU */ 100 200 144 113 175 200 178 188 200 200 200 200 140 200 143 153 /* AU.GG..GU */ 94 200 138 221 200 200 200 200 90 200 109 144 145 200 116 44 /* AU.GU..GU */ 200 200 200 200 180 200 183 193 173 200 144 46 159 200 130 172 /* AU.UA..GU */ 200 163 136 150 200 209 141 155 200 140 145 159 200 200 200 200 /* AU.UC..GU */ 200 153 85 99 200 187 160 133 200 200 200 200 200 127 125 98 /* AU.UG..GU */ 200 188 193 207 200 200 200 200 200 143 116 130 200 125 -10 144 /* AU.UU..GU */ 200 200 200 200 200 192 165 138 200 153 44 172 200 98 144 19 /* AU.AA..UG */ 213 203 197 200 188 183 172 200 109 99 93 200 200 200 200 200 /* AU.AC..UG */ 210 205 194 200 226 216 251 200 200 200 200 200 182 172 207 200 /* AU.AG..UG */ 176 166 160 200 200 200 200 200 179 169 163 200 96 45 153 200 /* AU.AU..UG */ 200 200 200 200 232 222 257 200 226 175 283 200 168 117 225 200 /* AU.CA..UG */ 259 237 200 242 239 212 200 217 155 174 200 179 200 200 200 200 /* AU.CC..UG */ 261 234 200 239 272 250 200 255 200 200 200 200 228 206 200 211 /* AU.CG..UG */ 222 241 200 246 200 200 200 200 225 203 200 208 101 120 200 125 /* AU.CU..UG */ 200 200 200 200 278 256 200 261 231 250 200 255 173 151 200 156 /* AU.GA..UG */ 149 200 193 203 124 200 168 137 45 200 89 172 200 200 200 200 /* AU.GC..UG */ 146 200 190 159 203 200 206 216 200 200 200 200 159 200 162 172 /* AU.GG..UG */ 112 200 156 239 200 200 200 200 115 200 159 169 105 200 76 4 /* AU.GU..UG */ 200 200 200 200 209 200 212 222 235 200 206 134 177 200 148 190 /* AU.UA..UG */ 200 202 175 189 200 177 109 123 200 139 144 158 200 200 200 200 /* AU.UC..UG */ 200 199 131 145 200 215 188 161 200 200 200 200 200 171 144 117 /* AU.UG..UG */ 200 206 211 225 200 200 200 200 200 168 141 155 200 85 -24 104 /* AU.UU..UG */ 200 200 200 200 200 221 194 167 200 215 106 234 200 116 162 62 /* AU.AA..AU */ 148 164 158 200 220 215 204 200 110 100 94 200 200 200 200 200 /* AU.AC..AU */ 164 138 148 200 198 188 223 200 200 200 200 200 163 153 188 200 /* AU.AG..AU */ 158 148 116 200 200 200 200 200 154 144 138 200 136 85 193 200 /* AU.AU..AU */ 200 200 200 200 203 193 228 200 164 113 221 200 150 99 207 200 /* AU.CA..AU */ 220 198 200 203 250 244 200 249 156 175 200 180 200 200 200 200 /* AU.CC..AU */ 215 188 200 193 244 197 200 227 200 200 200 200 209 187 200 192 /* AU.CG..AU */ 204 223 200 228 200 200 200 200 200 178 200 183 141 160 200 165 /* AU.CU..AU */ 200 200 200 200 249 227 200 206 169 188 200 193 155 133 200 138 /* AU.GA..AU */ 110 200 154 164 156 200 200 169 21 200 90 173 200 200 200 200 /* AU.GC..AU */ 100 200 144 113 175 200 178 188 200 200 200 200 140 200 143 153 /* AU.GG..AU */ 94 200 138 221 200 200 200 200 90 200 109 144 145 200 116 44 /* AU.GU..AU */ 200 200 200 200 180 200 183 193 173 200 144 46 159 200 130 172 /* AU.UA..AU */ 200 163 136 150 200 209 141 155 200 140 145 159 200 200 200 200 /* AU.UC..AU */ 200 153 85 99 200 187 160 133 200 200 200 200 200 127 125 98 /* AU.UG..AU */ 200 188 193 207 200 200 200 200 200 143 116 130 200 125 -10 144 /* AU.UU..AU */ 200 200 200 200 200 192 165 138 200 153 44 172 200 98 144 19 /* AU.AA..UA */ 213 203 197 200 188 183 172 200 109 99 93 200 200 200 200 200 /* AU.AC..UA */ 210 205 194 200 226 216 251 200 200 200 200 200 182 172 207 200 /* AU.AG..UA */ 176 166 160 200 200 200 200 200 179 169 163 200 96 45 153 200 /* AU.AU..UA */ 200 200 200 200 232 222 257 200 226 175 283 200 168 117 225 200 /* AU.CA..UA */ 259 237 200 242 239 212 200 217 155 174 200 179 200 200 200 200 /* AU.CC..UA */ 261 234 200 239 272 250 200 255 200 200 200 200 228 206 200 211 /* AU.CG..UA */ 222 241 200 246 200 200 200 200 225 203 200 208 101 120 200 125 /* AU.CU..UA */ 200 200 200 200 278 256 200 261 231 250 200 255 173 151 200 156 /* AU.GA..UA */ 149 200 193 203 124 200 168 137 45 200 89 172 200 200 200 200 /* AU.GC..UA */ 146 200 190 159 203 200 206 216 200 200 200 200 159 200 162 172 /* AU.GG..UA */ 112 200 156 239 200 200 200 200 115 200 159 169 105 200 76 4 /* AU.GU..UA */ 200 200 200 200 209 200 212 222 235 200 206 134 177 200 148 190 /* AU.UA..UA */ 200 202 175 189 200 177 109 123 200 139 144 158 200 200 200 200 /* AU.UC..UA */ 200 199 131 145 200 215 188 161 200 200 200 200 200 171 144 117 /* AU.UG..UA */ 200 206 211 225 200 200 200 200 200 168 141 155 200 85 -24 104 /* AU.UU..UA */ 200 200 200 200 200 221 194 167 200 215 106 234 200 116 162 62 /* AU.AA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.AC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.AG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.AU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.CA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.CC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.CG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.CU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.GA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.GC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.GG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.GU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.UA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.UC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.UG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* AU.UU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.AA..CG */ 193 190 156 200 204 206 167 200 86 83 49 200 200 200 200 200 /* UA.AC..CG */ 188 190 151 200 207 204 211 200 200 200 200 200 171 168 175 200 /* UA.AG..CG */ 99 96 62 200 200 200 200 200 154 151 117 200 33 -11 69 200 /* UA.AU..CG */ 200 200 200 200 200 197 204 200 127 83 163 200 158 114 194 200 /* UA.CA..CG */ 168 206 200 212 184 217 200 223 61 140 200 146 200 200 200 200 /* UA.CC..CG */ 168 201 200 207 182 220 200 226 200 200 200 200 146 184 200 190 /* UA.CG..CG */ 74 153 200 159 200 200 200 200 129 167 200 173 -33 46 200 52 /* UA.CU..CG */ 200 200 200 200 175 213 200 219 61 140 200 146 92 130 200 136 /* UA.GA..CG */ 89 200 159 206 100 200 170 176 -18 200 52 172 200 200 200 200 /* UA.GC..CG */ 84 200 154 160 144 200 173 220 200 200 200 200 108 200 137 184 /* UA.GG..CG */ -5 200 65 185 200 200 200 200 50 200 120 167 2 200 -1 -36 /* UA.GU..CG */ 200 200 200 200 137 200 166 213 96 200 93 58 127 200 124 203 /* UA.UA..CG */ 200 162 76 148 200 173 46 118 200 96 42 114 200 200 200 200 /* UA.UC..CG */ 200 157 30 102 200 176 90 121 200 200 200 200 200 140 54 85 /* UA.UG..CG */ 200 109 55 127 200 200 200 200 200 123 37 109 200 2 -166 20 /* UA.UU..CG */ 200 200 200 200 200 169 83 114 200 96 -72 114 200 86 73 31 /* UA.AA..GC */ 179 176 142 200 157 159 120 200 38 35 1 200 200 200 200 200 /* UA.AC..GC */ 183 185 146 200 166 163 170 200 200 200 200 200 155 152 159 200 /* UA.AG..GC */ 85 82 48 200 200 200 200 200 87 84 50 200 35 -9 71 200 /* UA.AU..GC */ 200 200 200 200 182 179 186 200 18 -26 54 200 121 77 157 200 /* UA.CA..GC */ 154 192 200 198 137 170 200 176 13 92 200 98 200 200 200 200 /* UA.CC..GC */ 163 196 200 202 141 179 200 185 200 200 200 200 130 168 200 174 /* UA.CG..GC */ 60 139 200 145 200 200 200 200 62 100 200 106 -31 48 200 54 /* UA.CU..GC */ 200 200 200 200 157 195 200 201 -48 31 200 37 55 93 200 99 /* UA.GA..GC */ 75 200 145 192 53 200 123 129 -66 200 4 124 200 200 200 200 /* UA.GC..GC */ 79 200 149 155 103 200 132 179 200 200 200 200 92 200 121 168 /* UA.GG..GC */ -19 200 51 171 200 200 200 200 -17 200 53 100 4 200 1 -34 /* UA.GU..GC */ 200 200 200 200 119 200 148 195 -13 200 -16 -51 90 200 87 166 /* UA.UA..GC */ 200 148 62 134 200 126 -1 71 200 48 -6 66 200 200 200 200 /* UA.UC..GC */ 200 152 25 97 200 135 49 80 200 200 200 200 200 124 38 69 /* UA.UG..GC */ 200 95 41 113 200 200 200 200 200 56 -30 42 200 4 -164 22 /* UA.UU..GC */ 200 200 200 200 200 151 65 96 200 -13 -181 5 200 49 36 -6 /* UA.AA..GU */ 213 210 176 200 259 261 222 200 149 146 112 200 200 200 200 200 /* UA.AC..GU */ 203 205 166 200 237 234 241 200 200 200 200 200 202 199 206 200 /* UA.AG..GU */ 197 194 160 200 200 200 200 200 193 190 156 200 175 131 211 200 /* UA.AU..GU */ 200 200 200 200 242 239 246 200 203 159 239 200 189 145 225 200 /* UA.CA..GU */ 188 226 200 232 239 272 200 278 124 203 200 209 200 200 200 200 /* UA.CC..GU */ 183 216 200 222 212 250 200 256 200 200 200 200 177 215 200 221 /* UA.CG..GU */ 172 251 200 257 200 200 200 