## RNAfold parameter file # stack_energies /* CG GC GU UG AU UA @ */ -125 -206 -137 -32 -131 -126 NST -206 -210 -150 -91 -128 -125 NST -137 -150 -15 -64 -78 -56 NST -32 -91 -64 -34 -12 -3 NST -131 -128 -78 -12 -82 -69 NST -126 -125 -56 -3 -69 -70 NST NST NST NST NST NST NST NST # mismatch_hairpin 0 0 0 0 0 -90 -148 -130 -106 -100 -90 -128 -134 -214 -137 -90 -155 -141 -109 -110 -90 -128 -170 -205 -151 0 0 0 0 0 -70 -118 -146 -185 -13 -70 -111 -147 -140 -118 -70 -177 -122 -162 -81 -70 -110 -161 -175 -210 0 0 0 0 0 0 -49 -32 -67 83 0 -58 -65 -46 -112 0 -202 -95 -64 21 0 -88 -103 -43 -77 0 0 0 0 0 0 -72 -60 -26 -4 0 -62 -77 -127 -75 0 -138 -145 -107 -19 0 -73 -156 -133 -151 0 0 0 0 0 0 -73 -37 -48 2 0 -117 -103 -71 -69 0 -142 -90 -95 -51 0 -87 -124 -81 -127 0 0 0 0 0 0 -100 -60 -40 -49 0 -65 -78 -80 -104 0 -155 -69 -99 -44 0 -67 -131 -69 -88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 # mismatch_interior 0 0 0 0 0 0 0 0 -48 0 0 0 0 0 0 0 -48 0 0 0 0 0 0 0 -47 0 0 0 0 0 0 0 0 -48 0 0 0 0 0 0 0 -48 0 0 0 0 0 0 0 -47 0 0 0 0 0 0 61 61 13 61 0 61 61 61 61 0 13 61 61 61 0 61 61 61 14 0 0 0 0 0 0 61 61 13 61 0 61 61 61 61 0 13 61 61 61 0 61 61 61 14 0 0 0 0 0 0 61 61 13 61 0 61 61 61 61 0 13 61 61 61 0 61 61 61 14 0 0 0 0 0 0 61 61 13 61 0 61 61 61 61 0 13 61 61 61 0 61 61 61 14 90 90 90 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 -20 90 90 90 90 90 90 90 20 # dangle5 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF -211 -256 -235 -180 INF -115 -229 -159 -168 INF -106 -93 -84 -130 INF -174 -205 -235 -79 INF -154 -147 -147 -132 INF -178 -97 -251 -180 0 0 0 0 0 # dangle3 /* @ A C G U */ INF INF INF INF INF INF 279 348 388 401 INF 158 203 293 304 INF 23 278 14 -2 INF 392 366 367 383 INF 61 -1 8 -41 INF 93 127 103 282 0 0 0 0 0 # int11_energies /* CG..CG */ 180 180 180 180 180 180 180 85 113 41 180 85 93 41 87 180 113 41 69 41 180 41 87 41 1 /* CG..GC */ 180 180 180 180 180 180 85 22 17 41 180 41 86 41 124 180 77 41 -18 41 180 41 56 41 -16 /* CG..GU */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* CG..UG */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* CG..AU */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 61 /* CG..UA */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 42 /* CG.. @ */ 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 /* GC..CG */ 180 180 180 180 180 180 85 41 77 41 180 22 86 41 56 180 17 41 -18 41 180 41 124 41 -16 /* GC..GC */ 180 180 180 180 180 180 123 7 42 41 180 7 38 41 -21 180 42 41 -54 41 180 41 -21 41 -167 /* GC..GU */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* GC..UG */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* GC..AU */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 -16 /* GC..UA */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 73 /* GC.. @ */ 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 /* GU..CG */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* GU..GC */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* GU..GU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* GU..UG */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* GU..AU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* GU..UA */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* GU.. @ */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* UG..CG */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* UG..GC */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 102 /* UG..GU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* UG..UG */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* UG..AU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* UG..UA */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* UG.. @ */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* AU..CG */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 61 /* AU..GC */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 -16 /* AU..GU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* AU..UG */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* AU..AU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 52 /* AU..UA */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 66 /* AU.. @ */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* UA..CG */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 42 /* UA..GC */ 180 180 180 180 180 180 102 102 102 102 180 102 102 102 102 180 102 102 52 102 180 102 102 102 73 /* UA..GU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* UA..UG */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 163 /* UA..AU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 66 /* UA..UA */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 113 163 163 163 163 163 137 /* UA.. @ */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* @..CG */ 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 /* @..GC */ 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 /* @..GU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* @..UG */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* @..AU */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* @..UA */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 /* @.. @ */ 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 163 # int21_energies /* CG.@..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.A..CG */ 348 348 348 348 348 348 169 169 149 187 348 202 201 219 187 348 164 160 129 187 348 187 187 187 187 /* CG.C..CG */ 348 348 348 348 348 348 101 199 187 218 348 190 203 187 236 348 187 187 187 187 348 152 159 187 210 /* CG.G..CG */ 348 348 348 348 348 348 119 187 100 187 348 187 187 187 187 348 157 187 141 187 348 187 187 187 187 /* CG.U..CG */ 348 348 348 348 348 348 187 187 187 187 348 187 213 187 212 348 187 187 187 187 348 187 152 187 137 /* CG.@..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.A..GC */ 348 348 348 348 348 348 185 171 13 187 348 224 178 198 187 348 193 151 154 187 348 187 187 187 187 /* CG.C..GC */ 348 348 348 348 348 348 137 165 187 190 348 185 199 187 244 348 187 187 187 187 348 197 165 187 217 /* CG.G..GC */ 348 348 348 348 348 348 161 187 97 187 348 187 187 187 187 348 219 187 286 187 348 187 187 187 187 /* CG.U..GC */ 348 348 348 348 348 348 187 187 187 187 348 187 194 187 169 348 187 187 187 187 348 187 134 187 89 /* CG.@..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.A..GU */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* CG.C..GU */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* CG.G..GU */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* CG.U..GU */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* CG.@..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.A..UG */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* CG.C..UG */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* CG.G..UG */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* CG.U..UG */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* CG.@..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.A..AU */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* CG.C..AU */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* CG.G..AU */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* CG.U..AU */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* CG.@..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.A..UA */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* CG.C..UA */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* CG.G..UA */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* CG.U..UA */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* CG.@.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.A.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.C.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.G.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* CG.U.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.@..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.A..CG */ 348 348 348 348 348 348 155 168 287 187 348 180 225 240 187 348 136 171 104 187 348 187 187 187 187 /* GC.C..CG */ 348 348 348 348 348 348 67 235 187 247 348 197 208 187 229 348 187 187 187 187 348 108 155 187 205 /* GC.G..CG */ 348 348 348 348 348 348 78 187 105 187 348 187 187 187 187 348 96 187 -4 187 348 187 187 187 187 /* GC.U..CG */ 348 348 348 348 348 348 187 187 187 187 348 187 232 187 257 348 187 187 187 187 348 187 171 187 187 /* GC.@..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.A..GC */ 348 348 348 348 348 348 169 169 149 187 348 202 201 219 187 348 164 160 129 187 348 187 187 187 187 /* GC.C..GC */ 348 348 348 348 348 348 101 199 187 218 348 190 203 187 236 348 187 187 187 187 348 152 159 187 210 /* GC.G..GC */ 348 348 348 348 348 348 119 187 100 187 348 187 187 187 187 348 157 187 141 187 348 187 187 187 187 /* GC.U..GC */ 348 348 348 348 348 348 187 187 187 187 348 187 213 187 212 348 187 187 187 187 348 187 152 187 137 /* GC.@..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.A..GU */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* GC.C..GU */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* GC.G..GU */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* GC.U..GU */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* GC.@..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.A..UG */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* GC.C..UG */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* GC.G..UG */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* GC.U..UG */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* GC.@..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.A..AU */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* GC.C..AU */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* GC.G..AU */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* GC.U..AU */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* GC.@..