## RNAfold parameter file # stack_energies /* CG GC GU UG AU UA @ */ -133 -207 -146 -37 -139 -132 NST -207 -205 -150 -91 -129 -123 NST -146 -150 -22 -67 -81 -58 NST -37 -91 -67 -38 -14 -2 NST -139 -129 -81 -14 -84 -69 NST -132 -123 -58 -2 -69 -68 NST NST NST NST NST NST NST NST # mismatch_hairpin 0 0 0 0 0 -90 -35 -13 3 13 -90 -12 -17 -98 -22 -90 -51 -24 -1 3 -90 -16 -57 -97 -38 0 0 0 0 0 -70 1 -22 -65 110 -70 11 -27 -17 0 -70 -67 1 -45 36 -70 8 -39 -55 -92 0 0 0 0 0 0 60 75 43 180 0 50 44 70 -1 0 -92 15 39 114 0 25 7 67 36 0 0 0 0 0 0 43 52 87 109 0 52 35 -10 40 0 -26 -28 5 92 0 42 -38 -14 -30 0 0 0 0 0 0 41 77 65 117 0 -2 8 44 43 0 -31 23 15 60 0 29 -6 32 -10 0 0 0 0 0 0 17 52 76 68 0 53 36 37 11 0 -39 46 16 68 0 50 -16 46 29 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 # mismatch_interior 0 0 0 0 0 0 0 0 -50 0 0 0 0 0 0 0 -50 0 0 0 0 0 0 0 -45 0 0 0 0 0 0 0 0 -50 0 0 0 0 0 0 0 -50 0 0 0 0 0 0 0 -45 0 0 0 0 0 0 63 63 13 63 0 63 63 63 63 0 13 63 63 63 0 63 63 63 18 0 0 0 0 0 0 63 63 13 63 0 63 63 63 63 0 13 63 63 63 0 63 63 63 18 0 0 0 0 0 0 63 63 13 63 0 63 63 63 63 0 13 63 63 63 0 63 63 63 18 0 0 0 0 0 0 63 63 13 63 0 63 63 63 63 0 13 63 63 63 0 63 63 63 18 90 90 90 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 90 20 # dangle5 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF -8 0 0 0 INF -10 0 0 0 INF 0 0 0 0 INF 0 0 0 0 INF -10 0 0 0 INF -3 0 0 0 0 0 0 0 0 # dangle3 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF -10 -9 -51 -14 INF -41 0 -46 -35 INF -10 0 -50 -2 INF -10 -40 -60 0 INF -10 -13 -25 -7 INF -10 -30 -44 -7 0 0 0 0 0 # int11_energies /* CG..CG */ 158 158 158 158 158 158 158 74 97 35 158 74 89 35 78 158 97 35 58 35 158 35 78 35 -12 /* CG..GC */ 158 158 158 158 158 158 76 18 6 35 158 46 85 35 124 158 72 35 -27 35 158 35 51 35 -20 /* CG..GU */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* CG..UG */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* CG..AU */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 53 /* CG..UA */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 36 /* CG.. @ */ 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 /* GC..CG */ 158 158 158 158 158 158 76 46 72 35 158 18 85 35 51 158 6 35 -27 35 158 35 124 35 -20 /* GC..GC */ 158 158 158 158 158 158 114 11 38 35 158 11 43 35 -10 158 38 35 -51 35 158 35 -10 35 -161 /* GC..GU */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* GC..UG */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* GC..AU */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 -18 /* GC..UA */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 68 /* GC.. @ */ 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 /* GU..CG */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* GU..GC */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* GU..GU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* GU..UG */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* GU..AU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* GU..UA */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* GU.. @ */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* UG..CG */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* UG..GC */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 98 /* UG..GU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* UG..UG */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* UG..AU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* UG..UA */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* UG.. @ */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* AU..CG */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 53 /* AU..GC */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 -18 /* AU..GU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* AU..UG */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* AU..AU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 45 /* AU..UA */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 62 /* AU.. @ */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* UA..CG */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 36 /* UA..GC */ 158 158 158 158 158 158 98 98 98 98 158 98 98 98 98 158 98 98 43 98 158 98 98 98 68 /* UA..GU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* UA..UG */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 161 /* UA..AU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 62 /* UA..UA */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 106 161 161 161 161 161 124 /* UA.. @ */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* @..CG */ 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 /* @..GC */ 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 158 /* @..GU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* @..UG */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* @..AU */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* @..UA */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 /* @.. @ */ 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 161 # int21_energies /* CG.@..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.A..CG */ 324 324 324 324 324 324 154 144 127 171 324 174 171 185 171 324 142 143 107 171 324 171 171 171 171 /* CG.C..CG */ 324 324 324 324 324 324 83 166 171 180 324 161 159 171 170 324 171 171 171 171 324 128 136 171 166 /* CG.G..CG */ 324 324 324 324 324 324 98 171 83 171 324 171 171 171 171 324 132 171 104 171 324 171 171 171 171 /* CG.U..CG */ 324 324 324 324 324 324 171 171 171 171 324 171 164 171 190 324 171 171 171 171 324 171 128 171 119 /* CG.@..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.A..GC */ 324 324 324 324 324 324 172 145 4 171 324 193 157 166 171 324 166 132 121 171 324 171 171 171 171 /* CG.C..GC */ 324 324 324 324 324 324 122 149 171 166 324 152 155 171 183 324 171 171 171 171 324 171 147 171 176 /* CG.G..GC */ 324 324 324 324 324 324 143 171 77 171 324 171 171 171 171 324 193 171 230 171 324 171 171 171 171 /* CG.U..GC */ 324 324 324 324 324 324 171 171 171 171 324 171 158 171 149 324 171 171 171 171 324 171 107 171 76 /* CG.@..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.A..GU */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* CG.C..GU */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* CG.G..GU */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* CG.U..GU */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* CG.@..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.A..UG */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* CG.C..UG */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* CG.G..UG */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* CG.U..UG */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* CG.@..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.A..AU */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* CG.C..AU */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* CG.G..AU */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* CG.U..AU */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* CG.@..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.A..UA */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* CG.C..UA */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* CG.G..UA */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* CG.U..UA */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* CG.@.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.A.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.C.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.G.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* CG.U.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.@..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.A..CG */ 324 324 324 324 324 324 137 144 250 171 324 157 186 205 171 324 119 154 95 171 324 171 171 171 171 /* GC.C..CG */ 324 324 324 324 324 324 45 184 171 195 324 171 164 171 159 324 171 171 171 171 324 86 127 171 157 /* GC.G..CG */ 324 324 324 324 324 324 55 171 91 171 324 171 171 171 171 324 72 171 -23 171 324 171 171 171 171 /* GC.U..CG */ 324 324 324 324 324 324 171 171 171 171 324 171 170 171 232 324 171 171 171 171 324 171 150 171 162 /* GC.@..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.A..GC */ 324 324 324 324 324 324 154 144 127 171 324 174 171 185 171 324 142 143 107 171 324 171 171 171 171 /* GC.C..GC */ 324 324 324 324 324 324 83 166 171 180 324 161 159 171 170 324 171 171 171 171 324 128 136 171 166 /* GC.G..GC */ 324 324 324 324 324 324 98 171 83 171 324 171 171 171 171 324 132 171 104 171 324 171 171 171 171 /* GC.U..GC */ 324 324 324 324 324 324 171 171 171 171 324 171 164 171 190 324 171 171 171 171 324 171 128 171 119 /* GC.@..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.A..GU */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* GC.C..GU */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* GC.G..GU */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* GC.U..GU */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* GC.@..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.A..UG */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* GC.C..UG */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* GC.G..UG */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* GC.U..UG */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* GC.@..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.A..AU */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* GC.C..AU */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* GC.G..AU */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* GC.U..AU */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* GC.@..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.A..UA */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* GC.C..UA */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* GC.G..UA */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* GC.U..UA */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* GC.