200 168 206 200 212 109 188 200 194 /* UA.CU..GU */ 200 200 200 200 217 255 200 261 137 216 200 222 123 161 200 167 /* UA.GA..GU */ 109 200 179 226 155 200 225 231 45 200 115 235 200 200 200 200 /* UA.GC..GU */ 99 200 169 175 174 200 203 250 200 200 200 200 139 200 168 215 /* UA.GG..GU */ 93 200 163 283 200 200 200 200 89 200 159 206 144 200 141 106 /* UA.GU..GU */ 200 200 200 200 179 200 208 255 172 200 169 134 158 200 155 234 /* UA.UA..GU */ 200 182 96 168 200 228 101 173 200 159 105 177 200 200 200 200 /* UA.UC..GU */ 200 172 45 117 200 206 120 151 200 200 200 200 200 171 85 116 /* UA.UG..GU */ 200 207 153 225 200 200 200 200 200 162 76 148 200 144 -24 162 /* UA.UU..GU */ 200 200 200 200 200 211 125 156 200 172 4 190 200 117 104 62 /* UA.AA..UG */ 227 249 215 200 227 229 190 200 148 145 111 200 200 200 200 200 /* UA.AC..UG */ 249 230 212 200 265 262 269 200 200 200 200 200 221 218 225 200 /* UA.AG..UG */ 215 212 153 200 200 200 200 200 218 215 181 200 135 91 171 200 /* UA.AU..UG */ 200 200 200 200 271 268 275 200 265 221 301 200 207 163 243 200 /* UA.CA..UG */ 227 265 200 271 187 240 200 246 123 202 200 208 200 200 200 200 /* UA.CC..UG */ 229 262 200 268 240 253 200 284 200 200 200 200 196 234 200 240 /* UA.CG..UG */ 190 269 200 275 200 200 200 200 193 231 200 237 69 148 200 154 /* UA.CU..UG */ 200 200 200 200 246 284 200 265 199 278 200 284 141 179 200 185 /* UA.GA..UG */ 148 200 218 265 123 200 193 199 18 200 114 234 200 200 200 200 /* UA.GC..UG */ 145 200 215 221 202 200 231 278 200 200 200 200 158 200 187 234 /* UA.GG..UG */ 111 200 181 301 200 200 200 200 114 200 158 231 104 200 101 66 /* UA.GU..UG */ 200 200 200 200 208 200 237 284 234 200 231 170 176 200 173 252 /* UA.UA..UG */ 200 221 135 207 200 196 69 141 200 158 104 176 200 200 200 200 /* UA.UC..UG */ 200 218 91 163 200 234 148 179 200 200 200 200 200 164 104 135 /* UA.UG..UG */ 200 225 171 243 200 200 200 200 200 187 101 173 200 104 -90 122 /* UA.UU..UG */ 200 200 200 200 200 240 154 185 200 234 66 252 200 135 122 55 /* UA.AA..AU */ 213 210 176 200 259 261 222 200 149 146 112 200 200 200 200 200 /* UA.AC..AU */ 203 205 166 200 237 234 241 200 200 200 200 200 202 199 206 200 /* UA.AG..AU */ 197 194 160 200 200 200 200 200 193 190 156 200 175 131 211 200 /* UA.AU..AU */ 200 200 200 200 242 239 246 200 203 159 239 200 189 145 225 200 /* UA.CA..AU */ 188 226 200 232 239 272 200 278 124 203 200 209 200 200 200 200 /* UA.CC..AU */ 183 216 200 222 212 250 200 256 200 200 200 200 177 215 200 221 /* UA.CG..AU */ 172 251 200 257 200 200 200 200 168 206 200 212 109 188 200 194 /* UA.CU..AU */ 200 200 200 200 217 255 200 261 137 216 200 222 123 161 200 167 /* UA.GA..AU */ 109 200 179 226 155 200 225 231 45 200 115 235 200 200 200 200 /* UA.GC..AU */ 99 200 169 175 174 200 203 250 200 200 200 200 139 200 168 215 /* UA.GG..AU */ 93 200 163 283 200 200 200 200 89 200 159 206 144 200 141 106 /* UA.GU..AU */ 200 200 200 200 179 200 208 255 172 200 169 134 158 200 155 234 /* UA.UA..AU */ 200 182 96 168 200 228 101 173 200 159 105 177 200 200 200 200 /* UA.UC..AU */ 200 172 45 117 200 206 120 151 200 200 200 200 200 171 85 116 /* UA.UG..AU */ 200 207 153 225 200 200 200 200 200 162 76 148 200 144 -24 162 /* UA.UU..AU */ 200 200 200 200 200 211 125 156 200 172 4 190 200 117 104 62 /* UA.AA..UA */ 227 249 215 200 227 229 190 200 148 145 111 200 200 200 200 200 /* UA.AC..UA */ 249 230 212 200 265 262 269 200 200 200 200 200 221 218 225 200 /* UA.AG..UA */ 215 212 153 200 200 200 200 200 218 215 181 200 135 91 171 200 /* UA.AU..UA */ 200 200 200 200 271 268 275 200 265 221 301 200 207 163 243 200 /* UA.CA..UA */ 227 265 200 271 187 240 200 246 123 202 200 208 200 200 200 200 /* UA.CC..UA */ 229 262 200 268 240 253 200 284 200 200 200 200 196 234 200 240 /* UA.CG..UA */ 190 269 200 275 200 200 200 200 193 231 200 237 69 148 200 154 /* UA.CU..UA */ 200 200 200 200 246 284 200 265 199 278 200 284 141 179 200 185 /* UA.GA..UA */ 148 200 218 265 123 200 193 199 18 200 114 234 200 200 200 200 /* UA.GC..UA */ 145 200 215 221 202 200 231 278 200 200 200 200 158 200 187 234 /* UA.GG..UA */ 111 200 