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.A..UA */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* GC.C..UA */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* GC.G..UA */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* GC.U..UA */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* GC.@.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.A.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.C.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.G.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GC.U.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.@..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.A..CG */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* GU.C..CG */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* GU.G..CG */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* GU.U..CG */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* GU.@..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.A..GC */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* GU.C..GC */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* GU.G..GC */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* GU.U..GC */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* GU.@..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.A..GU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* GU.C..GU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* GU.G..GU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* GU.U..GU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* GU.@..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.A..UG */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* GU.C..UG */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* GU.G..UG */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* GU.U..UG */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* GU.@..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.A..AU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* GU.C..AU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* GU.G..AU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* GU.U..AU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* GU.@..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.A..UA */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* GU.C..UA */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* GU.G..UA */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* GU.U..UA */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* GU.@.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.A.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.C.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.G.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* GU.U.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.@..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.A..CG */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* UG.C..CG */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* UG.G..CG */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* UG.U..CG */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* UG.@..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.A..GC */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* UG.C..GC */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* UG.G..GC */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* UG.U..GC */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* UG.@..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.A..GU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UG.C..GU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UG.G..GU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UG.U..GU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UG.@..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.A..UG */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UG.C..UG */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UG.G..UG */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UG.U..UG */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UG.@..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.A..AU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UG.C..AU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UG.G..AU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UG.U..AU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UG.@..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.A..UA */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UG.C..UA */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UG.G..UA */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UG.U..UA */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UG.@.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.A.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.C.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.G.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UG.U.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.@..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.A..CG */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* AU.C..CG */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* AU.G..CG */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* AU.U..CG */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* AU.@..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.A..GC */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* AU.C..GC */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* AU.G..GC */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* AU.U..GC */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* AU.@..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.A..GU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* AU.C..GU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* AU.G..GU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* AU.U..GU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* AU.@..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.A..UG */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* AU.C..UG */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* AU.G..UG */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* AU.U..UG */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* AU.@..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.A..AU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* AU.C..AU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* AU.G..AU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* AU.U..AU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* AU.@..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.A..UA */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* AU.C..UA */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* AU.G..UA */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* AU.U..UA */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* AU.@.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.A.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.C.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.G.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* AU.U.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.@..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.A..CG */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* UA.C..CG */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* UA.G..CG */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* UA.U..CG */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* UA.@..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.A..GC */ 348 348 348 348 348 348 225 225 205 243 348 258 257 275 243 348 220 216 185 243 348 243 243 243 243 /* UA.C..GC */ 348 348 348 348 348 348 157 255 243 274 348 246 259 243 292 348 243 243 243 243 348 208 215 243 266 /* UA.G..GC */ 348 348 348 348 348 348 175 243 156 243 348 243 243 243 243 348 213 243 197 243 348 243 243 243 243 /* UA.U..GC */ 348 348 348 348 348 348 243 243 243 243 348 243 269 243 268 348 243 243 243 243 348 243 208 243 193 /* UA.@..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.A..GU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UA.C..GU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UA.G..GU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UA.U..GU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UA.@..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.A..UG */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UA.C..UG */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UA.G..UG */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UA.U..UG */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UA.@..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.A..AU */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UA.C..AU */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UA.G..AU */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UA.U..AU */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UA.@..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.A..UA */ 348 348 348 348 348 348 281 281 261 299 348 314 313 331 299 348 276 272 241 299 348 299 299 299 299 /* UA.C..UA */ 348 348 348 348 348 348 213 311 299 330 348 302 315 299 348 348 299 299 299 299 348 264 271 299 322 /* UA.G..UA */ 348 348 348 348 348 348 231 299 212 299 348 299 299 299 299 348 269 299 253 299 348 299 299 299 299 /* UA.U..UA */ 348 348 348 348 348 348 299 299 299 299 348 299 325 299 324 348 299 299 299 299 348 299 264 299 249 /* UA.@.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.A.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.C.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.G.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* UA.U.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.@..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.A..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.C..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.G..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.U..CG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.@..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.A..