@.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.A.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.C.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.G.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GC.U.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.@..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.A..CG */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* GU.C..CG */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* GU.G..CG */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* GU.U..CG */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* GU.@..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.A..GC */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* GU.C..GC */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* GU.G..GC */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* GU.U..GC */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* GU.@..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.A..GU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* GU.C..GU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* GU.G..GU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* GU.U..GU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* GU.@..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.A..UG */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* GU.C..UG */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* GU.G..UG */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* GU.U..UG */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* GU.@..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.A..AU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* GU.C..AU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* GU.G..AU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* GU.U..AU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* GU.@..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.A..UA */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* GU.C..UA */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* GU.G..UA */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* GU.U..UA */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* GU.@.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.A.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.C.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.G.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* GU.U.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.@..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.A..CG */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* UG.C..CG */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* UG.G..CG */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* UG.U..CG */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* UG.@..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.A..GC */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* UG.C..GC */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* UG.G..GC */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* UG.U..GC */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* UG.@..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.A..GU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UG.C..GU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UG.G..GU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UG.U..GU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UG.@..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.A..UG */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UG.C..UG */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UG.G..UG */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UG.U..UG */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UG.@..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.A..AU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UG.C..AU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UG.G..AU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UG.U..AU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UG.@..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.A..UA */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UG.C..UA */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UG.G..UA */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UG.U..UA */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UG.@.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.A.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.C.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.G.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UG.U.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.@..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.A..CG */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* AU.C..CG */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* AU.G..CG */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* AU.U..CG */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* AU.@..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.A..GC */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* AU.C..GC */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* AU.G..GC */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* AU.U..GC */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* AU.@..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.A..GU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* AU.C..GU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* AU.G..GU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* AU.U..GU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* AU.@..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.A..UG */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* AU.C..UG */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* AU.G..UG */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* AU.U..UG */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* AU.@..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.A..AU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* AU.C..AU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* AU.G..AU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* AU.U..AU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* AU.@..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.A..UA */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* AU.C..UA */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* AU.G..UA */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* AU.U..UA */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* AU.@.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.A.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.C.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.G.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* AU.U.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.@..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.A..CG */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* UA.C..CG */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* UA.G..CG */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* UA.U..CG */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* UA.@..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.A..GC */ 324 324 324 324 324 324 221 211 194 238 324 241 238 252 238 324 209 210 174 238 324 238 238 238 238 /* UA.C..GC */ 324 324 324 324 324 324 150 233 238 247 324 228 226 238 237 324 238 238 238 238 324 195 203 238 233 /* UA.G..GC */ 324 324 324 324 324 324 165 238 150 238 324 238 238 238 238 324 199 238 171 238 324 238 238 238 238 /* UA.U..GC */ 324 324 324 324 324 324 238 238 238 238 324 238 231 238 257 324 238 238 238 238 324 238 195 238 186 /* UA.@..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.A..GU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UA.C..GU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UA.G..GU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UA.U..GU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UA.@..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.A..UG */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UA.C..UG */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UA.G..UG */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UA.U..UG */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UA.@..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.A..AU */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UA.C..AU */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UA.G..AU */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UA.U..AU */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UA.@..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.A..UA */ 324 324 324 324 324 324 288 278 261 305 324 308 305 319 305 324 276 277 241 305 324 305 305 305 305 /* UA.C..UA */ 324 324 324 324 324 324 217 300 305 314 324 295 293 305 304 324 305 305 305 305 324 262 270 305 300 /* UA.G..UA */ 324 324 324 324 324 324 232 305 217 305 324 305 305 305 305 324 266 305 238 305 324 305 305 305 305 /* UA.U..UA */ 324 324 324 324 324 324 305 305 305 305 324 305 298 305 324 324 305 305 305 305 324 305 262 305 253 /* UA.@.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.A.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.C.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.G.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* UA.U.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.@..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.A..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.C..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.G..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.U..CG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.@..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.A..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.C..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.G..