181 301 200 200 200 200 114 200 158 231 104 200 101 66 /* UA.GU..UA */ 200 200 200 200 208 200 237 284 234 200 231 170 176 200 173 252 /* UA.UA..UA */ 200 221 135 207 200 196 69 141 200 158 104 176 200 200 200 200 /* UA.UC..UA */ 200 218 91 163 200 234 148 179 200 200 200 200 200 164 104 135 /* UA.UG..UA */ 200 225 171 243 200 200 200 200 200 187 101 173 200 104 -90 122 /* UA.UU..UA */ 200 200 200 200 200 240 154 185 200 234 66 252 200 135 122 55 /* UA.AA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.AC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.AG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.AU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.CA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.CC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.CG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.CU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.GA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.GC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.GG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.GU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.UA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.UC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.UG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* UA.UU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AA..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AC..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AG..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AU..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CA..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CC..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CG..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CU..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GA..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GC..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GG..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GU..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UA..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UC..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UG..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UU..CG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AA..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AC..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AG..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AU..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CA..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CC..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CG..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CU..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GA..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GC..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GG..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GU..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UA..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UC..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UG..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UU..GC */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AA..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AC..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AG..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AU..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CA..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CC..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CG..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CU..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GA..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GC..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GG..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GU..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UA..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UC..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UG..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UU..GU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AA..