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.C..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.G..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.U..GC */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.@..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.A..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.C..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.G..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.U..GU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.@..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.A..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.C..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.G..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.U..UG */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.@..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.A..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.C..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.G..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.U..AU */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.@..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.A..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.C..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.G..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.U..UA */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.@.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.A.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.C.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.G.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 /* @.U.. @ */ 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 348 # int22_energies /* CG.AA..CG */ 121 179 83 250 186 225 135 250 74 119 23 250 250 250 250 250 /* CG.AC..CG */ 179 198 128 250 171 216 173 250 250 250 250 250 140 185 142 250 /* CG.AG..CG */ 83 128 19 250 250 250 250 250 150 195 99 250 114 106 158 250 /* CG.AU..CG */ 250 250 250 250 168 213 170 250 198 190 242 250 114 106 158 250 /* CG.CA..CG */ 186 171 250 168 212 223 250 220 126 164 250 161 250 250 250 250 /* CG.CC..CG */ 225 216 250 213 223 194 250 205 250 250 250 250 192 177 250 174 /* CG.CG..CG */ 135 173 250 170 250 250 250 250 202 187 250 184 113 151 250 148 /* CG.CU..CG */ 250 250 250 250 220 205 250 188 197 235 250 232 113 98 250 95 /* CG.GA..CG */ 74 250 150 198 126 250 202 197 0 250 90 233 250 250 250 250 /* CG.GC..CG */ 119 250 195 190 164 250 187 235 250 250 250 250 133 250 156 204 /* CG.GG..CG */ 23 250 99 242 250 250 250 250 90 250 153 214 149 250 130 72 /* CG.GU..CG */ 250 250 250 250 161 250 184 232 233 250 214 142 149 250 130 220 /* CG.UA..CG */ 250 140 114 114 250 192 113 113 250 133 149 149 250 250 250 250 /* CG.UC..CG */ 250 185 106 106 250 177 151 98 250 250 250 250 250 132 120 67 /* CG.UG..CG */ 250 142 158 158 250 250 250 250 250 156 130 130 250 120 -27 136 /* CG.UU..CG */ 250 250 250 250 250 174 148 95 250 204 72 220 250 67 136 -26 /* CG.AA..GC */ 152 197 101 250 155 194 104 250 53 98 2 250 250 250 250 250 /* CG.AC..GC */ 157 196 106 250 143 188 145 250 250 250 250 250 132 177 134 250 /* CG.AG..GC */ 71 116 20 250 250 250 250 250 121 166 70 250 127 119 171 250 /* CG.AU..GC */ 250 250 250 250 119 164 121 250 98 90 142 250 101 93 145 250 /* CG.CA..GC */ 204 189 250 186 201 192 250 189 105 143 250 140 250 250 250 250 /* CG.CC..GC */ 203 194 250 191 195 180 250 177 250 250 250 250 184 169 250 166 /* CG.CG..GC */ 123 161 250 158 250 250 250 250 173 158 250 155 126 164 250 161 /* CG.CU..GC */ 250 250 250 250 171 156 250 153 97 135 250 132 100 85 250 82 /* CG.GA..GC */ 92 250 168 216 95 250 171 166 -7 250 69 212 250 250 250 250 /* CG.GC..GC */ 97 250 173 168 136 250 159 207 250 250 250 250 125 250 148 196 /* CG.GG..GC */ 11 250 87 230 250 250 250 250 61 250 137 185 162 250 143 85 /* CG.GU..GC */ 250 250 250 250 112 250 135 183 133 250 114 56 136 250 117 207 /* CG.UA..GC */ 250 158 132 132 250 161 82 82 250 112 128 128 250 250 250 250 /* CG.UC..GC */ 250 163 84 84 250 149 123 70 250 250 250 250 250 138 112 59 /* CG.UG..GC */ 250 130 146 146 250 250 250 250 250 127 101 101 250 133 1 149 /* CG.UU..GC */ 250 250 250 250 250 125 99 46 250 104 -28 120 250 54 123 -25 /* CG.AA..GU */ 165 210 114 250 236 275 185 250 108 153 57 250 250 250 250 250 /* CG.AC..GU */ 163 202 112 250 162 207 164 250 250 250 250 250 171 216 173 250 /* CG.AG..GU */ 176 221 125 250 250 250 250 250 152 197 101 250 209 201 253 250 /* CG.AU..GU */ 250 250 250 250 135 180 137 250 232 224 276 250 131 123 175 250 /* CG.CA..GU */ 217 202 250 199 282 273 250 270 160 198 250 195 250 250 250 250 /* CG.CC..GU */ 209 200 250 197 214 199 250 196 250 250 250 250 223 208 250 205 /* CG.CG..GU */ 228 266 250 263 250 250 250 250 204 189 250 186 208 246 250 243 /* CG.CU..GU */ 250 250 250 250 187 172 250 169 231 269 250 266 130 115 250 112 /* CG.GA..GU */ 105 250 181 229 176 250 252 247 48 250 124 267 250 250 250 250 /* CG.GC..GU */ 103 250 179 174 155 250 178 226 250 250 250 250 164 250 187 235 /* CG.GG..GU */ 116 250 192 335 250 250 250 250 92 250 168 216 244 250 225 167 /* CG.GU..GU */ 250 250 250 250 128 250 151 199 267 250 248 190 166 250 147 237 /* CG.UA..GU */ 250 171 145 145 250 242 163 163 250 167 183 183 250 250 250 250 /* CG.UC..GU */ 250 169 90 90 250 168 142 89 250 250 250 250 250 177 151 98 /* CG.UG..GU */ 250 235 251 251 250 250 250 250 250 158 132 132 250 215 83 231 /* CG.UU..GU */ 250 250 250 250 250 141 115 62 250 238 106 254 250 84 153 5 /* CG.AA..UG */ 217 262 166 250 189 228 138 250 95 140 44 250 250 250 250 250 /* CG.AC..UG */ 167 206 116 250 194 239 196 250 250 250 250 250 191 236 193 250 /* CG.AG..UG */ 172 217 121 250 250 250 250 250 192 237 141 250 204 196 248 250 /* CG.AU..UG */ 250 250 250 250 217 262 219 250 257 249 301 250 127 119 171 250 /* CG.CA..UG */ 269 254 250 251 235 226 250 223 147 185 250 182 250 250 250 250 /* CG.CC..UG */ 213 204 250 201 246 231 250 228 250 250 250 250 243 228 250 225 /* CG.CG..UG */ 224 262 250 259 250 250 250 250 244 229 250 226 203 241 250 238 /* CG.CU..UG */ 250 250 250 250 269 254 250 251 256 294 250 291 126 111 250 108 /* CG.GA..UG */ 157 250 233 281 129 250 205 200 35 250 111 254 250 250 250 250 /* CG.GC..UG */ 107 250 183 178 187 250 210 258 250 250 250 250 184 250 207 255 /* CG.GG..UG */ 112 250 188 331 250 250 250 250 132 250 208 256 239 250 220 162 /* CG.GU..UG */ 250 250 250 250 210 250 233 281 292 250 273 215 162 250 143 233 /* CG.UA..UG */ 250 223 197 197 250 195 116 116 250 154 170 170 250 250 250 250 /* CG.UC..UG */ 250 173 94 94 250 200 174 121 250 250 250 250 250 197 171 118 /* CG.UG..UG */ 250 231 247 247 250 250 250 250 250 198 172 172 250 210 78 226 /* CG.UU..UG */ 250 250 250 250 250 223 197 144 250 263 131 279 250 80 149 1 /* CG.AA..AU */ 165 210 114 250 236 275 185 250 108 153 57 250 250 250 250 250 /* CG.AC..AU */ 163 202 112 250 162 207 164 250 250 250 250 250 171 216 173 250 /* CG.AG..AU */ 176 221 125 250 250 250 250 250 152 197 101 250 209 201 253 250 /* CG.AU..AU */ 250 250 250 250 135 180 137 250 232 224 276 250 131 123 175 250 /* CG.CA..AU */ 217 202 250 199 282 273 250 270 160 198 250 195 250 250 250 250 /* CG.CC..AU */ 209 200 250 197 214 199 250 196 250 250 250 250 223 208 250 205 /* CG.CG..AU */ 228 266 250 263 250 250 250 250 204 189 250 186 208 246 250 243 /* CG.CU..AU */ 250 250 250 250 187 172 250 169 231 269 250 266 130 115 250 112 /* CG.GA..AU */ 105 250 181 229 176 250 252 247 48 250 124 267 250 250 250 250 /* CG.GC..AU */ 103 250 179 174 155 250 178 226 250 250 250 250 164 250 187 235 /* CG.GG..AU */ 116 250 192 335 250 250 250 250 92 250 168 216 244 250 225 167 /* CG.GU..AU */ 250 250 250 250 128 250 151 199 267 250 248 190 166 250 147 237 /* CG.UA..AU */ 250 171 145 145 250 242 163 163 250 167 183 183 250 250 250 250 /* CG.UC..AU */ 250 169 90 90 250 168 142 89 250 250 250 250 250 177 151 98 /* CG.UG..AU */ 250 235 251 251 250 250 250 250 250 158 132 132 250 215 83 231 /* CG.UU..AU */ 250 250 250 250 250 141 115 62 250 238 106 254 250 84 153 5 /* CG.AA..UA */ 217 262 166 250 189 228 138 250 95 140 44 250 250 250 250 250 /* CG.AC..UA */ 167 206 116 250 194 239 196 250 250 250 250 250 191 236 193 250 /* CG.AG..UA */ 172 217 121 250 250 250 250 250 192 237 141 250 204 196 248 250 /* CG.AU..UA */ 250 250 250 250 217 262 219 250 257 249 301 250 127 119 171 250 /* CG.CA..UA */ 269 254 250 251 235 226 250 223 147 185 250 182 250 250 250 250 /* CG.CC..UA */ 213 204 250 201 246 231 250 228 250 250 250 250 243 228 250 225 /* CG.CG..UA */ 224 262 250 259 250 250 250 250 244 229 250 226 203 241 250 238 /* CG.CU..UA */ 250 250 250 250 269 254 250 251 256 294 250 291 126 111 250 108 /* CG.GA..UA */ 157 250 233 281 129 250 205 200 35 250 111 254 250 250 250 250 /* CG.GC..UA */ 107 250 183 178 187 250 210 258 250 250 250 250 184 250 207 255 /* CG.GG..UA */ 112 250 188 331 250 250 250 250 132 250 208 256 239 250 220 162 /* CG.GU..UA */ 250 250 250 250 210 250 233 281 292 250 273 215 162 250 143 233 /* CG.UA..UA */ 250 223 197 197 250 195 116 116 250 154 170 170 250 250 250 250 /* CG.UC..UA */ 250 173 94 94 250 200 174 121 250 250 250 250 250 197 171 118 /* CG.UG..UA */ 250 231 247 247 250 250 250 250 250 198 172 172 250 210 78 226 /* CG.UU..UA */ 250 250 250 250 250 223 197 144 250 263 131 279 250 80 149 1 /* CG.AA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.AC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.AG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.AU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.CA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.CC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.CG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.CU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.GA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.GC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.GG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.GU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.UA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.UC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.UG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* CG.UU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.AA..CG */ 152 157 71 250 204 203 123 250 92 97 11 250 250 250 250 250 /* GC.AC..CG */ 197 196 116 250 189 194 161 250 250 250 250 250 158 163 130 250 /* GC.AG..CG */ 101 106 20 250 250 250 250 250 168 173 87 250 132 84 146 250 /* GC.AU..CG */ 250 250 250 250 186 191 158 250 216 168 230 250 132 84 146 250 /* GC.CA..CG */ 155 143 250 119 201 195 250 171 95 136 250 112 250 250 250 250 /* GC.CC..CG */ 194 188 250 164 192 180 250 156 250 250 250 250 161 149 250 125 /* GC.CG..CG */ 104 145 250 121 250 250 250 250 171 159 250 135 82 123 250 99 /* GC.CU..CG */ 250 250 250 250 189 177 250 153 166 207 250 183 82 70 250 46 /* GC.GA..CG */ 53 250 121 98 105 250 173 97 -7 250 61 133 250 250 250 250 /* GC.GC..CG */ 98 250 166 90 143 250 158 135 250 250 250 250 112 250 127 104 /* GC.GG..CG */ 2 250 70 142 250 250 250 250 69 250 137 114 128 250 101 -28 /* GC.GU..CG */ 250 250 250 250 140 250 155 132 212 250 185 56 128 250 101 120 /* GC.UA..CG */ 250 132 127 101 250 184 126 100 250 125 162 136 250 250 250 250 /* GC.UC..CG */ 250 177 119 93 250 169 164 85 250 250 250 250 250 138 133 54 /* GC.UG..CG */ 250 134 171 145 250 250 250 250 250 148 143 117 250 112 1 123 /* GC.UU..CG */ 250 250 250 250 250 166 161 82 250 196 85 207 250 59 149 -25 /* GC.AA..GC */ 157 175 89 250 173 172 92 250 71 76 -10 250 250 250 250 250 /* GC.AC..GC */ 175 155 94 250 161 166 133 250 250 250 250 250 150 155 122 250 /* GC.AG..GC */ 89 94 -7 250 250 250 250 250 139 144 58 250 145 97 159 250 /* GC.AU..GC */ 250 250 250 250 137 142 109 250 116 68 130 250 119 71 133 250 /* GC.CA..GC */ 173 161 250 137 151 164 250 140 74 115 250 91 250 250 250 250 /* GC.CC..GC */ 172 166 250 142 164 139 250 128 250 250 250 250 153 141 250 117 /* GC.CG..GC */ 92 133 250 109 250 250 250 250 142 130 250 106 95 136 250 112 /* GC.CU..GC */ 250 250 250 250 140 128 250 91 66 107 250 83 69 57 250 33 /* GC.GA..GC */ 71 250 139 116 74 250 142 66 -42 250 40 112 250 250 250 250 /* GC.GC..GC */ 76 250 144 68 115 250 130 107 250 250 250 250 104 250 119 96 /* GC.GG..GC */ -10 250 58 130 250 250 250 250 40 250 94 85 141 250 114 -15 /* GC.GU..GC */ 250 250 250 250 91 250 106 83 112 250 85 -58 115 250 88 107 /* GC.UA..GC */ 250 150 145 119 250 153 95 69 250 104 141 115 250 250 250 250 /* GC.UC..GC */ 250 155 97 71 250 141 136 57 250 250 250 250 250 116 125 46 /* GC.UG..GC */ 250 122 159 133 250 250 250 250 250 119 114 88 250 125 0 136 /* GC.UU..GC */ 250 250 250 250 250 117 112 33 250 96 -15 107 250 46 136 -52 /* GC.AA..GU */ 183 188 102 250 254 253 173 250 126 131 45 250 250 250 250 250 /* GC.AC..GU */ 181 180 100 250 180 185 152 250 250 250 250 250 189 194 161 250 /* GC.AG..GU */ 194 199 113 250 250 250 250 250 170 175 89 250 227 179 241 250 /* GC.AU..GU */ 250 250 250 250 153 158 125 250 250 202 264 250 149 101 163 250 /* GC.CA..GU */ 186 174 250 150 251 245 250 221 129 170 250 146 250 250 250 250 /* GC.CC..GU */ 178 172 250 148 183 171 250 147 250 250 250 250 192 180 250 156 /* GC.CG..GU */ 197 238 250 214 250 250 250 250 173 161 250 137 177 218 250 194 /* GC.CU..GU */ 250 250 250 250 156 144 250 120 200 241 250 217 99 87 250 63 /* GC.GA..GU */ 84 250 152 129 155 250 223 147 27 250 95 167 250 250 250 250 /* GC.GC..GU */ 82 250 150 74 134 250 149 126 250 250 250 250 143 250 158 135 /* GC.GG..GU */ 95 250 163 235 250 250 250 250 71 250 139 116 223 250 196 67 /* GC.GU..GU */ 250 250 250 250 107 250 122 99 246 250 219 90 145 250 118 137 /* GC.UA..GU */ 250 163 158 132 250 234 176 150 250 159 196 170 250 250 250 250 /* GC.UC..GU */ 250 161 103 77 250 160 155 76 250 250 250 250 250 169 164 85 /* GC.UG..GU */ 250 227 264 238 250 250 250 250 250 150 145 119 250 207 96 218 /* GC.UU..GU */ 250 250 250 250 250 133 128 49 250 230 119 241 250 76 166 -8 /* GC.AA..UG */ 235 240 154 250 207 206 126 250 113 118 32 250 250 250 250 250 /* GC.AC..UG */ 185 184 104 250 212 217 184 250 250 250 250 250 209 214 181 250 /* GC.AG..UG */ 190 195 109 250 250 250 250 250 210 215 129 250 222 174 236 250 /* GC.AU..UG */ 250 250 250 250 235 240 207 250 275 227 289 250 145 97 159 250 /* GC.CA..UG */ 238 226 250 202 204 198 250 174 116 157 250 133 250 250 250 250 /* GC.CC..UG */ 182 176 250 152 215 203 250 179 250 250 250 250 212 200 250 176 /* GC.CG..UG */ 193 234 250 210 250 250 250 250 213 201 250 177 172 213 250 189 /* GC.CU..UG */ 250 250 250 250 238 226 250 202 225 266 250 242 95 83 250 59 /* GC.GA..UG */ 136 250 204 181 108 250 176 100 14 250 82 154 250 250 250 250 /* GC.GC..UG */ 86 250 154 78 166 250 181 158 250 250 250 250 163 250 178 155 /* GC.GG..UG */ 91 250 159 231 250 250 250 250 111 250 179 156 218 250 191 62 /* GC.GU..UG */ 250 250 250 250 189 250 204 181 271 250 244 115 141 250 114 133 /* GC.UA..UG */ 250 215 210 184 250 187 129 103 250 146 183 157 250 250 250 250 /* GC.UC..UG */ 250 165 107 81 250 192 187 108 250 250 250 250 250 189 184 105 /* GC.UG..UG */ 250 223 260 234 250 250 250 250 250 190 185 159 250 202 91 213 /* GC.UU..UG */ 250 250 250 250 250 215 210 131 250 255 144 266 250 72 162 -12 /* GC.AA..AU */ 183 188 102 250 254 253 173 250 126 131 45 250 250 250 250 250 /* GC.AC..AU */ 181 180 100 250 180 185 152 250 250 250 250 250 189 194 161 250 /* GC.AG..AU */ 194 199 113 250 250 250 250 250 170 175 89 250 227 179 241 250 /* GC.AU..AU */ 250 250 250 250 153 158 125 250 250 202 264 250 149 101 163 250 /* GC.CA..AU */ 186 174 250 150 251 245 250 221 129 170 250 146 250 250 250 250 /* GC.CC..AU */ 178 172 250 148 183 171 250 147 250 250 250 250 192 180 250 156 /* GC.CG..AU */ 197 238 250 214 250 250 250 250 173 161 250 137 177 218 250 194 /* GC.CU..AU */ 250 250 250 250 156 144 250 120 200 241 250 217 99 87 250 63 /* GC.GA..AU */ 84 250 152 129 155 250 223 147 27 250 95 167 250 250 250 250 /* GC.GC..AU */ 82 250 150 74 134 250 149 126 250 250 250 250 143 250 158 135 /* GC.GG..AU */ 95 250 163 235 250 250 250 250 71 250 139 116 223 250 196 67 /* GC.GU..AU */ 250 250 250 250 107 250 122 99 246 250 219 90 145 250 118 137 /* GC.UA..AU */ 250 163 158 132 250 234 176 150 250 159 196 170 250 250 250 250 /* GC.UC..AU */ 250 161 103 77 250 160 155 76 250 250 250 250 250 169 164 85 /* GC.UG..AU */ 250 227 264 238 250 250 250 250 250 150 145 119 250 207 96 218 /* GC.UU..AU */ 250 250 250 250 250 133 128 49 250 230 119 241 250 76 166 -8 /* GC.AA..UA */ 235 240 154 250 207 206 126 250 113 118 32 250 250 250 250 250 /* GC.AC..UA */ 185 184 104 250 212 217 184 250 250 250 250 250 209 214 181 250 /* GC.AG..UA */ 190 195 109 250 250 250 250 250 210 215 129 250 222 174 236 250 /* GC.AU..UA */ 250 250 250 250 235 240 207 250 275 227 289 250 145 97 159 250 /* GC.CA..UA */ 238 226 250 202 204 198 250 174 116 157 250 133 250 250 250 250 /* GC.CC..UA */ 182 176 250 152 215 203 250 179 250 250 250 250 212 200 250 176 /* GC.CG..UA */ 193 234 250 210 250 250 250 250 213 201 250 177 172 213 250 189 /* GC.CU..UA */ 250 250 250 250 238 226 250 202 225 266 250 242 95 83 250 59 /* GC.GA..UA */ 136 250 204 181 108 250 176 100 14 250 82 154 250 250 250 250 /* GC.GC..UA */ 86 250 154 78 166 250 181 158 250 250 250 250 163 250 178 155 /* GC.GG..UA */ 91 250 159 231 250 250 250 250 111 250 179 156 218 250 191 62 /* GC.GU..UA */ 250 250 250 250 189 250 204 181 271 250 244 115 141 250 114 133 /* GC.UA..UA */ 250 215 210 184 250 187 129 103 250 146 183 157 250 250 250 250 /* GC.UC..UA */ 250 165 107 81 250 192 187 108 250 250 250 250 250 189 184 105 /* GC.UG..UA */ 250 223 260 234 250 250 250 250 250 190 185 159 250 202 91 213 /* GC.UU..UA */ 250 250 250 250 250 215 210 131 250 255 144 266 250 72 162 -12 /* GC.AA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.AC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.AG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.AU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.CA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.CC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.CG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.CU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.GA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.GC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.GG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.GU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.UA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.UC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.UG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GC.UU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.AA..CG */ 165 163 176 250 217 209 228 250 105 103 116 250 250 250 250 250 /* GU.AC..CG */ 210 202 221 250 202 200 266 250 250 250 250 250 171 169 235 250 /* GU.AG..CG */ 114 112 125 250 250 250 250 250 181 179 192 250 145 90 251 250 /* GU.AU..CG */ 250 250 250 250 199 197 263 250 229 174 335 250 145 90 251 250 /* GU.CA..CG */ 236 162 250 135 282 214 250 187 176 155 250 128 250 250 250 250 /* GU.CC..CG */ 275 207 250 180 273 199 250 172 250 250 250 250 242 168 250 141 /* GU.CG..CG */ 185 164 250 137 250 250 250 250 252 178 250 151 163 142 250 115 /* GU.CU..CG */ 250 250 250 250 270 196 250 169 247 226 250 199 163 89 250 62 /* GU.GA..CG */ 108 250 152 232 160 250 204 231 48 250 92 267 250 250 250 250 /* GU.GC..CG */ 153 250 197 224 198 250 189 269 250 250 250 250 167 250 158 238 /* GU.GG..CG */ 57 250 101 276 250 250 250 250 124 250 168 248 183 250 132 106 /* GU.GU..CG */ 250 250 250 250 195 250 186 266 267 250 216 190 183 250 132 254 /* GU.UA..CG */ 250 171 209 131 250 223 208 130 250 164 244 166 250 250 250 250 /* GU.UC..CG */ 250 216 201 123 250 208 246 115 250 250 250 250 250 177 215 84 /* GU.UG..CG */ 250 173 253 175 250 250 250 250 250 187 225 147 250 151 83 153 /* GU.UU..CG */ 250 250 250 250 250 205 243 112 250 235 