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.U..GC */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.@..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.A..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.C..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.G..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.U..GU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.@..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.A..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.C..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.G..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.U..UG */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.@..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.A..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.C..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.G..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.U..AU */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.@..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.A..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.C..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.G..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.U..UA */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.@.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.A.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.C.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.G.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 /* @.U.. @ */ 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 324 # int22_energies /* CG.AA..CG */ 99 158 70 242 176 188 127 242 63 102 14 242 242 242 242 242 /* CG.AC..CG */ 158 123 109 242 145 184 143 242 242 242 242 242 118 157 116 242 /* CG.AG..CG */ 70 109 -1 242 242 242 242 242 131 170 82 242 127 119 153 242 /* CG.AU..CG */ 242 242 242 242 145 184 143 242 189 181 215 242 99 91 125 242 /* CG.CA..CG */ 176 145 242 145 158 202 242 202 120 136 242 136 242 242 242 242 /* CG.CC..CG */ 188 184 242 184 202 151 242 171 242 242 242 242 175 144 242 144 /* CG.CG..CG */ 127 143 242 143 242 242 242 242 188 157 242 157 137 153 242 153 /* CG.CU..CG */ 242 242 242 242 202 171 242 150 199 215 242 215 109 78 242 78 /* CG.GA..CG */ 63 242 131 189 120 242 188 199 -15 242 75 208 242 242 242 242 /* CG.GC..CG */ 102 242 170 181 136 242 157 215 242 242 242 242 109 242 130 188 /* CG.GG..CG */ 14 242 82 215 242 242 242 242 75 242 123 201 146 242 139 103 /* CG.GU..CG */ 242 242 242 242 136 242 157 215 208 242 201 144 118 242 111 197 /* CG.UA..CG */ 242 118 127 99 242 175 137 109 242 109 146 118 242 242 242 242 /* CG.UC..CG */ 242 157 119 91 242 144 153 78 242 242 242 242 242 97 126 51 /* CG.UG..CG */ 242 116 153 125 242 242 242 242 242 130 139 111 242 126 21 135 /* CG.UU..CG */ 242 242 242 242 242 144 153 78 242 188 103 197 242 51 135 -36 /* CG.AA..GC */ 141 180 92 242 151 163 102 242 45 84 -4 242 242 242 242 242 /* CG.AC..GC */ 154 166 105 242 130 169 128 242 242 242 242 242 131 170 129 242 /* CG.AG..GC */ 66 105 17 242 242 242 242 242 105 144 56 242 158 150 184 242 /* CG.AU..GC */ 242 242 242 242 106 145 104 242 101 93 127 242 92 84 118 242 /* CG.CA..GC */ 198 167 242 167 181 177 242 177 102 118 242 118 242 242 242 242 /* CG.CC..GC */ 184 180 242 180 187 156 242 156 242 242 242 242 188 157 242 157 /* CG.CG..GC */ 123 139 242 139 242 242 242 242 162 131 242 131 168 184 242 184 /* CG.CU..GC */ 242 242 242 242 163 132 242 132 111 127 242 127 102 71 242 71 /* CG.GA..GC */ 85 242 153 211 95 242 163 174 -11 242 57 190 242 242 242 242 /* CG.GC..GC */ 98 242 166 177 121 242 142 200 242 242 242 242 122 242 143 201 /* CG.GG..GC */ 10 242 78 211 242 242 242 242 49 242 117 175 177 242 170 134 /* CG.GU..GC */ 242 242 242 242 97 242 118 176 120 242 113 77 111 242 104 190 /* CG.UA..GC */ 242 140 149 121 242 150 112 84 242 91 128 100 242 242 242 242 /* CG.UC..GC */ 242 153 115 87 242 129 138 63 242 242 242 242 242 130 139 64 /* CG.UG..GC */ 242 112 149 121 242 242 242 242 242 104 113 85 242 157 72 166 /* CG.UU..GC */ 242 242 242 242 242 105 114 39 242 100 15 109 242 44 128 -22 /* CG.AA..GU */ 150 189 101 242 217 229 168 242 95 134 46 242 242 242 242 242 /* CG.AC..GU */ 149 161 100 242 134 173 132 242 242 242 242 242 152 191 150 242 /* CG.AG..GU */ 163 202 114 242 242 242 242 242 132 171 83 242 227 219 253 242 /* CG.AU..GU */ 242 242 242 242 114 153 112 242 219 211 245 242 119 111 145 242 /* CG.CA..GU */ 207 176 242 176 247 243 242 243 152 168 242 168 242 242 242 242 /* CG.CC..GU */ 179 175 242 175 191 160 242 160 242 242 242 242 209 178 242 178 /* CG.CG..GU */ 220 236 242 236 242 242 242 242 189 158 242 158 237 253 242 253 /* CG.CU..GU */ 242 242 242 242 171 140 242 140 229 245 242 245 129 98 242 98 /* CG.GA..GU */ 94 242 162 220 161 242 229 240 39 242 107 240 242 242 242 242 /* CG.GC..GU */ 93 242 161 172 125 242 146 204 242 242 242 242 143 242 164 222 /* CG.GG..GU */ 107 242 175 308 242 242 242 242 76 242 144 202 246 242 239 203 /* CG.GU..GU */ 242 242 242 242 105 242 126 184 238 242 231 195 138 242 131 217 /* CG.UA..GU */ 242 149 158 130 242 216 178 150 242 141 178 150 242 242 242 242 /* CG.UC..GU */ 242 148 110 82 242 133 142 67 242 242 242 242 242 151 160 85 /* CG.UG..GU */ 242 209 246 218 242 242 242 242 242 131 140 112 242 226 141 235 /* CG.UU..GU */ 242 242 242 242 242 113 122 47 242 218 133 227 242 71 155 5 /* CG.AA..UG */ 202 241 153 242 179 191 130 242 85 124 36 242 242 242 242 242 /* CG.AC..UG */ 154 166 105 242 162 201 160 242 242 242 242 242 168 207 166 242 /* CG.AG..UG */ 161 200 112 242 242 242 242 242 172 211 123 242 232 224 258 242 /* CG.AU..UG */ 242 242 242 242 190 229 188 242 249 241 275 242 114 106 140 242 /* CG.CA..UG */ 259 228 242 228 209 205 242 205 142 158 242 158 242 242 242 242 /* CG.CC..UG */ 184 180 242 180 219 188 242 188 242 242 242 242 225 194 242 194 /* CG.CG..UG */ 218 234 242 234 242 242 242 242 229 198 242 198 242 258 242 258 /* CG.CU..UG */ 242 242 242 242 247 216 242 216 259 275 242 275 124 93 242 93 /* CG.GA..UG */ 146 242 214 272 123 242 191 202 29 242 97 230 242 242 242 242 /* CG.GC..UG */ 98 242 166 177 153 242 174 232 242 242 242 242 159 242 180 238 /* CG.GG..UG */ 105 242 173 306 242 242 242 242 116 242 184 242 251 242 244 208 /* CG.GU..UG */ 242 242 242 242 181 242 202 260 268 242 261 225 133 242 126 212 /* CG.UA..UG */ 242 201 210 182 242 178 140 112 242 131 168 140 242 242 242 242 /* CG.UC..UG */ 242 153 115 87 242 161 170 95 242 242 242 242 242 167 176 101 /* CG.UG..UG */ 242 207 244 216 242 242 242 242 242 171 180 152 242 231 146 240 /* CG.UU..UG */ 242 242 242 242 242 189 198 123 242 248 163 257 242 66 150 0 /* CG.AA..AU */ 150 189 101 242 217 229 168 242 95 134 46 242 242 242 242 242 /* CG.AC..AU */ 149 161 100 242 134 173 132 242 242 242 242 242 152 191 150 242 /* CG.AG..AU */ 163 202 114 242 242 242 242 242 132 171 83 242 227 219 253 242 /* CG.AU..AU */ 242 242 242 242 114 153 112 242 219 211 245 242 119 111 145 242 /* CG.CA..AU */ 207 176 242 176 247 243 242 243 152 168 242 168 242 242 242 242 /* CG.CC..AU */ 179 175 242 175 191 160 242 160 242 242 242 242 209 178 242 178 /* CG.CG..AU */ 220 236 242 236 242 242 242 242 189 158 242 158 237 253 242 253 /* CG.CU..AU */ 242 242 242 242 171 140 242 140 229 245 242 245 129 98 242 98 /* CG.GA..AU */ 94 242 162 220 161 242 229 240 39 242 107 240 242 242 242 242 /* CG.GC..AU */ 93 242 161 172 125 242 146 204 242 242 242 242 143 242 164 222 /* CG.GG..AU */ 107 242 175 308 242 242 242 242 76 242 144 202 246 242 239 203 /* CG.GU..AU */ 242 242 242 242 105 242 126 184 238 242 231 195 138 242 131 217 /* CG.UA..AU */ 242 149 158 130 242 216 178 150 242 141 178 150 242 242 242 242 /* CG.UC..AU */ 242 148 110 82 242 133 142 67 242 242 242 242 242 151 160 85 /* CG.UG..AU */ 242 209 246 218 242 242 242 242 242 131 140 112 242 226 141 235 /* CG.UU..AU */ 242 242 242 242 242 113 122 47 242 218 133 227 242 71 155 5 /* CG.AA..UA */ 202 241 153 242 179 191 130 242 85 124 36 242 242 242 242 242 /* CG.AC..UA */ 154 166 105 242 162 201 160 242 242 242 242 242 168 207 166 242 /* CG.AG..UA */ 161 200 112 242 242 242 242 242 172 211 123 242 232 224 258 242 /* CG.AU..UA */ 242 242 242 242 190 229 188 242 249 241 275 242 114 106 140 242 /* CG.CA..UA */ 259 228 242 228 209 205 242 205 142 158 242 158 242 242 242 242 /* CG.CC..UA */ 184 180 242 180 219 188 242 188 242 242 242 242 225 194 242 194 /* CG.CG..UA */ 218 234 242 234 242 242 242 242 229 198 242 198 242 258 242 258 /* CG.CU..UA */ 242 242 242 242 247 216 242 216 259 275 242 275 124 93 242 93 /* CG.GA..UA */ 146 242 214 272 123 242 191 202 29 242 97 230 242 242 242 242 /* CG.GC..UA */ 98 242 166 177 153 242 174 232 242 242 242 242 159 242 180 238 /* CG.GG..UA */ 105 242 173 306 242 242 242 242 116 242 184 242 251 242 244 208 /* CG.GU..UA */ 242 242 242 242 181 242 202 260 268 242 261 225 133 242 126 212 /* CG.UA..UA */ 242 201 210 182 242 178 140 112 242 131 168 140 242 242 242 242 /* CG.UC..UA */ 242 153 115 87 242 161 170 95 242 242 242 242 242 167 176 101 /* CG.UG..UA */ 242 207 244 216 242 242 242 242 242 171 180 152 242 231 146 240 /* CG.UU..UA */ 242 242 242 242 242 189 198 123 242 248 163 257 242 66 150 0 /* CG.AA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.AC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.AG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.AU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.CA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.CC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.CG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.CU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.GA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.GC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.GG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.GU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.UA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.UC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.UG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* CG.UU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.AA..CG */ 141 154 66 242 198 184 123 242 85 98 10 242 242 242 242 242 /* GC.AC..CG */ 180 166 105 242 167 180 139 242 242 242 242 242 140 153 112 242 /* GC.AG..CG */ 92 105 17 242 242 242 242 242 153 166 78 242 149 115 149 242 /* GC.AU..CG */ 242 242 242 242 167 180 139 242 211 177 211 242 121 87 121 242 /* GC.CA..CG */ 151 130 242 106 181 187 242 163 95 121 242 97 242 242 242 242 /* GC.CC..CG */ 163 169 242 145 177 156 242 132 242 242 242 242 150 129 242 105 /* GC.CG..CG */ 102 128 242 104 242 242 242 242 163 142 242 118 112 138 242 114 /* GC.CU..CG */ 242 242 242 242 177 156 242 132 174 200 242 176 84 63 242 39 /* GC.GA..CG */ 45 242 105 101 102 242 162 111 -11 242 49 120 242 242 242 242 /* GC.GC..CG */ 84 242 144 93 118 242 131 127 242 242 242 242 91 242 104 100 /* GC.GG..CG */ -4 242 56 127 242 242 242 242 57 242 117 113 128 242 113 15 /* GC.GU..CG */ 242 242 242 242 118 242 131 127 190 242 175 77 100 242 85 109 /* GC.UA..CG */ 242 131 158 92 242 188 168 102 242 122 177 111 242 242 242 242 /* GC.UC..CG */ 242 170 150 84 242 157 184 71 242 242 242 242 242 130 157 44 /* GC.UG..CG */ 242 129 184 118 242 242 242 242 242 143 170 104 242 139 72 128 /* GC.UU..CG */ 242 242 242 242 242 157 184 71 242 201 134 190 242 64 166 -22 /* GC.AA..GC */ 142 176 88 242 173 159 98 242 67 80 -8 242 242 242 242 242 /* GC.AC..GC */ 176 115 101 242 152 165 124 242 242 242 242 242 153 166 125 242 /* GC.AG..GC */ 88 101 -8 242 242 242 242 242 127 140 52 242 180 146 180 242 /* GC.AU..GC */ 242 242 242 242 128 141 100 242 123 89 123 242 114 80 114 242 /* GC.CA..GC */ 173 152 242 128 109 162 242 138 77 103 242 79 242 242 242 242 /* GC.CC..GC */ 159 165 242 141 162 121 242 117 242 242 242 242 163 142 242 118 /* GC.CG..GC */ 98 124 242 100 242 242 242 242 137 116 242 92 143 169 242 145 /* GC.CU..GC */ 242 242 242 242 138 117 242 72 86 112 242 88 77 56 242 32 /* GC.GA..GC */ 67 242 127 123 77 242 137 86 -51 242 31 102 242 242 242 242 /* GC.GC..GC */ 80 242 140 89 103 242 116 112 242 242 242 242 104 242 117 113 /* GC.GG..GC */ -8 242 52 123 242 242 242 242 31 242 71 87 159 242 144 46 /* GC.GU..GC */ 242 242 242 242 79 242 92 88 102 242 87 -33 93 242 78 102 /* GC.UA..GC */ 242 153 180 114 242 163 143 77 242 104 159 93 242 242 242 242 /* GC.UC..GC */ 242 166 146 80 242 142 169 56 242 242 242 242 242 123 170 57 /* GC.UG..GC */ 242 125 180 114 242 242 242 242 242 117 144 78 242 170 83 159 /* GC.UU..GC */ 242 242 242 242 242 118 145 32 242 113 46 102 242 57 159 -50 /* GC.AA..GU */ 172 185 97 242 239 225 164 242 117 130 42 242 242 242 242 242 /* GC.AC..GU */ 171 157 96 242 156 169 128 242 242 242 242 242 174 187 146 242 /* GC.AG..GU */ 185 198 110 242 242 242 242 242 154 167 79 242 249 215 249 242 /* GC.AU..GU */ 242 242 242 242 136 149 108 242 241 207 241 242 141 107 141 242 /* GC.CA..GU */ 182 161 242 137 222 228 242 204 127 153 242 129 242 242 242 242 /* GC.CC..GU */ 154 160 242 136 166 145 242 121 242 242 242 242 184 163 242 139 /* GC.CG..GU */ 195 221 242 197 242 242 242 242 164 143 242 119 212 238 242 214 /* GC.CU..GU */ 242 242 242 242 146 125 242 101 204 230 242 206 104 83 242 59 /* GC.GA..GU */ 76 242 136 132 143 242 203 152 21 242 81 152 242 242 242 242 /* GC.GC..GU */ 75 242 135 84 107 242 120 116 242 242 242 242 125 242 138 134 /* GC.GG..GU */ 89 242 149 220 242 242 242 242 58 242 118 114 228 242 213 115 /* GC.GU..GU */ 242 242 242 242 87 242 100 96 220 242 205 107 120 242 105 129 /* GC.UA..GU */ 242 162 189 123 242 229 209 143 242 154 209 143 242 242 242 242 /* GC.UC..GU */ 242 161 141 75 242 146 173 60 242 242 242 242 242 164 191 78 /* GC.UG..GU */ 242 222 277 211 242 242 242 242 242 144 171 105 242 239 172 228 /* GC.UU..GU */ 242 242 242 242 242 126 153 40 242 231 164 220 242 84 186 -2 /* GC.AA..UG */ 224 237 149 242 201 187 126 242 107 120 32 242 242 242 242 242 /* GC.AC..UG */ 176 162 101 242 184 197 156 242 242 242 242 242 190 203 162 242 /* GC.AG..UG */ 183 196 108 242 242 242 242 242 194 207 119 242 254 220 254 242 /* GC.AU..UG */ 242 242 242 242 212 225 184 242 271 237 271 242 136 102 136 242 /* GC.CA..UG */ 234 213 242 189 184 190 242 166 117 143 242 119 242 242 242 242 /* GC.CC..UG */ 159 165 242 141 194 173 242 149 242 242 242 242 200 179 242 155 /* GC.CG..UG */ 193 219 242 195 242 242 242 242 204 183 242 159 217 243 242 219 /* GC.CU..UG */ 242 242 242 242 222 201 242 177 234 260 242 236 99 78 242 54 /* GC.GA..UG */ 128 242 188 184 105 242 165 114 11 242 71 142 242 242 242 242 /* GC.GC..UG */ 80 242 140 89 135 242 148 144 242 242 242 242 141 242 154 150 /* GC.GG..UG */ 87 242 147 218 242 242 242 242 98 242 158 154 233 242 218 120 /* GC.GU..UG */ 242 242 242 242 163 242 176 172 250 242 235 137 115 242 100 124 /* GC.UA..UG */ 242 214 241 175 242 191 171 105 242 144 199 133 242 242 242 242 /* GC.UC..UG */ 242 166 146 80 242 174 201 88 242 242 242 242 242 180 207 94 /* GC.UG..UG */ 242 220 275 209 242 242 242 242 242 184 211 145 242 244 177 233 /* GC.UU..UG */ 242 242 242 242 242 202 229 116 242 261 194 250 242 79 181 -7 /* GC.AA..AU */ 172 185 97 242 239 225 164 242 117 130 42 242 242 242 242 242 /* GC.AC..AU */ 171 157 96 242 156 169 128 242 242 242 242 242 174 187 146 242 /* GC.AG..AU */ 185 198 110 242 242 242 242 242 154 167 79 242 249 215 249 242 /* GC.AU..AU */ 242 242 242 242 136 149 108 242 241 207 241 242 141 107 141 242 /* GC.CA..AU */ 182 161 242 137 222 228 242 204 127 153 242 129 242 242 242 242 /* GC.CC..AU */ 154 160 242 136 166 145 242 121 242 242 242 242 184 163 242 139 /* GC.CG..AU */ 195 221 242 197 242 242 242 242 164 143 242 119 212 238 242 214 /* GC.CU..AU */ 242 242 242 242 146 125 242 101 204 230 242 206 104 83 242 59 /* GC.GA..AU */ 76 242 136 132 143 242 203 152 21 242 81 152 242 242 242 242 /* GC.GC..AU */ 75 242 135 84 107 242 120 116 242 242 242 242 125 242 138 134 /* GC.GG..AU */ 89 242 149 220 242 242 242 242 58 242 118 114 228 242 213 115 /* GC.GU..AU */ 242 242 242 242 87 242 100 96 220 242 205 107 120 242 105 129 /* GC.UA..AU */ 242 162 189 123 242 229 209 143 242 154 209 143 242 242 242 242 /* GC.UC..AU */ 242 161 141 75 242 146 173 60 242 242 242 242 242 164 191 78 /* GC.UG..AU */ 242 222 277 211 242 242 242 242 242 144 171 105 242 239 172 228 /* GC.UU..AU */ 242 242 242 242 242 126 153 40 242 231 164 220 242 84 186 -2 /* GC.AA..UA */ 224 237 149 242 201 187 126 242 107 120 32 242 242 242 242 242 /* GC.AC..UA */ 176 162 101 242 184 197 156 242 242 242 242 242 190 203 162 242 /* GC.AG..UA */ 183 196 108 242 242 242 242 242 194 207 119 242 254 220 254 242 /* GC.AU..UA */ 242 242 242 242 212 225 184 242 271 237 271 242 136 102 136 242 /* GC.CA..UA */ 234 213 242 189 184 190 242 166 117 143 242 119 242 242 242 242 /* GC.CC..UA */ 159 165 242 141 194 173 242 149 242 242 242 242 200 179 242 155 /* GC.CG..UA */ 193 219 242 195 242 242 242 242 204 183 242 159 217 243 242 219 /* GC.CU..UA */ 242 242 242 242 222 201 242 177 234 260 242 236 99 78 242 54 /* GC.GA..UA */ 128 242 188 184 105 242 165 114 11 242 71 142 242 242 242 242 /* GC.GC..UA */ 80 242 140 89 135 242 148 144 242 242 242 242 141 242 154 150 /* GC.GG..UA */ 87 242 147 218 242 242 242 242 98 242 158 154 233 242 218 120 /* GC.GU..UA */ 242 242 242 242 163 242 176 172 250 242 235 137 115 242 100 124 /* GC.UA..UA */ 242 214 241 175 242 191 171 105 242 144 199 133 242 242 242 242 /* GC.UC..UA */ 242 166 146 80 242 174 201 88 242 242 242 242 242 180 207 94 /* GC.UG..UA */ 242 220 275 209 242 242 242 242 242 184 211 145 242 244 177 233 /* GC.UU..UA */ 242 242 242 242 242 202 229 116 242 261 194 250 242 79 181 -7 /* GC.AA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.AC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.AG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.AU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.CA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.CC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.CG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.CU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.GA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.GC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.GG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.GU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.UA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.UC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.UG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GC.UU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.AA..CG */ 150 149 163 242 207 179 220 242 94 93 107 242 242 242 242 242 /* GU.AC..CG */ 189 161 202 242 176 175 236 242 242 242 242 242 149 148 209 242 /* GU.AG..CG */ 101 100 114 242 242 242 242 242 162 161 175 242 158 110 246 242 /* GU.AU..CG */ 242 242 242 242 176 175 236 242 220 172 308 242 130 82 218 242 /* GU.CA..CG */ 217 134 242 114 247 191 242 171 161 125 242 105 242 242 242 242 /* GU.CC..CG */ 229 173 242 153 243 160 242 140 242 242 242 242 216 133 242 113 /* GU.CG..CG */ 168 132 242 112 242 242 242 242 229 146 242 126 178 142 242 122 /* GU.CU..CG */ 242 242 242 242 243 160 242 140 240 204 242 184 150 67 242 47 /* GU.GA..CG */ 95 242 132 219 152 242 189 229 39 242 76 238 242 242 242 242 /* GU.GC..CG */ 134 242 171 211 168 242 158 245 242 242 242 242 141 242 131 218 /* GU.GG..CG */ 46 242 83 245 242 242 242 242 107 242 144 231 178 242 140 133 /* GU.GU..CG */ 242 242 242 242 168 242 158 245 240 242 202 195 150 242 112 227 /* GU.UA..CG */ 242 152 227 119 242 209 237 129 242 143 246 138 242 242 242 242 /* GU.UC..CG */ 242 191 219 111 242 178 253 98 242 242 242 242 242 151 226 71 /* GU.UG..CG */ 242 150 253 145 242 242 242 242 242 164 239 131 242 160 141 155 /* GU.UU..CG */ 242 242 242 242 242 178 253 98 242 222 203 217 242 85 235 5 /* GU.AA..GC */ 172 171 185 242 182 154 195 242 76 75 89 242 242 242 242 242 /* GU.AC..GC */ 