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AC..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AG..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AU..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CA..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CC..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CG..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CU..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GA..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GC..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GG..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GU..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UA..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UC..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UG..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UU..UG */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AA..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AC..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AG..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AU..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CA..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CC..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CG..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CU..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GA..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GC..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GG..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GU..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UA..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UC..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UG..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UU..AU */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AA..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AC..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AG..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AU..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CA..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CC..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CG..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CU..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GA..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GC..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GG..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GU..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UA..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UC..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UG..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UU..UA */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.AU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.CU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.GU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UA.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UC.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UG.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 /* @.UU.. @ */ 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 301 # hairpin INF INF INF 426 506 471 464 433 425 440 451 461 471 479 487 495 502 508 514 520 526 531 536 541 545 550 554 558 562 566 569 # bulge INF 289 165 226 325 301 282 298 313 325 337 347 356 365 373 380 387 394 400 406 411 417 422 426 431 435 440 444 448 452 455 # internal_loop INF INF INF INF 100 81 29 45 60 72 84 94 103 112 120 127 134 141 147 153 158 164 169 173 178 182 187 191 195 199 202 # ML_params /* F = cu*n_unpaired + cc + ci*loop_degree (+TermAU) */ /* cu cc ci TerminalAU */ -10 540 -25 13 # NINIO /* Ninio = MIN(max, m*|n1-n2| */ /* m max */ 50 300 # Tetraloops GGGGAC -186 GGUGAC -283 CGAAAG -121 GGAGAC -138 CGCAAG -210 GGAAAC -162 CGGAAG -161 CUUCGG -170 CGUGAG -195 CGAAGG -143 CUACGG -131 GGCAAC -240 CGCGAG -189 UGAGAG -335 CGAGAG -74 AGAAAU -96 CGUAAG -135 CUAACG -167 UGAAAG -199 GGAAGC -135 GGGAAC -150 UGAAAA -143 AGCAAU -182 AGUAAU -137 CGGGAG -112 AGUGAU -149 GGCGAC -166 GGGAGC -78 GUGAAC -26 UGGAAA -20 # Triloops #END