167 237 250 98 231 5 /* GU.AA..GC */ 183 181 194 250 186 178 197 250 84 82 95 250 250 250 250 250 /* GU.AC..GC */ 188 180 199 250 174 172 238 250 250 250 250 250 163 161 227 250 /* GU.AG..GC */ 102 100 113 250 250 250 250 250 152 150 163 250 158 103 264 250 /* GU.AU..GC */ 250 250 250 250 150 148 214 250 129 74 235 250 132 77 238 250 /* GU.CA..GC */ 254 180 250 153 251 183 250 156 155 134 250 107 250 250 250 250 /* GU.CC..GC */ 253 185 250 158 245 171 250 144 250 250 250 250 234 160 250 133 /* GU.CG..GC */ 173 152 250 125 250 250 250 250 223 149 250 122 176 155 250 128 /* GU.CU..GC */ 250 250 250 250 221 147 250 120 147 126 250 99 150 76 250 49 /* GU.GA..GC */ 126 250 170 250 129 250 173 200 27 250 71 246 250 250 250 250 /* GU.GC..GC */ 131 250 175 202 170 250 161 241 250 250 250 250 159 250 150 230 /* GU.GG..GC */ 45 250 89 264 250 250 250 250 95 250 139 219 196 250 145 119 /* GU.GU..GC */ 250 250 250 250 146 250 137 217 167 250 116 90 170 250 119 241 /* GU.UA..GC */ 250 189 227 149 250 192 177 99 250 143 223 145 250 250 250 250 /* GU.UC..GC */ 250 194 179 101 250 180 218 87 250 250 250 250 250 169 207 76 /* GU.UG..GC */ 250 161 241 163 250 250 250 250 250 158 196 118 250 164 96 166 /* GU.UU..GC */ 250 250 250 250 250 156 194 63 250 135 67 137 250 85 218 -8 /* GU.AA..GU */ 183 194 207 250 267 259 278 250 139 137 150 250 250 250 250 250 /* GU.AC..GU */ 194 167 205 250 193 191 257 250 250 250 250 250 202 200 266 250 /* GU.AG..GU */ 207 205 205 250 250 250 250 250 183 181 194 250 240 185 346 250 /* GU.AU..GU */ 250 250 250 250 166 164 230 250 263 208 369 250 162 107 268 250 /* GU.CA..GU */ 267 193 250 166 313 264 250 237 210 189 250 162 250 250 250 250 /* GU.CC..GU */ 259 191 250 164 264 176 250 163 250 250 250 250 273 199 250 172 /* GU.CG..GU */ 278 257 250 230 250 250 250 250 254 180 250 153 258 237 250 210 /* GU.CU..GU */ 250 250 250 250 237 163 250 123 281 260 250 233 180 106 250 79 /* GU.GA..GU */ 139 250 183 263 210 250 254 281 68 250 126 301 250 250 250 250 /* GU.GC..GU */ 137 250 181 208 189 250 180 260 250 250 250 250 198 250 189 269 /* GU.GG..GU */ 150 250 194 369 250 250 250 250 126 250 157 250 278 250 227 201 /* GU.GU..GU */ 250 250 250 250 162 250 153 233 301 250 250 210 200 250 149 271 /* GU.UA..GU */ 250 202 240 162 250 273 258 180 250 198 278 200 250 250 250 250 /* GU.UC..GU */ 250 200 185 107 250 199 237 106 250 250 250 250 250 195 246 115 /* GU.UG..GU */ 250 266 346 268 250 250 250 250 250 189 227 149 250 246 164 248 /* GU.UU..GU */ 250 250 250 250 250 172 210 79 250 269 201 271 250 115 248 8 /* GU.AA..UG */ 248 246 259 250 220 212 231 250 126 124 137 250 250 250 250 250 /* GU.AC..UG */ 198 190 209 250 225 223 289 250 250 250 250 250 222 220 286 250 /* GU.AG..UG */ 203 201 214 250 250 250 250 250 223 221 234 250 235 180 341 250 /* GU.AU..UG */ 250 250 250 250 248 246 312 250 288 233 394 250 158 103 264 250 /* GU.CA..UG */ 319 245 250 218 285 217 250 190 197 176 250 149 250 250 250 250 /* GU.CC..UG */ 263 195 250 168 296 222 250 195 250 250 250 250 293 219 250 192 /* GU.CG..UG */ 274 253 250 226 250 250 250 250 294 220 250 193 253 232 250 205 /* GU.CU..UG */ 250 250 250 250 319 245 250 218 306 285 250 258 176 102 250 75 /* GU.GA..UG */ 191 250 235 315 163 250 207 234 69 250 113 288 250 250 250 250 /* GU.GC..UG */ 141 250 185 212 221 250 212 292 250 250 250 250 218 250 209 289 /* GU.GG..UG */ 146 250 190 365 250 250 250 250 166 250 210 290 273 250 222 196 /* GU.GU..UG */ 250 250 250 250 244 250 235 315 326 250 275 249 196 250 145 267 /* GU.UA..UG */ 250 254 292 214 250 226 211 133 250 185 265 187 250 250 250 250 /* GU.UC..UG */ 250 204 189 111 250 231 269 138 250 250 250 250 250 228 266 135 /* GU.UG..UG */ 250 262 342 264 250 250 250 250 250 229 267 189 250 241 173 243 /* GU.UU..UG */ 250 250 250 250 250 254 292 161 250 294 226 296 250 111 244 18 /* GU.AA..AU */ 183 194 207 250 267 259 278 250 139 137 150 250 250 250 250 250 /* GU.AC..AU */ 194 167 205 250 193 191 257 250 250 250 250 250 202 200 266 250 /* GU.AG..AU */ 207 205 205 250 250 250 250 250 183 181 194 250 240 185 346 250 /* GU.AU..AU */ 250 250 250 250 166 164 230 250 263 208 369 250 162 107 268 250 /* GU.CA..AU */ 267 193 250 166 313 264 250 237 210 189 250 162 250 250 250 250 /* GU.CC..AU */ 259 191 250 164 264 176 250 163 250 250 250 250 273 199 250 172 /* GU.CG..AU */ 278 257 250 230 250 250 250 250 254 180 250 153 258 237 250 210 /* GU.CU..AU */ 250 250 250 250 237 163 250 123 281 260 250 233 180 106 250 79 /* GU.GA..AU */ 139 250 183 263 210 250 254 281 68 250 126 301 250 250 250 250 /* GU.GC..AU */ 137 250 181 208 189 250 180 260 250 250 250 250 198 250 189 269 /* GU.GG..AU */ 150 250 194 369 250 250 250 250 126 250 157 250 278 250 227 201 /* GU.GU..AU */ 250 250 250 250 162 250 153 233 301 250 250 210 200 250 149 271 /* GU.UA..AU */ 250 202 240 162 250 273 258 180 250 198 278 200 250 250 250 250 /* GU.UC..AU */ 250 200 185 107 250 199 237 106 250 250 250 250 250 195 246 115 /* GU.UG..AU */ 250 266 346 268 250 250 250 250 250 189 227 149 250 246 164 248 /* GU.UU..AU */ 250 250 250 250 250 172 210 79 250 269 201 271 250 115 248 8 /* GU.AA..UA */ 248 246 259 250 220 212 231 250 126 124 137 250 250 250 250 250 /* GU.AC..UA */ 198 190 209 250 225 223 289 250 250 250 250 250 222 220 286 250 /* GU.AG..UA */ 203 201 214 250 250 250 250 250 223 221 234 250 235 180 341 250 /* GU.AU..UA */ 250 250 250 250 248 246 312 250 288 233 394 250 158 103 264 250 /* GU.CA..UA */ 319 245 250 218 285 217 250 190 197 176 250 149 250 250 250 250 /* GU.CC..UA */ 263 195 250 168 296 222 250 195 250 250 250 250 293 219 250 192 /* GU.CG..UA */ 274 253 250 226 250 250 250 250 294 220 250 193 253 232 250 205 /* GU.CU..UA */ 250 250 250 250 319 245 250 218 306 285 250 258 176 102 250 75 /* GU.GA..UA */ 191 250 235 315 163 250 207 234 69 250 113 288 250 250 250 250 /* GU.GC..UA */ 141 250 185 212 221 250 212 292 250 250 250 250 218 250 209 289 /* GU.GG..UA */ 146 250 190 365 250 250 250 250 166 250 210 290 273 250 222 196 /* GU.GU..UA */ 250 250 250 250 244 250 235 315 326 250 275 249 196 250 145 267 /* GU.UA..UA */ 250 254 292 214 250 226 211 133 250 185 265 187 250 250 250 250 /* GU.UC..UA */ 250 204 189 111 250 231 269 138 250 250 250 250 250 228 266 135 /* GU.UG..UA */ 250 262 342 264 250 250 250 250 250 229 267 189 250 241 173 243 /* GU.UU..UA */ 250 250 250 250 250 254 292 161 250 294 226 296 250 111 244 18 /* GU.AA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.AC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.AG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.AU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.CA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.CC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.CG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.CU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.GA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.GC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.GG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.GU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.UA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.UC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.UG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* GU.UU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.AA..CG */ 217 167 172 250 269 213 224 250 157 107 112 250 250 250 250 250 /* UG.AC..CG */ 262 206 217 250 254 204 262 250 250 250 250 250 223 173 231 250 /* UG.AG..CG */ 166 116 121 250 250 250 250 250 233 183 188 250 197 94 247 250 /* UG.AU..CG */ 250 250 250 250 251 201 259 250 281 178 331 250 197 94 247 250 /* UG.CA..CG */ 189 194 250 217 235 246 250 269 129 187 250 210 250 250 250 250 /* UG.CC..CG */ 228 239 250 262 226 231 250 254 250 250 250 250 195 200 250 223 /* UG.CG..CG */ 138 196 250 219 250 250 250 250 205 210 250 233 116 174 250 197 /* UG.CU..CG */ 250 250 250 250 223 228 250 251 200 258 250 281 116 121 250 144 /* UG.GA..CG */ 95 250 192 257 147 250 244 256 35 250 132 292 250 250 250 250 /* UG.GC..CG */ 140 250 237 249 185 250 229 294 250 250 250 250 154 250 198 263 /* UG.GG..CG */ 44 250 141 301 250 250 250 250 111 250 208 273 170 250 172 131 /* UG.GU..CG */ 250 250 250 250 182 250 226 291 254 250 256 215 170 250 172 279 /* UG.UA..CG */ 250 191 204 127 250 243 203 126 250 184 239 162 250 250 250 250 /* UG.UC..CG */ 250 236 196 119 250 228 241 111 250 250 250 250 250 197 210 80 /* UG.UG..CG */ 250 193 248 171 250 250 250 250 250 207 220 143 250 171 78 149 /* UG.UU..CG */ 250 250 250 250 250 225 238 108 250 255 162 233 250 118 226 1 /* UG.AA..GC */ 235 185 190 250 238 182 193 250 136 86 91 250 250 250 250 250 /* UG.AC..GC */ 240 184 195 250 226 176 234 250 250 250 250 250 215 165 223 250 /* UG.AG..GC */ 154 104 109 250 250 250 250 250 204 154 159 250 210 107 260 250 /* UG.AU..GC */ 250 250 250 250 202 152 210 250 181 78 231 250 184 81 234 250 /* UG.CA..GC */ 207 212 250 235 204 215 250 238 108 166 250 189 250 250 250 250 /* UG.CC..GC */ 206 217 250 240 198 203 250 226 250 250 250 250 187 192 250 215 /* UG.CG..GC */ 126 184 250 207 250 250 250 250 176 181 250 204 129 187 250 210 /* UG.CU..GC */ 250 250 250 250 174 179 250 202 100 158 250 181 103 108 250 131 /* UG.GA..GC */ 113 250 210 275 116 250 213 225 14 250 111 271 250 250 250 250 /* UG.GC..GC */ 118 250 215 227 157 250 201 266 250 250 250 250 146 250 190 255 /* UG.GG..GC */ 32 250 129 289 250 250 250 250 82 250 179 244 183 250 185 144 /* UG.GU..GC */ 250 250 250 250 133 250 177 242 154 250 156 115 157 250 159 266 /* UG.UA..GC */ 250 209 222 145 250 212 172 95 250 163 218 141 250 250 250 250 /* UG.UC..GC */ 250 214 174 97 250 200 213 83 250 250 250 250 250 189 202 72 /* UG.UG..GC */ 250 181 236 159 250 250 250 250 250 178 191 114 250 184 91 162 /* UG.UU..GC */ 250 250 250 250 250 176 189 59 250 155 62 133 250 105 213 -12 /* UG.AA..GU */ 248 198 203 250 319 263 274 250 191 141 146 250 250 250 250 250 /* UG.AC..GU */ 246 190 201 