185 157 198 242 161 160 221 242 242 242 242 242 162 161 222 242 /* GU.AG..GC */ 97 96 110 242 242 242 242 242 136 135 149 242 189 141 277 242 /* GU.AU..GC */ 242 242 242 242 137 136 197 242 132 84 220 242 123 75 211 242 /* GU.CA..GC */ 239 156 242 136 222 166 242 146 143 107 242 87 242 242 242 242 /* GU.CC..GC */ 225 169 242 149 228 145 242 125 242 242 242 242 229 146 242 126 /* GU.CG..GC */ 164 128 242 108 242 242 242 242 203 120 242 100 209 173 242 153 /* GU.CU..GC */ 242 242 242 242 204 121 242 101 152 116 242 96 143 60 242 40 /* GU.GA..GC */ 117 242 154 241 127 242 164 204 21 242 58 220 242 242 242 242 /* GU.GC..GC */ 130 242 167 207 153 242 143 230 242 242 242 242 154 242 144 231 /* GU.GG..GC */ 42 242 79 241 242 242 242 242 81 242 118 205 209 242 171 164 /* GU.GU..GC */ 242 242 242 242 129 242 119 206 152 242 114 107 143 242 105 220 /* GU.UA..GC */ 242 174 249 141 242 184 212 104 242 125 228 120 242 242 242 242 /* GU.UC..GC */ 242 187 215 107 242 163 238 83 242 242 242 242 242 164 239 84 /* GU.UG..GC */ 242 146 249 141 242 242 242 242 242 138 213 105 242 191 172 186 /* GU.UU..GC */ 242 242 242 242 242 139 214 59 242 134 115 129 242 78 228 -2 /* GU.AA..GU */ 160 180 194 242 248 220 261 242 126 125 139 242 242 242 242 242 /* GU.AC..GU */ 180 105 193 242 165 164 225 242 242 242 242 242 183 182 243 242 /* GU.AG..GU */ 194 193 186 242 242 242 242 242 163 162 176 242 258 210 346 242 /* GU.AU..GU */ 242 242 242 242 145 144 205 242 250 202 338 242 150 102 238 242 /* GU.CA..GU */ 248 165 242 145 241 232 242 212 193 157 242 137 242 242 242 242 /* GU.CC..GU */ 220 164 242 144 232 128 242 129 242 242 242 242 250 167 242 147 /* GU.CG..GU */ 261 225 242 205 242 242 242 242 230 147 242 127 278 242 242 222 /* GU.CU..GU */ 242 242 242 242 212 129 242 89 270 234 242 214 170 87 242 67 /* GU.GA..GU */ 126 242 163 250 193 242 230 270 51 242 108 270 242 242 242 242 /* GU.GC..GU */ 125 242 162 202 157 242 147 234 242 242 242 242 175 242 165 252 /* GU.GG..GU */ 139 242 176 338 242 242 242 242 108 242 125 232 278 242 240 233 /* GU.GU..GU */ 242 242 242 242 137 242 127 214 270 242 232 204 170 242 132 247 /* GU.UA..GU */ 242 183 258 150 242 250 278 170 242 175 278 170 242 242 242 242 /* GU.UC..GU */ 242 182 210 102 242 167 242 87 242 242 242 242 242 164 260 105 /* GU.UG..GU */ 242 243 346 238 242 242 242 242 242 165 240 132 242 260 220 255 /* GU.UU..GU */ 242 242 242 242 242 147 222 67 242 252 233 247 242 105 255 4 /* GU.AA..UG */ 233 232 246 242 210 182 223 242 116 115 129 242 242 242 242 242 /* GU.AC..UG */ 185 157 198 242 193 192 253 242 242 242 242 242 199 198 259 242 /* GU.AG..UG */ 192 191 205 242 242 242 242 242 203 202 216 242 263 215 351 242 /* GU.AU..UG */ 242 242 242 242 221 220 281 242 280 232 368 242 145 97 233 242 /* GU.CA..UG */ 300 217 242 197 250 194 242 174 183 147 242 127 242 242 242 242 /* GU.CC..UG */ 225 169 242 149 260 177 242 157 242 242 242 242 266 183 242 163 /* GU.CG..UG */ 259 223 242 203 242 242 242 242 270 187 242 167 283 247 242 227 /* GU.CU..UG */ 242 242 242 242 288 205 242 185 300 264 242 244 165 82 242 62 /* GU.GA..UG */ 178 242 215 302 155 242 192 232 61 242 98 260 242 242 242 242 /* GU.GC..UG */ 130 242 167 207 185 242 175 262 242 242 242 242 191 242 181 268 /* GU.GG..UG */ 137 242 174 336 242 242 242 242 148 242 185 272 283 242 245 238 /* GU.GU..UG */ 242 242 242 242 213 242 203 290 300 242 262 255 165 242 127 242 /* GU.UA..UG */ 242 235 310 202 242 212 240 132 242 165 268 160 242 242 242 242 /* GU.UC..UG */ 242 187 215 107 242 195 270 115 242 242 242 242 242 201 276 121 /* GU.UG..UG */ 242 241 344 236 242 242 242 242 242 205 280 172 242 265 246 260 /* GU.UU..UG */ 242 242 242 242 242 223 298 143 242 282 263 277 242 100 250 20 /* GU.AA..AU */ 160 180 194 242 248 220 261 242 126 125 139 242 242 242 242 242 /* GU.AC..AU */ 180 105 193 242 165 164 225 242 242 242 242 242 183 182 243 242 /* GU.AG..AU */ 194 193 186 242 242 242 242 242 163 162 176 242 258 210 346 242 /* GU.AU..AU */ 242 242 242 242 145 144 205 242 250 202 338 242 150 102 238 242 /* GU.CA..AU */ 248 165 242 145 241 232 242 212 193 157 242 137 242 242 242 242 /* GU.CC..AU */ 220 164 242 144 232 128 242 129 242 242 242 242 250 167 242 147 /* GU.CG..AU */ 261 225 242 205 242 242 242 242 230 147 242 127 278 242 242 222 /* GU.CU..AU */ 242 242 242 242 212 129 242 89 270 234 242 214 170 87 242 67 /* GU.GA..AU */ 126 242 163 250 193 242 230 270 51 242 108 270 242 242 242 242 /* GU.GC..AU */ 125 242 162 202 157 242 147 234 242 242 242 242 175 242 165 252 /* GU.GG..AU */ 139 242 176 338 242 242 242 242 108 242 125 232 278 242 240 233 /* GU.GU..AU */ 242 242 242 242 137 242 127 214 270 242 232 204 170 242 132 247 /* GU.UA..AU */ 242 183 258 150 242 250 278 170 242 175 278 170 242 242 242 242 /* GU.UC..AU */ 242 182 210 102 242 167 242 87 242 242 242 242 242 164 260 105 /* GU.UG..AU */ 242 243 346 238 242 242 242 242 242 165 240 132 242 260 220 255 /* GU.UU..AU */ 242 242 242 242 242 147 222 67 242 252 233 247 242 105 255 4 /* GU.AA..UA */ 233 232 246 242 210 182 223 242 116 115 129 242 242 242 242 242 /* GU.AC..UA */ 185 157 198 242 193 192 253 242 242 242 242 242 199 198 259 242 /* GU.AG..UA */ 192 191 205 242 242 242 242 242 203 202 216 242 263 215 351 242 /* GU.AU..UA */ 242 242 242 242 221 220 281 242 280 232 368 242 145 97 233 242 /* GU.CA..UA */ 300 217 242 197 250 194 242 174 183 147 242 127 242 242 242 242 /* GU.CC..UA */ 225 169 242 149 260 177 242 157 242 242 242 242 266 183 242 163 /* GU.CG..UA */ 259 223 242 203 242 242 242 242 270 187 242 167 283 247 242 227 /* GU.CU..UA */ 242 242 242 242 288 205 242 185 300 264 242 244 165 82 242 62 /* GU.GA..UA */ 178 242 215 302 155 242 192 232 61 242 98 260 242 242 242 242 /* GU.GC..UA */ 130 242 167 207 185 242 175 262 242 242 242 242 191 242 181 268 /* GU.GG..UA */ 137 242 174 336 242 242 242 242 148 242 185 272 283 242 245 238 /* GU.GU..UA */ 242 242 242 242 213 242 203 290 300 242 262 255 165 242 127 242 /* GU.UA..UA */ 242 235 310 202 242 212 240 132 242 165 268 160 242 242 242 242 /* GU.UC..UA */ 242 187 215 107 242 195 270 115 242 242 242 242 242 201 276 121 /* GU.UG..UA */ 242 241 344 236 242 242 242 242 242 205 280 172 242 265 246 260 /* GU.UU..UA */ 242 242 242 242 242 223 298 143 242 282 263 277 242 100 250 20 /* GU.AA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.AC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.AG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.AU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.CA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.CC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.CG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.CU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.GA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.GC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.GG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.GU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.UA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.UC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.UG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* GU.UU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.AA..CG */ 202 154 161 242 259 184 218 242 146 98 105 242 242 242 242 242 /* UG.AC..CG */ 241 166 200 242 228 180 234 242 242 242 242 242 201 153 207 242 /* UG.AG..CG */ 153 105 112 242 242 242 242 242 214 166 173 242 210 115 244 242 /* UG.AU..CG */ 242 242 242 242 228 180 234 242 272 177 306 242 182 87 216 242 /* UG.CA..CG */ 179 162 242 190 209 219 242 247 123 153 242 181 242 242 242 242 /* UG.CC..CG */ 191 201 242 229 205 188 242 216 242 242 242 242 178 161 242 189 /* UG.CG..CG */ 130 160 242 188 242 242 242 242 191 174 242 202 140 170 242 198 /* UG.CU..CG */ 242 242 242 242 205 188 242 216 202 232 242 260 112 95 242 123 /* UG.GA..CG */ 85 242 172 249 142 242 229 259 29 242 116 268 242 242 242 242 /* UG.GC..CG */ 124 242 211 241 158 242 198 275 242 242 242 242 131 242 171 248 /* UG.GG..CG */ 36 242 123 275 242 242 242 242 97 242 184 261 168 242 180 163 /* UG.GU..CG */ 242 242 242 242 158 242 198 275 230 242 242 225 140 242 152 257 /* UG.UA..CG */ 242 168 232 114 242 225 242 124 242 159 251 133 242 242 242 242 /* UG.UC..CG */ 242 207 224 106 242 194 258 93 242 242 242 242 242 167 231 66 /* UG.UG..CG */ 242 166 258 140 242 242 242 242 242 180 244 126 242 176 146 150 /* UG.UU..CG */ 242 242 242 242 242 194 258 93 242 238 208 212 242 101 240 0 /* UG.AA..GC */ 224 176 183 242 234 159 193 242 128 80 87 242 242 242 242 242 /* UG.AC..GC */ 237 162 196 242 213 165 219 242 242 242 242 242 214 166 220 242 /* UG.AG..GC */ 149 101 108 242 242 242 242 242 188 140 147 242 241 146 275 242 /* UG.AU..GC */ 242 242 242 242 189 141 195 242 184 89 218 242 175 80 209 242 /* UG.CA..GC */ 201 184 242 212 184 194 242 222 105 135 242 163 242 242 242 242 /* UG.CC..GC */ 187 197 242 225 190 173 242 201 242 242 242 242 191 174 242 202 /* UG.CG..GC */ 126 156 242 184 242 242 242 242 165 148 242 176 171 201 242 229 /* UG.CU..GC */ 242 242 242 242 166 149 242 177 114 144 242 172 105 88 242 116 /* UG.GA..GC */ 107 242 194 271 117 242 204 234 11 242 98 250 242 242 242 242 /* UG.GC..GC */ 120 242 207 237 143 242 183 260 242 242 242 242 144 242 184 261 /* UG.GG..GC */ 32 242 119 271 242 242 242 242 71 242 158 235 199 242 211 194 /* UG.GU..GC */ 242 242 242 242 119 242 159 236 142 242 154 137 133 242 145 250 /* UG.UA..GC */ 242 190 254 136 242 200 217 99 242 141 233 115 242 242 242 242 /* UG.UC..GC */ 242 203 220 102 242 179 243 78 242 242 242 242 242 180 244 79 /* UG.UG..GC */ 242 162 254 136 242 242 242 242 242 154 218 100 242 207 177 181 /* UG.UU..GC */ 242 242 242 242 242 155 219 54 242 150 120 124 242 94 233 -7 /* UG.AA..GU */ 233 185 192 242 300 225 259 242 178 130 137 242 242 242 242 242 /* UG.AC..GU */ 232 157 191 242 217 169 223 242 242 242 242 242 235 187 241 242 /* UG.AG..GU */ 246 198 205 242 242 242 242 242 215 