250 245 195 253 250 250 250 250 250 254 204 262 250 /* UG.AG..GU */ 259 209 214 250 250 250 250 250 235 185 190 250 292 189 342 250 /* UG.AU..GU */ 250 250 250 250 218 168 226 250 315 212 365 250 214 111 264 250 /* UG.CA..GU */ 220 225 250 248 285 296 250 319 163 221 250 244 250 250 250 250 /* UG.CC..GU */ 212 223 250 246 217 222 250 245 250 250 250 250 226 231 250 254 /* UG.CG..GU */ 231 289 250 312 250 250 250 250 207 212 250 235 211 269 250 292 /* UG.CU..GU */ 250 250 250 250 190 195 250 218 234 292 250 315 133 138 250 161 /* UG.GA..GU */ 126 250 223 288 197 250 294 306 69 250 166 326 250 250 250 250 /* UG.GC..GU */ 124 250 221 233 176 250 220 285 250 250 250 250 185 250 229 294 /* UG.GG..GU */ 137 250 234 394 250 250 250 250 113 250 210 275 265 250 267 226 /* UG.GU..GU */ 250 250 250 250 149 250 193 258 288 250 290 249 187 250 189 296 /* UG.UA..GU */ 250 222 235 158 250 293 253 176 250 218 273 196 250 250 250 250 /* UG.UC..GU */ 250 220 180 103 250 219 232 102 250 250 250 250 250 228 241 111 /* UG.UG..GU */ 250 286 341 264 250 250 250 250 250 209 222 145 250 266 173 244 /* UG.UU..GU */ 250 250 250 250 250 192 205 75 250 289 196 267 250 135 243 18 /* UG.AA..UG */ 286 250 255 250 272 216 227 250 178 128 133 250 250 250 250 250 /* UG.AC..UG */ 250 174 205 250 277 227 285 250 250 250 250 250 274 224 282 250 /* UG.AG..UG */ 255 205 196 250 250 250 250 250 275 225 230 250 287 184 337 250 /* UG.AU..UG */ 250 250 250 250 300 250 308 250 340 237 390 250 210 107 260 250 /* UG.CA..UG */ 272 277 250 300 219 249 250 272 150 208 250 231 250 250 250 250 /* UG.CC..UG */ 216 227 250 250 249 240 250 277 250 250 250 250 246 251 250 274 /* UG.CG..UG */ 227 285 250 308 250 250 250 250 247 252 250 275 206 264 250 287 /* UG.CU..UG */ 250 250 250 250 272 277 250 286 259 317 250 340 129 134 250 157 /* UG.GA..UG */ 178 250 275 340 150 250 247 259 43 250 153 313 250 250 250 250 /* UG.GC..UG */ 128 250 225 237 208 250 252 317 250 250 250 250 205 250 249 314 /* UG.GG..UG */ 133 250 230 390 250 250 250 250 153 250 236 315 260 250 262 221 /* UG.GU..UG */ 250 250 250 250 231 250 275 340 313 250 315 261 183 250 185 292 /* UG.UA..UG */ 250 274 287 210 250 246 206 129 250 205 260 183 250 250 250 250 /* UG.UC..UG */ 250 224 184 107 250 251 264 134 250 250 250 250 250 234 261 131 /* UG.UG..UG */ 250 282 337 260 250 250 250 250 250 249 262 185 250 261 155 239 /* UG.UU..UG */ 250 250 250 250 250 274 287 157 250 314 221 292 250 131 239 0 /* UG.AA..AU */ 248 198 203 250 319 263 274 250 191 141 146 250 250 250 250 250 /* UG.AC..AU */ 246 190 201 250 245 195 253 250 250 250 250 250 254 204 262 250 /* UG.AG..AU */ 259 209 214 250 250 250 250 250 235 185 190 250 292 189 342 250 /* UG.AU..AU */ 250 250 250 250 218 168 226 250 315 212 365 250 214 111 264 250 /* UG.CA..AU */ 220 225 250 248 285 296 250 319 163 221 250 244 250 250 250 250 /* UG.CC..AU */ 212 223 250 246 217 222 250 245 250 250 250 250 226 231 250 254 /* UG.CG..AU */ 231 289 250 312 250 250 250 250 207 212 250 235 211 269 250 292 /* UG.CU..AU */ 250 250 250 250 190 195 250 218 234 292 250 315 133 138 250 161 /* UG.GA..AU */ 126 250 223 288 197 250 294 306 69 250 166 326 250 250 250 250 /* UG.GC..AU */ 124 250 221 233 176 250 220 285 250 250 250 250 185 250 229 294 /* UG.GG..AU */ 137 250 234 394 250 250 250 250 113 250 210 275 265 250 267 226 /* UG.GU..AU */ 250 250 250 250 149 250 193 258 288 250 290 249 187 250 189 296 /* UG.UA..AU */ 250 222 235 158 250 293 253 176 250 218 273 196 250 250 250 250 /* UG.UC..AU */ 250 220 180 103 250 219 232 102 250 250 250 250 250 228 241 111 /* UG.UG..AU */ 250 286 341 264 250 250 250 250 250 209 222 145 250 266 173 244 /* UG.UU..AU */ 250 250 250 250 250 192 205 75 250 289 196 267 250 135 243 18 /* UG.AA..UA */ 286 250 255 250 272 216 227 250 178 128 133 250 250 250 250 250 /* UG.AC..UA */ 250 174 205 250 277 227 285 250 250 250 250 250 274 224 282 250 /* UG.AG..UA */ 255 205 196 250 250 250 250 250 275 225 230 250 287 184 337 250 /* UG.AU..UA */ 250 250 250 250 300 250 308 250 340 237 390 250 210 107 260 250 /* UG.CA..UA */ 272 277 250 300 219 249 250 272 150 208 250 231 250 250 250 250 /* UG.CC..UA */ 216 227 250 250 249 240 250 277 250 250 250 250 246 251 250 274 /* UG.CG..UA */ 227 285 250 308 250 250 250 250 247 252 250 275 206 264 250 287 /* UG.CU..UA */ 250 250 250 250 272 277 250 286 259 317 250 340 129 134 250 157 /* UG.GA..UA */ 178 250 275 340 150 250 247 259 43 250 153 313 250 250 250 250 /* UG.GC..UA */ 128 250 225 237 208 250 252 317 250 250 250 250 205 250 249 314 /* UG.GG..UA */ 133 250 230 390 250 250 250 250 153 250 236 315 260 250 262 221 /* UG.GU..UA */ 250 250 250 250 231 250 275 340 313 250 315 261 183 250 185 292 /* UG.UA..UA */ 250 274 287 210 250 246 206 129 250 205 260 183 250 250 250 250 /* UG.UC..UA */ 250 224 184 107 250 251 264 134 250 250 250 250 250 234 261 131 /* UG.UG..UA */ 250 282 337 260 250 250 250 250 250 249 262 185 250 261 155 239 /* UG.UU..UA */ 250 250 250 250 250 274 287 157 250 314 221 292 250 131 239 0 /* UG.AA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.AC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.AG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.AU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.CA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.CC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.CG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.CU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.GA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.GC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.GG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.GU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.UA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.UC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.UG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UG.UU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.AA..CG */ 165 163 176 250 217 209 228 250 105 103 116 250 250 250 250 250 /* AU.AC..CG */ 210 202 221 250 202 200 266 250 250 250 250 250 171 169 235 250 /* AU.AG..CG */ 114 112 125 250 250 250 250 250 181 179 192 250 145 90 251 250 /* AU.AU..CG */ 250 250 250 250 199 197 263 250 229 174 335 250 145 90 251 250 /* AU.CA..CG */ 236 162 250 135 282 214 250 187 176 155 250 128 250 250 250 250 /* AU.CC..CG */ 275 207 250 180 273 199 250 172 250 250 250 250 242 168 250 141 /* AU.CG..CG */ 185 164 250 137 250 250 250 250 252 178 250 151 163 142 250 115 /* AU.CU..CG */ 250 250 250 250 270 196 250 169 247 226 250 199 163 89 250 62 /* AU.GA..CG */ 108 250 152 232 160 250 204 231 48 250 92 267 250 250 250 250 /* AU.GC..CG */ 153 250 197 224 198 250 189 269 250 250 250 250 167 250 158 238 /* AU.GG..CG */ 57 250 101 276 250 250 250 250 124 250 168 248 183 250 132 106 /* AU.GU..CG */ 250 250 250 250 195 250 186 266 267 250 216 190 183 250 132 254 /* AU.UA..CG */ 250 171 209 131 250 223 208 130 250 164 244 166 250 250 250 250 /* AU.UC..CG */ 250 216 201 123 250 208 246 115 250 250 250 250 250 177 215 84 /* AU.UG..CG */ 250 173 253 175 250 250 250 250 250 187 225 147 250 151 83 153 /* AU.UU..CG */ 250 250 250 250 250 205 243 112 250 235 167 237 250 98 231 5 /* AU.AA..GC */ 183 181 194 250 186 178 197 250 84 82 95 250 250 250 250 250 /* AU.AC..GC */ 188 180 199 250 174 172 238 250 250 250 250 250 163 161 227 250 /* AU.AG..GC */ 102 100 113 250 250 250 250 250 152 150 163 250 158 103 264 250 /* AU.AU..GC */ 250 250 250 250 150 148 214 250 129 74 235 250 132 77 238 250 /* AU.CA..GC */ 254 180 250 153 251 183 250 156 155 134 250 107 250 250 250 250 /* AU.CC..GC */ 253 185 250 158 245 171 250 144 250 250 250 250 234 160 250 133 /* AU.CG..GC */ 173 152 250 125 250 250 250 250 223 149 250 122 176 155 250 128 /* AU.CU..GC */ 250 250 250 250 221 147 250 120 147 126 250 99 150 76 250 49 /* AU.GA..GC */ 126 250 170 250 129 250 173 200 27 250 71 246 250 250 250 250 /* AU.GC..GC */ 131 250 175 202 170 250 161 241 250 250 250 250 159 250 150 230 /* AU.GG..GC */ 45 250 89 264 250 250 250 250 95 250 139 219 196 250 145 119 /* AU.GU..GC */ 250 250 250 250 146 250 137 217 167 250 116 90 170 250 119 241 /* AU.UA..GC */ 250 189 227 149 250 192 177 99 250 143 223 145 250 250 250 250 /* AU.UC..GC */ 250 194 179 101 250 180 218 87 250 250 250 250 250 169 207 76 /* AU.UG..GC */ 250 161 241 163 250 250 250 250 250 158 196 118 250 164 96 166 /* AU.UU..GC */ 250 250 250 250 250 156 194 63 250 135 67 137 250 85 218 -8 /* AU.AA..GU */ 183 194 207 250 267 259 278 250 139 137 150 250 250 250 250 250 /* AU.AC..GU */ 194 167 205 250 193 191 257 250 250 250 250 250 202 200 266 250 /* AU.AG..GU */ 207 205 205 250 250 250 250 250 183 181 194 250 240 185 346 250 /* AU.AU..GU */ 250 250 250 250 166 164 230 250 263 208 369 250 162 107 268 250 /* AU.CA..GU */ 267 193 250 166 313 264 250 237 210 189 250 162 250 250 250 250 /* AU.CC..GU */ 259 191 250 164 264 176 250 163 250 250 250 250 273 199 250 172 /* AU.CG..GU */ 278 257 250 230 250 250 250 250 254 180 250 153 258 237 250 210 /* AU.CU..GU */ 250 250 250 250 237 163 250 123 281 260 250 233 180 106 250 79 /* AU.GA..GU */ 139 250 183 263 210 250 254 281 68 250 126 301 250 250 250 250 /* AU.GC..GU */ 137 250 181 208 189 250 180 260 250 250 250 250 198 250 189 269 /* AU.GG..GU */ 150 250 194 369 250 250 250 250 126 250 157 250 278 250 227 201 /* AU.GU..GU */ 250 250 250 250 162 250 153 233 301 250 250 210 200 250 149 271 /* AU.UA..GU */ 250 202 240 162 250 273 258 180 250 198 278 200 250 250 250 250 /* AU.UC..GU */ 250 200 185 107 250 199 237 106 250 250 250 250 250 195 246 115 /* AU.UG..GU */ 250 266 346 268 250 250 250 250 250 189 227 149 250 246 164 248 /* AU.UU..GU */ 250 250 250 250 250 172 210 79 250 269 201 271 250 115 248 8 /* AU.AA..UG */ 248 246 259 250 220 212 231 250 126 124 137 250 250 250 250 250 /* AU.AC..UG */ 198 190 209 250 225 223 289 250 250 250 250 250 222 220 286 250 /* AU.AG..UG */ 203 201 214 250 250 250 250 250 223 221 234 250 235 