167 174 242 310 215 344 242 /* UG.AU..GU */ 242 242 242 242 197 149 203 242 302 207 336 242 202 107 236 242 /* UG.CA..GU */ 210 193 242 221 250 260 242 288 155 185 242 213 242 242 242 242 /* UG.CC..GU */ 182 192 242 220 194 177 242 205 242 242 242 242 212 195 242 223 /* UG.CG..GU */ 223 253 242 281 242 242 242 242 192 175 242 203 240 270 242 298 /* UG.CU..GU */ 242 242 242 242 174 157 242 185 232 262 242 290 132 115 242 143 /* UG.GA..GU */ 116 242 203 280 183 242 270 300 61 242 148 300 242 242 242 242 /* UG.GC..GU */ 115 242 202 232 147 242 187 264 242 242 242 242 165 242 205 282 /* UG.GG..GU */ 129 242 216 368 242 242 242 242 98 242 185 262 268 242 280 263 /* UG.GU..GU */ 242 242 242 242 127 242 167 244 260 242 272 255 160 242 172 277 /* UG.UA..GU */ 242 199 263 145 242 266 283 165 242 191 283 165 242 242 242 242 /* UG.UC..GU */ 242 198 215 97 242 183 247 82 242 242 242 242 242 201 265 100 /* UG.UG..GU */ 242 259 351 233 242 242 242 242 242 181 245 127 242 276 246 250 /* UG.UU..GU */ 242 242 242 242 242 163 227 62 242 268 238 242 242 121 260 20 /* UG.AA..UG */ 264 237 244 242 262 187 221 242 168 120 127 242 242 242 242 242 /* UG.AC..UG */ 237 114 196 242 245 197 251 242 242 242 242 242 251 203 257 242 /* UG.AG..UG */ 244 196 182 242 242 242 242 242 255 207 214 242 315 220 349 242 /* UG.AU..UG */ 242 242 242 242 273 225 279 242 332 237 366 242 197 102 231 242 /* UG.CA..UG */ 262 245 242 273 164 222 242 250 145 175 242 203 242 242 242 242 /* UG.CC..UG */ 187 197 242 225 222 185 242 233 242 242 242 242 228 211 242 239 /* UG.CG..UG */ 221 251 242 279 242 242 242 242 232 215 242 243 245 275 242 303 /* UG.CU..UG */ 242 242 242 242 250 233 242 240 262 292 242 320 127 110 242 138 /* UG.GA..UG */ 168 242 255 332 145 242 232 262 30 242 138 290 242 242 242 242 /* UG.GC..UG */ 120 242 207 237 175 242 215 292 242 242 242 242 181 242 221 298 /* UG.GG..UG */ 127 242 214 366 242 242 242 242 138 242 204 302 273 242 285 268 /* UG.GU..UG */ 242 242 242 242 203 242 243 320 290 242 302 265 155 242 167 272 /* UG.UA..UG */ 242 251 315 197 242 228 245 127 242 181 273 155 242 242 242 242 /* UG.UC..UG */ 242 203 220 102 242 211 275 110 242 242 242 242 242 196 281 116 /* UG.UG..UG */ 242 257 349 231 242 242 242 242 242 221 285 167 242 281 231 255 /* UG.UU..UG */ 242 242 242 242 242 239 303 138 242 298 268 272 242 116 255 -7 /* UG.AA..AU */ 233 185 192 242 300 225 259 242 178 130 137 242 242 242 242 242 /* UG.AC..AU */ 232 157 191 242 217 169 223 242 242 242 242 242 235 187 241 242 /* UG.AG..AU */ 246 198 205 242 242 242 242 242 215 167 174 242 310 215 344 242 /* UG.AU..AU */ 242 242 242 242 197 149 203 242 302 207 336 242 202 107 236 242 /* UG.CA..AU */ 210 193 242 221 250 260 242 288 155 185 242 213 242 242 242 242 /* UG.CC..AU */ 182 192 242 220 194 177 242 205 242 242 242 242 212 195 242 223 /* UG.CG..AU */ 223 253 242 281 242 242 242 242 192 175 242 203 240 270 242 298 /* UG.CU..AU */ 242 242 242 242 174 157 242 185 232 262 242 290 132 115 242 143 /* UG.GA..AU */ 116 242 203 280 183 242 270 300 61 242 148 300 242 242 242 242 /* UG.GC..AU */ 115 242 202 232 147 242 187 264 242 242 242 242 165 242 205 282 /* UG.GG..AU */ 129 242 216 368 242 242 242 242 98 242 185 262 268 242 280 263 /* UG.GU..AU */ 242 242 242 242 127 242 167 244 260 242 272 255 160 242 172 277 /* UG.UA..AU */ 242 199 263 145 242 266 283 165 242 191 283 165 242 242 242 242 /* UG.UC..AU */ 242 198 215 97 242 183 247 82 242 242 242 242 242 201 265 100 /* UG.UG..AU */ 242 259 351 233 242 242 242 242 242 181 245 127 242 276 246 250 /* UG.UU..AU */ 242 242 242 242 242 163 227 62 242 268 238 242 242 121 260 20 /* UG.AA..UA */ 264 237 244 242 262 187 221 242 168 120 127 242 242 242 242 242 /* UG.AC..UA */ 237 114 196 242 245 197 251 242 242 242 242 242 251 203 257 242 /* UG.AG..UA */ 244 196 182 242 242 242 242 242 255 207 214 242 315 220 349 242 /* UG.AU..UA */ 242 242 242 242 273 225 279 242 332 237 366 242 197 102 231 242 /* UG.CA..UA */ 262 245 242 273 164 222 242 250 145 175 242 203 242 242 242 242 /* UG.CC..UA */ 187 197 242 225 222 185 242 233 242 242 242 242 228 211 242 239 /* UG.CG..UA */ 221 251 242 279 242 242 242 242 232 215 242 243 245 275 242 303 /* UG.CU..UA */ 242 242 242 242 250 233 242 240 262 292 242 320 127 110 242 138 /* UG.GA..UA */ 168 242 255 332 145 242 232 262 30 242 138 290 242 242 242 242 /* UG.GC..UA */ 120 242 207 237 175 242 215 292 242 242 242 242 181 242 221 298 /* UG.GG..UA */ 127 242 214 366 242 242 242 242 138 242 204 302 273 242 285 268 /* UG.GU..UA */ 242 242 242 242 203 242 243 320 290 242 302 265 155 242 167 272 /* UG.UA..UA */ 242 251 315 197 242 228 245 127 242 181 273 155 242 242 242 242 /* UG.UC..UA */ 242 203 220 102 242 211 275 110 242 242 242 242 242 196 281 116 /* UG.UG..UA */ 242 257 349 231 242 242 242 242 242 221 285 167 242 281 231 255 /* UG.UU..UA */ 242 242 242 242 242 239 303 138 242 298 268 272 242 116 255 -7 /* UG.AA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.AC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.AG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.AU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.CA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.CC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.CG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.CU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.GA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.GC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.GG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.GU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.UA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.UC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.UG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UG.UU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.AA..CG */ 150 149 163 242 207 179 220 242 94 93 107 242 242 242 242 242 /* AU.AC..CG */ 189 161 202 242 176 175 236 242 242 242 242 242 149 148 209 242 /* AU.AG..CG */ 101 100 114 242 242 242 242 242 162 161 175 242 158 110 246 242 /* AU.AU..CG */ 242 242 242 242 176 175 236 242 220 172 308 242 130 82 218 242 /* AU.CA..CG */ 217 134 242 114 247 191 242 171 161 125 242 105 242 242 242 242 /* AU.CC..CG */ 229 173 242 153 243 160 242 140 242 242 242 242 216 133 242 113 /* AU.CG..CG */ 168 132 242 112 242 242 242 242 229 146 242 126 178 142 242 122 /* AU.CU..CG */ 242 242 242 242 243 160 242 140 240 204 242 184 150 67 242 47 /* AU.GA..CG */ 95 242 132 219 152 242 189 229 39 242 76 238 242 242 242 242 /* AU.GC..CG */ 134 242 171 211 168 242 158 245 242 242 242 242 141 242 131 218 /* AU.GG..CG */ 46 242 83 245 242 242 242 242 107 242 144 231 178 242 140 133 /* AU.GU..CG */ 242 242 242 242 168 242 158 245 240 242 202 195 150 242 112 227 /* AU.UA..CG */ 242 152 227 119 242 209 237 129 242 143 246 138 242 242 242 242 /* AU.UC..CG */ 242 191 219 111 242 178 253 98 242 242 242 242 242 151 226 71 /* AU.UG..CG */ 242 150 253 145 242 242 242 242 242 164 239 131 242 160 141 155 /* AU.UU..CG */ 242 242 242 242 242 178 253 98 242 222 203 217 242 85 235 5 /* AU.AA..GC */ 172 171 185 242 182 154 195 242 76 75 89 242 242 242 242 242 /* AU.AC..GC */ 185 157 198 242 161 160 221 242 242 242 242 242 162 161 222 242 /* AU.AG..GC */ 97 96 110 242 242 242 242 242 136 135 149 242 189 141 277 242 /* AU.AU..GC */ 242 242 242 242 137 136 197 242 132 84 220 242 123 75 211 242 /* AU.CA..GC */ 239 156 242 136 222 166 242 146 143 107 242 87 242 242 242 242 /* AU.CC..GC */ 225 169 242 149 228 145 242 125 242 242 242 242 229 146 242 126 /* AU.CG..GC */ 164 128 242 108 242 242 242 242 203 120 242 100 209 173 242 153 /* AU.CU..GC */ 242 242 242 242 204 121 242 101 152 116 242 96 143 60 242 40 /* AU.GA..GC */ 117 242 154 241 127 242 164 204 21 242 58 220 242 242 242 242 /* AU.GC..GC */ 130 242 167 207 153 242 143 230 242 242 242 242 154 242 144 231 /* AU.GG..GC */ 42 242 79 241 242 242 242 242 81 242 118 205 209 242 171 164 /* AU.GU..GC */ 242 242 242 242 129 242 119 206 152 242 114 107 143 242 105 220 /* AU.UA..GC */ 242 174 249 141 242 184 212 104 242 125 228 120 242 242 242 242 /* AU.UC..GC */ 242 187 215 107 242 163 238 83 242 242 242 242 242 164 239 84 /* AU.UG..GC */ 242 146 249 141 242 242 242 242 242 138 213 105 242 191 172 186 /* AU.UU..GC */ 242 242 242 242 242 139 214 59 242 134 115 129 242 78 228 -2 /* AU.AA..GU */ 160 180 194 242 248 220 261 242 126 125 139 242 242 242 242 242 /* AU.AC..GU */ 180 105 193 242 165 164 225 242 242 242 242 242 183 182 243 242 /* AU.AG..GU */ 194 193 186 242 242 242 242 242 163 162 176 242 258 210 346 242 /* AU.AU..GU */ 242 242 242 242 145 144 205 242 250 202 338 242 150 102 238 242 /* AU.CA..GU */ 248 165 242 145 241 232 242 212 193 157 242 137 242 242 242 242 /* AU.CC..GU */ 220 164 242 144 232 128 242 129 242 242 242 242 250 167 242 147 /* AU.CG..GU */ 261 225 242 205 242 242 242 242 230 147 242 127 278 242 242 222 /* AU.CU..GU */ 242 242 242 242 212 129 242 89 270 234 242 214 170 87 242 67 /* AU.GA..GU */ 126 242 163 250 193 242 230 270 51 242 108 270 242 242 242 242 /* AU.GC..GU */ 125 242 162 202 157 242 147 234 242 242 242 242 175 242 165 252 /* AU.GG..GU */ 139 242 176 338 242 242 242 242 108 242 125 232 278 242 240 233 /* AU.GU..GU */ 242 242 242 242 137 242 127 214 270 242 232 204 170 242 132 247 /* AU.UA..GU */ 242 183 258 150 242 250 278 170 242 175 278 170 242 242 242 242 /* AU.UC..GU */ 242 182 210 102 242 167 242 87 242 242 242 242 242 164 260 105 /* AU.UG..GU */ 242 243 346 238 242 242 242 242 242 165 240 132 242 260 220 255 /* AU.UU..GU */ 242 242 242 242 242 147 222 67 242 252 233 247 242 105 255 4 /* AU.AA..UG */ 233 232 246 242 210 182 223 242 116 115 129 242 242 242 242 242 /* AU.AC..UG */ 185 157 198 242 193 192 253 242 242 242 242 242 199 198 259 242 /* AU.AG..UG */ 192 191 205 242 242 242 242 242 203 202 216 242 263 215 351 242 /* AU.AU..UG */ 242 242 242 242 221 220 281 242 280 232 368 242 145 97 233 242 /* AU.CA..UG */ 300 217 242 197 250 194 242 174 183 147 242 127 242 242 242 242 /* AU.CC..UG */ 225 169 242 149 260 177 242 157 242 242 242 242 266 183 242 163 /* AU.CG..UG */ 259 223 242 203 242 242 242 242 270 187 242 167 283 247 242 227 /* AU.CU..UG */ 242 242 242 242 288 205 242 185 300 264 242 244 165 82 242 62 /* AU.GA..UG */ 178 242 215 302 155 242 192 232 61 242 98 260 242 242 242 242 /* AU.GC..UG */ 130 242 167 207 185 242 175 262 242 242 242 242 191 242 181 268 /* AU.GG..UG */ 137 242 174 336 242 242 242 242 148 242 185 272 283 242 245 238 /* AU.GU..UG */ 242 242 242 242 213 242 203 290 300 242 262 255 165 242 127 242 /* AU.UA..UG */ 242 235 310 202 242 212 240 132 242 165 268 160 242 242 242 242 /* AU.UC..UG */ 242 187 215 107 242 195 270 115 242 242 242 242 242 201 276 121 /* AU.UG..UG */ 242 241 344 236 242 242 242 242 242 205 280 172 242 265 246 260 /* AU.UU..UG */ 242 242 242 242 242 223 298 143 242 282 263 277 242 100 250 20 /* AU.AA..AU */ 160 180 194 242 248 220 261 242 126 125 139 242 242 242 242 242 /* AU.AC..AU */ 180 105 193 242 165 164 225 242 242 242 242 242 183 182 243 242 /* AU.AG..AU */ 194 193 186 242 242 242 242 242 163 162 176 242 258 210 346 242 /* AU.AU..AU */ 242 242 242 242 145 144 205 242 250 202 338 242 150 102 238 242 /* AU.CA..AU */ 248 165 242 145 241 232 242 212 193 157 242 137 242 242 242 242 /* AU.CC..AU */ 220 164 242 144 232 128 242 129 242 242 242 242 250 167 242 147 /* AU.CG..AU */ 261 225 242 205 242 242 242 242 230 147 242 127 278 242 242 222 /* AU.CU..AU */ 242 242 242 242 212 129 242 89 270 234 242 214 170 87 242 67 /* AU.GA..AU */ 126 242 163 250 193 242 230 270 51 242 108 270 242 242 242 242 /* AU.GC..AU */ 125 242 162 202 157 242 147 234 242 242 242 242 175 242 165 252 /* AU.GG..AU */ 139 242 176 338 242 242 242 242 108 242 125 232 278 242 240 233 /* AU.GU..AU */ 242 242 242 242 137 242 127 214 270 242 232 204 170 242 132 247 /* AU.UA..AU */ 242 183 258 150 242 250 278 170 242 175 278 170 242 242 242 242 /* AU.UC..AU */ 242 182 210 102 242 167 242 87 242 242 242 242 242 164 260 105 /* AU.UG..AU */ 242 243 346 238 242 242 242 242 242 165 240 132 242 260 220 255 /* AU.UU..AU */ 242 242 242 242 242 147 222 67 242 252 233 247 242 105 255 4 /* AU.AA..UA */ 233 232 246 242 210 182 223 242 116 115 129 242 242 242 242 242 /* AU.AC..UA */ 185 157 198 242 193 192 253 242 242 242 242 242 199 198 259 242 /* AU.AG..UA */ 192 191 205 242 242 242 242 242 203 202 216 242 263 215 351 242 /* AU.AU..UA */ 242 242 242 242 221 220 281 242 280 232 368 242 145 97 233 242 /* AU.CA..UA */ 300 217 242 197 250 194 242 174 183 147 242 127 242 242 242 242 /* AU.CC..UA */ 225 169 242 149 260 177 242 157 242 242 242 242 266 183 242 163 /* AU.CG..UA */ 259 223 242 203 242 242 242 242 270 187 242 167 283 247 242 227 /* AU.CU..UA */ 242 242 242 242 288 205 242 185 300 264 242 244 165 82 242 62 /* AU.GA..UA */ 178 242 215 302 155 242 192 232 61 242 98 260 242 242 242 242 /* AU.GC..UA */ 130 242 167 207 185 242 175 262 242 242 242 242 191 242 181 268 /* AU.GG..UA */ 137 242 174 336 242 242 242 242 148 242 185 272 283 242 245 238 /* AU.GU..UA */ 242 242 242 242 213 242 203 290 300 242 262 255 165 242 127 242 /* AU.UA..UA */ 242 235 310 202 242 212 240 132 242 165 268 160 242 242 242 242 /* AU.UC..UA */ 242 187 215 107 242 195 270 115 242 242 242 242 242 201 276 121 /* AU.UG..UA */ 242 241 344 236 242 242 242 242 242 205 280 172 242 265 246 260 /* AU.UU..UA */ 242 242 242 242 242 223 298 143 242 282 263 277 242 100 250 20 /* AU.AA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.AC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.AG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.AU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.CA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.CC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.CG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.CU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.GA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.GC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.GG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.GU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.UA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.UC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.UG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* AU.UU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.AA..CG */ 202 154 161 242 259 184 218 242 146 98 105 242 242 242 242 242 /* UA.AC..CG */ 241 166 200 242 228 180 234 242 242 242 242 242 201 153 207 242 /* UA.AG..CG */ 153 105 112 242 242 242 242 242 214 166 173 242 210 115 244 242 /* UA.AU..CG */ 242 242 242 242 228 180 234 242 272 177 306 242 182 87 216 242 /* UA.CA..CG */ 179 162 242 190 209 219 242 247 123 153 242 181 242 242 242 242 /* UA.CC..CG */ 191 201 242 229 205 188 242 216 242 242 242 242 178 161 242 189 /* UA.CG..CG */ 130 160 242 188 242 242 242 242 191 174 242 202 140 170 242 198 /* UA.CU..CG */ 242 242 242 242 205 188 242 216 202 232 242 260 112 95 242 123 /* UA.GA..CG */ 85 242 172 249 142 242 229 259 29 242 116 268 242 242 242 242 /* UA.GC..CG */ 124 242 211 241 158 242 198 275 242 242 242 242 131 242 171 248 /* UA.GG..CG */ 36 242 123 275 242 242 242 242 97 242 184 261 168 242 180 163 /* UA.GU..CG */ 242 242 242 242 158 242 198 275 230 242 242 225 140 242 152 257 /* UA.UA..CG */ 242 168 232 114 242 225 242 124 242 159 251 133 242 242 242 242 /* UA.UC..CG */ 242 207 224 106 242 194 258 93 242 242 242 242 242 167 231 66 /* UA.UG..CG */ 242 166 258 140 242 242 242 242 242 180 244 126 242 176 146 150 /* UA.UU..CG */ 242 242 242 242 242 194 258 93 242 238 208 212 242 101 240 0 /* UA.AA..GC */ 224 176 183 242 234 159 193 242 128 80 87 242 242 242 242 242 /* UA.AC..GC */ 237 162 196 242 213 165 219 242 242 242 242 242 214 166 220 242 /* UA.AG..GC */ 149 101 108 242 242 242 242 242 188 140 147 242 241 146 275 242 /* UA.AU..GC */ 242 242 242 242 189 141 195 242 184 89 218 242 175 80 209 242 /* UA.CA..GC */ 201 184 242 212 184 194 242 222 105 135 242 163 242 242 242 242 /* UA.CC..GC */ 187 197 242 225 190 173 242 201 242 242 242 242 191 174 242 202 /* UA.CG..GC */ 126 156 242 184 242 242 242 242 165 148 242 176 171 201 242 229 /* UA.CU..GC */ 242 242 242 242 166 149 242 177 114 144 242 172 105 88 242 116 /* UA.GA..GC */ 107 242 194 271 117 242 204 234 11 242 98 250 242 242 242 242 /* UA.GC..GC */ 120 242 207 237 143 242 183 260 242 242 242 242 144 242 184 261 /* UA.GG..GC */ 32 242 119 271 242 242 242 242 71 242 158 235 199 242 211 194 /* UA.GU..GC */ 242 242 242 242 119 242 159 236 142 242 154 137 133 242 145 250 /* UA.UA..GC */ 242 190 254 136 242 200 217 99 242 141 233 115 242 242 242 242 /* UA.UC..GC */ 242 203 220 102 242 179 243 78 242 242 242 242 242 180 244 79 /* UA.UG..GC */ 242 162 254 136 242 242 242 242 242 154 218 100 242 207 177 181 /* UA.UU..GC */ 242 242 242 242 242 155 219 54 242 150 120 124 242 94 233 -7 /* UA.AA..GU */ 233 185 192 242 300 225 259 242 178 130 137 242 242 242 242 242 /* UA.AC..GU */ 232 157 191 242 217 169 223 242 242 242 242 242 235 187 241 242 /* UA.AG..GU */ 246 198 205 242 242 242 242 242 215 167 174 242 310 215 344 242 /* UA.AU..GU */ 242 242 242 242 197 149 203 242 302 207 336 242 202 107 236 242 /* UA.CA..GU */ 210 193 242 221 250 260 242 288 155 185 242 213 242 242 242 242 /* UA.CC..GU */ 182 192 242 220 194 177 242 205 242 242 242 242 212 195 242 223 /* UA.CG..GU */ 223 253 242 281 242 242 242 242 192 175 242 203 240 270 242 298 /* UA.CU..GU */ 242 242 242 242 174 157 242 185 232 262 242 290 132 115 242 143 /* UA.GA..GU */ 116 242 203 280 183 242 270 300 61 242 148 300 242 242 242 242 /* UA.GC..GU */ 115 242 202 232 147 242 187 264 242 242 242 242 165 242 205 282 /* UA.GG..GU */ 129 242 216 368 242 242 242 242 98 242 185 262 268 242 280 263 /* UA.GU..GU */ 242 242 242 242 127 242 167 244 260 242 272 255 160 242 172 277 /* UA.UA..GU */ 242 199 263 145 242 266 283 165 242 191 283 165 242 242 242 242 /* UA.UC..GU */ 242 198 215 97 242 183 247 82 242 242 242 242 242 201 265 100 /* UA.UG..GU */ 242 259 351 233 242 242 242 242 242 181 245 127 242 276 246 250 /* UA.UU..GU */ 242 242 242 242 242 163 227 62 242 268 238 242 242 121 260 20 /* UA.AA..UG */ 264 237 244 242 262 187 221 242 168 120 127 242 242 242 242 242 /* UA.AC..UG */ 237 114 196 242 245 197 251 242 242 242 242 242 251 203 257 242 /* UA.AG..UG */ 244 196 182 242 242 242 242 242 255 207 214 242 315 220 349 242 /* UA.AU..UG */ 242 242 242 242 273 225 279 242 332 237 366 242 197 102 231 242 /* UA.CA..UG */ 262 245 242 273 164 222 242 250 145 175 242 203 242 242 242 242 /* UA.CC..UG */ 187 197 242 225 222 185 242 233 242 242 242 242 228 211 242 239 /* UA.CG..UG */ 221 251 242 279 242 242 242 242 232 215 242 243 245 275 242 303 /* UA.CU..UG */ 242 242 242 242 250 233 242 240 262 292 242 320 127 110 242 138 /* UA.GA..UG */ 168 242 255 332 145 242 232 262 30 242 138 290 242 242 242 242 /* UA.GC..UG */ 120 242 207 237 175 242 215 292 242 242 242 242 181 242 221 298 /* UA.GG..UG */ 127 242 214 366 242 242 242 242 138 242 204 302 273 242 285 268 /* UA.GU..UG */ 242 242 242 242 203 242 243 320 290 242 302 265 155 242 167 272 /* UA.UA..UG */ 242 251 315 197 242 228 245 127 242 181 273 155 242 242 242 242 /* UA.UC..UG */ 242 203 220 102 242 211 275 110 242 242 242 242 242 196 281 116 /* UA.UG..UG */ 242 257 349 231 242 242 242 242 242 221 285 167 242 281 231 255 /* UA.UU..UG */ 242 242 242 242 242 239 303 138 242 298 268 272 242 116 255 -7 /* UA.AA..AU */ 233 185 192 242 300 225 259 242 178 130 137 242 242 242 242 242 /* UA.AC..AU */ 232 157 191 242 217 169 223 242 242 242 242 242 235 187 241 242 /* UA.AG..AU */ 246 198 205 242 242 242 242 242 215 167 174 242 310 215 344 242 /* UA.AU..AU */ 242 242 242 242 197 149 203 242 302 207 336 242 202 107 236 242 /* UA.CA..AU */ 210 193 242 221 250 260 242 288 155 185 242 213 242 242 242 242 /* UA.CC..AU */ 182 192 242 220 194 177 242 205 242 242 242 242 212 195 242 223 /* UA.CG..AU */ 223 253 242 281 242 242 242 242 192 175 242 203 240 270 242 298 /* UA.CU..AU */ 242 242 242 242 174 157 242 185 232 262 242 290 132 115 242 143 /* UA.GA..AU */ 116 242 203 280 183 242 270 300 61 242 148 300 242 242 242 242 /* UA.GC..AU */ 115 242 202 232 147 242 187 264 242 242 242 242 165 242 205 282 /* UA.GG..AU */ 129 242 216 368 242 242 242 242 98 242 185 262 268 242 280 263 /* UA.GU..AU */ 242 242 242 242 127 242 167 244 260 242 272 255 160 242 172 277 /* UA.UA..AU */ 242 199 263 145 242 266 283 165 242 191 283 165 242 242 242 242 /* UA.UC..AU */ 242 198 215 97 242 183 247 82 242 242 242 242 242 201 265 100 /* UA.UG..AU */ 242 259 351 233 242 242 242 242 242 181 245 127 242 276 246 250 /* UA.UU..AU */ 242 242 242 242 242 163 227 62 242 268 238 242 242 121 260 20 /* UA.AA..UA */ 264 237 244 242 262 187 221 242 168 120 127 242 242 242 242 242 /* UA.AC..UA */ 237 114 196 242 245 197 251 242 242 242 242 242 251 203 257 242 /* UA.AG..UA */ 244 196 182 242 242 242 242 242 255 207 214 242 315 220 349 242 /* UA.AU..UA */ 242 242 242 242 273 225 279 242 332 237 366 242 197 102 231 242 /* UA.CA..UA */ 262 245 242 273 164 222 242 250 145 175 242 203 242 242 242 242 /* UA.CC..UA */ 187 197 242 225 222 185 242 233 242 242 242 242 228 211 242 239 /* UA.CG..UA */ 221 251 242 279 242 242 242 242 232 215 242 243 245 275 242 303 /* UA.CU..UA */ 242 242 242 242 250 233 242 240 262 292 242 320 127 110 242 138 /* UA.GA..UA */ 168 242 255 332 145 242 232 262 30 242 138 290 242 242 242 242 /* UA.GC..UA */ 120 242 207 237 175 242 215 292 242 242 242 242 181 242 221 298 /* UA.GG..UA */ 127 242 214 366 242 242 242 242 138 242 204 302 273 242 285 268 /* UA.GU..UA */ 242 242 242 242 203 242 243 320 290 242 302 265 155 242 167 272 /* UA.UA..UA */ 242 251 315 197 242 228 245 127 242 181 273 155 242 242 242 242 /* UA.UC..UA */ 242 203 220 102 242 211 275 110 242 242 242 242 242 196 281 116 /* UA.UG..UA */ 242 257 349 231 242 242 242 242 242 221 285 167 242 281 231 255 /* UA.UU..UA */ 242 242 242 242 242 239 303 138 242 298 268 272 242 116 255 -7 /* UA.AA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.AC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.AG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.AU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.CA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.CC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.CG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.CU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.GA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.GC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.GG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.GU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.UA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.UC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.UG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* UA.UU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AA..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AC..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AG..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AU..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CA..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CC..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CG..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CU..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GA..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GC..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GG..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GU..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UA..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UC..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UG..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UU..CG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AA..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AC..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AG..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AU..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CA..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CC..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CG..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CU..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GA..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GC..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GG..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GU..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UA..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UC..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UG..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UU..GC */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AA..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AC..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AG..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AU..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CA..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CC..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CG..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CU..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GA..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GC..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GG..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GU..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UA..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UC..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UG..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UU..GU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AA..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AC..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AG..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AU..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CA..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CC..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CG..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CU..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GA..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GC..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GG..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GU..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UA..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UC..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UG..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UU..UG */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AA..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AC..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AG..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AU..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CA..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CC..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CG..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CU..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GA..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GC..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GG..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GU..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UA..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UC..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UG..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UU..AU */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AA..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AC..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AG..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AU..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CA..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CC..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CG..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CU..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GA..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GC..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GG..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GU..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UA..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UC..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UG..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UU..UA */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.AU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.CU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.GU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UA.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UC.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UG.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 /* @.UU.. @ */ 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 368 # hairpin INF INF INF 364 282 297 287 259 259 272 283 293 303 311 319 327 334 340 346 352 358 363 368 373 377 382 386 390 394 398 401 # bulge INF 281 157 201 288 298 272 288 303 315 327 337 346 355 363 370 377 384 390 396 401 407 412 416 421 425 430 434 438 442 445 # internal_loop INF INF INF INF 83 118 90 106 121 133 145 155 164 173 181 188 195 202 208 214 219 225 230 234 239 243 248 252 256 260 263 # ML_params /* F = cu*n_unpaired + cc + ci*loop_degree (+TermAU) */ /* cu cc ci TerminalAU */ -2 315 15 56 # NINIO /* Ninio = MIN(max, m*|n1-n2| */ /* m max */ 50 300 # Tetraloops GGGGAC -33 GGUGAC -228 CGAAAG -160 GGAGAC -85 CGCAAG -209 GGAAAC -146 CGGAAG -146 CUUCGG -190 CGUGAG -232 CGAAGG -219 CUACGG -157 GGCAAC -153 CGCGAG -183 UGAGAG -219 CGAGAG -55 AGAAAU -140 CGUAAG -124 CUAACG -125 UGAAAG -114 GGAAGC -82 GGGAAC -78 UGAAAA -74 AGCAAU -118 AGUAAU -74 CGGGAG -71 AGUGAU -107 GGCGAC -119 GGGAGC -29 GUGAAC -40 UGGAAA 1 # Triloops #END