180 341 250 /* AU.AU..UG */ 250 250 250 250 248 246 312 250 288 233 394 250 158 103 264 250 /* AU.CA..UG */ 319 245 250 218 285 217 250 190 197 176 250 149 250 250 250 250 /* AU.CC..UG */ 263 195 250 168 296 222 250 195 250 250 250 250 293 219 250 192 /* AU.CG..UG */ 274 253 250 226 250 250 250 250 294 220 250 193 253 232 250 205 /* AU.CU..UG */ 250 250 250 250 319 245 250 218 306 285 250 258 176 102 250 75 /* AU.GA..UG */ 191 250 235 315 163 250 207 234 69 250 113 288 250 250 250 250 /* AU.GC..UG */ 141 250 185 212 221 250 212 292 250 250 250 250 218 250 209 289 /* AU.GG..UG */ 146 250 190 365 250 250 250 250 166 250 210 290 273 250 222 196 /* AU.GU..UG */ 250 250 250 250 244 250 235 315 326 250 275 249 196 250 145 267 /* AU.UA..UG */ 250 254 292 214 250 226 211 133 250 185 265 187 250 250 250 250 /* AU.UC..UG */ 250 204 189 111 250 231 269 138 250 250 250 250 250 228 266 135 /* AU.UG..UG */ 250 262 342 264 250 250 250 250 250 229 267 189 250 241 173 243 /* AU.UU..UG */ 250 250 250 250 250 254 292 161 250 294 226 296 250 111 244 18 /* AU.AA..AU */ 183 194 207 250 267 259 278 250 139 137 150 250 250 250 250 250 /* AU.AC..AU */ 194 167 205 250 193 191 257 250 250 250 250 250 202 200 266 250 /* AU.AG..AU */ 207 205 205 250 250 250 250 250 183 181 194 250 240 185 346 250 /* AU.AU..AU */ 250 250 250 250 166 164 230 250 263 208 369 250 162 107 268 250 /* AU.CA..AU */ 267 193 250 166 313 264 250 237 210 189 250 162 250 250 250 250 /* AU.CC..AU */ 259 191 250 164 264 176 250 163 250 250 250 250 273 199 250 172 /* AU.CG..AU */ 278 257 250 230 250 250 250 250 254 180 250 153 258 237 250 210 /* AU.CU..AU */ 250 250 250 250 237 163 250 123 281 260 250 233 180 106 250 79 /* AU.GA..AU */ 139 250 183 263 210 250 254 281 68 250 126 301 250 250 250 250 /* AU.GC..AU */ 137 250 181 208 189 250 180 260 250 250 250 250 198 250 189 269 /* AU.GG..AU */ 150 250 194 369 250 250 250 250 126 250 157 250 278 250 227 201 /* AU.GU..AU */ 250 250 250 250 162 250 153 233 301 250 250 210 200 250 149 271 /* AU.UA..AU */ 250 202 240 162 250 273 258 180 250 198 278 200 250 250 250 250 /* AU.UC..AU */ 250 200 185 107 250 199 237 106 250 250 250 250 250 195 246 115 /* AU.UG..AU */ 250 266 346 268 250 250 250 250 250 189 227 149 250 246 164 248 /* AU.UU..AU */ 250 250 250 250 250 172 210 79 250 269 201 271 250 115 248 8 /* AU.AA..UA */ 248 246 259 250 220 212 231 250 126 124 137 250 250 250 250 250 /* AU.AC..UA */ 198 190 209 250 225 223 289 250 250 250 250 250 222 220 286 250 /* AU.AG..UA */ 203 201 214 250 250 250 250 250 223 221 234 250 235 180 341 250 /* AU.AU..UA */ 250 250 250 250 248 246 312 250 288 233 394 250 158 103 264 250 /* AU.CA..UA */ 319 245 250 218 285 217 250 190 197 176 250 149 250 250 250 250 /* AU.CC..UA */ 263 195 250 168 296 222 250 195 250 250 250 250 293 219 250 192 /* AU.CG..UA */ 274 253 250 226 250 250 250 250 294 220 250 193 253 232 250 205 /* AU.CU..UA */ 250 250 250 250 319 245 250 218 306 285 250 258 176 102 250 75 /* AU.GA..UA */ 191 250 235 315 163 250 207 234 69 250 113 288 250 250 250 250 /* AU.GC..UA */ 141 250 185 212 221 250 212 292 250 250 250 250 218 250 209 289 /* AU.GG..UA */ 146 250 190 365 250 250 250 250 166 250 210 290 273 250 222 196 /* AU.GU..UA */ 250 250 250 250 244 250 235 315 326 250 275 249 196 250 145 267 /* AU.UA..UA */ 250 254 292 214 250 226 211 133 250 185 265 187 250 250 250 250 /* AU.UC..UA */ 250 204 189 111 250 231 269 138 250 250 250 250 250 228 266 135 /* AU.UG..UA */ 250 262 342 264 250 250 250 250 250 229 267 189 250 241 173 243 /* AU.UU..UA */ 250 250 250 250 250 254 292 161 250 294 226 296 250 111 244 18 /* AU.AA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.AC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.AG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.AU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.CA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.CC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.CG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.CU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.GA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.GC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.GG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.GU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.UA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.UC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.UG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* AU.UU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.AA..CG */ 217 167 172 250 269 213 224 250 157 107 112 250 250 250 250 250 /* UA.AC..CG */ 262 206 217 250 254 204 262 250 250 250 250 250 223 173 231 250 /* UA.AG..CG */ 166 116 121 250 250 250 250 250 233 183 188 250 197 94 247 250 /* UA.AU..CG */ 250 250 250 250 251 201 259 250 281 178 331 250 197 94 247 250 /* UA.CA..CG */ 189 194 250 217 235 246 250 269 129 187 250 210 250 250 250 250 /* UA.CC..CG */ 228 239 250 262 226 231 250 254 250 250 250 250 195 200 250 223 /* UA.CG..CG */ 138 196 250 219 250 250 250 250 205 210 250 233 116 174 250 197 /* UA.CU..CG */ 250 250 250 250 223 228 250 251 200 258 250 281 116 121 250 144 /* UA.GA..CG */ 95 250 192 257 147 250 244 256 35 250 132 292 250 250 250 250 /* UA.GC..CG */ 140 250 237 249 185 250 229 294 250 250 250 250 154 250 198 263 /* UA.GG..CG */ 44 250 141 301 250 250 250 250 111 250 208 273 170 250 172 131 /* UA.GU..CG */ 250 250 250 250 182 250 226 291 254 250 256 215 170 250 172 279 /* UA.UA..CG */ 250 191 204 127 250 243 203 126 250 184 239 162 250 250 250 250 /* UA.UC..CG */ 250 236 196 119 250 228 241 111 250 250 250 250 250 197 210 80 /* UA.UG..CG */ 250 193 248 171 250 250 250 250 250 207 220 143 250 171 78 149 /* UA.UU..CG */ 250 250 250 250 250 225 238 108 250 255 162 233 250 118 226 1 /* UA.AA..GC */ 235 185 190 250 238 182 193 250 136 86 91 250 250 250 250 250 /* UA.AC..GC */ 240 184 195 250 226 176 234 250 250 250 250 250 215 165 223 250 /* UA.AG..GC */ 154 104 109 250 250 250 250 250 204 154 159 250 210 107 260 250 /* UA.AU..GC */ 250 250 250 250 202 152 210 250 181 78 231 250 184 81 234 250 /* UA.CA..GC */ 207 212 250 235 204 215 250 238 108 166 250 189 250 250 250 250 /* UA.CC..GC */ 206 217 250 240 198 203 250 226 250 250 250 250 187 192 250 215 /* UA.CG..GC */ 126 184 250 207 250 250 250 250 176 181 250 204 129 187 250 210 /* UA.CU..GC */ 250 250 250 250 174 179 250 202 100 158 250 181 103 108 250 131 /* UA.GA..GC */ 113 250 210 275 116 250 213 225 14 250 111 271 250 250 250 250 /* UA.GC..GC */ 118 250 215 227 157 250 201 266 250 250 250 250 146 250 190 255 /* UA.GG..GC */ 32 250 129 289 250 250 250 250 82 250 179 244 183 250 185 144 /* UA.GU..GC */ 250 250 250 250 133 250 177 242 154 250 156 115 157 250 159 266 /* UA.UA..GC */ 250 209 222 145 250 212 172 95 250 163 218 141 250 250 250 250 /* UA.UC..GC */ 250 214 174 97 250 200 213 83 250 250 250 250 250 189 202 72 /* UA.UG..GC */ 250 181 236 159 250 250 250 250 250 178 191 114 250 184 91 162 /* UA.UU..GC */ 250 250 250 250 250 176 189 59 250 155 62 133 250 105 213 -12 /* UA.AA..GU */ 248 198 203 250 319 263 274 250 191 141 146 250 250 250 250 250 /* UA.AC..GU */ 246 190 201 250 245 195 253 250 250 250 250 250 254 204 262 250 /* UA.AG..GU */ 259 209 214 250 250 250 250 250 235 185 190 250 292 189 342 250 /* UA.AU..GU */ 250 250 250 250 218 168 226 250 315 212 365 250 214 111 264 250 /* UA.CA..GU */ 220 225 250 248 285 296 250 319 163 221 250 244 250 250 250 250 /* UA.CC..GU */ 212 223 250 246 217 222 250 245 250 250 250 250 226 231 250 254 /* UA.CG..GU */ 231 289 250 312 250 250 250 250 207 212 250 235 211 269 250 292 /* UA.CU..GU */ 250 250 250 250 190 195 250 218 234 292 250 315 133 138 250 161 /* UA.GA..GU */ 126 250 223 288 197 250 294 306 69 250 166 326 250 250 250 250 /* UA.GC..GU */ 124 250 221 233 176 250 220 285 250 250 250 250 185 250 229 294 /* UA.GG..GU */ 137 250 234 394 250 250 250 250 113 250 210 275 265 250 267 226 /* UA.GU..GU */ 250 250 250 250 149 250 193 258 288 250 290 249 187 250 189 296 /* UA.UA..GU */ 250 222 235 158 250 293 253 176 250 218 273 196 250 250 250 250 /* UA.UC..GU */ 250 220 180 103 250 219 232 102 250 250 250 250 250 228 241 111 /* UA.UG..GU */ 250 286 341 264 250 250 250 250 250 209 222 145 250 266 173 244 /* UA.UU..GU */ 250 250 250 250 250 192 205 75 250 289 196 267 250 135 243 18 /* UA.AA..UG */ 286 250 255 250 272 216 227 250 178 128 133 250 250 250 250 250 /* UA.AC..UG */ 250 174 205 250 277 227 285 250 250 250 250 250 274 224 282 250 /* UA.AG..UG */ 255 205 196 250 250 250 250 250 275 225 230 250 287 184 337 250 /* UA.AU..UG */ 250 250 250 250 300 250 308 250 340 237 390 250 210 107 260 250 /* UA.CA..UG */ 272 277 250 300 219 249 250 272 150 208 250 231 250 250 250 250 /* UA.CC..UG */ 216 227 250 250 249 240 250 277 250 250 250 250 246 251 250 274 /* UA.CG..UG */ 227 285 250 308 250 250 250 250 247 252 250 275 206 264 250 287 /* UA.CU..UG */ 250 250 250 250 272 277 250 286 259 317 250 340 129 134 250 157 /* UA.GA..UG */ 178 250 275 340 150 250 247 259 43 250 153 313 250 250 250 250 /* UA.GC..UG */ 128 250 225 237 208 250 252 317 250 250 250 250 205 250 249 314 /* UA.GG..UG */ 133 250 230 390 250 250 250 250 153 250 236 315 260 250 262 221 /* UA.GU..UG */ 250 250 250 250 231 250 275 340 313 250 315 261 183 250 185 292 /* UA.UA..UG */ 250 274 287 210 250 246 206 129 250 205 260 183 250 250 250 250 /* UA.UC..UG */ 250 224 184 107 250 251 264 134 250 250 250 250 250 234 261 131 /* UA.UG..UG */ 250 282 337 260 250 250 250 250 250 249 262 185 250 261 155 239 /* UA.UU..UG */ 250 250 250 250 250 274 287 157 250 314 221 292 250 131 239 0 /* UA.AA..AU */ 248 198 203 250 319 263 274 250 191 141 146 250 250 250 250 250 /* UA.AC..AU */ 246 190 201 250 245 195 253 250 250 250 250 250 254 204 262 250 /* UA.AG..AU */ 259 209 214 250 250 250 250 250 235 185 190 250 292 189 342 250 /* UA.AU..AU */ 250 250 250 250 218 168 226 250 315 212 365 250 214 111 264 250 /* UA.CA..AU */ 220 225 250 248 285 296 250 319 163 221 250 244 250 250 250 250 /* UA.CC..AU */ 212 223 250 246 217 222 250 245 250 250 250 250 226 231 250 254 /* UA.CG..AU */ 231 289 250 312 250 250 250 250 207 212 250 235 211 269 250 292 /* UA.CU..AU */ 250 250 250 250 190 195 250 218 234 292 250 315 133 138 250 161 /* UA.GA..AU */ 126 250 223 288 197 250 294 306 69 250 166 326 250 250 250 250 /* UA.GC..AU */ 124 250 221 233 176 250 220 285 250 250 250 250 185 250 229 294 /* UA.GG..AU */ 137 250 234 394 250 250 250 250 113 250 210 275 265 250 267 226 /* UA.GU..AU */ 250 250 250 250 149 250 193 258 288 250 290 249 187 250 189 296 /* UA.UA..AU */ 250 222 235 158 250 293 253 176 250 218 273 196 250 250 250 250 /* UA.UC..AU */ 250 220 180 103 250 219 232 102 250 250 250 250 250 228 241 111 /* UA.UG..AU */ 250 286 341 264 250 250 250 250 250 209 222 145 250 266 173 244 /* UA.UU..AU */ 250 250 250 250 250 192 205 75 250 289 196 267 250 135 243 18 /* UA.AA..UA */ 286 250 255 250 272 216 227 250 178 128 133 250 250 250 250 250 /* UA.AC..UA */ 250 174 205 250 277 227 285 250 250 250 250 250 274 224 282 250 /* UA.AG..UA */ 255 205 196 250 250 250 250 250 275 225 230 250 287 184 337 250 /* UA.AU..UA */ 250 250 250 250 300 250 308 250 340 237 390 250 210 107 260 250 /* UA.CA..UA */ 272 277 250 300 219 249 250 272 150 208 250 231 250 250 250 250 /* UA.CC..UA */ 216 227 250 250 249 240 250 277 250 250 250 250 246 251 250 274 /* UA.CG..UA */ 227 285 250 308 250 250 250 250 247 252 250 275 206 264 250 287 /* UA.CU..UA */ 250 250 250 250 272 277 250 286 259 317 250 340 129 134 250 157 /* UA.GA..UA */ 178 250 275 340 150 250 247 259 43 250 153 313 250 250 250 250 /* UA.GC..UA */ 128 250 225 237 208 250 252 317 250 250 250 250 205 250 249 314 /* UA.GG..UA */ 133 250 230 390 250 250 250 250 153 250 236 315 260 250 262 221 /* UA.GU..UA */ 250 250 250 250 231 250 275 340 313 250 315 261 183 250 185 292 /* UA.UA..UA */ 250 274 287 210 250 246 206 129 250 205 260 183 250 250 250 250 /* UA.UC..UA */ 250 224 184 107 250 251 264 134 250 250 250 250 250 234 261 131 /* UA.UG..UA */ 250 282 337 260 250 250 250 250 250 249 262 185 250 261 155 239 /* UA.UU..UA */ 250 250 250 250 250 274 287 157 250 314 221 292 250 131 239 0 /* UA.AA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.AC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.AG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.AU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.CA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.CC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.CG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.CU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.GA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.GC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.GG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.GU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.UA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.UC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.UG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* UA.UU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AA..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AC..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AG..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AU..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CA..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CC..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CG..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CU..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GA..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GC..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GG..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GU..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UA..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UC..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UG..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UU..CG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AA..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AC..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AG..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AU..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CA..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CC..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CG..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CU..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GA..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GC..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GG..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GU..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UA..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UC..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UG..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UU..GC */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AA..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AC..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AG..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AU..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CA..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CC..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CG..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CU..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GA..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GC..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GG..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GU..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UA..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UC..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UG..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UU..GU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AA..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AC..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AG..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AU..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CA..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CC..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CG..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CU..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GA..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GC..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GG..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GU..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UA..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UC..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UG..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UU..UG */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AA..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AC..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AG..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AU..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CA..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CC..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CG..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CU..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GA..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GC..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GG..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GU..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UA..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UC..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UG..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UU..AU */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AA..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AC..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AG..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AU..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CA..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CC..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CG..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CU..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GA..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GC..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GG..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GU..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UA..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UC..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UG..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UU..UA */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.AU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.CU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.GU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UA.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UC.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UG.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 /* @.UU.. @ */ 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 394 # hairpin INF INF INF -13 -13 -13 -13 -13 -13 -13 -1 8 18 26 34 42 49 55 61 67 73 78 83 88 92 97 101 105 109 113 116 # bulge INF -137 -59 -73 -13 -13 -13 3 18 30 42 52 61 70 78 85 92 99 105 111 116 122 127 131 136 140 145 149 153 157 160 # internal_loop INF INF INF INF -93 -99 -126 -109 -94 -82 -70 -60 -51 -42 -34 -27 -20 -13 -7 -1 3 9 14 18 23 27 32 36 40 44 47 # ML_params /* F = cu*n_unpaired + cc + ci*loop_degree (+TermAU) */ /* cu cc ci TerminalAU */ -13 -13 -13 -13 # NINIO /* Ninio = MIN(max, m*|n1-n2| */ /* m max */ 50 300 # Tetraloops GGGGAC -13 GGUGAC -13 CGAAAG -13 GGAGAC -13 CGCAAG -13 GGAAAC -13 CGGAAG -13 CUUCGG -13 CGUGAG -13 CGAAGG -13 CUACGG -13 GGCAAC -13 CGCGAG -13 UGAGAG -13 CGAGAG -13 AGAAAU -13 CGUAAG -13 CUAACG -13 UGAAAG -13 GGAAGC -13 GGGAAC -13 UGAAAA -13 AGCAAU -13 AGUAAU -13 CGGGAG -13 AGUGAU -13 GGCGAC -13 GGGAGC -13 GUGAAC -13 UGGAAA -13 # Triloops #END